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The map label for this gene is icmF

Identifier: 54293451

GI number: 54293451

Start: 544714

End: 547635

Strand: Reverse

Name: icmF

Synonym: lpl0500

Alternate gene names: NA

Gene position: 547635-544714 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54293452

Following gene: 54293450

Centisome position: 16.37

GC content: 36.79

Gene sequence:

>2922_bases
ATGGACAATTCATTGCGCGCATTATGTGATGCTATAAAAAAAATTCTCTCTCAATTAAAACCACAAGCTAATCAATTATC
TTTTATTGTCATCACCGGGAAAAACGCCCAAGGCAAATCGGCACTGTTAAAGCAAAGTAATATGGAAGAAATGCCCGTAT
TCAGCGAAGAGCATGCCAAACTGTATTTTAATCAAAAAGGAATCATAGTAGAGCTTGGCGAAAATTGGCTTACCAATAGC
AAAACATTATTGCTCACAACACTTAAACAATTAAATAAATGCAACCGCCATCTCAAGATTACAGGCTTGATTTTATGCGT
GGATGTCAATGATTTACTGATCGCTGAACCAGCACAATTCACTGAACAAAAAAAATCTCATTTGCAACTTATTCAACGTT
TAGGTGTTAACCTGGGATATCAGGCTGAATTAGCTTTAATATTCACCAAAATGGATACCTTGGCTGGCTTTTCTGAATTT
TATCAAATGGATCATGTCAATGATCTATCTAAACCTCTTGGCTTTTCCCTTGATTGTGTCAACCAATTAAGAAAAAAAAT
TGAAACGTTTTCCCTTCAATTCAATCAATTAATTGAAGCTTTGGGACAGCAAGTTATCAATAAAATGCACCCGGCACGTT
CTACTATCAAGCGCAGTTTGATACGCGAATTTCCTTTGCAATTAGCCAGCTTGAGAGCCCCAATTCAGTCGTTAATTCAG
GGGATTTCGCCAAAATTATTCCATGTTCACTCTATTTTTTTCACGAGTGCCGAACAAGGTGGAGTCAGTATAGATAGGCT
AAACAAAAAAATTCAGCATGAATACGCTCTGGTTGTTCAGGATACTTTCCCTCAAGCAACCAATTTCAGATCCTATTTTG
TAGAAGGTGCACTGCAAACAATCCAGGAACAATGTATCCAGGTACCACAGACTACAAAATTTTCTCAAAAACCATTCATT
GCTGTTGCAGTAAGTTTGGCTGGGCTCAGTTTATTGACGCTGATCTATAACCACTACAAAACCTCTCATATTCTTGATGA
GGCTAGTAAAGAATTGCTTGCCTATGAAGCACTGAATAATCAGGGCACTAGTGGTGCACAAGCGCTATATCACTTATCGC
AGGCTGCAAATAAAATGAATTACATTACATCAAACTCCATATCGCTGCCTACTGTGCACCAATTAAAATTAAACCTTCAC
AACAACGCTCAAAATCGTTTACAAGGAGAATTTCTTCCCTCCTTAGCCAATGAGTTAGAACAAGTCATAACAAGTCCTGG
CAACACCCCTATTACTCGTTATAAGGCTTTAAAAATTTATTTAATGTTAGGGGACTCAAAATATTTTTCATCCCAACTCA
TTCTGGATTGGTTTCAACAACAATGGCAGGGACGTGCACCAGGTACTACGCAAAAACAGTTGGCTCTTTTAAAACAAACT
CTTAGCAATCCTCCTCAAAATATACCCATCAAATCACAAATAATCAGTGATGCAAGGAATTATCTTAATGCACTTCCAAC
AAGCTATTTATATTACTCTATTGCGAAAGAATATTTCCCTCAGGAAAAACAAAAGATTGTGATTGAAGGTTTTTCTATAC
CCACGGATGAAGTGCCAACCTATTTTACTAAAACCGGATTTACGAAAATTATTAACGAATTACCTAAAATTACCAGCACA
CTTCAATCAGAAAACTGGGTACTTGCGAGACAGGATTTGTCTCAATTACACAATATGCTGATTCAGGCTTATTGTTTTGA
TTACGTCACTTGGTGGCAAACGTTCATGAAGAAATCCCAACCATTACGTTATCAGGATTATCAGCAAGGTCGTCAATTAA
CAAAATTAATACAACAATCCAATTCGTTTTATAAATTCGCTAATCTTATTCAGCAGGAAACCAAACCGGATTTAACCGAA
GGCATATCCACCTTTAATCAATTCATTGCCAATCAATTTACTGATTTAAATTTAACAACTTTATCCAGCATTAAGGAATT
AGATTTTAGAATTTCTGAATTAGAACGATTTATTGCAACGTTATCTGTTGTAAATGATGGAGGTAAAACAGCGTTTACCA
TTACACGCTCGCGTTTTCTCAATGAAAATTCCTCTGACCCTGTGAGTTTGCTCTACAGCCAGGCACGACAATTACCTGAA
CCATTGAGTTCGTGGACAAAGCAAATAGCTGGTGACACTTGGGTTATACTGATTAGAGATAGTCGTCAATATATTAATAA
TCAGTGGCAAAAAACCGTCTATAGAGAGTTCCAAAACTCTATTGCCCAGCGCTATCCTTTTGACTCGTCACAAACTGCAG
AAATAGATATTGCAGATTTTAATCGCTTTTTCTCAACACATGGCTTATTGAACACCTACTCTGAACAATACATTAAGCCC
TTTCTTGACACTTCATCTCCAGAATGGAAGCCTAAAGCTGTCAATGATTTCATCTTGCCTATTTCAAATGAAGTAATTGA
TGAGTTAATTCGTGCCAATATCATTACTAATATGTTCTTTCCTGATCACAGTGATGAAAGCAAAATTGATTTTAGCTTGC
AAAAAATCTCTCTGGATCCTGTAGTTTCTAATCTAGTCCTTGAAATTGGCGGCACTAAATTGATGGATAATCAAACAAGC
GATTCACTAATTCGCTTCACCTGGCCTCAAAACAACGCTAAATTGGCTCTTGATTCTATTGAGGGGAATCATTACGAGCT
CGCAGAATATGGAACCTGGGCAATATTTAAATTACTTGAAAAAGTCAATGTGCTTGTGGATGAACAAGATAGTTCCAGCC
TCCAAATACTTTTTGAAGTGAATAGCAACTCCGGCCGCTATTTATTAAAAACAAACAACCAAATTAATCCTTTTACTCCA
GGAATTCTAAATGGGTTTACTTTAAACGACCATATTGCCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTATTGTAATTCTAGCTTTTGTTACTAGCCATGTTTTATTAGAAAACAAAGCTAAAACTGTTTTATTTGGACATACCCAA
CTTGCTATGCTGGAAAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATGAAACAAAATACCAAACACAGCATTATTGCTGGATTATACGGAAATGCTTTGGAGTGGTATGATTTTTTACTCTAT
GCCAGTTTTGCTCCTGTCTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ImcF Domain-Containing Protein; IcmF-Related Protein; IcmF Family Protein; Inner Membrane Protein; IcmF-Like Protein; Lipoprotein; ImcF-Like Protein; Secretion Protein IcmF; ImcF Family Protein; ImcF-Related; Replication Related Protein; Protein Conserved In Bacteria; Fis Family Transcriptional Regulator

