| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46447180
Identifier: 46447180
GI number: 46447180
Start: 1851903
End: 1854593
Strand: Direct
Name: 46447180
Synonym: pc1546
Alternate gene names: NA
Gene position: 1851903-1854593 (Clockwise)
Preceding gene: 46447176
Following gene: 46447181
Centisome position: 76.7
GC content: 34.08
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CTATTTATTGTTTGAACCCTGTTTAGCAAATCTATTTTTTTATGGCTCTAATTGGAACATTATTTTATTAATCATCATTG GCTGCTCAATTCTAAGCGTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896
Protein sequence:
>896_residues MKKCLFFFFYIISCRTFLSAELADLNSSKKFLHAERLKAEGHYEDALHYYFFMDEHFETTPELCQSMHLSQAHCLLELHQ PELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNILNTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIE WSPFEPTMYYLSKLYLIRMALLNKETSSAKASLLHLHDKLPDTHPLHFEKNYLEGMMYFQDGKYQEAITYLQKVNFTSNS YQKKVQAHLVKCFFKLAEKATDQAEVVDFLTQAEAILKNTSDEIKNLLLCDFYLLKAARLSDPNAYQQAKEILKNLATFN TEEGQRQAKLKLANAAPCRVERIEQYNKLIQDAQSDLILQADAWYLKGLNELEEGQIQCLSISSLPLSNIYFEEAALSFK HAHQLYLNIQPQSAGDALKNQILANFYQSDDSKKKQAFKLLTALTKNGSDSGQLLILAGLIVTSIKNPDSEDLLNAKTLL KTSPNFDQKTNEKILKLQGILLTKENDWKAAYNHFSDFFKYYPHSIEIGEILFWMADCCSHLNNEQVRQEHLRTLYLNYP QSPFAAPAYFNLFSYREYMQGQRQSIKHLEAMPELFSESPYVISAYYLIGLDHLKNHMTYNGKTHRRKDEIAAIAAFQAA ESKFDELFEKKKLTPIDTIYYIHIKYQAMLERASANLAIADQSTSTKKMIYLEYTEDVFKELIQVFHDPNPLIQTTLLKD QSYPKILQEAEFGLAQTYTRRNKIDEAYQLFDQLTQKAQQNITENNYLLAKAYYEKGVLSQKKYNYSQALNDFLQAEEVN HAFNFLSPDEKLDLWIQQSQCYKELGQLEEAMLLLSKVINDEAISSLRVKAMYLRADIYTQQGRPELALKQLDATSKKGG EWSKKAKEKMEKDYAY
Sequences:
>Translated_896_residues MKKCLFFFFYIISCRTFLSAELADLNSSKKFLHAERLKAEGHYEDALHYYFFMDEHFETTPELCQSMHLSQAHCLLELHQ PELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNILNTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIE WSPFEPTMYYLSKLYLIRMALLNKETSSAKASLLHLHDKLPDTHPLHFEKNYLEGMMYFQDGKYQEAITYLQKVNFTSNS YQKKVQAHLVKCFFKLAEKATDQAEVVDFLTQAEAILKNTSDEIKNLLLCDFYLLKAARLSDPNAYQQAKEILKNLATFN TEEGQRQAKLKLANAAPCRVERIEQYNKLIQDAQSDLILQADAWYLKGLNELEEGQIQCLSISSLPLSNIYFEEAALSFK HAHQLYLNIQPQSAGDALKNQILANFYQSDDSKKKQAFKLLTALTKNGSDSGQLLILAGLIVTSIKNPDSEDLLNAKTLL KTSPNFDQKTNEKILKLQGILLTKENDWKAAYNHFSDFFKYYPHSIEIGEILFWMADCCSHLNNEQVRQEHLRTLYLNYP QSPFAAPAYFNLFSYREYMQGQRQSIKHLEAMPELFSESPYVISAYYLIGLDHLKNHMTYNGKTHRRKDEIAAIAAFQAA ESKFDELFEKKKLTPIDTIYYIHIKYQAMLERASANLAIADQSTSTKKMIYLEYTEDVFKELIQVFHDPNPLIQTTLLKD QSYPKILQEAEFGLAQTYTRRNKIDEAYQLFDQLTQKAQQNITENNYLLAKAYYEKGVLSQKKYNYSQALNDFLQAEEVN HAFNFLSPDEKLDLWIQQSQCYKELGQLEEAMLLLSKVINDEAISSLRVKAMYLRADIYTQQGRPELALKQLDATSKKGG EWSKKAKEKMEKDYAY >Mature_896_residues MKKCLFFFFYIISCRTFLSAELADLNSSKKFLHAERLKAEGHYEDALHYYFFMDEHFETTPELCQSMHLSQAHCLLELHQ PELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNILNTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIE WSPFEPTMYYLSKLYLIRMALLNKETSSAKASLLHLHDKLPDTHPLHFEKNYLEGMMYFQDGKYQEAITYLQKVNFTSNS YQKKVQAHLVKCFFKLAEKATDQAEVVDFLTQAEAILKNTSDEIKNLLLCDFYLLKAARLSDPNAYQQAKEILKNLATFN TEEGQRQAKLKLANAAPCRVERIEQYNKLIQDAQSDLILQADAWYLKGLNELEEGQIQCLSISSLPLSNIYFEEAALSFK HAHQLYLNIQPQSAGDALKNQILANFYQSDDSKKKQAFKLLTALTKNGSDSGQLLILAGLIVTSIKNPDSEDLLNAKTLL KTSPNFDQKTNEKILKLQGILLTKENDWKAAYNHFSDFFKYYPHSIEIGEILFWMADCCSHLNNEQVRQEHLRTLYLNYP QSPFAAPAYFNLFSYREYMQGQRQSIKHLEAMPELFSESPYVISAYYLIGLDHLKNHMTYNGKTHRRKDEIAAIAAFQAA ESKFDELFEKKKLTPIDTIYYIHIKYQAMLERASANLAIADQSTSTKKMIYLEYTEDVFKELIQVFHDPNPLIQTTLLKD QSYPKILQEAEFGLAQTYTRRNKIDEAYQLFDQLTQKAQQNITENNYLLAKAYYEKGVLSQKKYNYSQALNDFLQAEEVN HAFNFLSPDEKLDLWIQQSQCYKELGQLEEAMLLLSKVINDEAISSLRVKAMYLRADIYTQQGRPELALKQLDATSKKGG EWSKKAKEKMEKDYAY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103857; Mature: 103857
Theoretical pI: Translated: 6.71; Mature: 6.71
Prosite motif: PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKCLFFFFYIISCRTFLSAELADLNSSKKFLHAERLKAEGHYEDALHYYFFMDEHFETT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEEEEEHHHCCCC PELCQSMHLSQAHCLLELHQPELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNIL HHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH NTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIEWSPFEPTMYYLSKLYLIRMA HHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLNKETSSAKASLLHLHDKLPDTHPLHFEKNYLEGMMYFQDGKYQEAITYLQKVNFTSNS HHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHH YQKKVQAHLVKCFFKLAEKATDQAEVVDFLTQAEAILKNTSDEIKNLLLCDFYLLKAARL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SDPNAYQQAKEILKNLATFNTEEGQRQAKLKLANAAPCRVERIEQYNKLIQDAQSDLILQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEE ADAWYLKGLNELEEGQIQCLSISSLPLSNIYFEEAALSFKHAHQLYLNIQPQSAGDALKN CCHHHHHCCCHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHH QILANFYQSDDSKKKQAFKLLTALTKNGSDSGQLLILAGLIVTSIKNPDSEDLLNAKTLL HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH KTSPNFDQKTNEKILKLQGILLTKENDWKAAYNHFSDFFKYYPHSIEIGEILFWMADCCS HCCCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH HLNNEQVRQEHLRTLYLNYPQSPFAAPAYFNLFSYREYMQGQRQSIKHLEAMPELFSESP HCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC YVISAYYLIGLDHLKNHMTYNGKTHRRKDEIAAIAAFQAAESKFDELFEKKKLTPIDTIY CEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE YIHIKYQAMLERASANLAIADQSTSTKKMIYLEYTEDVFKELIQVFHDPNPLIQTTLLKD EEEEEHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCC QSYPKILQEAEFGLAQTYTRRNKIDEAYQLFDQLTQKAQQNITENNYLLAKAYYEKGVLS CCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHCCCH QKKYNYSQALNDFLQAEEVNHAFNFLSPDEKLDLWIQQSQCYKELGQLEEAMLLLSKVIN HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC DEAISSLRVKAMYLRADIYTQQGRPELALKQLDATSKKGGEWSKKAKEKMEKDYAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKKCLFFFFYIISCRTFLSAELADLNSSKKFLHAERLKAEGHYEDALHYYFFMDEHFETT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEEEEEHHHCCCC PELCQSMHLSQAHCLLELHQPELAIDLLTQDSNPHSPYQNYLIGLAYRQQKNYQLALNIL HHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH NTIDSNRDTALGDKINFEKGINYFYLGKSKDSAFFLKKIEWSPFEPTMYYLSKLYLIRMA HHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLNKETSSAKASLLHLHDKLPDTHPLHFEKNYLEGMMYFQDGKYQEAITYLQKVNFTSNS HHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHH YQKKVQAHLVKCFFKLAEKATDQAEVVDFLTQAEAILKNTSDEIKNLLLCDFYLLKAARL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SDPNAYQQAKEILKNLATFNTEEGQRQAKLKLANAAPCRVERIEQYNKLIQDAQSDLILQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEE ADAWYLKGLNELEEGQIQCLSISSLPLSNIYFEEAALSFKHAHQLYLNIQPQSAGDALKN CCHHHHHCCCHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHH QILANFYQSDDSKKKQAFKLLTALTKNGSDSGQLLILAGLIVTSIKNPDSEDLLNAKTLL HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH KTSPNFDQKTNEKILKLQGILLTKENDWKAAYNHFSDFFKYYPHSIEIGEILFWMADCCS HCCCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH HLNNEQVRQEHLRTLYLNYPQSPFAAPAYFNLFSYREYMQGQRQSIKHLEAMPELFSESP HCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC YVISAYYLIGLDHLKNHMTYNGKTHRRKDEIAAIAAFQAAESKFDELFEKKKLTPIDTIY CEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE YIHIKYQAMLERASANLAIADQSTSTKKMIYLEYTEDVFKELIQVFHDPNPLIQTTLLKD EEEEEHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCC QSYPKILQEAEFGLAQTYTRRNKIDEAYQLFDQLTQKAQQNITENNYLLAKAYYEKGVLS CCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHCCCH QKKYNYSQALNDFLQAEEVNHAFNFLSPDEKLDLWIQQSQCYKELGQLEEAMLLLSKVIN HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC DEAISSLRVKAMYLRADIYTQQGRPELALKQLDATSKKGGEWSKKAKEKMEKDYAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA