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The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 50084015

GI number: 50084015

Start: 791811

End: 793985

Strand: Reverse

Name: yccS [H]

Synonym: ACIAD0801

Alternate gene names: 50084015

Gene position: 793985-791811 (Counterclockwise)

Preceding gene: 50084017

Following gene: 50084014

Centisome position: 22.06

GC content: 41.15

Gene sequence:

>2175_bases
TTGAAGCCCTGGTTGTCTAAAGTCAGAAAAGCGACATACAACACATCATTGATGTATAACCTGAGAATGCTCATTGCATT
TGCAGGCACTGCATTTGTCCCCTACTTTCTTGACTATCAACTCGCGACAATTCCCTTAACATTAGGCGTTGTTGCTGCAG
GTCTGAGCGATATTGATGACCGCTTTTCGGTTCGCATCATGAATCTGGTTTATACCTATATTGGATTTTTTGTTGCGGCA
ACTTCGGTTCAACTCCTATTTCCCTATCCTATTGCATTTGCATTGGGATTGATTGTCGCTTGTATTTTCTGGATTTTACT
GGGTTCACTAGGGCGACGTTATGCCACCATCTCGTATGGATGTTTAGTCGTCTCGGTATATTCGATGCTCGGCGTTCATT
TGTTCTCGGAATGGTATGTGCAACCTGTACTGCTAGTTTGTGGTGCTGCATGGTATGGCTTAATTGCAACTATTAGTTTT
TTACTATTTCCGATTCGCCCTGTTCAAGACAAACTGGCAGCATGCTATTCATCTCTGGGAGATTTTCTTTTTGCAAAATC
AAGTGTATTTGATGTCGATATGACGCCAAATAGTTACCAGCAGAGCTTGATTGATTTGTCTTTGGAAAATGGCAAATTGG
TGGGAATTTTTAATGATCTAAAAACCGCTCTGCTCACCCGGCTTAAAGGCGACCGGGGACAAAAAGATACACGCCGTAGT
TTGCAATATTATTTCGTTGCGCAAGATATTCATGAGCGTGCTGATTCTGCACATATTAATTATCAAGAATTGAGTAAGAT
TTTTCAGCACAGTGATATTCTGTTTCGCTTTCAACGAATCTTGAGTATTCAGGGCAAAGCCTGTAAAGACTTGAGTGAAA
GTATTTTAAAAAGAGAGTCTTATAAACATAACAAGCGATTTAAGCATGCTTTTGAAAATTTAAAGCAGTCACTTGAAAAA
CTGCGTCAGGATCAGGTATATGACCAGATGTGGGTCAATGCCCTTTTTGCACTGTATCAAAATTTAAAAGGAATCGATGC
GCAACTGCGTAACCTGGAAACAGAACGTAATATCGCACTTGATAAAAACAAACAACTCGAACAACAGCTTAAAGATGATG
ATCTTAAAGGCTGGAAAGACATCAAGATTCGCATCAAACAAAATTTAACACCAGAATCGGTGCTGTTCCGTCACGCCATC
CGTTTATCCACAGTACTGGTGATTGGCTATATTTTTGTACAAATGACAGGTATTCAGTACGGTTACTGGATCTTGCTCAC
CGCCCTGTTTGTATCCCAGCCCAACTTTAATGCAACCAAACGCCGTTTACGTTTAAGGATTGTAGGTACATTGGTTGGGA
TTATTATTGGTCTTGCTATTCTGTATTTTGTTCCATCATTAGAAGGACAACTCTTATTACTGGTGATAAGTGGCGTATTA
TTTTTTGAATTGCGTAGTAAACAATATGCACAGGCCACTGCATTTATCACTATTTTGGCGCTCATTAACTTTAATCTGGA
TGGATTCGGTTTCTCTGCTGGCTTACCACGTATGATTGATACCTTGATTGGTTGTGCATTGGCATGGTTCGGTGTCAGTT
TTATCTGGCCAGACTGGAAATTCAGGCGCTTGCCACGTACCATCCGACGCGCCTTACAGGCACAGTGTAATTATCTAATC
GATGTGGTTCAGCAATATCATGAAGGTCGAAACCATGGCCTAAGCTATCGTATTGCTCGACGTAATGCACATAATACTGA
TGCTGATGTTGCCTCCCTCATTTCGACTCTGGCGACAGAACCCGACTTTGATCCACTGCAAAAAAATCTAGCCTTTGAGT
TCCTGTGTTTAAACCATACCTTTCTGAGCTATATTGCTGCTTTAGGGGCACATCGCCAAAAAATTGAAGACAAAGAGGTT
CTTCAATTGCTAGATCAGGCGCTGGATGATATTCAGGGTGCTTTGCTGCGTGACGAAATGCCAGATCTGACCGCACATAA
TATGCTACAGACTATTCGCACACGGTTAAAACAAAGTAGTGAAGAAGATCAAAGCGCTTTACTCATTTTGCAGCAACTTT
CACTAATGTATAGCATCCTAAAACAACTCAGTACACTCAAGCAAAGTCTGAGCCATGACCGAGACGATGCCGCCACAGAA
TTAGCATCTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCATAGTATGATTTCACAGCATAAAACAATGAAAGTTTTTCAAATACTAAATTTAAATGTCATATCACCGTCCTCACTCA
GCAGATTATAAGGAATCCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCCCATGAAAATGGCACAATATATTCACGGAATAGGGTTATTTAATGCTAAACTTTGGCGAGTTTAAAATTCACTTTAT
GCACTTAGCACTATGACCGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 724; Mature: 724

Protein sequence:

>724_residues
MKPWLSKVRKATYNTSLMYNLRMLIAFAGTAFVPYFLDYQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLVYTYIGFFVAA
TSVQLLFPYPIAFALGLIVACIFWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYSMLGVHLFSEWYVQPVLLVCGAAWYGLIATISF
LLFPIRPVQDKLAACYSSLGDFLFAKSSVFDVDMTPNSYQQSLIDLSLENGKLVGIFNDLKTALLTRLKGDRGQKDTRRS
LQYYFVAQDIHERADSAHINYQELSKIFQHSDILFRFQRILSIQGKACKDLSESILKRESYKHNKRFKHAFENLKQSLEK
LRQDQVYDQMWVNALFALYQNLKGIDAQLRNLETERNIALDKNKQLEQQLKDDDLKGWKDIKIRIKQNLTPESVLFRHAI
RLSTVLVIGYIFVQMTGIQYGYWILLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIIGLAILYFVPSLEGQLLLLVISGVL
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGFGFSAGLPRMIDTLIGCALAWFGVSFIWPDWKFRRLPRTIRRALQAQCNYLI
DVVQQYHEGRNHGLSYRIARRNAHNTDADVASLISTLATEPDFDPLQKNLAFEFLCLNHTFLSYIAALGAHRQKIEDKEV
LQLLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAHNMLQTIRTRLKQSSEEDQSALLILQQLSLMYSILKQLSTLKQSLSHDRDDAATE
LASL

Sequences:

>Translated_724_residues
MKPWLSKVRKATYNTSLMYNLRMLIAFAGTAFVPYFLDYQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLVYTYIGFFVAA
TSVQLLFPYPIAFALGLIVACIFWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYSMLGVHLFSEWYVQPVLLVCGAAWYGLIATISF
LLFPIRPVQDKLAACYSSLGDFLFAKSSVFDVDMTPNSYQQSLIDLSLENGKLVGIFNDLKTALLTRLKGDRGQKDTRRS
LQYYFVAQDIHERADSAHINYQELSKIFQHSDILFRFQRILSIQGKACKDLSESILKRESYKHNKRFKHAFENLKQSLEK
LRQDQVYDQMWVNALFALYQNLKGIDAQLRNLETERNIALDKNKQLEQQLKDDDLKGWKDIKIRIKQNLTPESVLFRHAI
RLSTVLVIGYIFVQMTGIQYGYWILLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIIGLAILYFVPSLEGQLLLLVISGVL
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGFGFSAGLPRMIDTLIGCALAWFGVSFIWPDWKFRRLPRTIRRALQAQCNYLI
DVVQQYHEGRNHGLSYRIARRNAHNTDADVASLISTLATEPDFDPLQKNLAFEFLCLNHTFLSYIAALGAHRQKIEDKEV
LQLLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAHNMLQTIRTRLKQSSEEDQSALLILQQLSLMYSILKQLSTLKQSLSHDRDDAATE
LASL
>Mature_724_residues
MKPWLSKVRKATYNTSLMYNLRMLIAFAGTAFVPYFLDYQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLVYTYIGFFVAA
TSVQLLFPYPIAFALGLIVACIFWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYSMLGVHLFSEWYVQPVLLVCGAAWYGLIATISF
LLFPIRPVQDKLAACYSSLGDFLFAKSSVFDVDMTPNSYQQSLIDLSLENGKLVGIFNDLKTALLTRLKGDRGQKDTRRS
LQYYFVAQDIHERADSAHINYQELSKIFQHSDILFRFQRILSIQGKACKDLSESILKRESYKHNKRFKHAFENLKQSLEK
LRQDQVYDQMWVNALFALYQNLKGIDAQLRNLETERNIALDKNKQLEQQLKDDDLKGWKDIKIRIKQNLTPESVLFRHAI
RLSTVLVIGYIFVQMTGIQYGYWILLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIIGLAILYFVPSLEGQLLLLVISGVL
FFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGFGFSAGLPRMIDTLIGCALAWFGVSFIWPDWKFRRLPRTIRRALQAQCNYLI
DVVQQYHEGRNHGLSYRIARRNAHNTDADVASLISTLATEPDFDPLQKNLAFEFLCLNHTFLSYIAALGAHRQKIEDKEV
LQLLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAHNMLQTIRTRLKQSSEEDQSALLILQQLSLMYSILKQLSTLKQSLSHDRDDAATE
LASL

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=705, Percent_Identity=50.354609929078, Blast_Score=732, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=628, Percent_Identity=25.1592356687898, Blast_Score=110, Evalue=4e-25,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82591; Mature: 82591

Theoretical pI: Translated: 9.23; Mature: 9.23

Prosite motif: PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHCC
>Mature Secondary Structure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HHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]