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The map label for this gene is yoeA [H]

Identifier: 50086508

GI number: 50086508

Start: 3479143

End: 3480555

Strand: Direct

Name: yoeA [H]

Synonym: ACIAD3554

Alternate gene names: 50086508

Gene position: 3479143-3480555 (Clockwise)

Preceding gene: 50086507

Following gene: 50086510

Centisome position: 96.68

GC content: 43.24

Gene sequence:

>1413_bases
CTGAAACATCGCCTTTCAGATTACTTCGTGCGCCAAGGAGAGCCAATGACGCCAAAACGCTCGTTGATCACACAACAAAA
GTTATGGAAAACCTTTTTAATTTTTTTACTCCCTTTAATCGCGACCAATATTCTGCAAAACCTCTCTGGTACCATTAACA
CCGTATTTGTAGGACAAATGATGGGGGTGGATGCGATTGCAGCCGTTGCTGTTTTTTTCCCGATTCTCTTTTGTATGATG
GCTTTTATTATTGGCTTATCGGCAGGCTCTACTGTGCTGATTGGTCAGGCATGGGGGGCACAAAATATTGAGAAAGTCCG
CTGTGTGGTCGGCTCTACGCTTTTCATGACCATCATTGGTGGTTGTATTATTGCCGCATTGGGTGTTTTTTTTAGTCGGG
AAATTCTCACGCTATTAGGTACAGATGCAAGTGTGATGCACTTGTCATTGCCTTACGTGCAATGGATGCTGGCGGGTAGT
CCCTTATTGTTTGTGTATATTATTTACACCTCCATCCTGCGTGGCGTGGGAGACAGTATTACCCCGCTCATCGCGCTGGG
CATGACCAGTTTAATTGGTTTAGTCATTACCCCTGTACTTATTGCAGGCTACTTCGGCTTTCCGAAGCTCGGGATTGTAG
CACCCGCCATTGCCACCATTATTGGCTATCTTTCTGTCCTCGCCTTTTTGGCAGTGTATCTGAATAAAAAAAATCACCCA
CTAAAGCCTGATCTGGCACTACTTCGACATATTCGTCACCACAGTGAAATCAGTCGTTTGATTTTAAGATTGGGAATTCC
AACAGGTGTTCAGATGATCACCACCTCTGTTGCAGGTCTGGTCATTGTAGGTCTGGTCAACCGTTTTGGTGCCCATGCGA
CTGCGGCTTATGGCGCTGTCAATCAAGTCCTGAATTATATTCAGTTTCCAGCTTTATCGATTGCAATTGCAGCCTCAATT
TTTGGTGCACAAGCAATTGGTATGGGCAAATCAGATTTATTGGCACGTGTGACTCGTACAGCATTATGGATGAATATTAT
CATCACAGGCACATTGGTTATTCTGGCCTATTTATTTTCCAAGTATCTGATGGCGCTATTTATTACCGATGAAAGTGTGG
TACAGCTTGGTCAGGAATTATTGTTTATTGTGCTTTGGTCAATTTTATTTTTTGGTGCAGCCGCAATTTTTGCCTCAATT
ATGCGTTCTAGTGGAACGGTTACCGTCCCGATGCTAATTAATATTGCCGCCATTTTATTCATTGAAGTACCTTGTGCCTA
TTGGTTTAGCACGCTATGGGGGTTAAAAGGTATCTGGATCGGATATGCACTTGCTTTTGTATGTTTGTGCATCATGCAAG
CGGCCTATTATCAATTTGTCTGGAAGAAAAAGACCATTAAAGCACTGATCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCCTAAAAGATGCCACCCAGCGTCTGAGTCAATGTTAATCCCGACACACCCATCTATAGCAAAAATCACACTTAATCTA
GAGTCTGACTATGCTATGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGATAAAAAAGACCTATCATTGATGGGTCTAGATCGTTTTAGGTAAATAATTAATTTAAAGCTTCTTGCTCAGTGAGGT
CGCAAAGGCCGTCACTTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 470; Mature: 470

Protein sequence:

>470_residues
MKHRLSDYFVRQGEPMTPKRSLITQQKLWKTFLIFLLPLIATNILQNLSGTINTVFVGQMMGVDAIAAVAVFFPILFCMM
AFIIGLSAGSTVLIGQAWGAQNIEKVRCVVGSTLFMTIIGGCIIAALGVFFSREILTLLGTDASVMHLSLPYVQWMLAGS
PLLFVYIIYTSILRGVGDSITPLIALGMTSLIGLVITPVLIAGYFGFPKLGIVAPAIATIIGYLSVLAFLAVYLNKKNHP
LKPDLALLRHIRHHSEISRLILRLGIPTGVQMITTSVAGLVIVGLVNRFGAHATAAYGAVNQVLNYIQFPALSIAIAASI
FGAQAIGMGKSDLLARVTRTALWMNIIITGTLVILAYLFSKYLMALFITDESVVQLGQELLFIVLWSILFFGAAAIFASI
MRSSGTVTVPMLINIAAILFIEVPCAYWFSTLWGLKGIWIGYALAFVCLCIMQAAYYQFVWKKKTIKALI

Sequences:

>Translated_470_residues
MKHRLSDYFVRQGEPMTPKRSLITQQKLWKTFLIFLLPLIATNILQNLSGTINTVFVGQMMGVDAIAAVAVFFPILFCMM
AFIIGLSAGSTVLIGQAWGAQNIEKVRCVVGSTLFMTIIGGCIIAALGVFFSREILTLLGTDASVMHLSLPYVQWMLAGS
PLLFVYIIYTSILRGVGDSITPLIALGMTSLIGLVITPVLIAGYFGFPKLGIVAPAIATIIGYLSVLAFLAVYLNKKNHP
LKPDLALLRHIRHHSEISRLILRLGIPTGVQMITTSVAGLVIVGLVNRFGAHATAAYGAVNQVLNYIQFPALSIAIAASI
FGAQAIGMGKSDLLARVTRTALWMNIIITGTLVILAYLFSKYLMALFITDESVVQLGQELLFIVLWSILFFGAAAIFASI
MRSSGTVTVPMLINIAAILFIEVPCAYWFSTLWGLKGIWIGYALAFVCLCIMQAAYYQFVWKKKTIKALI
>Mature_470_residues
MKHRLSDYFVRQGEPMTPKRSLITQQKLWKTFLIFLLPLIATNILQNLSGTINTVFVGQMMGVDAIAAVAVFFPILFCMM
AFIIGLSAGSTVLIGQAWGAQNIEKVRCVVGSTLFMTIIGGCIIAALGVFFSREILTLLGTDASVMHLSLPYVQWMLAGS
PLLFVYIIYTSILRGVGDSITPLIALGMTSLIGLVITPVLIAGYFGFPKLGIVAPAIATIIGYLSVLAFLAVYLNKKNHP
LKPDLALLRHIRHHSEISRLILRLGIPTGVQMITTSVAGLVIVGLVNRFGAHATAAYGAVNQVLNYIQFPALSIAIAASI
FGAQAIGMGKSDLLARVTRTALWMNIIITGTLVILAYLFSKYLMALFITDESVVQLGQELLFIVLWSILFFGAAAIFASI
MRSSGTVTVPMLINIAAILFIEVPCAYWFSTLWGLKGIWIGYALAFVCLCIMQAAYYQFVWKKKTIKALI

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=424, Percent_Identity=22.877358490566, Blast_Score=86, Evalue=7e-18,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51173; Mature: 51173

Theoretical pI: Translated: 10.03; Mature: 10.03

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]