| Definition | Legionella pneumophila str. Lens, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006369 |
| Length | 3,345,687 |
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The map label for this gene is 54293052
Identifier: 54293052
GI number: 54293052
Start: 102895
End: 106869
Strand: Direct
Name: 54293052
Synonym: lpl0089
Alternate gene names: NA
Gene position: 102895-106869 (Clockwise)
Preceding gene: 54293048
Following gene: 54293053
Centisome position: 3.08
GC content: 37.03
Gene sequence:
>3975_bases ATGAAGCAGTTAATAAGTATAATAAAAGGACAAATTCAACAGCTCCCCATTCCCGGCCTAAAACATTTGTTGTTAAGTCA CCTTAAAGAAGATGCTCACGATTTAACAGAACTCTTTTGCCAACAAATCCCGGCTCAGAAAAATCAATTCTCGCTTAATC ACTCAGTTCCATTTGGTTTACCGGCTTCGCTATCTGTACTCGCAATCGTTTTGACTTATGCCCCCAATCTGCTTCACCGA GAGTTATCAGAGCAGTTGCTGACAATGCTAGATTCAATAAAAGAGACCAAAACCAGTGTTGATAATCAATTAGCAGAGAG ATGCACGAAGCAATTGAATTATTATAGTGATGCGAAACCTGTCCTTATCCCGTTGAAAGAAAGAGGAGCAAAGGATTTAA TTCAGATCTTGGAGCAAGCCGATGAGCGCAGTTTGTCAGCTTTTTCTCATCTGGCTAAAGATACTGATTTAAATGTTTTA ATTGAAACCTTTTTAGTCAAAAACAATAAGGATTTGGATTTAGTCAATAGAAACCATTTGGTACAATTTTTACGTCAACC TGATTTGGCAGGATGGTTAACCCGTTTCCTTGATTCATTAATCTATGAATCTATCAATGCTCTCTCAATTCGATTGTTGT TGTCTTTGGTTTCTTCTGAGAAAGCGATTGAGAAACTGAAGGAGGCTAGAGCCTGCCTGGCTCAGTATCCTTTTTCCATA GATTTGCACGCCATGCGGGCTGTGTTTGATTTTTATCAGTATGAATTAAAAAGAGATTTATTTTCTCCTGAAAGCCATTT AGTCATGCAGTTGCTGCATGATTTATTAAAAAACACCAAATTAGACAAACAACAAGAGTTTTTTCAGGGCTTAAGTCAGG AAACTGTGCTTTTGATCATTGAGTATTGTATAGCGGAATATAACAAAACGACTGAGGAAGAGAAGCAGAACTGTAAAAAC TTGCTTACCAGGTTATGTTCGGCTTTTTCTGATTCCAGCCAGGACTTTTTGGGGAAAATAAGAACAAAATTTAATCAGCT GGATCCTTATCTCTTTGATACCCCTCAGCTATATCAGCTGGCCTCCGATTTAATAACTAAATCATGTAACTCAGGAAAGG AGCCGTTATCCAGTTCTCCGATCGCTTTATTGTTATCCACGCCACAATTTGTCGGGGTTTGTACGCCTAAGGTTTTAAAA CAATTAGTTGAAAGATACAGCTTGTATACCTTAACTCTGAATCAGAAGGACTATAAGCAAGACCTTTGTTTTAAAGAATA TGCTCCATATTTTGATGAAATCAATGAACATATGGCTCAGATTGAGCGTAATCTGCTTATTCATCCGGAAGCTCAGTCAT TTTGGCTGGATAAAAAATACAGTTTATTGCAGTTTAGAGTTGAGATTAGTAAAAGTGCTTTGCTTCACCAAATGGAGTGT TTACTGGAGGCGAACAAGGGAGGAGATGAGCTACATAATAAGGGATTAGAGGTGTTATATCATTATTACGCCTTGAGTTA