Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 54020019

Identifier: 54020019

GI number: 54020019

Start: 84177

End: 86786

Strand: Direct

Name: 54020019

Synonym: mhp069

Alternate gene names: NA

Gene position: 84177-86786 (Clockwise)

Preceding gene: 54020018

Following gene: 54020020

Centisome position: 9.43

GC content: 24.48

Gene sequence:

>2610_bases
ATGGTAAATGGCTCAATTACGGGAATTTCTTTTCCTGCTTTTTTTGTTAATTTTGCCCAAATTATTAAGTCTGATTCCGT
TAAGTCATTTAAAAATTTAGCCTTAAATGATTCAGGAATTTTGGACTGATTATATTTTTTGGAGCCAAAAAATAATTTTC
TTGATAAGGCAAGGTTGAATAATTTTAAAGCGCAAATTTACAATAAGTCCCGATTCACAGAGATAATTAGGTCAGTTTTT
GGGGATTTTAGTTCTAGTTTTCCAAAATTAATTGAAGAGATAAAAAAAGCAAATTTAATTAGTATTTCACTTGGATTTAA
AGATTTTTTAGATGCATTTAATTCTCAATTTTTTGATGATCTTAAGCTTTCAAGTTTAAAAGAAAATAGAAAAAACACTG
ATTTTGTGTTAAAAGTAGACAAAATTTTCACAAGAATTGAGGCAAATTTAGAAAGAATAATAACCATTATCAAAAAAATA
AATCCTAAAGCTCATATAAATTTAATAGAATACTATCAAATTCAGCCAAAAATCCAAAAATATTTACAGGATTTAGCCGA
AAATTATTTAATAGAAATTAATGATAATAATCTTTCGATTTATCGATTGAACAAACTAATCCAAAAAGTAGCCCAAAAAA
CAGGGGTTAATTATATAAATCCTTTTAGAGGCGTTAATTCTAAGGTTGGTGATGAATTTTATTTTGATAGTCATATGAAT
TTTCGCCCGCAAATTAAGGGAAGTAAGCAAATTGCGCAAAATTTAATTTTATCGTTAACCCTAGAAAAAAACCAAATAAA
TTCTCCATCTGAAGCAAAAGATCGCAGAATTCACCAAACTAATTTTTCTAGTGATTTAAATGAAAACCAACAAATTAATT
TAGCTCCAGATAAAGAAATTTTAGAAAAACTATCGCTTAATGGTTCATTGCTAAATTTTGTAAAAGCTGATTCAAATTTT
GAAAAGAAAAGCATTCAGGCATTGCATACTTTTAAAAAAGAGGAAAAAACTAATTTTTCTGCAAAGGATTTTCTAAGTAA
AATTACTCCACTTCTTGACTCACAGCAAAGTCCCTTTGTAAAATTAGTAAACGAAATAATTGATACTTTTGTCAATGAGG
CAAATCCTAATTTTGAAACATTTAATAATATTATTGACATTATTTTCAAAAGTAATTTTGTCACAAATCTTCTTCAGGTC
GCCCAAAGTTATTTATTTAATTCCTCACCTACAAACCAGACAAATTCTAAAACTGAACAAAAAAAACCCGATTTACTTAC
TTATTTAAAATCGACCGTTTTAACAGAAAAAGAAATTGTTAAGCTTTTAATTGAGGTTTTAGCAAGCCCCTATGTTCAAA
AACACCAAAATGAAACTATTAGTTTATTTTATAATCTATTTTTCCGGCAAAAAAAAATTATCAGACTAATTATTAGTTCA
TTTACCAATGATCCAGTTTATCAGGAAATTATCAGTCAAGTTTTAGATTTTAATACTCTTCAAAAATTTGTAATTTTTAT
TTTAACGGAATTAATTAAAAATAACAAGGATTATTCAACTGTTAGATCATTTAAAGATTTATTGTCGCTGTTTTTGCAGA
ATTCAAATAATTATAATAAATCAATCACTTTTATCCGAAATTTTGTAATTGAAGCATTCAAACAGACAGATTTTCTAAAA
AATGTTTTAAATTTATTATTAAATAAATGAAGTTTTAGTATAAATCACGACGATCAAGCTTCCTTAGTATCTCTAATTTC
AAGCATCAGCGATATATTGACAAGAACAAAAACTTTTAAAAATTTAATTAATTTAATATCAAGCGAAATTATATTAGGAC
TTAAACTAAATAGCGAAAAAAATAGCAGTAATTTAGGATCTTTTTTAGAAATTTTAACAAATTTGCCTCTTAAAATTCAA
AATTTTTTTAAGGAAAAAGATAATATTTTTAATTTATCACAAGATATTTTACATTTTAGTCCTTCTGTCAGACAGTTAGA
TGCAATAAAAGCTTTTATTGATAAAATTTTACCTTTTATTACCAAGATAAAAATCAAACTAACAGATTTTTTGGCCCTAG
ATTCAAATAATTTTACAGAAATAAATTTAGTTTTTGAAGCTTTTGTAAAATTTTTATCAGAAAATAATTTTCAGCAACTA
TCCAAATTAATCAAAGCTTTTCTTGAGAGTTTTTTTGTAATTGATAGTTTAAAATATCGGAATAGTTTGGATTTTAATGG
GATAATTTTTAATTTAATAAGTAATAATTCCGAGATAATAAAGCAAATTTTCTTGGATTTTGTAATTACCAATAAAAATA
ATACGCAAATTTTAGGTATAATTTCCTCAATATTTTTAAAAATGATTAATAATAACGCGGTAAAACACCTTCAAGGCCAG
GAAACAAACACATTTGATCGTATAAAAATTTATTATTTAATTGATACATTTTTACTAAAAATTAAGGAATTAACAAATCA
ATATAATATTAATATTGCAGAAATTAATTCAAAATTAGCAGATTCAAAAAATTCCTTAGAATTTCCCGAATTAATTAAAA
AACGTGAGAATTTAAAGACCTTTTTAAATATTAATAAGCTTAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATAAAAAAACCATTATTAAATGAGATTAATTATCTTGCCCTTGGTGATTTTTTAAGCACTGGATTTGATTGAAATAACA
ATCTTGATGGTCGGGGTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTGTTAACTTATTTTTTTCAAAAAGATAACAAAATTTAAATGCTGAAATTTGAATTATCTCTTAGAAAATAAACTTT
TTATTTGTTTTTTCTTCATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 869; Mature: 869

Protein sequence:

>869_residues
MVNGSITGISFPAFFVNFAQIIKSDSVKSFKNLALNDSGILDWLYFLEPKNNFLDKARLNNFKAQIYNKSRFTEIIRSVF
GDFSSSFPKLIEEIKKANLISISLGFKDFLDAFNSQFFDDLKLSSLKENRKNTDFVLKVDKIFTRIEANLERIITIIKKI
NPKAHINLIEYYQIQPKIQKYLQDLAENYLIEINDNNLSIYRLNKLIQKVAQKTGVNYINPFRGVNSKVGDEFYFDSHMN
FRPQIKGSKQIAQNLILSLTLEKNQINSPSEAKDRRIHQTNFSSDLNENQQINLAPDKEILEKLSLNGSLLNFVKADSNF
EKKSIQALHTFKKEEKTNFSAKDFLSKITPLLDSQQSPFVKLVNEIIDTFVNEANPNFETFNNIIDIIFKSNFVTNLLQV
AQSYLFNSSPTNQTNSKTEQKKPDLLTYLKSTVLTEKEIVKLLIEVLASPYVQKHQNETISLFYNLFFRQKKIIRLIISS
FTNDPVYQEIISQVLDFNTLQKFVIFILTELIKNNKDYSTVRSFKDLLSLFLQNSNNYNKSITFIRNFVIEAFKQTDFLK
NVLNLLLNKWSFSINHDDQASLVSLISSISDILTRTKTFKNLINLISSEIILGLKLNSEKNSSNLGSFLEILTNLPLKIQ
NFFKEKDNIFNLSQDILHFSPSVRQLDAIKAFIDKILPFITKIKIKLTDFLALDSNNFTEINLVFEAFVKFLSENNFQQL
SKLIKAFLESFFVIDSLKYRNSLDFNGIIFNLISNNSEIIKQIFLDFVITNKNNTQILGIISSIFLKMINNNAVKHLQGQ
ETNTFDRIKIYYLIDTFLLKIKELTNQYNINIAEINSKLADSKNSLEFPELIKKRENLKTFLNINKLKN

Sequences:

>Translated_869_residues
MVNGSITGISFPAFFVNFAQIIKSDSVKSFKNLALNDSGILD*LYFLEPKNNFLDKARLNNFKAQIYNKSRFTEIIRSVF
GDFSSSFPKLIEEIKKANLISISLGFKDFLDAFNSQFFDDLKLSSLKENRKNTDFVLKVDKIFTRIEANLERIITIIKKI
NPKAHINLIEYYQIQPKIQKYLQDLAENYLIEINDNNLSIYRLNKLIQKVAQKTGVNYINPFRGVNSKVGDEFYFDSHMN
FRPQIKGSKQIAQNLILSLTLEKNQINSPSEAKDRRIHQTNFSSDLNENQQINLAPDKEILEKLSLNGSLLNFVKADSNF
EKKSIQALHTFKKEEKTNFSAKDFLSKITPLLDSQQSPFVKLVNEIIDTFVNEANPNFETFNNIIDIIFKSNFVTNLLQV
AQSYLFNSSPTNQTNSKTEQKKPDLLTYLKSTVLTEKEIVKLLIEVLASPYVQKHQNETISLFYNLFFRQKKIIRLIISS
FTNDPVYQEIISQVLDFNTLQKFVIFILTELIKNNKDYSTVRSFKDLLSLFLQNSNNYNKSITFIRNFVIEAFKQTDFLK
NVLNLLLNK*SFSINHDDQASLVSLISSISDILTRTKTFKNLINLISSEIILGLKLNSEKNSSNLGSFLEILTNLPLKIQ
NFFKEKDNIFNLSQDILHFSPSVRQLDAIKAFIDKILPFITKIKIKLTDFLALDSNNFTEINLVFEAFVKFLSENNFQQL
SKLIKAFLESFFVIDSLKYRNSLDFNGIIFNLISNNSEIIKQIFLDFVITNKNNTQILGIISSIFLKMINNNAVKHLQGQ
ETNTFDRIKIYYLIDTFLLKIKELTNQYNINIAEINSKLADSKNSLEFPELIKKRENLKTFLNINKLKN
>Mature_869_residues
MVNGSITGISFPAFFVNFAQIIKSDSVKSFKNLALNDSGILD*LYFLEPKNNFLDKARLNNFKAQIYNKSRFTEIIRSVF
GDFSSSFPKLIEEIKKANLISISLGFKDFLDAFNSQFFDDLKLSSLKENRKNTDFVLKVDKIFTRIEANLERIITIIKKI
NPKAHINLIEYYQIQPKIQKYLQDLAENYLIEINDNNLSIYRLNKLIQKVAQKTGVNYINPFRGVNSKVGDEFYFDSHMN
FRPQIKGSKQIAQNLILSLTLEKNQINSPSEAKDRRIHQTNFSSDLNENQQINLAPDKEILEKLSLNGSLLNFVKADSNF
EKKSIQALHTFKKEEKTNFSAKDFLSKITPLLDSQQSPFVKLVNEIIDTFVNEANPNFETFNNIIDIIFKSNFVTNLLQV
AQSYLFNSSPTNQTNSKTEQKKPDLLTYLKSTVLTEKEIVKLLIEVLASPYVQKHQNETISLFYNLFFRQKKIIRLIISS
FTNDPVYQEIISQVLDFNTLQKFVIFILTELIKNNKDYSTVRSFKDLLSLFLQNSNNYNKSITFIRNFVIEAFKQTDFLK
NVLNLLLNK*SFSINHDDQASLVSLISSISDILTRTKTFKNLINLISSEIILGLKLNSEKNSSNLGSFLEILTNLPLKIQ
NFFKEKDNIFNLSQDILHFSPSVRQLDAIKAFIDKILPFITKIKIKLTDFLALDSNNFTEINLVFEAFVKFLSENNFQQL
SKLIKAFLESFFVIDSLKYRNSLDFNGIIFNLISNNSEIIKQIFLDFVITNKNNTQILGIISSIFLKMINNNAVKHLQGQ
ETNTFDRIKIYYLIDTFLLKIKELTNQYNINIAEINSKLADSKNSLEFPELIKKRENLKTFLNINKLKN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100213; Mature: 100213

Theoretical pI: Translated: 9.91; Mature: 9.91

Prosite motif: PS50014 BROMODOMAIN_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
0.3 %Met     (Translated Protein)
0.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
0.3 %Met     (Mature Protein)
0.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVNGSITGISFPAFFVNFAQIIKSDSVKSFKNLALNDSGILDLYFLEPKNNFLDKARLNN
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHCC
FKAQIYNKSRFTEIIRSVFGDFSSSFPKLIEEIKKANLISISLGFKDFLDAFNSQFFDDL
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH
KLSSLKENRKNTDFVLKVDKIFTRIEANLERIITIIKKINPKAHINLIEYYQIQPKIQKY
HHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHH
LQDLAENYLIEINDNNLSIYRLNKLIQKVAQKTGVNYINPFRGVNSKVGDEFYFDSHMNF
HHHHHHCCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCC
RPQIKGSKQIAQNLILSLTLEKNQINSPSEAKDRRIHQTNFSSDLNENQQINLAPDKEIL
CCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHH
EKLSLNGSLLNFVKADSNFEKKSIQALHTFKKEEKTNFSAKDFLSKITPLLDSQQSPFVK
HHHCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LVNEIIDTFVNEANPNFETFNNIIDIIFKSNFVTNLLQVAQSYLFNSSPTNQTNSKTEQK
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHC
KPDLLTYLKSTVLTEKEIVKLLIEVLASPYVQKHQNETISLFYNLFFRQKKIIRLIISSF
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
TNDPVYQEIISQVLDFNTLQKFVIFILTELIKNNKDYSTVRSFKDLLSLFLQNSNNYNKS
CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
ITFIRNFVIEAFKQTDFLKNVLNLLLNKSFSINHDDQASLVSLISSISDILTRTKTFKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INLISSEIILGLKLNSEKNSSNLGSFLEILTNLPLKIQNFFKEKDNIFNLSQDILHFSPS
HHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCC
VRQLDAIKAFIDKILPFITKIKIKLTDFLALDSNNFTEINLVFEAFVKFLSENNFQQLSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LIKAFLESFFVIDSLKYRNSLDFNGIIFNLISNNSEIIKQIFLDFVITNKNNTQILGIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHH
SIFLKMINNNAVKHLQGQETNTFDRIKIYYLIDTFLLKIKELTNQYNINIAEINSKLADS
HHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
KNSLEFPELIKKRENLKTFLNINKLKN
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MVNGSITGISFPAFFVNFAQIIKSDSVKSFKNLALNDSGILDLYFLEPKNNFLDKARLNN
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHCC
FKAQIYNKSRFTEIIRSVFGDFSSSFPKLIEEIKKANLISISLGFKDFLDAFNSQFFDDL
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH
KLSSLKENRKNTDFVLKVDKIFTRIEANLERIITIIKKINPKAHINLIEYYQIQPKIQKY
HHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHH
LQDLAENYLIEINDNNLSIYRLNKLIQKVAQKTGVNYINPFRGVNSKVGDEFYFDSHMNF
HHHHHHCCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCC
RPQIKGSKQIAQNLILSLTLEKNQINSPSEAKDRRIHQTNFSSDLNENQQINLAPDKEIL
CCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHH
EKLSLNGSLLNFVKADSNFEKKSIQALHTFKKEEKTNFSAKDFLSKITPLLDSQQSPFVK
HHHCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LVNEIIDTFVNEANPNFETFNNIIDIIFKSNFVTNLLQVAQSYLFNSSPTNQTNSKTEQK
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHC
KPDLLTYLKSTVLTEKEIVKLLIEVLASPYVQKHQNETISLFYNLFFRQKKIIRLIISSF
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
TNDPVYQEIISQVLDFNTLQKFVIFILTELIKNNKDYSTVRSFKDLLSLFLQNSNNYNKS
CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
ITFIRNFVIEAFKQTDFLKNVLNLLLNKSFSINHDDQASLVSLISSISDILTRTKTFKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INLISSEIILGLKLNSEKNSSNLGSFLEILTNLPLKIQNFFKEKDNIFNLSQDILHFSPS
HHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCC
VRQLDAIKAFIDKILPFITKIKIKLTDFLALDSNNFTEINLVFEAFVKFLSENNFQQLSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LIKAFLESFFVIDSLKYRNSLDFNGIIFNLISNNSEIIKQIFLDFVITNKNNTQILGIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHH
SIFLKMINNNAVKHLQGQETNTFDRIKIYYLIDTFLLKIKELTNQYNINIAEINSKLADS
HHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
KNSLEFPELIKKRENLKTFLNINKLKN
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA