| Definition | Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005957 |
| Length | 5,237,682 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 49478196
Identifier: 49478196
GI number: 49478196
Start: 3207819
End: 3210308
Strand: Reverse
Name: 49478196
Synonym: BT9727_3141
Alternate gene names: NA
Gene position: 3210308-3207819 (Counterclockwise)
Preceding gene: 49478197
Following gene: 49481596
Centisome position: 61.29
GC content: 29.64
Gene sequence:
>2490_bases ATGATAAAATCAGTACGAGGATTAAGTTTACGCTTTTTTAAGACGAATAAATTCACTGCTATTTCCTCTATAGTTAGCGT TATGTTGGCTGTTTCTCTAATTGTTACGATGATTGTATTTTCGAGTCATGCGAAACAGTCTGTTATAAATGAAGTGAAAA ATGTATACGGAGATATGGATTTATCTGTTGGATATAACCCTGATCAAAATAAGTTGATGGATAAATCTTTACTGCAAAAT ATTAAGGAACAAGAAAATGTTGAATACATGTCAAAAGTATTAGTAAATCATTTGCAAGTAAATAAATTGAATACAGCTAT TTATACAGTAGGTGTTCAAAATGATTCATTATCTAAAAGTCGATATCACTTTTCTAAAAATCTATCAAATGAGGAAGTAA CATTAAATGATGGATTAGCAGAAACTTTACAAGTAAAAGTTGGGGAAAAGATTGAAATCGAAAATAAATCATATGTAGTA AAAGAAGTGTTGCCTGATATAGAAGCTGGAGGTTCAGCTCCAGATATACTTATTTTGTCTGAAGGTGCGATGAAACAGCA CGTATATGAAAAAACGGGTAAACACAATGAAGCTACTTATTTGTTAATAAAAGCAAAAGAGAATGCAGATGTACTAGCAT TGTCTAGTGAAATTCATAAAATAGACAGAGAATTAAGAATCGATATTGCGGAGGAAGACGAGTTTTTAAAAAGTAATTTA GCATCATTACATATTTTTATAATCGTTTTATCTACATTAATACTTATTGTTACTGCGTTATTGTTGGTGTCTAATTTTGA AGTGTTTTTATATAAATATAAAAGTCAATTTGCTATTATGCGATCAATGGGAGCAACAACGAAACAAATGTTTAAAGTTA TATTTATTCAATGTAGTGTAATCAATTTCTTTGGTGGAATATTAGGTTTGTTATTAGCTGTAATAAGTAACCGTTTTTTA CAAAGTTGGCTAGAGCATGTATTTGCTTTTCAAATTAATTCAATGAATTTTGATTATAAAATAGCAATTGTAACATTGAT TTTTAGTATCTTTTTTATTGAACTGTTTATGTTATATCCGTCATACAGAAGTTCGAAAATATTGCCAGTAAAGCTTATGC GGGAGAATGAAGAATCCGATTTTTCTAATAAAAAAATACGCAGTATTATGGGGAAATTCCTTTTAATGAGTAGCGTATTT TTAACTGTTTTAGGTGGGTTTGTAGCAAATACGGGAGATACGCAGGCAATAGTGATATTAATAGGAGCTATATTTCTCGT TTTAGGAGTATATATTTTATTTCCGACTTATCTCTCTTCGATATTAATAGCATGTCTACCTATAATGAAAAAAATATTTG GAAGGAATACATTTGTTGCTATTAAAAATGTAATTCCGCAAGTAAGAAAAAATACATTTGTTATCTTAATGATAAGTACA ATGATGGTGATAGTGGTCTTCGGGTCCACTATATTTAAAACGATGCAAAAAAATAATGAAAGATATTTACAACGAGAATT TCCAACACATATTGTTGTGGAAAATCGTTTGAATAATGATTCAACAATTTCCTCACCTCATATACAAAATATATTTAAAG AAATAAGTAGCGTAAAAGGAGCTAGTACGATTAGTACGAACTCACTGGCAGAATTAAAGCAAGGTGAAAAATATATTACT TTTGACTATAATCTAGGTGATGTAAAGGAAATGGAAAAGCAAGGATTACTGCCAGAAGTGTCTGCAAATTTAGAGAATAG TATAATTGTTACAGAAGAGTTAGCGGGGCGATATAAACTTCATGTAGGGGATATCGTTCAATTGGGTCTATTTTCAGAAC AGGAACAAAAAGTTAGACCGACTGGTAAGGTAGAAGTTGGATTAATTGTTAACGAGCTACCGAATTCTCCTTCGGTACTC ATGGATTGGAGTAATGTAACATATAAACAAGATTATACAGTTTTTGAGCGTGCATTTATTAGTTCAAATAATGAAAGAGA GACGTTGGAGCAATTAAAGAAACTTAAAGGTCAATATCCACAATTAAAAATAAGTAGTTATACTCAATCATTAAAACAAT CTAATTTAATGTTTCAGCAAAGGTGGTCCATTTTTATCGTTGTTATTGTAGTAATTTTGTTTAGTATAACATTAGGGGTA TGTAATACACTTATAAATAATATTCAATCTAAAAGAAAAGAGTTTGCTATTTTACGAGCAATAACAGTTAAGAAAAAAGG GATTGTACAAATTATTTTGACGCAAGTTAATTTATATGTATTTATTGGAATCGTACTAGGGGCTGTTATAGGAGCATTAT TAACCTATATGGTAAGTATAATAGATCGTACACCTTTATTTTTTGATTTCAAACTTATCGTAACGGTAATAGCGGGGATG TTTGGAATAGTCTTTATTATTTTTATACCTTTTGCTAATAGAATAGGAAAAAGGGACATTGTAGAAGAGTTAAATAAGGA TAATAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCATAATGGAGAAGTTGTTGATGATTGTACGTGTTCTCATGGAGTAAATGATATGAAGATTATTTTAGATAAATTCAAA AAATTAATGGAGAAATCAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGAGGTTAACCCAAGTTGCTATTCAGCTACTTTTGGGTCAATCTCTCTTTTTATTAAAAGTTGATTTTCATATTGGTGT ACTCATTCATAAATGTATAG
Product: ABC transporter permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 829; Mature: 829
Protein sequence:
>829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGYNPDQNKLMDKSLLQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNLSNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGILGLLLAVISNRFL QSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVF LTVLGGFVANTGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKLHVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLIVTVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK
Sequences:
>Translated_829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGYNPDQNKLMDKSLLQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNLSNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGILGLLLAVISNRFL QSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVF LTVLGGFVANTGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKLHVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLIVTVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK >Mature_829_residues MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMDLSVGYNPDQNKLMDKSLLQN IKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKSRYHFSKNLSNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVV KEVLPDIEAGGSAPDILILSEGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSVINFFGGILGLLLAVISNRFL QSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYPSYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVF LTVLGGFVANTGDTQAIVILIGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKGASTISTNSLAELKQGEKYIT FDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKLHVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVL MDWSNVTYKQDYTVFERAFISSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSIIDRTPLFFDFKLIVTVIAGM FGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK
Specific function: Unknown
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 93724; Mature: 93724
Theoretical pI: Translated: 9.58; Mature: 9.58
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMD CCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSVGYNPDQNKLMDKSLLQNIKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKS EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECEEEEEEEECCCCCCHH RYHFSKNLSNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVVKEVLPDIEAGGSAPDILILS HHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHEECCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC EGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHH ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH INFFGGILGLLLAVISNRFLQSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVFLTVLGGFVANTGDTQAIVIL CCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH IGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC ASTISTNSLAELKQGEKYITFDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKL CCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEHHHCCCEEE HVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVLMDWSNVTYKQDYTVFERAFI EHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH SSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDRTPLFFDFKLIVTVIAGMFGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MIKSVRGLSLRFFKTNKFTAISSIVSVMLAVSLIVTMIVFSSHAKQSVINEVKNVYGDMD CCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSVGYNPDQNKLMDKSLLQNIKEQENVEYMSKVLVNHLQVNKLNTAIYTVGVQNDSLSKS EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECEEEEEEEECCCCCCHH RYHFSKNLSNEEVTLNDGLAETLQVKVGEKIEIENKSYVVKEVLPDIEAGGSAPDILILS HHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHEECCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC EGAMKQHVYEKTGKHNEATYLLIKAKENADVLALSSEIHKIDRELRIDIAEEDEFLKSNL CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHH ASLHIFIIVLSTLILIVTALLLVSNFEVFLYKYKSQFAIMRSMGATTKQMFKVIFIQCSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH INFFGGILGLLLAVISNRFLQSWLEHVFAFQINSMNFDYKIAIVTLIFSIFFIELFMLYP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYRSSKILPVKLMRENEESDFSNKKIRSIMGKFLLMSSVFLTVLGGFVANTGDTQAIVIL CCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH IGAIFLVLGVYILFPTYLSSILIACLPIMKKIFGRNTFVAIKNVIPQVRKNTFVILMIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH MMVIVVFGSTIFKTMQKNNERYLQREFPTHIVVENRLNNDSTISSPHIQNIFKEISSVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC ASTISTNSLAELKQGEKYITFDYNLGDVKEMEKQGLLPEVSANLENSIIVTEELAGRYKL CCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEHHHCCCEEE HVGDIVQLGLFSEQEQKVRPTGKVEVGLIVNELPNSPSVLMDWSNVTYKQDYTVFERAFI EHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH SSNNERETLEQLKKLKGQYPQLKISSYTQSLKQSNLMFQQRWSIFIVVIVVILFSITLGV CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CNTLINNIQSKRKEFAILRAITVKKKGIVQIILTQVNLYVFIGIVLGAVIGALLTYMVSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDRTPLFFDFKLIVTVIAGMFGIVFIIFIPFANRIGKRDIVEELNKDNK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]