| Definition | Acinetobacter sp. ADP1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005966 |
| Length | 3,598,621 |
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The map label for this gene is ygxB [H]
Identifier: 50083968
GI number: 50083968
Start: 735373
End: 737043
Strand: Direct
Name: ygxB [H]
Synonym: ACIAD0750
Alternate gene names: 50083968
Gene position: 735373-737043 (Clockwise)
Preceding gene: 50083967
Following gene: 50083975
Centisome position: 20.43
GC content: 41.89
Gene sequence:
>1671_bases ATGAATGATTTTTTAGGAAATGGGTCATCTCGTGCCCATTATGATCTGATGTATTACTGGGATATTTTTCAGCCCATTAT CGCTGCGATTGCTGTGTTTATTGTGGGTTGGATTTTAGCTCTTGTCATTGCTGCAGGGATTAAAAAATTACTCAGTGCGA TTGGGACAAACCATCGTTTGTCTACGGCTACAGGAAAAACGCCTGATTTTGAGAGGATTGTATCCAAGTTTGTCTTCTGG TTTGTATTGGTTATCGCGCTGATAGCTGCATTAAATGTTTTAAACATTTATAGCGTGAGTGGGCCATTTAGTGCCATGGT AACTCAGGTACTGGTTTTTGTACCCAACATCATTGCTGCTGCCGTTGTGGGACTGGTGGGATGGATTATTGCACGTTTAG TACGAGCGGGAATAAGTAATGTACTTGCCAGAACTCAACTTGATGAAAGGCTCAGTTCAGAAGTAGGCGTACGTCCATTA AGTGAAAATATCGCAGATATTATCTATTGGTTAATTCTTTTACTGTTCCTGCCTATAGTGTTGTCGATCTTGGGATTAAA CGGTCTGTTAATTCCAGTTCAGAATATGGTGAATGATGCAGTCGGTTATTTACCAAATATCTTTATTGCGGGCGTCATCA TTTTTGTTGGTTACATATTGGCAAAGATTGTGCGAGGTATTGTAGAAGGGCTAGTTAATAGTGTGGGCCTTCAGCAACAA GCACAAAAAATTGGCTTATTTAAACAAAGCAACATTGGACGTGTACTGGGTTCATTTGTATTTGCTCTAGTCATCATCAC TGCATTGATTGTGGCATTTGAAGCACTGGGTATCGAAACAATTTCTCAGCCAGCAACATCAATGCTGAATGAAATTATGT ATGCGATTCCAAATATCATTGCAGCAGGATTAATCCTGATCATTGCTTATGTGGTATCACGTTTCGTCGCGAATCTGGTG CAGGATATTTTGTCTGGCACTGGTGTTGATGATGTACCTGCAAAATTTGATTTACAGCGCTTTTTAGGCACTACCAAAAT TTCCCAAGTGGTTGCAGTATTGATTGTATTCTTTACTATGCTATTTGCGATTTCCGAAGCAGCAAACCGTCTTGGGTTTG ACCAGATTAGTAACCTGATTACGATCTTTATTGCTTTTGGTGCCAATATCTTGCTGGGTGCGGTCATTCTCGTGATTGGT TTCTGGCTAGCCAATGTCGTTGCGAATGTGGTACAGCGTGGTGAATACAATAGCTCGCGTTGGTTAGGCAATTTGGTCCG TGTGCTGATCATGGGTCTTGTGCTTGCCATGGGCCTTCGTGCCATGGGTATTGCAGACTCGATTGTGAATCTTGCATTCG GTTTAACTTTAGGCGCAGTAGCCGTCGCGTTTGCTTTGGCCTTTGGTTTAGGTGGACGTCAGCCAGCAGAGCGTGTATTG ACTGATCTGATTGATAAAGCCAAGAAGGAAGGTAATCAACCGAACCCTGTAGCTAAAACTGCTGATGTAGACACCAGTTT GGTGCCAAAACCAGTAAGTTCAAGTTCAGATCATGACGTGCCAACAAGTTTTGATGTCGATCCTCAAAACAAGCCATTGA ATAATCCATATGGCTCAAAAGGTGAAGGGGATGATATTTCTCCACCACAATCCGATGATCAACCAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATATGGTGATAGACATCACAAAAATATTTTCTTTATGACTAGAACTATTTTGATTTTATTGTGAGTGAAGTCAAAAACAT AACAAGAGGACATCAACAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTTGATTTTTAAATCAAGATCGGCCACTCTATCATGAGTGGCCGATGTTTTGGTCATCTATAAAAAGAACATAGAGGA GTGAAATAATGGAAAAACAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORF1 [H]
Number of amino acids: Translated: 556; Mature: 556
Protein sequence:
>556_residues MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRLSTATGKTPDFERIVSKFVFW FVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAAAVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPL SENIADIIYWLILLLFLPIVLSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNIIAAGLILIIAYVVSRFVANLV QDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTMLFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIG FWLANVVANVVQRGEYNSSRWLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSKGEGDDISPPQSDDQPK
Sequences:
>Translated_556_residues MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRLSTATGKTPDFERIVSKFVFW FVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAAAVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPL SENIADIIYWLILLLFLPIVLSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNIIAAGLILIIAYVVSRFVANLV QDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTMLFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIG FWLANVVANVVQRGEYNSSRWLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSKGEGDDISPPQSDDQPK >Mature_556_residues MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRLSTATGKTPDFERIVSKFVFW FVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAAAVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPL SENIADIIYWLILLLFLPIVLSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNIIAAGLILIIAYVVSRFVANLV QDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTMLFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIG FWLANVVANVVQRGEYNSSRWLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSKGEGDDISPPQSDDQPK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR008910 [H]
Pfam domain/function: PF05552 TM_helix [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59608; Mature: 59608
Theoretical pI: Translated: 6.31; Mature: 6.31
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRL CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC STATGKTPDFERIVSKFVFWFVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAA CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPLSENIADIIYWLILLLFLPIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNII HHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAGLILIIAYVVSRFVANLVQDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIGFWLANVVANVVQRGEYNSSR HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH WLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSK HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC GEGDDISPPQSDDQPK CCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRL CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC STATGKTPDFERIVSKFVFWFVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAA CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPLSENIADIIYWLILLLFLPIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNII HHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAGLILIIAYVVSRFVANLVQDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIGFWLANVVANVVQRGEYNSSR HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH WLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSK HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC GEGDDISPPQSDDQPK CCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 8144469 [H]