| Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006055 |
| Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50365370
Identifier: 50365370
GI number: 50365370
Start: 644924
End: 646408
Strand: Reverse
Name: 50365370
Synonym: Mfl553
Alternate gene names: NA
Gene position: 646408-644924 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50365371
Following gene: 50365369
Centisome position: 81.49
GC content: 23.23
Gene sequence:
>1485_bases ATGAATAATTGAGATTTAATTATTGTTGTTCCTTTTGTAATTGTTTTAGGTTTTTTATTCTTATACTTCATTTACAAAAA ACTTAATTTTGAAAAAAAATTATTTTGATTTTATATGCAGACTTTAATCGTATGAGTTATGAATGCTATTTTGATACAAG AAAATTCAAACATTTTAACTGATACTTTTCATAACACACCACCAGCCATAATTGTTGTATTGCTATTATTTGGTAGTTCA ATTTTATTTGCTATTTTAATGAAACCACTAGCAACTTGAATAACAGGAAAAATTAGAAGCAGAAATATATGAATAAGATC TTCAATTATTGCGTCAATTGCTGCTTCAATGCTTTTATTGATTCCATTAAATGACAGTGCTTGATTTAAATTTATTATTA TTTTGCAAGCGATTATATTGGCCATAAGCATTTCTTCACAGAGTTTATACTTTTTATATTTAAATGAGCAAAAATACAAT AGACTATTTGCATTAAAAGTTTCTTTCTCAGTTGGGTTTGTTATAACATTTGCAACATTTATTGGTAATTGAATAATAAG TTTAAATAACTTCCTAACTGATAAACTTATAATTCTAAATATTTTTGTAATTATCTGTCTGTTAATTTCTTTATTAATAA GTTTTAAAATTGGAACAGAAAATAAAAATAAAATTGGTGAATTTAGATTAGTTTTAAAAGAGGAATTAATAAAATACTCT AAATCAACTTTGGTAAAATTAATTATTTTAACTTTATTACTGGGTGTTATTTATGGTTTTGTTCAGTCACCAATATTTAG AATGTATTTTGTAACAAATTCAAAAATAAGTAATAATGACGTTGAATGATTATCAACTTTAGATAGAAAATACCAAGCAT TATTTATATTTGGACAATTTGCAATAGGTTATACATTGTATAAAATTTTATTACCAAAGATTGGAGTTAAAAATCTAATT TATGGTCTAATTGTAATCTCAGGAATAGCACTATTAATTAGTACATTTATTATTAATCCTACTTGAATGGTTATTTCTAA TTTAATATTTGGTGCGTCATATTTTATATTATTTTACATGTGATTTGGATTCGCAATTATGTGAAACTATAGAGCAACAA AAGGTGTTCCAGTAACTGGTTTTATCGCCTCAGCATTACTTGTAGGTCAATTCTTAGTTATTTTTGTTTTTAATTCAATT ATTTATACTAAATCTGGTTTATTTACTTACCAATCAATTGAAGCAATAATTGCAGAAACAAATATAGATAATATTATTGC TTTTGAGAATAATTTAAAAATTGTTATTAGAATAACTGCAGCAGCTTTATTCTTTATAAATAGTATTTATTTATTTTTAA CAGTTATTTGAATTGATCAAGTTATTGCAGAATTTGTTGATTACGCAAATATTAAACATATTTTTTCTGAGTATGAAAAA CAATCAGTTGAAAGAAAAATTAATTCAAGAATAGTTACAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCAACAAGTGAAGCAAGATTGGGATTGGTATTGTCTGTTTTACAAGTATTGACTAATGCATTTAACATCATTGGTGTCAG TGCTTTAGAAACAATGTAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGGAATATATGAAAAATAATTTTGAAAAAATTAATGATATTAAAATAGATGAAAATTTAAATAATAAAGTATTTCGTGA TTTTATAAAATATTTTGAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 494; Mature: 494
Protein sequence:
>494_residues MNNWDLIIVVPFVIVLGFLFLYFIYKKLNFEKKLFWFYMQTLIVWVMNAILIQENSNILTDTFHNTPPAIIVVLLLFGSS ILFAILMKPLATWITGKIRSRNIWIRSSIIASIAASMLLLIPLNDSAWFKFIIILQAIILAISISSQSLYFLYLNEQKYN RLFALKVSFSVGFVITFATFIGNWIISLNNFLTDKLIILNIFVIICLLISLLISFKIGTENKNKIGEFRLVLKEELIKYS KSTLVKLIILTLLLGVIYGFVQSPIFRMYFVTNSKISNNDVEWLSTLDRKYQALFIFGQFAIGYTLYKILLPKIGVKNLI YGLIVISGIALLISTFIINPTWMVISNLIFGASYFILFYMWFGFAIMWNYRATKGVPVTGFIASALLVGQFLVIFVFNSI IYTKSGLFTYQSIEAIIAETNIDNIIAFENNLKIVIRITAAALFFINSIYLFLTVIWIDQVIAEFVDYANIKHIFSEYEK QSVERKINSRIVTE
Sequences:
>Translated_494_residues MNN*DLIIVVPFVIVLGFLFLYFIYKKLNFEKKLF*FYMQTLIV*VMNAILIQENSNILTDTFHNTPPAIIVVLLLFGSS ILFAILMKPLAT*ITGKIRSRNI*IRSSIIASIAASMLLLIPLNDSA*FKFIIILQAIILAISISSQSLYFLYLNEQKYN RLFALKVSFSVGFVITFATFIGN*IISLNNFLTDKLIILNIFVIICLLISLLISFKIGTENKNKIGEFRLVLKEELIKYS KSTLVKLIILTLLLGVIYGFVQSPIFRMYFVTNSKISNNDVE*LSTLDRKYQALFIFGQFAIGYTLYKILLPKIGVKNLI YGLIVISGIALLISTFIINPT*MVISNLIFGASYFILFYM*FGFAIM*NYRATKGVPVTGFIASALLVGQFLVIFVFNSI IYTKSGLFTYQSIEAIIAETNIDNIIAFENNLKIVIRITAAALFFINSIYLFLTVI*IDQVIAEFVDYANIKHIFSEYEK QSVERKINSRIVTE >Mature_494_residues MNN*DLIIVVPFVIVLGFLFLYFIYKKLNFEKKLF*FYMQTLIV*VMNAILIQENSNILTDTFHNTPPAIIVVLLLFGSS ILFAILMKPLAT*ITGKIRSRNI*IRSSIIASIAASMLLLIPLNDSA*FKFIIILQAIILAISISSQSLYFLYLNEQKYN RLFALKVSFSVGFVITFATFIGN*IISLNNFLTDKLIILNIFVIICLLISLLISFKIGTENKNKIGEFRLVLKEELIKYS KSTLVKLIILTLLLGVIYGFVQSPIFRMYFVTNSKISNNDVE*LSTLDRKYQALFIFGQFAIGYTLYKILLPKIGVKNLI YGLIVISGIALLISTFIINPT*MVISNLIFGASYFILFYM*FGFAIM*NYRATKGVPVTGFIASALLVGQFLVIFVFNSI IYTKSGLFTYQSIEAIIAETNIDNIIAFENNLKIVIRITAAALFFINSIYLFLTVI*IDQVIAEFVDYANIKHIFSEYEK QSVERKINSRIVTE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54369; Mature: 54369
Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNNDLIIVVPFVIVLGFLFLYFIYKKLNFEKKLFFYMQTLIVVMNAILIQENSNILTDTF CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEECC HNTPPAIIVVLLLFGSSILFAILMKPLATITGKIRSRNIIRSSIIASIAASMLLLIPLND CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC SAFKFIIILQAIILAISISSQSLYFLYLNEQKYNRLFALKVSFSVGFVITFATFIGNIIS CHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH LNNFLTDKLIILNIFVIICLLISLLISFKIGTENKNKIGEFRLVLKEELIKYSKSTLVKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IILTLLLGVIYGFVQSPIFRMYFVTNSKISNNDVELSTLDRKYQALFIFGQFAIGYTLYK HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEHHHHCHHHEEEEEHHHHHHHHHHH ILLPKIGVKNLIYGLIVISGIALLISTFIINPTMVISNLIFGASYFILFYMFGFAIMNYR HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ATKGVPVTGFIASALLVGQFLVIFVFNSIIYTKSGLFTYQSIEAIIAETNIDNIIAFENN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECC LKIVIRITAAALFFINSIYLFLTVIIDQVIAEFVDYANIKHIFSEYEKQSVERKINSRIV CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TE CC >Mature Secondary Structure MNNDLIIVVPFVIVLGFLFLYFIYKKLNFEKKLFFYMQTLIVVMNAILIQENSNILTDTF CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEECC HNTPPAIIVVLLLFGSSILFAILMKPLATITGKIRSRNIIRSSIIASIAASMLLLIPLND CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC SAFKFIIILQAIILAISISSQSLYFLYLNEQKYNRLFALKVSFSVGFVITFATFIGNIIS CHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH LNNFLTDKLIILNIFVIICLLISLLISFKIGTENKNKIGEFRLVLKEELIKYSKSTLVKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IILTLLLGVIYGFVQSPIFRMYFVTNSKISNNDVELSTLDRKYQALFIFGQFAIGYTLYK HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEHHHHCHHHEEEEEHHHHHHHHHHH ILLPKIGVKNLIYGLIVISGIALLISTFIINPTMVISNLIFGASYFILFYMFGFAIMNYR HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ATKGVPVTGFIASALLVGQFLVIFVFNSIIYTKSGLFTYQSIEAIIAETNIDNIIAFENN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECC LKIVIRITAAALFFINSIYLFLTVIIDQVIAEFVDYANIKHIFSEYEKQSVERKINSRIV CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TE CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA