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Definition Acinetobacter sp. ADP1 chromosome, complete genome.
Accession NC_005966
Length 3,598,621

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The map label for this gene is ygxB [H]

Identifier: 50083968

GI number: 50083968

Start: 735373

End: 737043

Strand: Direct

Name: ygxB [H]

Synonym: ACIAD0750

Alternate gene names: 50083968

Gene position: 735373-737043 (Clockwise)

Preceding gene: 50083967

Following gene: 50083975

Centisome position: 20.43

GC content: 41.89

Gene sequence:

>1671_bases
ATGAATGATTTTTTAGGAAATGGGTCATCTCGTGCCCATTATGATCTGATGTATTACTGGGATATTTTTCAGCCCATTAT
CGCTGCGATTGCTGTGTTTATTGTGGGTTGGATTTTAGCTCTTGTCATTGCTGCAGGGATTAAAAAATTACTCAGTGCGA
TTGGGACAAACCATCGTTTGTCTACGGCTACAGGAAAAACGCCTGATTTTGAGAGGATTGTATCCAAGTTTGTCTTCTGG
TTTGTATTGGTTATCGCGCTGATAGCTGCATTAAATGTTTTAAACATTTATAGCGTGAGTGGGCCATTTAGTGCCATGGT
AACTCAGGTACTGGTTTTTGTACCCAACATCATTGCTGCTGCCGTTGTGGGACTGGTGGGATGGATTATTGCACGTTTAG
TACGAGCGGGAATAAGTAATGTACTTGCCAGAACTCAACTTGATGAAAGGCTCAGTTCAGAAGTAGGCGTACGTCCATTA
AGTGAAAATATCGCAGATATTATCTATTGGTTAATTCTTTTACTGTTCCTGCCTATAGTGTTGTCGATCTTGGGATTAAA
CGGTCTGTTAATTCCAGTTCAGAATATGGTGAATGATGCAGTCGGTTATTTACCAAATATCTTTATTGCGGGCGTCATCA
TTTTTGTTGGTTACATATTGGCAAAGATTGTGCGAGGTATTGTAGAAGGGCTAGTTAATAGTGTGGGCCTTCAGCAACAA
GCACAAAAAATTGGCTTATTTAAACAAAGCAACATTGGACGTGTACTGGGTTCATTTGTATTTGCTCTAGTCATCATCAC
TGCATTGATTGTGGCATTTGAAGCACTGGGTATCGAAACAATTTCTCAGCCAGCAACATCAATGCTGAATGAAATTATGT
ATGCGATTCCAAATATCATTGCAGCAGGATTAATCCTGATCATTGCTTATGTGGTATCACGTTTCGTCGCGAATCTGGTG
CAGGATATTTTGTCTGGCACTGGTGTTGATGATGTACCTGCAAAATTTGATTTACAGCGCTTTTTAGGCACTACCAAAAT
TTCCCAAGTGGTTGCAGTATTGATTGTATTCTTTACTATGCTATTTGCGATTTCCGAAGCAGCAAACCGTCTTGGGTTTG
ACCAGATTAGTAACCTGATTACGATCTTTATTGCTTTTGGTGCCAATATCTTGCTGGGTGCGGTCATTCTCGTGATTGGT
TTCTGGCTAGCCAATGTCGTTGCGAATGTGGTACAGCGTGGTGAATACAATAGCTCGCGTTGGTTAGGCAATTTGGTCCG
TGTGCTGATCATGGGTCTTGTGCTTGCCATGGGCCTTCGTGCCATGGGTATTGCAGACTCGATTGTGAATCTTGCATTCG
GTTTAACTTTAGGCGCAGTAGCCGTCGCGTTTGCTTTGGCCTTTGGTTTAGGTGGACGTCAGCCAGCAGAGCGTGTATTG
ACTGATCTGATTGATAAAGCCAAGAAGGAAGGTAATCAACCGAACCCTGTAGCTAAAACTGCTGATGTAGACACCAGTTT
GGTGCCAAAACCAGTAAGTTCAAGTTCAGATCATGACGTGCCAACAAGTTTTGATGTCGATCCTCAAAACAAGCCATTGA
ATAATCCATATGGCTCAAAAGGTGAAGGGGATGATATTTCTCCACCACAATCCGATGATCAACCAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATGGTGATAGACATCACAAAAATATTTTCTTTATGACTAGAACTATTTTGATTTTATTGTGAGTGAAGTCAAAAACAT
AACAAGAGGACATCAACAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTGATTTTTAAATCAAGATCGGCCACTCTATCATGAGTGGCCGATGTTTTGGTCATCTATAAAAAGAACATAGAGGA
GTGAAATAATGGAAAAACAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF1 [H]

Number of amino acids: Translated: 556; Mature: 556

Protein sequence:

>556_residues
MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRLSTATGKTPDFERIVSKFVFW
FVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAAAVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPL
SENIADIIYWLILLLFLPIVLSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ
AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNIIAAGLILIIAYVVSRFVANLV
QDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTMLFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIG
FWLANVVANVVQRGEYNSSRWLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL
TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSKGEGDDISPPQSDDQPK

Sequences:

>Translated_556_residues
MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRLSTATGKTPDFERIVSKFVFW
FVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAAAVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPL
SENIADIIYWLILLLFLPIVLSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ
AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNIIAAGLILIIAYVVSRFVANLV
QDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTMLFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIG
FWLANVVANVVQRGEYNSSRWLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL
TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSKGEGDDISPPQSDDQPK
>Mature_556_residues
MNDFLGNGSSRAHYDLMYYWDIFQPIIAAIAVFIVGWILALVIAAGIKKLLSAIGTNHRLSTATGKTPDFERIVSKFVFW
FVLVIALIAALNVLNIYSVSGPFSAMVTQVLVFVPNIIAAAVVGLVGWIIARLVRAGISNVLARTQLDERLSSEVGVRPL
SENIADIIYWLILLLFLPIVLSILGLNGLLIPVQNMVNDAVGYLPNIFIAGVIIFVGYILAKIVRGIVEGLVNSVGLQQQ
AQKIGLFKQSNIGRVLGSFVFALVIITALIVAFEALGIETISQPATSMLNEIMYAIPNIIAAGLILIIAYVVSRFVANLV
QDILSGTGVDDVPAKFDLQRFLGTTKISQVVAVLIVFFTMLFAISEAANRLGFDQISNLITIFIAFGANILLGAVILVIG
FWLANVVANVVQRGEYNSSRWLGNLVRVLIMGLVLAMGLRAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALAFGLGGRQPAERVL
TDLIDKAKKEGNQPNPVAKTADVDTSLVPKPVSSSSDHDVPTSFDVDPQNKPLNNPYGSKGEGDDISPPQSDDQPK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008910 [H]

Pfam domain/function: PF05552 TM_helix [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59608; Mature: 59608

Theoretical pI: Translated: 6.31; Mature: 6.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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CCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 8144469 [H]