Number of amino acids: Translated: 973; Mature: 973

Protein sequence:

>973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQLRKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSIDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNYITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQLILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDTWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA

Sequences:

>Translated_973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQLRKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSIDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNYITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQLILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDTWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA
>Mature_973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQLRKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSIDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNYITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQLILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDTWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA

Specific function: Unknown

COG id: COG3523

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 110921; Mature: 110921

Theoretical pI: Translated: 7.49; Mature: 7.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
LYFNQKGIIVELGENWLTNSKTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQF
EEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEECCHHH
TEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEFYQMDHVNDLSKPLGFSLDCV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
NQLRKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSIDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQT
CCCCCCEEHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IQEQCIQVPQTTKFSQKPFIAVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNN
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QGTSGAQALYHLSQAANKMNYITSNSISLPTVHQLKLNLHNNAQNRLQGEFLPSLANELE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQLILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
HHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPT
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
YFTKTGFTKIINELPKITSTLQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTEGISTFNQFIANQFTDLNLTT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCH
PLSSWTKQIAGDTWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADF
HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHH
NRFFSTHGLLNTYSEQYIKPFLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFF
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTSDSLIRFTWPQNNAKLALDSI
CCCCCCCCEEEEHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEC
EGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
GILNGFTLNDHIA
HHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
LYFNQKGIIVELGENWLTNSKTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQF
EEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEECCHHH
TEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEFYQMDHVNDLSKPLGFSLDCV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
NQLRKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSIDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQT
CCCCCCEEHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QGTSGAQALYHLSQAANKMNYITSNSISLPTVHQLKLNLHNNAQNRLQGEFLPSLANELE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQLILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
HHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPT
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YFTKTGFTKIINELPKITSTLQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQ
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PLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTEGISTFNQFIANQFTDLNLTT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCH
PLSSWTKQIAGDTWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADF
HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHH
NRFFSTHGLLNTYSEQYIKPFLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFF
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTSDSLIRFTWPQNNAKLALDSI
CCCCCCCCEEEEHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEC
EGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
GILNGFTLNDHIA
HHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA