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The map label for this gene is 49480811

Identifier: 49480811

GI number: 49480811

Start: 5166362

End: 5167675

Strand: Reverse

Name: 49480811

Synonym: BT9727_5104

Alternate gene names: NA

Gene position: 5167675-5166362 (Counterclockwise)

Preceding gene: 49479000

Following gene: 49478995

Centisome position: 98.66

GC content: 30.14

Gene sequence:

>1314_bases
ATGAATCATATACAAACAAATTTTTCATCTTTCTTCAGTAAAATAATGATCGGTGCGATGCTCGCATTTTTTGTTTATAG
TTGTTGGTCTGCGTTCGAAACAAGTAAACAGTTTTTTGGAGGCAGTACAACAAGTGTAACAATTGTATTGATTATTTTTG
TTATTCTCATGCTGTTAGTAGCATCGATTTTACAGTACCGTTTTACAGATAAACAATTTCTTATTTTTCTTATCAGTACA
TCTATAGTTGTGAGACTGAGTATGGTTTTATTTGTAGATGTTCCGGTAATCGATGATATGAAAGCTATGTTTGAGTCTGC
AAAGCAGATTGCAATTGGTAATAGCGTAGAGAATGTTGCGCAGTTACCTTTTATTATTTATGAATCAATTATTATTCGTG
TATTTGGCGATACGGTATTCGCATTGCAGCTATTTAATATTTTATTTTGCACAGGGACTGCATTTTTCATTTATCGTATT
GCAGCGATGGTTTTTGGAGAAGAATGCGGCCGTATTGCTTCTGTATTTTATGCTTTATATATTCCAAATATATTTACAAG
TGCTTTATTAACATCAGAATCGCTTGCAATACTTTTATTTTATTTAGCTTGTTACATACTTTTATATAAAGGCTTAGATC
ATCCTTATATGTGGGTGCTTTCAGCAATTTTATTTGCATGTAGTAATATGATTTTTCCAATGGGATTATTTCTCCCTATT
TTTATTGCTGTATATGTGTTGTTAATTGAACTTTTTCAATCACCAATGAAGCAAAAAGTATTATTAAAGATGATAGGGAT
ACTTATTCTATTTTATAGTGCCCATTTTGGTGTGAGTTATGGAATTCAGACAATGGGAATGTCACAATATACGATTTCGA
ATGAGACGTATGTTCAATCTGTTTTAATTGGAAAAGGTAAAAATGAGGAGAAAGTAACAAAGAATCAAAGCGTAACAGAA
CATATTGATCAAAAGCAAAAAGAGATTGAAGAAGAAAGATTTAAACTTTTAAAACCAGTAATTAATCAATTATCAGATGA
GGGAATACATTCTATTTTATTTAAATGTGAAAAGCTTATATATATAGCGGTAACATTGTTTATGTCGATAGCTTTATTAC
ACTTTCTTATTAAGAAACAACAAAACGAAGGATATATGTTGTTCTTATTGTTAATTAGCGGATATGTATTGTTAAGACTC
TTCCAAGTAAATATGGCATACTACAATCTTATTGTGCCAGCCTTGTTTATTTTGCAAAGCTTTGGTGTTTATATGAGTTA
TGTGTACTGTCAAAAAATATTCTTCAGAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTATGACTCTGTATTTGTCATATAAATTCCCTATCAGCTGTGTACCTATTCGTGATAGAATCGTTTTGTTATGAATGGA
AATAGAGGTGCAATGGACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGAATCCAGTTTGGATTCTTTTTTTTCATGGAAGATGAGGACTGAGAGTCAGCAGAGATGAAGAATCTCTACTGACAT
AAGCTTCAATCTATCGGTTG

Product: permease

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 437; Mature: 437

Protein sequence:

>437_residues
MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIST
SIVVRLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI
AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAILLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI
FIAVYVLLIELFQSPMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQSVLIGKGKNEEKVTKNQSVTE
HIDQKQKEIEEERFKLLKPVINQLSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL
FQVNMAYYNLIVPALFILQSFGVYMSYVYCQKIFFRK

Sequences:

>Translated_437_residues
MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIST
SIVVRLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI
AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAILLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI
FIAVYVLLIELFQSPMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQSVLIGKGKNEEKVTKNQSVTE
HIDQKQKEIEEERFKLLKPVINQLSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL
FQVNMAYYNLIVPALFILQSFGVYMSYVYCQKIFFRK
>Mature_437_residues
MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIST
SIVVRLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI
AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAILLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI
FIAVYVLLIELFQSPMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQSVLIGKGKNEEKVTKNQSVTE
HIDQKQKEIEEERFKLLKPVINQLSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL
FQVNMAYYNLIVPALFILQSFGVYMSYVYCQKIFFRK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50062; Mature: 50062

Theoretical pI: Translated: 8.41; Mature: 8.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
5.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASILQYRFTDKQFLIFLISTSIVVRLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVA
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
QLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRIAAMVFGEECGRIASVFYALY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPNIFTSALLTSESLAILLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIAVYVLLIELFQSPMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCEEECCHHHHHH
VLIGKGKNEEKVTKNQSVTEHIDQKQKEIEEERFKLLKPVINQLSDEGIHSILFKCEKLI
HHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRLFQVNMAYYNLIVPALFILQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGVYMSYVYCQKIFFRK
HHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA