| Definition | Bartonella henselae str. Houston-1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005956 |
| Length | 1,931,047 |
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The map label for this gene is 49475110
Identifier: 49475110
GI number: 49475110
Start: 380994
End: 383294
Strand: Reverse
Name: 49475110
Synonym: BH03060
Alternate gene names: NA
Gene position: 383294-380994 (Counterclockwise)
Preceding gene: 49475111
Following gene: 49475109
Centisome position: 19.85
GC content: 43.89
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTGCCATTGTGTTCCATTGGTCCCTTTCAGAGATGATGGAAATGGAACCACAAGAACTCATATTCTGGCGAAAACAAGCA GCAGAAAGGTATAAGACAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACATCATGATGTTAGCTTTGGGTGGTTTTATTTTTTCCATTGAAACGGCCGCTTATCAAACCCTTGACATGTCTTATGGC ATTCCATGGGTGGAGCAAGG
Product: Phage tail protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 766; Mature: 765
Protein sequence:
>766_residues MSEKVADAKVKLSLEDELTAPLKRVQKQFDTLSKKLSHSLGIPRFSAAVQNMTKSLHGVQGALSTAASRASVFTGVLGLA GGGLVASVTALTMKTMHLGDSLHHASHHLGMSVASLQLWGDAADNSGYSAELFQQSLATLNRRSAQAYAGQKRGMMGFDA LGISVKNASGKLKSNSVLLEEITDKMSKMKNQAQRQHIAALLFGGDGKEMASMLSQGMAPIKELFAKARKGKWLIGADVA RYAADLSDKLGAFKKKIGGIASFIGARFMPVINDMVDGFSKLIDENRDLIQTTVARWAKTLRKVLQDLLNPTSDLRKGIS DLTERIKGWFRWLEPLIGEITLFKVGLVALGSFIFGPLIAALAAVGAAFVSLGITIMTTPIGWIIGGITALVAAGYLLYK NWDKINGWLLTSLAIVSAVFIRLAFALSGPVLAAFTSVGSKITGLAVNLGKSLLSKIVAADKAFIRFSATLGRSLLSALA SAASAVASLALTLVGTLISAITAVGSAFISLGVAIMTTPIGWILGGIAALVAAGYLLYKNWDTVISFISKLWDSFASLCS NAFNNLFALFKNFSPLSWISKKINELIEWLFGVDLMAAGTNLINGLWEGIKSKWNALSDWLSGMMRKLTSWMPNWMKEKL GFNVSINKTSTETIKTFTEETNTRAKKMLDTAVVTNTPPEKRKSGFNTGIVEAGQMQATNTKVGAFKAPKPITVHKPVEI DARVMISNLNISVPNGLKDEIRAAVNQALERYAKQQRLAIASSLSD
Sequences:
>Translated_766_residues MSEKVADAKVKLSLEDELTAPLKRVQKQFDTLSKKLSHSLGIPRFSAAVQNMTKSLHGVQGALSTAASRASVFTGVLGLA GGGLVASVTALTMKTMHLGDSLHHASHHLGMSVASLQLWGDAADNSGYSAELFQQSLATLNRRSAQAYAGQKRGMMGFDA LGISVKNASGKLKSNSVLLEEITDKMSKMKNQAQRQHIAALLFGGDGKEMASMLSQGMAPIKELFAKARKGKWLIGADVA RYAADLSDKLGAFKKKIGGIASFIGARFMPVINDMVDGFSKLIDENRDLIQTTVARWAKTLRKVLQDLLNPTSDLRKGIS DLTERIKGWFRWLEPLIGEITLFKVGLVALGSFIFGPLIAALAAVGAAFVSLGITIMTTPIGWIIGGITALVAAGYLLYK NWDKINGWLLTSLAIVSAVFIRLAFALSGPVLAAFTSVGSKITGLAVNLGKSLLSKIVAADKAFIRFSATLGRSLLSALA SAASAVASLALTLVGTLISAITAVGSAFISLGVAIMTTPIGWILGGIAALVAAGYLLYKNWDTVISFISKLWDSFASLCS NAFNNLFALFKNFSPLSWISKKINELIEWLFGVDLMAAGTNLINGLWEGIKSKWNALSDWLSGMMRKLTSWMPNWMKEKL GFNVSINKTSTETIKTFTEETNTRAKKMLDTAVVTNTPPEKRKSGFNTGIVEAGQMQATNTKVGAFKAPKPITVHKPVEI DARVMISNLNISVPNGLKDEIRAAVNQALERYAKQQRLAIASSLSD >Mature_765_residues SEKVADAKVKLSLEDELTAPLKRVQKQFDTLSKKLSHSLGIPRFSAAVQNMTKSLHGVQGALSTAASRASVFTGVLGLAG GGLVASVTALTMKTMHLGDSLHHASHHLGMSVASLQLWGDAADNSGYSAELFQQSLATLNRRSAQAYAGQKRGMMGFDAL GISVKNASGKLKSNSVLLEEITDKMSKMKNQAQRQHIAALLFGGDGKEMASMLSQGMAPIKELFAKARKGKWLIGADVAR YAADLSDKLGAFKKKIGGIASFIGARFMPVINDMVDGFSKLIDENRDLIQTTVARWAKTLRKVLQDLLNPTSDLRKGISD LTERIKGWFRWLEPLIGEITLFKVGLVALGSFIFGPLIAALAAVGAAFVSLGITIMTTPIGWIIGGITALVAAGYLLYKN WDKINGWLLTSLAIVSAVFIRLAFALSGPVLAAFTSVGSKITGLAVNLGKSLLSKIVAADKAFIRFSATLGRSLLSALAS AASAVASLALTLVGTLISAITAVGSAFISLGVAIMTTPIGWILGGIAALVAAGYLLYKNWDTVISFISKLWDSFASLCSN AFNNLFALFKNFSPLSWISKKINELIEWLFGVDLMAAGTNLINGLWEGIKSKWNALSDWLSGMMRKLTSWMPNWMKEKLG FNVSINKTSTETIKTFTEETNTRAKKMLDTAVVTNTPPEKRKSGFNTGIVEAGQMQATNTKVGAFKAPKPITVHKPVEID ARVMISNLNISVPNGLKDEIRAAVNQALERYAKQQRLAIASSLSD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82128; Mature: 81997
Theoretical pI: Translated: 10.62; Mature: 10.62
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSEKVADAKVKLSLEDELTAPLKRVQKQFDTLSKKLSHSLGIPRFSAAVQNMTKSLHGVQ CCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GALSTAASRASVFTGVLGLAGGGLVASVTALTMKTMHLGDSLHHASHHLGMSVASLQLWG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCHHHHHHHEEC DAADNSGYSAELFQQSLATLNRRSAQAYAGQKRGMMGFDALGISVKNASGKLKSNSVLLE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCEEEECCCCCCCCCCHHHH EITDKMSKMKNQAQRQHIAALLFGGDGKEMASMLSQGMAPIKELFAKARKGKWLIGADVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHH RYAADLSDKLGAFKKKIGGIASFIGARFMPVINDMVDGFSKLIDENRDLIQTTVARWAKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH LRKVLQDLLNPTSDLRKGISDLTERIKGWFRWLEPLIGEITLFKVGLVALGSFIFGPLIA HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALAAVGAAFVSLGITIMTTPIGWIIGGITALVAAGYLLYKNWDKINGWLLTSLAIVSAVF HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRLAFALSGPVLAAFTSVGSKITGLAVNLGKSLLSKIVAADKAFIRFSATLGRSLLSALA HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAASAVASLALTLVGTLISAITAVGSAFISLGVAIMTTPIGWILGGIAALVAAGYLLYKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC WDTVISFISKLWDSFASLCSNAFNNLFALFKNFSPLSWISKKINELIEWLFGVDLMAAGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLINGLWEGIKSKWNALSDWLSGMMRKLTSWMPNWMKEKLGFNVSINKTSTETIKTFTEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH TNTRAKKMLDTAVVTNTPPEKRKSGFNTGIVEAGQMQATNTKVGAFKAPKPITVHKPVEI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCC DARVMISNLNISVPNGLKDEIRAAVNQALERYAKQQRLAIASSLSD CHHEEEEECCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SEKVADAKVKLSLEDELTAPLKRVQKQFDTLSKKLSHSLGIPRFSAAVQNMTKSLHGVQ CCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH GALSTAASRASVFTGVLGLAGGGLVASVTALTMKTMHLGDSLHHASHHLGMSVASLQLWG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCHHHHHHHEEC DAADNSGYSAELFQQSLATLNRRSAQAYAGQKRGMMGFDALGISVKNASGKLKSNSVLLE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCEEEECCCCCCCCCCHHHH EITDKMSKMKNQAQRQHIAALLFGGDGKEMASMLSQGMAPIKELFAKARKGKWLIGADVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHH RYAADLSDKLGAFKKKIGGIASFIGARFMPVINDMVDGFSKLIDENRDLIQTTVARWAKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH LRKVLQDLLNPTSDLRKGISDLTERIKGWFRWLEPLIGEITLFKVGLVALGSFIFGPLIA HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALAAVGAAFVSLGITIMTTPIGWIIGGITALVAAGYLLYKNWDKINGWLLTSLAIVSAVF HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRLAFALSGPVLAAFTSVGSKITGLAVNLGKSLLSKIVAADKAFIRFSATLGRSLLSALA HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAASAVASLALTLVGTLISAITAVGSAFISLGVAIMTTPIGWILGGIAALVAAGYLLYKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC WDTVISFISKLWDSFASLCSNAFNNLFALFKNFSPLSWISKKINELIEWLFGVDLMAAGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLINGLWEGIKSKWNALSDWLSGMMRKLTSWMPNWMKEKLGFNVSINKTSTETIKTFTEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHH TNTRAKKMLDTAVVTNTPPEKRKSGFNTGIVEAGQMQATNTKVGAFKAPKPITVHKPVEI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCC DARVMISNLNISVPNGLKDEIRAAVNQALERYAKQQRLAIASSLSD CHHEEEEECCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA