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The map label for this gene is yvqJ [H]

Identifier: 52142295

GI number: 52142295

Start: 3080343

End: 3081602

Strand: Direct

Name: yvqJ [H]

Synonym: BCZK2947

Alternate gene names: 52142295

Gene position: 3080343-3081602 (Clockwise)

Preceding gene: 52142296

Following gene: 52142291

Centisome position: 58.11

GC content: 39.6

Gene sequence:

>1260_bases
ATGGACATATTGAAAAACCGGGATTTCCTCTTATTATTTTTAGGGAGAATCTTTACAAACATAGGAGATAGCTTGTACTA
TGTAGCCGCGATGTGGCTCGTATATAAGCTAAGTGGTAATCCTTTTTATTCTGGATTGGCTGGTTTCCTTACGTTACTAC
CTTCTGCATTACAATTTCTTACCGGTCCATTCGTTGATAGATGGCCAATAAAAAACACCCTCGTCATCACACAAGTGCTG
CAATGCATTCTAATATTAATCATTCCTATTACACACTACTTCGACCTATTAACAGTCCAACTACTACTCATCATCATGCC
CATCGTAGCCTTTATCGAACAATTCGCCTATCCTGCACAGTCAAAAGCTTTACCACTTCTACTGCATAAAACACAATTAT
TAAAAGGAAACTCTCTCTTCTCATTTGCGTATCAAGGCATTGATTTAATTTGTACGACGCTTTCTGGAATATTAGTAGCA
CTATTTGGCGCGATCACTTTATATGTAATTGACTCTTTCACATTCGCGATTACTGCCCTTTTGTTCTTTTCATTAAAAAT
GCCAAAGCAAACCGAAACAGGTACAACACTTTCAACTAAACAATATTTCTCTGATTTAAAAGAAGGTTTTTCAATCGTCT
TCCGTTCCTTAATGGGCGTATTCTTAATCGGTTCCGTTGTCGCTAATTTTTCAATTGGTATGACGATGGCCATACTCCCT
TCTTTCGCTGATTCTTTAGGTGGTGTGAAATCATACGGCTTCTTCTTAGCTGCTATATCAGCAGGTAGTCTCATCGGTGC
ATTATTCAGTTCATGGGTAGGCAAACGTAACGTTGGCCGCATCTCCATTATTAGCTTTGCGACTGGCGCTACCTTTTGGT
TTCTCTCTACGGTTGTACCGTTTCAATGGTTATCTATTTTCTTATTCGGCCTAGCTTGGGTACCGATTGGTGCAACCAAC
ATATTATTTGCGACAATTAGTCAAATTTTAATTCCAAATCAATATATTGGCCGCATCAACTCAGTTATGCGAAGTATGGG
CACAATTGCTATGCCGTTCGGTTCTTTAATTGGCGGATACGCTGCAAATGTATTTAGTAGCCAACTTATTTTTGCGCTCG
CTAGCATCGGGATTTTATTTATTTCTCTCGTATGGCTACTCCATCCGAAATTACGAGCATTGCCGAAAGCTGATGAAATT
ACAGCGGATACTTTTGGGGTGCAGTTTAAGGAAGAGCGTGGGAAAGGTGCGGCTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAATTTGTTAAAGAAGAAGAAAAATCGTAATACGATTTTTTTTACATAAACGGTCAAATTTATTTTACCGAATAAATTT
ATTATAAAGGAGTAGATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGAGTTAGGGTACGTGAAATTTATATCGGCGATTTTTCAAATATATCAGCGCAACTCGAATTATATCGGCGATTTTCA
CAATATATCGGCGCAACTCA

Product: macrolide-efflux protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 419

Protein sequence:

>419_residues
MDILKNRDFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPKQTETGTTLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMGVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRISIISFATGATFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNQYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANVFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVQFKEERGKGAAL

Sequences:

>Translated_419_residues
MDILKNRDFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPKQTETGTTLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMGVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRISIISFATGATFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNQYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANVFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVQFKEERGKGAAL
>Mature_419_residues
MDILKNRDFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPKQTETGTTLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMGVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRISIISFATGATFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNQYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANVFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVQFKEERGKGAAL

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45927; Mature: 45927

Theoretical pI: Translated: 9.87; Mature: 9.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHCCEEHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHCCEEHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9639930; 9384377 [H]