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The map label for this gene is ycgO [C]

Identifier: 49478682

GI number: 49478682

Start: 4337059

End: 4338849

Strand: Reverse

Name: ycgO [C]

Synonym: BT9727_4275

Alternate gene names: 49478682

Gene position: 4338849-4337059 (Counterclockwise)

Preceding gene: 49481789

Following gene: 49481626

Centisome position: 82.84

GC content: 36.85

Gene sequence:

>1791_bases
ATGGTTGAATCACTTTTACTTAGTATCGTTATTATCATTACGTTAGGTATTGCTTCACAATGGACTGCATGGCGCTTCCA
GCTCCCTGCGATTGTTGTTATGGCAGTTGCTGGATTATTAATTGGTCCGGTTTTCGGTATTATTAATCCAAAAGAGGTGC
TTGGAGATGTTTTTAGTCCACTCGTATCACTCTCTGTTGCGATTATATTGTTTGAGGGTAGTTTAAGTTTAGATATACGT
GAACTGAGGGGGCTATCGAAACCAGTATTTCGTATCGTTACGTTTGGAGCGTTTATCGCGTGGATTGCTGGCTCACTTGC
AGCTCATTACGTCGCTGGATTAGATTGGGCGGTTGCATTTATTATTGGGGGACTTTTTATTGTGACAGGTCCAACGGTAA
TTATTCCGTTGTTACGCCAAGCGCGATTAAAACCAAGAACAGCAGCAATTTTAAAATGGGAAGGGATTATCGTTGATCCA
TTTGGCGCTTTGCTTGCTGTATTCGCCTTTCAAATTGTAAATTTCTTAACGAAAGAAAATGTACAATTACATACGTTGCT
GTATTTCTTTGCAGGTTCATTATTTGCAATGGTACTCGGTTATATATTTAGTATTTTTATGAGCTATATGATTTTAAAGG
GGAAAGTACCAGAATATTTAAAAGCACCAATTTTGTTAGTTACGGTACTGTTATGCTTTGGCATTGCGGATGAGGTGATG
CATGAAACAGGTATGCTAGCTGTAACAGTAATGGGGATTACGCTTGCGCGGATGAAAAAATATATTTCTTCTATCGGTGA
TATTCGTCATTTTAACGAAAATATTTCTGTACTATTAACGTCGACTGTTTTTATTATATTAACAGCATCGCTTCCAAGAA
CAACGATTATGGAGATTTTCAGCTGGCCTATTATAAGCTTCGTACTTATGATGCTATTTGTTGTACGCCCTTTATCGATT
TGGATATCGACAATCGGCACAGAGTTAACAAAAGCAGAACGGGCGCTAGTTGGCTGGATTGCGCCGCGAGGTATTGTTGC
ATTAACGGTTTCAAGTTACTTTGCGACGGAGTTATTACAAGAAGGTTATAAAGATGCTTCTATATTAACGGCACTTACAT
TTGCACTCGTTATTACGACCGTTTGTGCTCATGGATTTTCAATTGGATTTTTAGCGAAAAGATTAGGATTGGCGAATACG
GAGCCACCAGGAATTTTAATTTCAGGTGCGAGTACATTCTCATCTGCTTTTGCATTGCACTGTAAAGAGATGGGTGTTCC
GAGCTTAATTGTAGATGTATCAGAAGAGCATTTGCAATGTGCAAAGGTGAAAGGGCTTAATACATATAATGGTCAAGTAC
TCTCTGAACAGTTACAATTTGAAGTTGATATGAATCAGTATGAATACTTAATTGCAGTTACAGATACGGATTCTTATAAT
GTATTAGTCGCAAATACATACGTACCACAGTTTGGACATCATAATACATTTTTACTTCCAATCCATGATGTAGAAAAGAT
TGAACAAGAACGCATTTCCCTTTCGAAAAAAGCTCATTTACTGTTTGGTCAAAATGAAATTTATGAAGAATTAAATAGAA
AAATTGAAGATGGTTATACGTTTAAAACGATACAAGTTGCAGAAGAACAAAAGATTAATAAAGAAGAAAGCGATTCAGAG
GATTTAATATTATTTATTCGCCATCGAGATGGTAGTCTTACTTTTTCAACATTGTATAAATATATAGCTGTTATGCCAGG
GGATGAGCTAGTTGTACTAGCAAAGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTTGATTATATATTATGTAAATAGAATTAATTGAAAATATATAGAAGTAAAGTATGGTTTATACTTTGCTGTCGCAATA
CTATGAACAAGGAGGGCATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGGTATAGTGAAACGAGGCTGTTTTTCAGTCTCGTTTTTTAAGTGCTTCCTATAAAGAAAGCATGCAAATGGAAAGGA
AGTTTTTATATGCGATCAGA

Product: Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)

Products: NA

Alternate protein names: MjNhaP1 [H]

Number of amino acids: Translated: 596; Mature: 596

Protein sequence:

>596_residues
MVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDVFSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIR
ELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGSLAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPLLRQARLKPRTAAILKWEGIIVDP
FGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVPEYLKAPILLVTVLLCFGIADEVM
HETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIMEIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSI
WISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALVITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANT
EPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQLQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYN
VLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIEDGYTFKTIQVAEEQKINKEESDSE
DLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ

Sequences:

>Translated_596_residues
MVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDVFSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIR
ELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGSLAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPLLRQARLKPRTAAILKWEGIIVDP
FGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVPEYLKAPILLVTVLLCFGIADEVM
HETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIMEIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSI
WISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALVITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANT
EPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQLQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYN
VLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIEDGYTFKTIQVAEEQKINKEESDSE
DLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ
>Mature_596_residues
MVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDVFSPLVSLSVAIILFEGSLSLDIR
ELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGSLAAHYVAGLDWAVAFIIGGLFIVTGPTVIIPLLRQARLKPRTAAILKWEGIIVDP
FGALLAVFAFQIVNFLTKENVQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVPEYLKAPILLVTVLLCFGIADEVM
HETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIMEIFSWPIISFVLMMLFVVRPLSI
WISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQEGYKDASILTALTFALVITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANT
EPPGILISGASTFSSAFALHCKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQLQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYN
VLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIEDGYTFKTIQVAEEQKINKEESDSE
DLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ

Specific function: This is a Na(+)/H(+) antiporter. Can also transport lithium [H]

COG id: COG0025

COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65920; Mature: 65920

Theoretical pI: Translated: 6.10; Mature: 6.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDVFSP
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LVSLSVAIILFEGSLSLDIRELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGSLAAHYVAGLDWAVAF
HHHHHHEEEEEECCCCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIGGLFIVTGPTVIIPLLRQARLKPRTAAILKWEGIIVDPFGALLAVFAFQIVNFLTKEN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVPEYLKAPILLVTVLLCFGIADEVM
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIMEIF
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHH
SWPIISFVLMMLFVVRPLSIWISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
EGYKDASILTALTFALVITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANTEPPGILISGASTFSSAFALH
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
CKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQLQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYN
HHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEECCCCCE
VLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIEDGYT
EEEEECCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHCCCE
FKTIQVAEEQKINKEESDSEDLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ
EEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MVESLLLSIVIIITLGIASQWTAWRFQLPAIVVMAVAGLLIGPVFGIINPKEVLGDVFSP
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LVSLSVAIILFEGSLSLDIRELRGLSKPVFRIVTFGAFIAWIAGSLAAHYVAGLDWAVAF
HHHHHHEEEEEECCCCEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIGGLFIVTGPTVIIPLLRQARLKPRTAAILKWEGIIVDPFGALLAVFAFQIVNFLTKEN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VQLHTLLYFFAGSLFAMVLGYIFSIFMSYMILKGKVPEYLKAPILLVTVLLCFGIADEVM
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HETGMLAVTVMGITLARMKKYISSIGDIRHFNENISVLLTSTVFIILTASLPRTTIMEIF
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHH
SWPIISFVLMMLFVVRPLSIWISTIGTELTKAERALVGWIAPRGIVALTVSSYFATELLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
EGYKDASILTALTFALVITTVCAHGFSIGFLAKRLGLANTEPPGILISGASTFSSAFALH
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
CKEMGVPSLIVDVSEEHLQCAKVKGLNTYNGQVLSEQLQFEVDMNQYEYLIAVTDTDSYN
HHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEECCCCCE
VLVANTYVPQFGHHNTFLLPIHDVEKIEQERISLSKKAHLLFGQNEIYEELNRKIEDGYT
EEEEECCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHCCCE
FKTIQVAEEQKINKEESDSEDLILFIRHRDGSLTFSTLYKYIAVMPGDELVVLAKQ
EEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]