Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46447180

Identifier: 46447180

GI number: 46447180

Start: 1851903

End: 1854593

Strand: Direct

Name: 46447180

Synonym: pc1546

Alternate gene names: NA

Gene position: 1851903-1854593 (Clockwise)

Preceding gene: 46447176

Following gene: 46447181

Centisome position: 76.7

GC content: 34.08

Gene sequence:

>2691_bases
ATGAAAAAATGCCTGTTTTTCTTTTTTTATATTATTAGCTGCAGAACCTTTCTATCAGCAGAGTTGGCAGATTTAAATTC
CTCGAAAAAATTTCTACATGCTGAAAGGTTAAAAGCTGAAGGACACTATGAAGATGCTCTGCACTATTATTTTTTCATGG
ATGAACATTTTGAAACGACACCTGAGCTTTGTCAATCAATGCATCTATCACAAGCTCACTGCCTCTTAGAATTACATCAA
CCTGAGCTCGCTATTGATTTATTGACTCAGGATTCCAACCCTCACTCCCCCTATCAAAACTATTTGATTGGCCTAGCCTA
TCGACAACAGAAAAATTATCAATTAGCTTTGAATATTTTAAATACAATAGATAGTAATCGAGACACTGCATTAGGTGATA
AAATCAATTTTGAAAAAGGGATCAATTACTTTTATTTAGGAAAGTCAAAAGATTCCGCTTTTTTTTTAAAAAAAATTGAG
TGGTCTCCCTTTGAGCCAACTATGTATTATTTATCAAAGCTTTATCTCATTAGAATGGCTTTATTAAATAAAGAAACTTC
TTCCGCAAAGGCTTCCCTTTTACATTTGCACGATAAATTACCCGATACCCATCCTCTTCATTTTGAAAAAAATTATTTAG
AAGGAATGATGTATTTTCAAGATGGCAAATACCAAGAAGCAATTACTTACTTACAAAAAGTCAATTTTACTTCAAACTCT
TATCAAAAAAAAGTTCAAGCTCATTTAGTAAAATGCTTTTTTAAATTAGCCGAGAAAGCCACAGATCAGGCAGAAGTAGT
CGATTTCCTGACACAAGCAGAAGCAATTTTAAAAAATACTTCTGATGAAATAAAAAATCTTCTTCTCTGCGATTTTTATT
TGTTGAAAGCAGCTCGTTTAAGTGATCCAAATGCTTACCAGCAAGCTAAAGAGATTTTGAAAAATTTAGCTACCTTTAAC
ACAGAAGAAGGTCAAAGGCAAGCAAAGCTCAAACTTGCAAATGCTGCTCCTTGTCGAGTCGAGCGAATTGAACAGTATAA
TAAGCTTATTCAAGATGCCCAATCTGATCTCATTTTGCAAGCCGATGCTTGGTATTTGAAAGGTTTAAACGAGCTAGAAG
AAGGACAAATTCAATGCCTATCTATTTCCTCACTTCCTCTCTCTAATATTTATTTTGAAGAAGCGGCATTATCGTTCAAA
CATGCTCATCAACTTTATTTAAATATTCAACCGCAATCCGCAGGAGATGCCTTAAAAAATCAGATTTTAGCGAATTTTTA
TCAATCAGACGATTCTAAAAAAAAACAAGCTTTTAAACTCCTGACCGCGCTCACAAAAAATGGTTCTGATTCAGGTCAGT
TATTAATCTTAGCAGGTTTAATTGTCACTTCCATAAAAAATCCTGATTCAGAAGACCTTTTGAATGCAAAAACTCTTTTA
AAAACCTCTCCCAACTTTGATCAAAAAACCAATGAAAAAATTCTCAAGCTTCAAGGAATTTTATTGACCAAAGAAAATGA
TTGGAAAGCTGCTTACAATCATTTTTCTGACTTTTTTAAATATTACCCTCATTCCATTGAAATAGGTGAAATTCTTTTTT
GGATGGCCGATTGTTGCAGCCATTTAAATAATGAACAAGTGAGGCAGGAACATTTAAGGACTCTTTATCTGAATTATCCT
CAAAGCCCTTTTGCGGCCCCAGCATATTTTAATTTATTTTCTTACCGAGAATATATGCAAGGACAGCGACAATCGATTAA
GCACTTAGAAGCAATGCCAGAATTATTTTCTGAAAGCCCTTACGTAATTAGTGCTTATTATTTAATTGGCCTTGACCATT
TAAAAAACCACATGACTTACAATGGCAAGACTCATCGCCGAAAAGATGAGATTGCTGCGATTGCCGCTTTCCAAGCGGCA
GAAAGTAAATTTGATGAGTTATTTGAAAAAAAGAAATTAACCCCTATCGACACAATTTACTACATTCATATCAAGTATCA
GGCTATGCTGGAAAGAGCATCAGCAAATTTAGCAATTGCCGATCAATCCACATCAACCAAAAAAATGATTTATTTGGAAT
ATACCGAAGATGTTTTTAAAGAACTAATTCAGGTCTTTCATGACCCAAATCCTCTTATCCAAACTACCCTACTTAAAGAT
CAATCCTATCCTAAAATCTTACAAGAAGCAGAGTTTGGACTCGCGCAAACATATACAAGACGAAATAAAATAGATGAAGC
TTATCAATTATTCGATCAATTGACTCAAAAAGCTCAGCAGAATATTACAGAAAACAATTATTTACTTGCGAAGGCTTATT
ATGAAAAAGGAGTACTTTCTCAAAAAAAATACAATTACTCCCAAGCTTTAAATGATTTTCTACAAGCGGAAGAAGTCAAT
CATGCTTTCAACTTCTTAAGTCCCGATGAAAAATTGGATTTATGGATTCAACAAAGTCAGTGTTATAAAGAGCTGGGACA
ACTAGAAGAAGCTATGTTACTTCTCTCGAAAGTCATTAATGACGAAGCCATTTCAAGTTTACGGGTTAAAGCTATGTATT
TAAGAGCAGATATTTATACTCAACAAGGCAGACCTGAGCTTGCCTTGAAGCAATTGGATGCTACCTCGAAAAAGGGGGGC
GAATGGAGCAAAAAAGCAAAAGAAAAAATGGAAAAAGATTATGCCTATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGTCAAGACTCCCAAACTCATTCGATGATTTTAGAGACATGATGAAAAATTGTCGCCATTCTGCTATATTGTTTAGATA
AATTGACTCTCAGAGGACTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTATTTATTGTTTGAACCCTGTTTAGCAAATCTATTTTTTTATGGCTCTAATTGGAACATTATTTTATTAATCATCATTG
GCTGCTCAATTCTAAGCGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896

Protein sequence:

>896_residues
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PELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNILNTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIE
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EWSKKAKEKMEKDYAY

Sequences:

>Translated_896_residues
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PELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNILNTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIE
WSPFEPTMYYLSKLYLIRMALLNKETSSAKASLLHLHDKLPDTHPLHFEKNYLEGMMYFQDGKYQEAITYLQKVNFTSNS
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KTSPNFDQKTNEKILKLQGILLTKENDWKAAYNHFSDFFKYYPHSIEIGEILFWMADCCSHLNNEQVRQEHLRTLYLNYP
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EWSKKAKEKMEKDYAY
>Mature_896_residues
MKKCLFFFFYIISCRTFLSAELADLNSSKKFLHAERLKAEGHYEDALHYYFFMDEHFETTPELCQSMHLSQAHCLLELHQ
PELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNILNTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIE
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HAFNFLSPDEKLDLWIQQSQCYKELGQLEEAMLLLSKVINDEAISSLRVKAMYLRADIYTQQGRPELALKQLDATSKKGG
EWSKKAKEKMEKDYAY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103857; Mature: 103857

Theoretical pI: Translated: 6.71; Mature: 6.71

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKCLFFFFYIISCRTFLSAELADLNSSKKFLHAERLKAEGHYEDALHYYFFMDEHFETT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEEEEEHHHCCCC
PELCQSMHLSQAHCLLELHQPELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNIL
HHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
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CEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE
YIHIKYQAMLERASANLAIADQSTSTKKMIYLEYTEDVFKELIQVFHDPNPLIQTTLLKD
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>Mature Secondary Structure
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA