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Definition Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence.
Accession NC_006156
Length 904,246

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The map label for this gene is 51598333

Identifier: 51598333

GI number: 51598333

Start: 67081

End: 69399

Strand: Direct

Name: 51598333

Synonym: BG0071

Alternate gene names: NA

Gene position: 67081-69399 (Clockwise)

Preceding gene: 51598332

Following gene: 51598334

Centisome position: 7.42

GC content: 23.93

Gene sequence:

>2319_bases
ATGCTAGACTTAGAAAAAGTAAAAACAATTTTTAAAAAATATAATAAATACGAGGTAAACATTGACGAGATTCAAATACC
TGAATATGCCCTCATACCCCTTGAAACAGAAAATTCAAAATCTATAATATACATAATTGAAAAACAAAAAATAGAAGAAA
ATCAAATTTTATCTAAAAATTCAAACATAGAACTATATACATACTCCCCAATATCTGGAATAGTGGAAAAAATATACACA
GCAAACTTTCCAGATGGTAAAAAATTAAAATCAGCATTAATCAAATTTCAAGGAAAAATAAAAACCGAAAAAACCCCAAT
TGAAGATGAAATATCAAGAGAAAAGACCCTAGCAAAATTAATTCAACTAGGAATTCCTTGGTTTAATGAAAATTCTTTAT
TTCAGTTCATAAACAAATGTAAAAAAATAGACAAAATGATTTTATTAACAAATGGAAAAGATGTGTTTACAAATATTTCA
GAAGCACTGATGGCAGAAAAATTAGAAGATATTCTTTCAGGATTCCAAATAATCGACAAAATATTTAAATTCAAAGAAAT
CACAATAATATCAAATAAAGACAAACTGAAAAAAGCATTCGAAAAATTAAATATTTTTAAAAACAAAAAAATAAAAATTA
AATCTTTAGAAAATGCATATCCTTATACAAATCACGAAATGATAATGCACTTTTTATACAATAATAAAAATGCAAAAGAT
GACATAAACCCTCTCAACAATATTTTATTAGTAAATATTGAAGATCTATATAATACAAATATTGTTATAAACAATAACAA
TCCTTATAAAGAAAAATTTGTAGCTATAAATGGAAATAAAAAAATAAAAAGTAGAATACTAAAAGTAAAAATTGGAACTT
CTTTCAGCCAAGTAATAAACGAAAAAATTGATACAAAAAAATATGAAATTTTTTTAAACAATCCGGTCAATAAAATAAAA
ATTGAAACATTAAACATACCAATAACAAGGGATATTTATAGCATCACCATATTAAAGAAAAAGTCAATATATGACAAAAT
TAGAGCATTGTTTATATCTAGCTTTTCGCCATTACAAATGGAAGATATTATTTTCTCATACTTAAAGAATGAAAAAATAA
ATGATAACAGCAAATTAAAAATATTTAAATATACAGACAAAGAAGTAGAAGAAGAAATACATAAAGTTCAAAAAGAAATT
AAAGGTAAAATTCTAAATGAAAGCCTAATAAATGAGGTAATATACACTGAAAACAATTTAAAAGATATATACTTTGCTAT
CATACTATCATTATTGCCTAGTTTAATGTTTTCTTTCTTAAATAATACAAAATTCATGACAGACACTTTACTGCTAATAT
TTATTAGTGTAGCAATCTATGTACCAATAATGCTAAAAATTAATTACAAATGTTTGTCTTTTTTTGTTTACAATGCCTTA
ATTATAAGCATTATATTGCCTTTAAATTTAGCAATTACACTAAAAATAGCCTCCTTATTGTTTACTTTTTTAGTATTCTT
TTACTTTTTCAGGCTATCAGCATTTTTAGCAAATCCTATATTAATTTCTTTTATGTTTTTTGTATTAAATTTTCCAGTAA
GTTTTAAGCAAACCTATCAAGAAGAGCTTAAAAACTCAACCCCAATAATTCCAACCTGGAATGAAATAATTAGCACAAAT
CCAAACATAAAAAATTTTAAAAGTTTAAATACCTTGACAAGATATGAAAATAAAAACATCGATGCAATTGAAAACTTTGT
AAATAAAAACATTTTTTCCGTTTTTAATATAATTGTCACAAGATTTCATATTGAAAGTCTTTTAGGAGTTAATAATGAAA
AAACAATATCTCCAATCTTGCTTTATTTTGGACTCTTATTGATAGTTGGTAAATATATAATTAACAAATTAATACCATTG
TCATTTTATATAAGTTTAATGACAATCTCATACATAACACATAATATAGGAATGCTAAGCCACATCAGCTCAGATATGTT
AACATTGCTTATTTCCCCAATACCAATGCTCTTAATATTTACAATGGCAACAGAAGTGCAAATAACACCTCACTTCAAAT
TTGAGCAAATCCTTTACGGGTCGATATTGGCATTTATATACTTTTTAATATTAAGCTATATTCCTTTTGAAACTTTATCG
GTCATAATATCTATCTTTATCTTACAAGCAAGCTCAAACTTAATAAAAAAATATAGCTTAACCTTTAAAATTAAAAAAAT
AATGCATTTTTTAAAAAAAAATAAAGGAAAAGCACTCAAACCCCTTCAAGAGGATGAAAAGGATATAATAAAATTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTTGTATTACTATTCCTATTTAAAGCAATAAGATTTACAATTCTTTTAAATATAAATGAAAAAACCTATAAAAAATA
TATTCAAGGATAGATAGCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAATAATTTGATTACATGCTTAATTATTAACAACTTAACTTTAATACACTTTGTTGGATTTGAAGACATAAAAATAAAA
AATAATGAAATCTTAATAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 772; Mature: 772

Protein sequence:

>772_residues
MLDLEKVKTIFKKYNKYEVNIDEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT
ANFPDGKKLKSALIKFQGKIKTEKTPIEDEISREKTLAKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDVFTNIS
EALMAEKLEDILSGFQIIDKIFKFKEITIISNKDKLKKAFEKLNIFKNKKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNAKD
DINPLNNILLVNIEDLYNTNIVINNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQVINEKIDTKKYEIFLNNPVNKIK
IETLNIPITRDIYSITILKKKSIYDKIRALFISSFSPLQMEDIIFSYLKNEKINDNSKLKIFKYTDKEVEEEIHKVQKEI
KGKILNESLINEVIYTENNLKDIYFAIILSLLPSLMFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYVPIMLKINYKCLSFFVYNAL
IISIILPLNLAITLKIASLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFFVLNFPVSFKQTYQEELKNSTPIIPTWNEIISTN
PNIKNFKSLNTLTRYENKNIDAIENFVNKNIFSVFNIIVTRFHIESLLGVNNEKTISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPL
SFYISLMTISYITHNIGMLSHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATEVQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLILSYIPFETLS
VIISIFILQASSNLIKKYSLTFKIKKIMHFLKKNKGKALKPLQEDEKDIIKL

Sequences:

>Translated_772_residues
MLDLEKVKTIFKKYNKYEVNIDEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT
ANFPDGKKLKSALIKFQGKIKTEKTPIEDEISREKTLAKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDVFTNIS
EALMAEKLEDILSGFQIIDKIFKFKEITIISNKDKLKKAFEKLNIFKNKKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNAKD
DINPLNNILLVNIEDLYNTNIVINNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQVINEKIDTKKYEIFLNNPVNKIK
IETLNIPITRDIYSITILKKKSIYDKIRALFISSFSPLQMEDIIFSYLKNEKINDNSKLKIFKYTDKEVEEEIHKVQKEI
KGKILNESLINEVIYTENNLKDIYFAIILSLLPSLMFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYVPIMLKINYKCLSFFVYNAL
IISIILPLNLAITLKIASLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFFVLNFPVSFKQTYQEELKNSTPIIPTWNEIISTN
PNIKNFKSLNTLTRYENKNIDAIENFVNKNIFSVFNIIVTRFHIESLLGVNNEKTISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPL
SFYISLMTISYITHNIGMLSHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATEVQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLILSYIPFETLS
VIISIFILQASSNLIKKYSLTFKIKKIMHFLKKNKGKALKPLQEDEKDIIKL
>Mature_772_residues
MLDLEKVKTIFKKYNKYEVNIDEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT
ANFPDGKKLKSALIKFQGKIKTEKTPIEDEISREKTLAKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDVFTNIS
EALMAEKLEDILSGFQIIDKIFKFKEITIISNKDKLKKAFEKLNIFKNKKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNAKD
DINPLNNILLVNIEDLYNTNIVINNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQVINEKIDTKKYEIFLNNPVNKIK
IETLNIPITRDIYSITILKKKSIYDKIRALFISSFSPLQMEDIIFSYLKNEKINDNSKLKIFKYTDKEVEEEIHKVQKEI
KGKILNESLINEVIYTENNLKDIYFAIILSLLPSLMFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYVPIMLKINYKCLSFFVYNAL
IISIILPLNLAITLKIASLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFFVLNFPVSFKQTYQEELKNSTPIIPTWNEIISTN
PNIKNFKSLNTLTRYENKNIDAIENFVNKNIFSVFNIIVTRFHIESLLGVNNEKTISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPL
SFYISLMTISYITHNIGMLSHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATEVQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLILSYIPFETLS
VIISIFILQASSNLIKKYSLTFKIKKIMHFLKKNKGKALKPLQEDEKDIIKL

Specific function: Unknown

COG id: COG4656

COG function: function code C; Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89855; Mature: 89855

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLDLEKVKTIFKKYNKYEVNIDEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKN
CCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEECCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCCC
SNIELYTYSPISGIVEKIYTANFPDGKKLKSALIKFQGKIKTEKTPIEDEISREKTLAKL
CCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
IQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDVFTNISEALMAEKLEDILSGFQIIDK
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFKFKEITIISNKDKLKKAFEKLNIFKNKKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNAKD
HHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC
DINPLNNILLVNIEDLYNTNIVINNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQVIN
CCCCCCCEEEEEEHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHHHHCEEEEEECCCHHHHHH
EKIDTKKYEIFLNNPVNKIKIETLNIPITRDIYSITILKKKSIYDKIRALFISSFSPLQM
HHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEECCEECCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
EDIIFSYLKNEKINDNSKLKIFKYTDKEVEEEIHKVQKEIKGKILNESLINEVIYTENNL
HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
KDIYFAIILSLLPSLMFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYVPIMLKINYKCLSFFVYNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHH
IISIILPLNLAITLKIASLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFFVLNFPVSFKQTYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
EELKNSTPIIPTWNEIISTNPNIKNFKSLNTLTRYENKNIDAIENFVNKNIFSVFNIIVT
HHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFHIESLLGVNNEKTISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPLSFYISLMTISYITHNIGMLS
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATEVQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLILSYIPFETLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
VIISIFILQASSNLIKKYSLTFKIKKIMHFLKKNKGKALKPLQEDEKDIIKL
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLDLEKVKTIFKKYNKYEVNIDEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKN
CCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEECCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCCC
SNIELYTYSPISGIVEKIYTANFPDGKKLKSALIKFQGKIKTEKTPIEDEISREKTLAKL
CCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
IQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDVFTNISEALMAEKLEDILSGFQIIDK
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFKFKEITIISNKDKLKKAFEKLNIFKNKKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNAKD
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DINPLNNILLVNIEDLYNTNIVINNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQVIN
CCCCCCCEEEEEEHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHHHHCEEEEEECCCHHHHHH
EKIDTKKYEIFLNNPVNKIKIETLNIPITRDIYSITILKKKSIYDKIRALFISSFSPLQM
HHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEECCEECCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
EDIIFSYLKNEKINDNSKLKIFKYTDKEVEEEIHKVQKEIKGKILNESLINEVIYTENNL
HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
KDIYFAIILSLLPSLMFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYVPIMLKINYKCLSFFVYNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHH
IISIILPLNLAITLKIASLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFFVLNFPVSFKQTYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
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HHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFHIESLLGVNNEKTISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPLSFYISLMTISYITHNIGMLS
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATEVQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLILSYIPFETLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
VIISIFILQASSNLIKKYSLTFKIKKIMHFLKKNKGKALKPLQEDEKDIIKL
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA