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The map label for this gene is ybbP [H]

Identifier: 50084259

GI number: 50084259

Start: 1053286

End: 1055757

Strand: Direct

Name: ybbP [H]

Synonym: ACIAD1059

Alternate gene names: 50084259

Gene position: 1053286-1055757 (Clockwise)

Preceding gene: 50084258

Following gene: 50084261

Centisome position: 29.27

GC content: 41.55

Gene sequence:

>2472_bases
ATGAGTTCAATCCTGAAACCATTATTATTGCAAAGTTTTCGTACGGGTGGCTTATATCTACTCATTATTGCGCTATCACT
GGCGATCAGTGCGACAACAGCATTGAAGTTTAGTAATGATCAGGTCAAGCAGGCAGTCAGCTTACAGGCAGCAGAAATGT
TGGCAGCCGATTTGGTTTTATCTGATCAAGAGCCAATTGCTCAGCAATGGACAGCACAGGCACAGCAAGACGGATTACAG
CAGTCCAAAGTCACTTTATTCAGCTCTATGGCGCGCACCGATCAAAATTTTGTGATGGTTAATGTCAAAGCAATAGATCA
TAAATTTCCGTTAAGAGGGGATTTGAAAATTGATCCTGTACAGCAAACGCTGCGTCGTGGAGAGGTTTGGCTAAGCCCTC
GTGCCAGAGATCTACTGAAAGTGAAATTAAATGACTTGGTGTTTATTGCAGATGGTCAATTTAAATTTACAGGGTTGATT
CAGCATGATTCCAATCAGGAACTTGGATTTTCGGGTTTTTCACCCACGGTCATGATCAATCAGCAGGATGTGGCAAAAAC
CAATGCGATTCAGACTGGCAGCCGTATCGAATATCGTCTGTTAATGGCTGGGAATCCAGAACAAACAAAAACGTTTTCGC
AGCAATTTAAGCATCTTCAGCAGCCGAATAGTGACAATGAAAGTTCTGAAAATCAGGCGACATTGCGGTTAAGAGACGCG
ACTCAAAACAACGCTCGTTTGATGAAGCCGATTGAGAATCTGGATACTTTTCTTCAACTCGCCAATATTTTAACCATCTT
GCTATGTGGAATTGCAATTGCGCTGACCAGTCAACGCTATGTGCAGCAAAACCAAGATCATATCGCTTTAATCCGTTGTC
TTGGCGCGAGCAAATGGCAAATCTTGCGTGCCTATATCGGACTACTGAGTATCGTAAGCCTGATTTCGATTGGTACGGGA
ACGCTCATTGGAATTGGGCTGGGGTATGGATTATTACAGCTCATGCTCCAGTTAATGCCTCAATTAAATATTGGTTTTTC
GGCTATGCATCTGATTGCTGGGCCTTTACCAATCGCTATTTTTACCAGTGTCGTGGTGTTATTTGGTTTTATTTTACCAA
GTGTGTGGGAGTTACTAAATACACCGCCAATCCGTGTGATCAGGCAAGAAATACGCTCCAAGCGTTCATTGAGTTTAACG
TTTTTGGCAGGTATATCCAGTCTGATTATTTTTAGCTTGATCCTGAGTGAAAATATCCCATTGAGTGGCATGATGCTGGC
TGCAATTTTACTGTTGAGTCTGTTGCTCTATGGCATCGTGTGGAGTTTACTTAAATTTCTAAAAACACTCCGAAATCGTT
TATCAGCTTATGTACGTTTACCACACCAAACTGCGCTTCAGATTACCGCACTGGCATTGGGAATTAGCTTAATTACAGTA
TTGAGTGTACTTCGGGTAGATTTACTGGAGCGTTGGCAGCAACAGTTACCTGAAGGAACACCGAACCAGTTTGTTTACGG
TTTACCGCCTTTTGAAATGCCACAGCTCAAGCAACAACTTAAGCAAAATGAGTGGAAAAGTACGCCACTCTATCCCAATA
TTCGTGGTCGCCTGATTGCCAAAAATGATCAGCCTTTTACAGCTGATCAGATTAAACAGAATAATGCCTTGCGCCGTGAG
TTAAATCTCACGCAAGCACAAAGTTTTCCTGAAGATAACCAGATCATTACTGGTATTACACGATTTAATCAGGTCAATCA
AGTTTCGGTGGAGTCTAAGCTGGCTCAAGAGCTTGGCATCAAGATTGGAGATCAATTGACATTTCAGCTTCCAGAAGGTC
CTTTGTCTGCCAGAGTAGTTAATTTAAGAACAGTGGAATGGGAAAGCTTTAGTCCCAATTTTTTCTTTATTTTCTCACCC
TCTACCATGGATGAAAATGCAGGAAGTTATCTGGGAAGCTTCTATGTCCCACTTCAAGATAAAACAAAACTAATCGCGGT
GATTCAACAATTTTCCAATACAGTATTTATCGATGTCAGCTTAATTTTGGATGAAGTGAAACGTTTGGTTGGAGTATTGG
TTCAGATTATTACGATACTGGCAGTCTTGGTGGGGGTGTCAGGAGTATTGGTACTCATTGCTTGTCTGAATTTGCTGATG
GATGAGCGTCGACGTGAAGTCGCTTTATTACGCTCATTTGGGATCTCGAAACGCAAACTGAAAAATATGCTCATGTTTGA
AGTTGGCTTGATCGGATTACTGTCAGGTGTTGTGGCTTGTTTGTTTGCCGAGGTGATCAGTGCAATTGCAAGTTATAAGA
TGAATATTGCTATTCAATGGCATATCGAGATCTGGCTGATTCTTCCAGTATTAATGATGTTAATTTGTGCAATGATTGGT
CGCTACCGATTAAGTTATTTGTGTGACATTCCACCTTTGCAAAGTTTAAGGGAACTTAACCAGTCATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTGGTTACGCACGATCTTAAACTTGCGCAACAATGCCAGCGTCATTTCCATCTGGAAGATGGTCAGTTGAGTCAAGAT
ATCAATCAACTGGAGCAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAGTATCAGCTTGGATGGCGTTAGCGTCCAAGCTGCTGACTCATTTGTGACAAAATCATTTGCCAAAATGGGGTAATCG
GTGGAAGTAAGCTAATGCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 823; Mature: 822

Protein sequence:

>823_residues
MSSILKPLLLQSFRTGGLYLLIIALSLAISATTALKFSNDQVKQAVSLQAAEMLAADLVLSDQEPIAQQWTAQAQQDGLQ
QSKVTLFSSMARTDQNFVMVNVKAIDHKFPLRGDLKIDPVQQTLRRGEVWLSPRARDLLKVKLNDLVFIADGQFKFTGLI
QHDSNQELGFSGFSPTVMINQQDVAKTNAIQTGSRIEYRLLMAGNPEQTKTFSQQFKHLQQPNSDNESSENQATLRLRDA
TQNNARLMKPIENLDTFLQLANILTILLCGIAIALTSQRYVQQNQDHIALIRCLGASKWQILRAYIGLLSIVSLISIGTG
TLIGIGLGYGLLQLMLQLMPQLNIGFSAMHLIAGPLPIAIFTSVVVLFGFILPSVWELLNTPPIRVIRQEIRSKRSLSLT
FLAGISSLIIFSLILSENIPLSGMMLAAILLLSLLLYGIVWSLLKFLKTLRNRLSAYVRLPHQTALQITALALGISLITV
LSVLRVDLLERWQQQLPEGTPNQFVYGLPPFEMPQLKQQLKQNEWKSTPLYPNIRGRLIAKNDQPFTADQIKQNNALRRE
LNLTQAQSFPEDNQIITGITRFNQVNQVSVESKLAQELGIKIGDQLTFQLPEGPLSARVVNLRTVEWESFSPNFFFIFSP
STMDENAGSYLGSFYVPLQDKTKLIAVIQQFSNTVFIDVSLILDEVKRLVGVLVQIITILAVLVGVSGVLVLIACLNLLM
DERRREVALLRSFGISKRKLKNMLMFEVGLIGLLSGVVACLFAEVISAIASYKMNIAIQWHIEIWLILPVLMMLICAMIG
RYRLSYLCDIPPLQSLRELNQSS

Sequences:

>Translated_823_residues
MSSILKPLLLQSFRTGGLYLLIIALSLAISATTALKFSNDQVKQAVSLQAAEMLAADLVLSDQEPIAQQWTAQAQQDGLQ
QSKVTLFSSMARTDQNFVMVNVKAIDHKFPLRGDLKIDPVQQTLRRGEVWLSPRARDLLKVKLNDLVFIADGQFKFTGLI
QHDSNQELGFSGFSPTVMINQQDVAKTNAIQTGSRIEYRLLMAGNPEQTKTFSQQFKHLQQPNSDNESSENQATLRLRDA
TQNNARLMKPIENLDTFLQLANILTILLCGIAIALTSQRYVQQNQDHIALIRCLGASKWQILRAYIGLLSIVSLISIGTG
TLIGIGLGYGLLQLMLQLMPQLNIGFSAMHLIAGPLPIAIFTSVVVLFGFILPSVWELLNTPPIRVIRQEIRSKRSLSLT
FLAGISSLIIFSLILSENIPLSGMMLAAILLLSLLLYGIVWSLLKFLKTLRNRLSAYVRLPHQTALQITALALGISLITV
LSVLRVDLLERWQQQLPEGTPNQFVYGLPPFEMPQLKQQLKQNEWKSTPLYPNIRGRLIAKNDQPFTADQIKQNNALRRE
LNLTQAQSFPEDNQIITGITRFNQVNQVSVESKLAQELGIKIGDQLTFQLPEGPLSARVVNLRTVEWESFSPNFFFIFSP
STMDENAGSYLGSFYVPLQDKTKLIAVIQQFSNTVFIDVSLILDEVKRLVGVLVQIITILAVLVGVSGVLVLIACLNLLM
DERRREVALLRSFGISKRKLKNMLMFEVGLIGLLSGVVACLFAEVISAIASYKMNIAIQWHIEIWLILPVLMMLICAMIG
RYRLSYLCDIPPLQSLRELNQSS
>Mature_822_residues
SSILKPLLLQSFRTGGLYLLIIALSLAISATTALKFSNDQVKQAVSLQAAEMLAADLVLSDQEPIAQQWTAQAQQDGLQQ
SKVTLFSSMARTDQNFVMVNVKAIDHKFPLRGDLKIDPVQQTLRRGEVWLSPRARDLLKVKLNDLVFIADGQFKFTGLIQ
HDSNQELGFSGFSPTVMINQQDVAKTNAIQTGSRIEYRLLMAGNPEQTKTFSQQFKHLQQPNSDNESSENQATLRLRDAT
QNNARLMKPIENLDTFLQLANILTILLCGIAIALTSQRYVQQNQDHIALIRCLGASKWQILRAYIGLLSIVSLISIGTGT
LIGIGLGYGLLQLMLQLMPQLNIGFSAMHLIAGPLPIAIFTSVVVLFGFILPSVWELLNTPPIRVIRQEIRSKRSLSLTF
LAGISSLIIFSLILSENIPLSGMMLAAILLLSLLLYGIVWSLLKFLKTLRNRLSAYVRLPHQTALQITALALGISLITVL
SVLRVDLLERWQQQLPEGTPNQFVYGLPPFEMPQLKQQLKQNEWKSTPLYPNIRGRLIAKNDQPFTADQIKQNNALRREL
NLTQAQSFPEDNQIITGITRFNQVNQVSVESKLAQELGIKIGDQLTFQLPEGPLSARVVNLRTVEWESFSPNFFFIFSPS
TMDENAGSYLGSFYVPLQDKTKLIAVIQQFSNTVFIDVSLILDEVKRLVGVLVQIITILAVLVGVSGVLVLIACLNLLMD
ERRREVALLRSFGISKRKLKNMLMFEVGLIGLLSGVVACLFAEVISAIASYKMNIAIQWHIEIWLILPVLMMLICAMIGR
YRLSYLCDIPPLQSLRELNQSS

Specific function: Unknown

COG id: COG3127

COG function: function code Q; Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786704, Length=806, Percent_Identity=29.7766749379653, Blast_Score=300, Evalue=2e-82,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91917; Mature: 91785

Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSILKPLLLQSFRTGGLYLLIIALSLAISATTALKFSNDQVKQAVSLQAAEMLAADLVL
CCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SDQEPIAQQWTAQAQQDGLQQSKVTLFSSMARTDQNFVMVNVKAIDHKFPLRGDLKIDPV
CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEECHH
QQTLRRGEVWLSPRARDLLKVKLNDLVFIADGQFKFTGLIQHDSNQELGFSGFSPTVMIN
HHHHHCCCEEECCCHHHHHHEEECCEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEC
QQDVAKTNAIQTGSRIEYRLLMAGNPEQTKTFSQQFKHLQQPNSDNESSENQATLRLRDA
CHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECC
TQNNARLMKPIENLDTFLQLANILTILLCGIAIALTSQRYVQQNQDHIALIRCLGASKWQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHCCCHHH
ILRAYIGLLSIVSLISIGTGTLIGIGLGYGLLQLMLQLMPQLNIGFSAMHLIAGPLPIAI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHH
FTSVVVLFGFILPSVWELLNTPPIRVIRQEIRSKRSLSLTFLAGISSLIIFSLILSENIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LSGMMLAAILLLSLLLYGIVWSLLKFLKTLRNRLSAYVRLPHQTALQITALALGISLITV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSVLRVDLLERWQQQLPEGTPNQFVYGLPPFEMPQLKQQLKQNEWKSTPLYPNIRGRLIA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEE
KNDQPFTADQIKQNNALRRELNLTQAQSFPEDNQIITGITRFNQVNQVSVESKLAQELGI
CCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
KIGDQLTFQLPEGPLSARVVNLRTVEWESFSPNFFFIFSPSTMDENAGSYLGSFYVPLQD
CCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHEEEECCCC
KTKLIAVIQQFSNTVFIDVSLILDEVKRLVGVLVQIITILAVLVGVSGVLVLIACLNLLM
CHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DERRREVALLRSFGISKRKLKNMLMFEVGLIGLLSGVVACLFAEVISAIASYKMNIAIQW
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEE
HIEIWLILPVLMMLICAMIGRYRLSYLCDIPPLQSLRELNQSS
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
SSILKPLLLQSFRTGGLYLLIIALSLAISATTALKFSNDQVKQAVSLQAAEMLAADLVL
CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SDQEPIAQQWTAQAQQDGLQQSKVTLFSSMARTDQNFVMVNVKAIDHKFPLRGDLKIDPV
CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEECHH
QQTLRRGEVWLSPRARDLLKVKLNDLVFIADGQFKFTGLIQHDSNQELGFSGFSPTVMIN
HHHHHCCCEEECCCHHHHHHEEECCEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEC
QQDVAKTNAIQTGSRIEYRLLMAGNPEQTKTFSQQFKHLQQPNSDNESSENQATLRLRDA
CHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECC
TQNNARLMKPIENLDTFLQLANILTILLCGIAIALTSQRYVQQNQDHIALIRCLGASKWQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHCCCHHH
ILRAYIGLLSIVSLISIGTGTLIGIGLGYGLLQLMLQLMPQLNIGFSAMHLIAGPLPIAI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHH
FTSVVVLFGFILPSVWELLNTPPIRVIRQEIRSKRSLSLTFLAGISSLIIFSLILSENIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LSGMMLAAILLLSLLLYGIVWSLLKFLKTLRNRLSAYVRLPHQTALQITALALGISLITV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSVLRVDLLERWQQQLPEGTPNQFVYGLPPFEMPQLKQQLKQNEWKSTPLYPNIRGRLIA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEE
KNDQPFTADQIKQNNALRRELNLTQAQSFPEDNQIITGITRFNQVNQVSVESKLAQELGI
CCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
KIGDQLTFQLPEGPLSARVVNLRTVEWESFSPNFFFIFSPSTMDENAGSYLGSFYVPLQD
CCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHEEEECCCC
KTKLIAVIQQFSNTVFIDVSLILDEVKRLVGVLVQIITILAVLVGVSGVLVLIACLNLLM
CHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DERRREVALLRSFGISKRKLKNMLMFEVGLIGLLSGVVACLFAEVISAIASYKMNIAIQW
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEE
HIEIWLILPVLMMLICAMIGRYRLSYLCDIPPLQSLRELNQSS
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503 [H]