TCCCAATTTACGTTCGGATTTATTCCTTAAAGTGGTAAATCATATTTATTCACGGTTTTTTATTAAGGGGAATAATGAAA CCGAAGCTCGGAACGGGTTATTTCACTGGTTAAGACAAAGTTTTCCTCTAATTGATAAGTTGCCCAAAGAATTAGACAGA AAAAAAGAAATTTTTTTATATAACTCTGCCGGGAAGAAGATTGGATTTCTTGGTGAGTCTAATGCTGCAATGACTTTTGT TAATGAGGAAATCGTATTATTAGCTCGAACGGGCTCTATGGATATCAATGAGCCTTTATATGATCAAGAGGGTTTGGTTC TAGGGTATTTAACGGAAGAGAGTTGTTTAAGAAGCGAAAGTGCCATTCACAAAAATGCTGCCGCCTGGGTTTTAGCTGGT TTGTCCAAAAGTGATTTGGAAAGTTCCTCGTTTGGATTGGAGTCCCTGTTACATAATGTGTTATTCGAGAACGCGATAGG GGTTTTATATCAATGTGAATCCATTTGCCTTGATGCCAATAAGCGCATATGGCTGAATAATAAATTATTAAAAGAAATCC AAGAGGCTCCAGGAGAAATCCCTGCATCTGTTTTATATCCATTGCTCGATCATTTTGAGGATGAAACAGTATTTGAATTA TTAGGCGCTATCAGGAATAAAAACAATGCGCTTGAGCTTTTTCATTATATTTTAAACCGAGACTCAAAGCGTTCTATTTT ACTGAATGGCTTGTATGAATCTGATTTTCAAAGATTTTTGGAACATCAAGGCGCCGATGTTTGCTTAGCTGATTATTTGG TTAATTATTATGATAAACCCTGGTTTTCAGAAGTCTTACTACGATTTGCTTACCATGGTAAAAAATATAAAAAGCCAGAT CTTCTAAGTAGCGCCTTAACTTTCATTACCAAGGAAATTTCTCAAGATAAGAAGCAAGAGACAATCTGTGATGCTGTACT GGATCGTTTAATAAATTCTGAAGCATGTGCCGCATTAGTGTTAAAGGAGTTTCTTGGTGATAGAACTCATAACTCCATTC AGAAGGTAAATAACCCGGAAATTGGCAAAGTAAGCCAATTTTTTGATAGGCGGCATATAGTGCCCCTTATTGCACAGTTA AATAAGACTTCTTATTGGGAGCAAAATGCTCAGTATAAATTGGCTTTACATATTTTGGCTAATCAACATGGACGCCTTTT TTCTGAAACTGATTTGAATCCCGATTCTCCTCAGGCCTGGCAAGGTAAAGAATTAAAAGAACTGGCCTGTTTTACCAGCA GGCATTTATCCAAAAAACGTCCTTTCGATAATAAACATGATATTGGATATCGTGTTTTAGGCGAGCTTCTTTTCAGGTGC GCCAATTCGGGGATAACGTCTTTATTTTACAAGCAAAAAGCGTTGAATCGTGCAATAACCCGATTGTCAATCACAGAACC CTTTTTAGTCAGGATGGTGGATAAATTATGGATGCCTAAAGGAATCAGGGAACTTTATGGAAAATCTTTGTTTTTTAAGG GCTCCTGGTTTGATGATCAAGTCTTCTTGCAAAAGGAATTAAAAGACCATCATCCTCTGCTGGACTGGAGTCATTTTATT AAGCAAACCTGGAGTAAAAGAGATAAACAGAAGAAGTCACCCATAATATGTTCTTATTTGCTGAGTTATACGGGTAAGAA AAGTGTATTGTTGCATTTATTACAGGATTATTTTAATTCTTTTCAAGGAATGCCAGACTACATCAGGCCAGTCAGTCAAT TATTAAGATTTTTCCCTCAACGCGATGTGTCCGCAGTCATATACGATGCGCTGGAAGCTGAAATGATAAAAAAACCTCAG TTATTAGACAGGCAAATTTTAAATGACATGGCCTTTTATTATGGAAAACAATTAGCCAGGAAGGACACAAGTTTCCCGCA GGCTGATAGTAATTTATTAACGTATTGGGGACAGAATAAACATTATTCTTTAGTAAAAAGAGGATGTGAACTATTAGCCA GGGATTGTGAGGATAAAGGAGTAAAAAAACGATTGATTAGTGCTGCCAAAGAAGCGGAAGTAGAACAGGATTTGAGTTCC AGTGCGCAAACATTTTATTTTGGTCTAATTAAATTTTTTAAAAGATTATGGCATTATGGCTTTAATGCGGAAAACAGCTC ATCAAAAATTATAAAGTTTTGTGATGATCTCACTCCCGGCCCTACTCGTAAAAAAGCAGGGGATTTCATCAATGCACCGG TTGCAGAGAGCAGAACCAATTCTTTGCATTTAGGCTTTTCTGAAAGACGCAAGCAGTTAATTAGTCTTTTAGCTACTATT AAAAGTAGTCCAGCGCACTTCACACGAGTTGTTAATTATTCAGACAATACTCAAACATTCTTTGGTGAGCAACCCAAACA GTCTATTGACTATAATACTCCTGCAATACCAAGTAACTTTGAAAGTATAATGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAGTTTTCAAATCAATAGTTTAAGGGTATAGTAAAAGCATTATCCTTTTAAATCCCTATTGGGGAAAGGATTATTTTAA GATGTTAGGGAAGTGTCGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases GATTGTCCTTATAGGGCATTTATACCTTTGCTCATATTTTTGTTTTATTAGCCAGGTGTTCTGCATGCATTAATCAACCC GATGCATGACTTATCAATGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1324; Mature: 1324
Protein sequence:
>1324_residues MKQLISIIKGQIQQLPIPGLKHLLLSHLKEDAHDLTELFCQQIPAQKNQFSLNHSVPFGLPASLSVLAIVLTYAPNLLHR ELSEQLLTMLDSIKETKTSVDNQLAERCTKQLNYYSDAKPVLIPLKERGAKDLIQILEQADERSLSAFSHLAKDTDLNVL IETFLVKNNKDLDLVNRNHLVQFLRQPDLAGWLTRFLDSLIYESINALSIRLLLSLVSSEKAIEKLKEARACLAQYPFSI DLHAMRAVFDFYQYELKRDLFSPESHLVMQLLHDLLKNTKLDKQQEFFQGLSQETVLLIIEYCIAEYNKTTEEEKQNCKN LLTRLCSAFSDSSQDFLGKIRTKFNQLDPYLFDTPQLYQLASDLITKSCNSGKEPLSSSPIALLLSTPQFVGVCTPKVLK QLVERYSLYTLTLNQKDYKQDLCFKEYAPYFDEINEHMAQIERNLLIHPEAQSFWLDKKYSLLQFRVEISKSALLHQMEC LLEANKGGDELHNKGLEVLYHYYALSYPNLRSDLFLKVVNHIYSRFFIKGNNETEARNGLFHWLRQSFPLIDKLPKELDR KKEIFLYNSAGKKIGFLGESNAAMTFVNEEIVLLARTGSMDINEPLYDQEGLVLGYLTEESCLRSESAIHKNAAAWVLAG LSKSDLESSSFGLESLLHNVLFENAIGVLYQCESICLDANKRIWLNNKLLKEIQEAPGEIPASVLYPLLDHFEDETVFEL LGAIRNKNNALELFHYILNRDSKRSILLNGLYESDFQRFLEHQGADVCLADYLVNYYDKPWFSEVLLRFAYHGKKYKKPD LLSSALTFITKEISQDKKQETICDAVLDRLINSEACAALVLKEFLGDRTHNSIQKVNNPEIGKVSQFFDRRHIVPLIAQL NKTSYWEQNAQYKLALHILANQHGRLFSETDLNPDSPQAWQGKELKELACFTSRHLSKKRPFDNKHDIGYRVLGELLFRC ANSGITSLFYKQKALNRAITRLSITEPFLVRMVDKLWMPKGIRELYGKSLFFKGSWFDDQVFLQKELKDHHPLLDWSHFI KQTWSKRDKQKKSPIICSYLLSYTGKKSVLLHLLQDYFNSFQGMPDYIRPVSQLLRFFPQRDVSAVIYDALEAEMIKKPQ LLDRQILNDMAFYYGKQLARKDTSFPQADSNLLTYWGQNKHYSLVKRGCELLARDCEDKGVKKRLISAAKEAEVEQDLSS SAQTFYFGLIKFFKRLWHYGFNAENSSSKIIKFCDDLTPGPTRKKAGDFINAPVAESRTNSLHLGFSERRKQLISLLATI KSSPAHFTRVVNYSDNTQTFFGEQPKQSIDYNTPAIPSNFESIM
Sequences:
>Translated_1324_residues MKQLISIIKGQIQQLPIPGLKHLLLSHLKEDAHDLTELFCQQIPAQKNQFSLNHSVPFGLPASLSVLAIVLTYAPNLLHR ELSEQLLTMLDSIKETKTSVDNQLAERCTKQLNYYSDAKPVLIPLKERGAKDLIQILEQADERSLSAFSHLAKDTDLNVL IETFLVKNNKDLDLVNRNHLVQFLRQPDLAGWLTRFLDSLIYESINALSIRLLLSLVSSEKAIEKLKEARACLAQYPFSI DLHAMRAVFDFYQYELKRDLFSPESHLVMQLLHDLLKNTKLDKQQEFFQGLSQETVLLIIEYCIAEYNKTTEEEKQNCKN LLTRLCSAFSDSSQDFLGKIRTKFNQLDPYLFDTPQLYQLASDLITKSCNSGKEPLSSSPIALLLSTPQFVGVCTPKVLK QLVERYSLYTLTLNQKDYKQDLCFKEYAPYFDEINEHMAQIERNLLIHPEAQSFWLDKKYSLLQFRVEISKSALLHQMEC LLEANKGGDELHNKGLEVLYHYYALSYPNLRSDLFLKVVNHIYSRFFIKGNNETEARNGLFHWLRQSFPLIDKLPKELDR KKEIFLYNSAGKKIGFLGESNAAMTFVNEEIVLLARTGSMDINEPLYDQEGLVLGYLTEESCLRSESAIHKNAAAWVLAG LSKSDLESSSFGLESLLHNVLFENAIGVLYQCESICLDANKRIWLNNKLLKEIQEAPGEIPASVLYPLLDHFEDETVFEL LGAIRNKNNALELFHYILNRDSKRSILLNGLYESDFQRFLEHQGADVCLADYLVNYYDKPWFSEVLLRFAYHGKKYKKPD LLSSALTFITKEISQDKKQETICDAVLDRLINSEACAALVLKEFLGDRTHNSIQKVNNPEIGKVSQFFDRRHIVPLIAQL NKTSYWEQNAQYKLALHILANQHGRLFSETDLNPDSPQAWQGKELKELACFTSRHLSKKRPFDNKHDIGYRVLGELLFRC ANSGITSLFYKQKALNRAITRLSITEPFLVRMVDKLWMPKGIRELYGKSLFFKGSWFDDQVFLQKELKDHHPLLDWSHFI KQTWSKRDKQKKSPIICSYLLSYTGKKSVLLHLLQDYFNSFQGMPDYIRPVSQLLRFFPQRDVSAVIYDALEAEMIKKPQ LLDRQILNDMAFYYGKQLARKDTSFPQADSNLLTYWGQNKHYSLVKRGCELLARDCEDKGVKKRLISAAKEAEVEQDLSS SAQTFYFGLIKFFKRLWHYGFNAENSSSKIIKFCDDLTPGPTRKKAGDFINAPVAESRTNSLHLGFSERRKQLISLLATI KSSPAHFTRVVNYSDNTQTFFGEQPKQSIDYNTPAIPSNFESIM >Mature_1324_residues MKQLISIIKGQIQQLPIPGLKHLLLSHLKEDAHDLTELFCQQIPAQKNQFSLNHSVPFGLPASLSVLAIVLTYAPNLLHR ELSEQLLTMLDSIKETKTSVDNQLAERCTKQLNYYSDAKPVLIPLKERGAKDLIQILEQADERSLSAFSHLAKDTDLNVL IETFLVKNNKDLDLVNRNHLVQFLRQPDLAGWLTRFLDSLIYESINALSIRLLLSLVSSEKAIEKLKEARACLAQYPFSI DLHAMRAVFDFYQYELKRDLFSPESHLVMQLLHDLLKNTKLDKQQEFFQGLSQETVLLIIEYCIAEYNKTTEEEKQNCKN LLTRLCSAFSDSSQDFLGKIRTKFNQLDPYLFDTPQLYQLASDLITKSCNSGKEPLSSSPIALLLSTPQFVGVCTPKVLK QLVERYSLYTLTLNQKDYKQDLCFKEYAPYFDEINEHMAQIERNLLIHPEAQSFWLDKKYSLLQFRVEISKSALLHQMEC LLEANKGGDELHNKGLEVLYHYYALSYPNLRSDLFLKVVNHIYSRFFIKGNNETEARNGLFHWLRQSFPLIDKLPKELDR KKEIFLYNSAGKKIGFLGESNAAMTFVNEEIVLLARTGSMDINEPLYDQEGLVLGYLTEESCLRSESAIHKNAAAWVLAG LSKSDLESSSFGLESLLHNVLFENAIGVLYQCESICLDANKRIWLNNKLLKEIQEAPGEIPASVLYPLLDHFEDETVFEL LGAIRNKNNALELFHYILNRDSKRSILLNGLYESDFQRFLEHQGADVCLADYLVNYYDKPWFSEVLLRFAYHGKKYKKPD LLSSALTFITKEISQDKKQETICDAVLDRLINSEACAALVLKEFLGDRTHNSIQKVNNPEIGKVSQFFDRRHIVPLIAQL NKTSYWEQNAQYKLALHILANQHGRLFSETDLNPDSPQAWQGKELKELACFTSRHLSKKRPFDNKHDIGYRVLGELLFRC ANSGITSLFYKQKALNRAITRLSITEPFLVRMVDKLWMPKGIRELYGKSLFFKGSWFDDQVFLQKELKDHHPLLDWSHFI KQTWSKRDKQKKSPIICSYLLSYTGKKSVLLHLLQDYFNSFQGMPDYIRPVSQLLRFFPQRDVSAVIYDALEAEMIKKPQ LLDRQILNDMAFYYGKQLARKDTSFPQADSNLLTYWGQNKHYSLVKRGCELLARDCEDKGVKKRLISAAKEAEVEQDLSS SAQTFYFGLIKFFKRLWHYGFNAENSSSKIIKFCDDLTPGPTRKKAGDFINAPVAESRTNSLHLGFSERRKQLISLLATI KSSPAHFTRVVNYSDNTQTFFGEQPKQSIDYNTPAIPSNFESIM
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 152476; Mature: 152476
Theoretical pI: Translated: 7.77; Mature: 7.77
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQLISIIKGQIQQLPIPGLKHLLLSHLKEDAHDLTELFCQQIPAQKNQFSLNHSVPFGL CHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCC PASLSVLAIVLTYAPNLLHRELSEQLLTMLDSIKETKTSVDNQLAERCTKQLNYYSDAKP CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC VLIPLKERGAKDLIQILEQADERSLSAFSHLAKDTDLNVLIETFLVKNNKDLDLVNRNHL EEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH VQFLRQPDLAGWLTRFLDSLIYESINALSIRLLLSLVSSEKAIEKLKEARACLAQYPFSI HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DLHAMRAVFDFYQYELKRDLFSPESHLVMQLLHDLLKNTKLDKQQEFFQGLSQETVLLII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHH EYCIAEYNKTTEEEKQNCKNLLTRLCSAFSDSSQDFLGKIRTKFNQLDPYLFDTPQLYQL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH ASDLITKSCNSGKEPLSSSPIALLLSTPQFVGVCTPKVLKQLVERYSLYTLTLNQKDYKQ HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCHHHHH DLCFKEYAPYFDEINEHMAQIERNLLIHPEAQSFWLDKKYSLLQFRVEISKSALLHQMEC 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA