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The map label for this gene is yabM [H]

Identifier: 49183863

GI number: 49183863

Start: 893202

End: 894722

Strand: Direct

Name: yabM [H]

Synonym: BAS0839

Alternate gene names: 49183863

Gene position: 893202-894722 (Clockwise)

Preceding gene: 49183860

Following gene: 49183864

Centisome position: 17.08

GC content: 35.04

Gene sequence:

>1521_bases
ATGAATAATAAGTTTGTGAAAGGCGCTGCGATTTTAACGATTACAACGTTTCTATCGAAAGTGTTGGGAAGTTTTTTTCA
AATCCCATTACAAAATATAGCAGGAGATGAAGTGCTTGGGATTTTCCGCCTTGTTTTTCCTGTGTATATGATAGCTTTAA
CTTTATCAGTAGCGGGAGTACCGCTAGCTATATCAAAGTTAATCGCTGAACTTCATGAGAAGAATGACCAGGACGGAATT
GCCAAACTATTTACTTCAGCATCTATTATTGGAGTAATATTTGGAGTGCTTGGATTTTCAGTTATTATGATTGGATCGAG
TATGTTTGCAAATATGCTTGGTGGACAAGATACGAGACTCCCATTAATTGTCACTTCGTTTGCGTTATTAATCGCACCGT
ATATGGCGGTATATCGAGGGTATTTCCAAGGTTTTGGAGATATGATTCCTACCGGGGTGTCACAAGTAATTGAGCAGTTC
ATTCGTGTTTTCTTTATGTTAGCAATTGCATTCTTATTTGTATATTGGAATAAAGAGAGTGATGTTGTAGCAGGCGGAGC
AATGATTGGCTCTTGCCTTGGGGTAATTACGTCACTGATCTATTTGAGATTGAAGTATGTAAAAAGTATATATCGTTATA
AAAGTAATACATATTCACTACAAGATTTTAAAGATAATGCAAAAAAGATACTTCAGGTTTCGATTCCAATTGCAATTGGG
GCATTATCGATGCCGGTGTTAAATTTAGTTGATTCTGTAACGATTCCACATATGTTGCATGAATCCACTACAACGATTCA
AGAACAATTTGGTATATATAGTCGTGGCTTTGCGTTTACACAATTAATTGTCGTGTTTGCAAGTGCGATGGTATTTCCAT
TAATTCCGTTGTTAACAGCTGCATTAACAAAGAAAGATATAGCGTTAGCCAAACAAACAATTGAACGAACAAATGATCTT
GCTCATGTTTTAACAACGCCGATAACAATCTGGCTCATGGCACTTACAATCCCGTTAAATGTTGGATTGTTTACAGATGC
TAAAGGGAGTGGAATGTTAGCTATTTTAATTGGTAGTTCGTATTTTACGTCACTTATGGTATTATCAATAGGGATTTTGC
AAGGAATTAACCGTTCTAAGCAAGCGGCGTGGATAGTTGTTGGAGCGAGTTTTGTAAAAGTCATATTAAATATAGTACTT
GTAAGTCAATTTGGCATAACTGGTGCGGCTTATAGTACACTTATCATATATATCATGATTTGTATCGTAAATTATATATA
CATTCGAAAAGAATTGGCTTATTCGATTCACATGGGGAGATTTTTTGCTGTAATTGGGGTATCTAGTATAGTAGGTATAG
GATTATATTTCACATCTACTTTCATAAATGTGGTAGATTCTAGAATTATTACAATAATATATAGTGGTTTAGCGTTTTGT
GTAGCCTTGTTCATATATGGCATATGCGCATTAAAGTTGAACTGGATATCTAAAAAGCAAATCCCATTTTTACGTAAGTA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGATAAAGTGAAATTTTTCAAAAAAGAGAAGAATATAGCTATCTCGTTTTATGATGTAATATGTATAGAAATTATATAT
TCAAAGAAAAGAGCTAGAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAGTCCATAAATGAGTATGGCTATTTATATGTTTGTGAAAGAAATCAATTTGAAGTTATCCAACTTTTCTTATTAAAG
AGTTGATAGCAATTTGTTGC

Product: polysaccharide biosynthesis protein CsaA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 506; Mature: 506

Protein sequence:

>506_residues
MNNKFVKGAAILTITTFLSKVLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDQDGI
AKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQF
IRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVAGGAMIGSCLGVITSLIYLRLKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAIG
ALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASAMVFPLIPLLTAALTKKDIALAKQTIERTNDL
AHVLTTPITIWLMALTIPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVL
VSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRIITIIYSGLAFC
VALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK

Sequences:

>Translated_506_residues
MNNKFVKGAAILTITTFLSKVLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDQDGI
AKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQF
IRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVAGGAMIGSCLGVITSLIYLRLKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAIG
ALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASAMVFPLIPLLTAALTKKDIALAKQTIERTNDL
AHVLTTPITIWLMALTIPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVL
VSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRIITIIYSGLAFC
VALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK
>Mature_506_residues
MNNKFVKGAAILTITTFLSKVLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDQDGI
AKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQF
IRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVAGGAMIGSCLGVITSLIYLRLKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAIG
ALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASAMVFPLIPLLTAALTKKDIALAKQTIERTNDL
AHVLTTPITIWLMALTIPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVL
VSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRIITIIYSGLAFC
VALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55441; Mature: 55441

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]