| Definition | Bacillus licheniformis ATCC 14580, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006322 |
| Length | 4,222,645 |
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The map label for this gene is yqbO [H]
Identifier: 52785323
GI number: 52785323
Start: 1524888
End: 1530188
Strand: Direct
Name: yqbO [H]
Synonym: BLi01559
Alternate gene names: 52785323
Gene position: 1524888-1530188 (Clockwise)
Preceding gene: 52785322
Following gene: 52785324
Centisome position: 36.11
GC content: 46.73
Gene sequence:
>5301_bases TTGGCGACTGAATCAGTCGGATCTATACGCGTTAGTTTAGGTCTAGACAACATTGACTTCTCTCGCGGCCTCCAGGACGT TAACAGAAAATTAAAGGTACTAAACTCGGAATTCAAAGCAGCAATGGCTGGCGCTGGCCGATTCGATAACAGCCTGGATT CATTGCGTAATAAGACCGACATATTAAATCGGACTTTACAAACGCAAAAGGCAAAACTTAACGAGTTGAAGCGGCAATAT GAAGAGAGCGTAAGGACGACGGGAAGGTATTCGGCACAATCCGAAAAGCTCCTCGCCCAGTATAATCGAACTGTTGCAGC GGTTCGGAAAACTGAGGATCAGTTAGACCTTCTTAACCGTAAAATGAGAGAGCAGAGCAACGGCTTCAGTCAATTAGGCG CTAAAATTAGCGCAAGCATTAAGACGATCGATACGAAGTTGCGCGTATTGGATTCGTCATTTGAGGCCGCATCAGCCGGC GTAAGGGATTTCGGTTCTACTACCGAGCAACTACGACAAAAATCGGAACATCTTACGCAATCGATCTCGTTACAAGAGCA GCGACTTAAAAACATCCGCCGACTGTATCTCGAAGCTAAACGCGCAAAAGGCGAAGATGCTCAGGCGACTCAAGAATTAC GCGTTCAAATGAATCAAGCGACGGCACAACTTCGAACAACTCAAGCCGAACTGGCCGCAACGAACCGACAGATCCAATCG AACACGGGCCGTTGGAACGAGCTCGGCAACCGGATGGGTGAAGTCGGGGACCGGATGCGGGACGTTGGGGGTCGAATGCA ATCTGCGGGATCTGAAATCGCGATGTCATTCGGCGTAGCGACAGCGGCTTTAGGCGGAGGTCTTGCGGTTTCAACGAAAA AAGCGATGGACTTCGAGCAGCAGATGTCGAGCGTGAAGGCGGTCATGAATCCGGCAGAAGCCAACCAATACAGCGCTGCC 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TTGTTCAAATCAATCGGGAAATTTGCGGCCGACACGTTCCACAACATGATCGAGGGAGCAAAGGCGCTACCAGGTGAAAT TGGTGACGGAATAAAAAATATGGCCGGCAGAGCTCTATCCGGAGTTAAATCTCTAGGAAATACGATGATCGGCGGACTTG AAGGAATTATCAATGGCTTGACGCAAAAAGGGATTAACAAGCTACTCGATACATTCGGGGTGGATAAAAAACTCCGGATC CCTAAACTCGAAATTCCGAGGTTCGCTAAAGGTACGCCAGCAGGTGGGCACAAAGGCGGTCTTGCTATCTTAGGAGATGG AGGCGGTCCGGAGTTATTCCGTACACCTTCCGGTTTCACAGGTTTAAGCCCTGGAACCGACACGCTCTTTAATCTGCCAA AGGGGACGCAAGTCTTGCCGCATAAAGAAACACGCGAGGTACTATCTTCTGGAATCCCCGCATTCAGGAAAGGTACGAAG AACAAAAGTTTCTTCGATTCTGCTATCGATGTTGGAAAATCCGCTGTTGATGCGGGTAAAGCTGCCGTAAACAGTGTTAA GGATTTCGCTTTTGATGCGTGGGAATACGTAAGCAATCCGTCAAAACTTATCGCTAAAACGATAGAAAGTCTCGGACTGA AGTTGCCGGATATTTCCGGAGCTTTCGGGACAATTGCGAAAGGTGCCTTCGGTAAAGTCAAAGATTCCGCCGTCAGCTTT ATGAAAAAGAAACTCGCTGACTTTGGTGGAGCTTTCGGAAGTGGCGATAAAGCGTCCGGAAACGTTAAGCAATGGATTCG GGCGGCGATGGCTAAAACGAATTCGCCAGCTTCTTGGTTCGCTCCACTCGTTACAATTGCGATGAAAGAGTCCGGAGGCC GTACGGGTCCGTCTACAATTAATCGTTGGGACTCGAACTGGAGACGTGGTACACCGTCAATGGGACTTATGCAAACGATC 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Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTAGTGATGGTGGTAGCTCTCACGGAAGCGGAAAAACACAACAAAAACTCGGCTATATCGATCAGATACCGGGTTTTT AGAAGGGAGGTATCGGAGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGGCGTATCTTACGATTATAAAAAACGGTGAAACCATTGATCACCGTAAATACGGCTTAAAGCTTTTGAGTTTTCGCAA GGAATCGCTAACACACCGAA
Product: YqbO
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1766; Mature: 1765
Protein sequence:
>1766_residues MATESVGSIRVSLGLDNIDFSRGLQDVNRKLKVLNSEFKAAMAGAGRFDNSLDSLRNKTDILNRTLQTQKAKLNELKRQY EESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNRKMREQSNGFSQLGAKISASIKTIDTKLRVLDSSFEAASAG VRDFGSTTEQLRQKSEHLTQSISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQS NTGRWNELGNRMGEVGDRMRDVGGRMQSAGSEIAMSFGVATAALGGGLAVSTKKAMDFEQQMSSVKAVMNPAEANQYSAA LTELAIKLGADTKYSALEAAQGMEELVKAGVSTKDILNGALKGALSLATAGELELADAAEIASTALNAFKDDNISVAQAA DILAGAANSSATTVGEMRYGLQMTSAVAAGMGLSFKDTATTLALFAQNGLKGSDAGTSMKTMLSRLVPMTKAQYETMHDL GLVTLDTSEAFKRMADKGFKPASKNIGDIYEALNKYVEKTTGAKQGTEKFEKAFDKATRSLGIMDNKFFDANGNIRSMTE ISGELSKALDGLSAKDKQEALYNIFGSDAIRGALILGKEGSKGFDKMAAAMDKIKADNVAAEKMNNLKGKIEELSGAVET AQISFGNALTPAISALVSVLQSATDWFNGLSKGMQSFVAISLAVTTVIMGIVAALGFLMLGVGQMISGLGTVSGLLKGLI KSEKFIKVIGVAFGALTSPIGLTVLGITAVGAALVIAYKKSEKFRNFVNGAFESVRNVTVTAFSSISAVVGDTFNFIQKA SVAGWERFSDGVSVIVPAVRKRFANVVNSIGEFVSNIGSSIADRFGSGLADRTGSAVDLFIQNLRAAFSSVGGIISILAP TVTALGLAMAGVSGSIGFVITSLVSLAGFLFRLYQTNEEFRASVQNAWSQIMSVIGNVVVAIQPIINQFIGYFSDIAAEL APEFAKTGEVIMSSISSLGPTFTELGNAFGELWTTLGQSFSEIAVQIAPVIQELGVTFAAFLPQVVTLVGQLIQTWASFQ VQFAQLIMQVASVLLPMLAQAFTSLLPLILQIVSSVLPIVLQLIQSLVPVVTTIATTLLPILLQAFQSIFPPVLAIIQSV VPIVANLLTSVAQILSQLAVTLLPLILQVVQAVFPVVTSIIQIAMQVAVTVLQLVATIIRTVLIPAIQFVLKIVQVVFPV VVSVIQNALNIVINVVKFFTALLKGNWSAVWNAILGILKSIWNIITAVIRGAVNVVLTLFSGLVNGAVSAWNFLKDRTVG LFKSIGKFAADTFHNMIEGAKALPGEIGDGIKNMAGRALSGVKSLGNTMIGGLEGIINGLTQKGINKLLDTFGVDKKLRI PKLEIPRFAKGTPAGGHKGGLAILGDGGGPELFRTPSGFTGLSPGTDTLFNLPKGTQVLPHKETREVLSSGIPAFRKGTK NKSFFDSAIDVGKSAVDAGKAAVNSVKDFAFDAWEYVSNPSKLIAKTIESLGLKLPDISGAFGTIAKGAFGKVKDSAVSF MKKKLADFGGAFGSGDKASGNVKQWIRAAMAKTNSPASWFAPLVTIAMKESGGRTGPSTINRWDSNWRRGTPSMGLMQTI KPTFDAYKLPGMGDIMNPVHNAVAAIRYIKSRYGSPFNTPGIRSMEKGGPYKGYKIGDIVTQKQLAWIAEEGPEAIIPLQ NHRQRAQQLWTAAGREIGMDPSGGSNEEELALLRGQNALLRQTNTLLTGILRKDPSVVVDTAALTDSVEKGQAQNIGFNK LLWGDR
Sequences:
>Translated_1766_residues MATESVGSIRVSLGLDNIDFSRGLQDVNRKLKVLNSEFKAAMAGAGRFDNSLDSLRNKTDILNRTLQTQKAKLNELKRQY EESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNRKMREQSNGFSQLGAKISASIKTIDTKLRVLDSSFEAASAG VRDFGSTTEQLRQKSEHLTQSISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQS NTGRWNELGNRMGEVGDRMRDVGGRMQSAGSEIAMSFGVATAALGGGLAVSTKKAMDFEQQMSSVKAVMNPAEANQYSAA LTELAIKLGADTKYSALEAAQGMEELVKAGVSTKDILNGALKGALSLATAGELELADAAEIASTALNAFKDDNISVAQAA DILAGAANSSATTVGEMRYGLQMTSAVAAGMGLSFKDTATTLALFAQNGLKGSDAGTSMKTMLSRLVPMTKAQYETMHDL GLVTLDTSEAFKRMADKGFKPASKNIGDIYEALNKYVEKTTGAKQGTEKFEKAFDKATRSLGIMDNKFFDANGNIRSMTE ISGELSKALDGLSAKDKQEALYNIFGSDAIRGALILGKEGSKGFDKMAAAMDKIKADNVAAEKMNNLKGKIEELSGAVET AQISFGNALTPAISALVSVLQSATDWFNGLSKGMQSFVAISLAVTTVIMGIVAALGFLMLGVGQMISGLGTVSGLLKGLI KSEKFIKVIGVAFGALTSPIGLTVLGITAVGAALVIAYKKSEKFRNFVNGAFESVRNVTVTAFSSISAVVGDTFNFIQKA SVAGWERFSDGVSVIVPAVRKRFANVVNSIGEFVSNIGSSIADRFGSGLADRTGSAVDLFIQNLRAAFSSVGGIISILAP TVTALGLAMAGVSGSIGFVITSLVSLAGFLFRLYQTNEEFRASVQNAWSQIMSVIGNVVVAIQPIINQFIGYFSDIAAEL APEFAKTGEVIMSSISSLGPTFTELGNAFGELWTTLGQSFSEIAVQIAPVIQELGVTFAAFLPQVVTLVGQLIQTWASFQ VQFAQLIMQVASVLLPMLAQAFTSLLPLILQIVSSVLPIVLQLIQSLVPVVTTIATTLLPILLQAFQSIFPPVLAIIQSV VPIVANLLTSVAQILSQLAVTLLPLILQVVQAVFPVVTSIIQIAMQVAVTVLQLVATIIRTVLIPAIQFVLKIVQVVFPV VVSVIQNALNIVINVVKFFTALLKGNWSAVWNAILGILKSIWNIITAVIRGAVNVVLTLFSGLVNGAVSAWNFLKDRTVG LFKSIGKFAADTFHNMIEGAKALPGEIGDGIKNMAGRALSGVKSLGNTMIGGLEGIINGLTQKGINKLLDTFGVDKKLRI PKLEIPRFAKGTPAGGHKGGLAILGDGGGPELFRTPSGFTGLSPGTDTLFNLPKGTQVLPHKETREVLSSGIPAFRKGTK NKSFFDSAIDVGKSAVDAGKAAVNSVKDFAFDAWEYVSNPSKLIAKTIESLGLKLPDISGAFGTIAKGAFGKVKDSAVSF MKKKLADFGGAFGSGDKASGNVKQWIRAAMAKTNSPASWFAPLVTIAMKESGGRTGPSTINRWDSNWRRGTPSMGLMQTI KPTFDAYKLPGMGDIMNPVHNAVAAIRYIKSRYGSPFNTPGIRSMEKGGPYKGYKIGDIVTQKQLAWIAEEGPEAIIPLQ NHRQRAQQLWTAAGREIGMDPSGGSNEEELALLRGQNALLRQTNTLLTGILRKDPSVVVDTAALTDSVEKGQAQNIGFNK LLWGDR >Mature_1765_residues ATESVGSIRVSLGLDNIDFSRGLQDVNRKLKVLNSEFKAAMAGAGRFDNSLDSLRNKTDILNRTLQTQKAKLNELKRQYE ESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNRKMREQSNGFSQLGAKISASIKTIDTKLRVLDSSFEAASAGV RDFGSTTEQLRQKSEHLTQSISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQSN TGRWNELGNRMGEVGDRMRDVGGRMQSAGSEIAMSFGVATAALGGGLAVSTKKAMDFEQQMSSVKAVMNPAEANQYSAAL TELAIKLGADTKYSALEAAQGMEELVKAGVSTKDILNGALKGALSLATAGELELADAAEIASTALNAFKDDNISVAQAAD ILAGAANSSATTVGEMRYGLQMTSAVAAGMGLSFKDTATTLALFAQNGLKGSDAGTSMKTMLSRLVPMTKAQYETMHDLG LVTLDTSEAFKRMADKGFKPASKNIGDIYEALNKYVEKTTGAKQGTEKFEKAFDKATRSLGIMDNKFFDANGNIRSMTEI SGELSKALDGLSAKDKQEALYNIFGSDAIRGALILGKEGSKGFDKMAAAMDKIKADNVAAEKMNNLKGKIEELSGAVETA QISFGNALTPAISALVSVLQSATDWFNGLSKGMQSFVAISLAVTTVIMGIVAALGFLMLGVGQMISGLGTVSGLLKGLIK SEKFIKVIGVAFGALTSPIGLTVLGITAVGAALVIAYKKSEKFRNFVNGAFESVRNVTVTAFSSISAVVGDTFNFIQKAS VAGWERFSDGVSVIVPAVRKRFANVVNSIGEFVSNIGSSIADRFGSGLADRTGSAVDLFIQNLRAAFSSVGGIISILAPT VTALGLAMAGVSGSIGFVITSLVSLAGFLFRLYQTNEEFRASVQNAWSQIMSVIGNVVVAIQPIINQFIGYFSDIAAELA PEFAKTGEVIMSSISSLGPTFTELGNAFGELWTTLGQSFSEIAVQIAPVIQELGVTFAAFLPQVVTLVGQLIQTWASFQV QFAQLIMQVASVLLPMLAQAFTSLLPLILQIVSSVLPIVLQLIQSLVPVVTTIATTLLPILLQAFQSIFPPVLAIIQSVV PIVANLLTSVAQILSQLAVTLLPLILQVVQAVFPVVTSIIQIAMQVAVTVLQLVATIIRTVLIPAIQFVLKIVQVVFPVV VSVIQNALNIVINVVKFFTALLKGNWSAVWNAILGILKSIWNIITAVIRGAVNVVLTLFSGLVNGAVSAWNFLKDRTVGL FKSIGKFAADTFHNMIEGAKALPGEIGDGIKNMAGRALSGVKSLGNTMIGGLEGIINGLTQKGINKLLDTFGVDKKLRIP KLEIPRFAKGTPAGGHKGGLAILGDGGGPELFRTPSGFTGLSPGTDTLFNLPKGTQVLPHKETREVLSSGIPAFRKGTKN KSFFDSAIDVGKSAVDAGKAAVNSVKDFAFDAWEYVSNPSKLIAKTIESLGLKLPDISGAFGTIAKGAFGKVKDSAVSFM KKKLADFGGAFGSGDKASGNVKQWIRAAMAKTNSPASWFAPLVTIAMKESGGRTGPSTINRWDSNWRRGTPSMGLMQTIK PTFDAYKLPGMGDIMNPVHNAVAAIRYIKSRYGSPFNTPGIRSMEKGGPYKGYKIGDIVTQKQLAWIAEEGPEAIIPLQN HRQRAQQLWTAAGREIGMDPSGGSNEEELALLRGQNALLRQTNTLLTGILRKDPSVVVDTAALTDSVEKGQAQNIGFNKL LWGDR
Specific function: Unknown
COG id: COG3953
COG function: function code R; SLT domain proteins
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To B.subtilis xkdO [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR008258 - InterPro: IPR010090 [H]
Pfam domain/function: PF10145 PhageMin_Tail; PF01464 SLT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 187971; Mature: 187839
Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20
Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MATESVGSIRVSLGLDNIDFSRGLQDVNRKLKVLNSEFKAAMAGAGRFDNSLDSLRNKTD CCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH ILNRTLQTQKAKLNELKRQYEESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KMREQSNGFSQLGAKISASIKTIDTKLRVLDSSFEAASAGVRDFGSTTEQLRQKSEHLTQ HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH SISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NTGRWNELGNRMGEVGDRMRDVGGRMQSAGSEIAMSFGVATAALGGGLAVSTKKAMDFEQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHH QMSSVKAVMNPAEANQYSAALTELAIKLGADTKYSALEAAQGMEELVKAGVSTKDILNGA HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LKGALSLATAGELELADAAEIASTALNAFKDDNISVAQAADILAGAANSSATTVGEMRYG HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LQMTSAVAAGMGLSFKDTATTLALFAQNGLKGSDAGTSMKTMLSRLVPMTKAQYETMHDL 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