| Definition | Bacillus licheniformis ATCC 14580, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006322 |
| Length | 4,222,645 |
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The map label for this gene is 52784062
Identifier: 52784062
GI number: 52784062
Start: 213825
End: 215015
Strand: Direct
Name: 52784062
Synonym: BLi00236
Alternate gene names: NA
Gene position: 213825-215015 (Clockwise)
Preceding gene: 52784061
Following gene: 52784063
Centisome position: 5.06
GC content: 28.88
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CATAATTCTTTAAATACTCAAGAAAAAAATCAGTTAAAAATTGCTATAGATAACTTTAAAAAATTAGGTCTGTTGGACAT ATGGAAGAGAGAAAGTATTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCTTGTCCAATTGTATTGGTGTTGGGTTGAGTTTTCGTCAAAATTTTTTTAAGGATTTAGATGTAATTAAGCAGGATGT TGATTTTTTAGAGATTATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 396; Mature: 396
Protein sequence:
>396_residues MKSLNNIKNKIVIVGTVDSLGAAIVWTGLPLYAYSITGSFLYTSSLFFTSAIARILATFFGGYLADVSSSKRIMLRCLSI NWFFYSLLFLGLSLGLTWIIFPIMLISQCFSTISIMNQNLWFNSLCSKETLASEISGRNSWFLISKTVGFSLGPLMYHWL NAYSLIINLLTILIAITLILTIKDLGYVNNKKKKESIFSSFKEVYKNQLLKRLNIIEILNGLTFPVLTSLSIYILEKNLN ASSLIISLFWLIGGVGAITANLMLSRLKLFKLQYIHQFIISFVLVVGGLLLMTIASYSFVYLIGFSLFTLGTPIINNLLR SKVFIFAPSHMKGKVTSVITSSSDLGTIIALSLSWIVVEKFGVLIFMSFVILTSVSRICLFFYTLHKVENKVDVEG
Sequences:
>Translated_396_residues MKSLNNIKNKIVIVGTVDSLGAAIVWTGLPLYAYSITGSFLYTSSLFFTSAIARILATFFGGYLADVSSSKRIMLRCLSI NWFFYSLLFLGLSLGLTWIIFPIMLISQCFSTISIMNQNLWFNSLCSKETLASEISGRNSWFLISKTVGFSLGPLMYHWL NAYSLIINLLTILIAITLILTIKDLGYVNNKKKKESIFSSFKEVYKNQLLKRLNIIEILNGLTFPVLTSLSIYILEKNLN ASSLIISLFWLIGGVGAITANLMLSRLKLFKLQYIHQFIISFVLVVGGLLLMTIASYSFVYLIGFSLFTLGTPIINNLLR SKVFIFAPSHMKGKVTSVITSSSDLGTIIALSLSWIVVEKFGVLIFMSFVILTSVSRICLFFYTLHKVENKVDVEG >Mature_396_residues MKSLNNIKNKIVIVGTVDSLGAAIVWTGLPLYAYSITGSFLYTSSLFFTSAIARILATFFGGYLADVSSSKRIMLRCLSI NWFFYSLLFLGLSLGLTWIIFPIMLISQCFSTISIMNQNLWFNSLCSKETLASEISGRNSWFLISKTVGFSLGPLMYHWL NAYSLIINLLTILIAITLILTIKDLGYVNNKKKKESIFSSFKEVYKNQLLKRLNIIEILNGLTFPVLTSLSIYILEKNLN ASSLIISLFWLIGGVGAITANLMLSRLKLFKLQYIHQFIISFVLVVGGLLLMTIASYSFVYLIGFSLFTLGTPIINNLLR SKVFIFAPSHMKGKVTSVITSSSDLGTIIALSLSWIVVEKFGVLIFMSFVILTSVSRICLFFYTLHKVENKVDVEG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44283; Mature: 44283
Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSLNNIKNKIVIVGTVDSLGAAIVWTGLPLYAYSITGSFLYTSSLFFTSAIARILATFF CCCCHHHCCCEEEEECHHHHCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGYLADVSSSKRIMLRCLSINWFFYSLLFLGLSLGLTWIIFPIMLISQCFSTISIMNQNL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC WFNSLCSKETLASEISGRNSWFLISKTVGFSLGPLMYHWLNAYSLIINLLTILIAITLIL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIKDLGYVNNKKKKESIFSSFKEVYKNQLLKRLNIIEILNGLTFPVLTSLSIYILEKNLN HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEEEEECCCC ASSLIISLFWLIGGVGAITANLMLSRLKLFKLQYIHQFIISFVLVVGGLLLMTIASYSFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIGFSLFTLGTPIINNLLRSKVFIFAPSHMKGKVTSVITSSSDLGTIIALSLSWIVVEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FGVLIFMSFVILTSVSRICLFFYTLHKVENKVDVEG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKSLNNIKNKIVIVGTVDSLGAAIVWTGLPLYAYSITGSFLYTSSLFFTSAIARILATFF CCCCHHHCCCEEEEECHHHHCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGYLADVSSSKRIMLRCLSINWFFYSLLFLGLSLGLTWIIFPIMLISQCFSTISIMNQNL HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC WFNSLCSKETLASEISGRNSWFLISKTVGFSLGPLMYHWLNAYSLIINLLTILIAITLIL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIKDLGYVNNKKKKESIFSSFKEVYKNQLLKRLNIIEILNGLTFPVLTSLSIYILEKNLN HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEEEEECCCC ASSLIISLFWLIGGVGAITANLMLSRLKLFKLQYIHQFIISFVLVVGGLLLMTIASYSFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIGFSLFTLGTPIINNLLRSKVFIFAPSHMKGKVTSVITSSSDLGTIIALSLSWIVVEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FGVLIFMSFVILTSVSRICLFFYTLHKVENKVDVEG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA