| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46447174
Identifier: 46447174
GI number: 46447174
Start: 1843181
End: 1845751
Strand: Direct
Name: 46447174
Synonym: pc1540
Alternate gene names: NA
Gene position: 1843181-1845751 (Clockwise)
Preceding gene: 46447173
Following gene: 46447175
Centisome position: 76.34
GC content: 30.65
Gene sequence:
>2571_bases ATGGCTTCACCTGCTGGAGGTCCAATCCATTCAAGTAATCTTATTCCTTCGTATTTTTTTGAAACAAAAAAACAAACAAC TTATAAATTAATTGATAATAATCCCCTTTTTCCAGTCAATCAAACTTTATTACCTCCACTAAAACTTTCAAATTCCGAAC GATTGAATTTATTATTGGAGGAAGAATTAGATGCTTTAATTGTTCAAAAAGAAGAACAAATTACGCAAACTCTAGAAAAA ATAGATGAAGTAATTCACGGTAGTCGTTTTTATAAAATGGTTTTGGATTTCACTAAATGGGCACATGAATATGCTGATAC CGGCAATGACACTGTGCAAAGTGGAATAGAATATCTCCAAAATTTGCTTCCAGAAAAATTAATCAAAGAAGGATCGATCC TTGGAAATCATTTAGAGTCTTTAGATGAGATAGCTGACCATGCCGGGAAATTTTTAAATGCTCTTGATTTGGGAGTAAGT GGTTTAGTGTTAATGCATAAAATAAAGATTTTAGAAATTTCAAAAAAAGTTTTTTTAAGTTTAAAAAACGAATATGACAC AAAAAAAGAAATGCTTCATGATAAGAAAATTTCCAAAGGCGAACAAAGAGAAATTAAAAAAATTTTAGCTACATTGGGAA AAATTATTAGTGAATTAGAAATTAAGCTTAAAATTCAAGAAAAGCAAATCAACTTACAAAAAACTAAGTATCAATTAAAA GTCGGTAAAAAATTCTTTTCATTCGTCAAAATTCCTTTAAAATATCTTCCCATTGATCAAACTGCTAAGGCCTTTCAATT TCTTTTAACAGGTGTCACTGTTGCAAAAACAGCTTTATCACTTGTTCTTTCTGGATTCATTTTACATAGAGCTGTAACCA ATCATTGTGTTTATACAGGGTGGACAGAAACGTTTAAGCAATGGAAAAAACGTCAACAACCAACTAGTCATATAGCTACC CAAATAGAGCCCCCCCTTCAAGTTCAATTTCCTGAAATTTTAAGTGAAATTTCTGAAAAAAACTTTCAGAAATTTCAAGA AGAGCTAGATAAGCTCATTTATCACCCAACGATGGTTTTTGAAGAAATTAAACAAGAGCTTAAAAATTTTGGTATTGAAT TAATGGAAGATATCAATACAACGAGTGAATTAATTGATCATTGGGAACTTCACGCTGAATTTAAACAAGATTTGATTTTT AAATACACGGACTTTGCAATAGTTTTAGGTCAGCTCGATTATCTTATTCAAACAAGTAAAAACTTGCTGATTAAAAGAGA AGCTGTTAGCAGAAAAAAAGTCTTACAATTAACCCCTCATTTTGAAGAACTCAAACCTAAAATTGTTGAATTGAAAAAGA GGCAGTACGAACAACTTGCTGGGCAATTTAGAGTTTTATATGGAGAAAAATTTTCTAAAAAAAACTTATCTCCTATTCTT TTTGAAAACCTACCGGAAAAAGAAGTTGAACGTATTTTAAAAGAACAAGAAGTTATTTTTAATGAACAGAAAATCATCAA GCTACAAAGCATTGCGAACCAGCTTCAACTCGGTTTTACAATTTCTCGTTTTAAGGACAAAGCTCACATAATCAATGCTT TTGAACGTGTAATCGTTTCAGATAAACAATTTGATCGATTTATGAAAAATTATACTTCAGCAGACCTGTTATATTTTTAT GTGGACCATCAAGAAACTTTAGAACATATAACGAAAAATAGCCTTAAAGAAATGATTTCAAAAAAACATGAAATCGAGCG AAATTTTACAAAATTTAAATTAGTAGAATCAGGGACACTTTTTACCATAGCTTCGATTTTTGCCATTATTTCTACTACCT TCGCTATTATAGGATTATTAACCATACCTGTCGCTGGCGCTGGTTTTATCTTAATAGGCTTATCTATCGCATCGACAATT TTTTCGTTGGGGTTTTTATGTGCTAGCTATTATCAAAAATCTAAATACAAATCTGCTTCTACGGCTGTAGAAACATATTT GACAGATGTGAAATTAATGTTCAATCGTGTCCGAGCAAGAATTGAAGAATATTGCTCTCTACGCAAAAATAAAAAATTAC AAGATATAGCTTTTATTCTAAAAAACTTACATAAAAAAGACGTTTCAACTGAGGAATATCAAAAAGCATTTAAAAAATAT GAAGAAGCTAAGACGCAATATGCACTGAGTCAATCTAAAGTCCAAGAGTGGAATCGAAAAATAAAAGCAATACAAACTCG TATTAATAATGCACGTTTGCAAGACTTTGCAAAATCTGCGTCTTTAAAAATTGCGGAGAGTCCACAAAATTTTGATACTT GGAAGGCTTTAAACGAATCATTATTAGCTATGGATTTAAGCTTATTGAGCGAAGAAACCAAATTACTTCTTCAAACACAA TTAGGGTTAGACATTGAAGTTTTACAAGCTCAAGCGATGAAAAATCCAGAATCTTTAAAAAAAGCTTTGCAAAAATTCTT CACATTAGAAGATTCTGAAATAGTTGAATTTATTCAATATCAACAAGCTCGTATCCAAGCAAATCTAATTCCTTCTATGA ATCCTAATTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GTGAAATTATGGTTTTACAACGCATTTCTTCTCTTTTAAAAGAAACTTTTTTTGATTGTTCCTATGTTGCAGCCTCTGAA ATAGAGCCATTTGATTATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 856; Mature: 855
Protein sequence:
>856_residues MASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLEEELDALIVQKEEQITQTLEK IDEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQNLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVS GLVLMHKIKILEISKKVFLSLKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLK VGKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTGWTETFKQWKKRQQPTSHIAT QIEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVFEEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIF KYTDFAIVLGQLDYLIQTSKNLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPIL FENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVSDKQFDRFMKNYTSADLLYFY VDHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTLFTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTI FSLGFLCASYYQKSKYKSASTAVETYLTDVKLMFNRVRARIEEYCSLRKNKKLQDIAFILKNLHKKDVSTEEYQKAFKKY EEAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNESLLAMDLSLLSEETKLLLQTQ LGLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQYQQARIQANLIPSMNPN
Sequences:
>Translated_856_residues MASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLEEELDALIVQKEEQITQTLEK IDEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQNLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVS GLVLMHKIKILEISKKVFLSLKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLK VGKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTGWTETFKQWKKRQQPTSHIAT QIEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVFEEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIF KYTDFAIVLGQLDYLIQTSKNLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPIL FENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVSDKQFDRFMKNYTSADLLYFY VDHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTLFTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTI FSLGFLCASYYQKSKYKSASTAVETYLTDVKLMFNRVRARIEEYCSLRKNKKLQDIAFILKNLHKKDVSTEEYQKAFKKY EEAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNESLLAMDLSLLSEETKLLLQTQ LGLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQYQQARIQANLIPSMNPN >Mature_855_residues ASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLEEELDALIVQKEEQITQTLEKI DEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQNLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVSG LVLMHKIKILEISKKVFLSLKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLKV GKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTGWTETFKQWKKRQQPTSHIATQ IEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVFEEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIFK YTDFAIVLGQLDYLIQTSKNLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPILF ENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVSDKQFDRFMKNYTSADLLYFYV DHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTLFTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTIF SLGFLCASYYQKSKYKSASTAVETYLTDVKLMFNRVRARIEEYCSLRKNKKLQDIAFILKNLHKKDVSTEEYQKAFKKYE EAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNESLLAMDLSLLSEETKLLLQTQL GLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQYQQARIQANLIPSMNPN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 98886; Mature: 98755
Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLE CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH EELDALIVQKEEQITQTLEKIDEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH NLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVSGLVLMHKIKILEISKKVFLS HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLK HHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHH VGKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECC WTETFKQWKKRQQPTSHIATQIEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVF HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIFKYTDFAIVLGQLDYLIQTSK HHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPIL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH FENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVS HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC DKQFDRFMKNYTSADLLYFYVDHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTL CHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCCH FTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTIFSLGFLCASYYQKSKYKSAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH TAVETYLTDVKLMFNRVRARIEEYCSLRKNKKLQDIAFILKNLHKKDVSTEEYQKAFKKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH EEAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHH LLAMDLSLLSEETKLLLQTQLGLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH QQARIQANLIPSMNPN HHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure ASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLE CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH EELDALIVQKEEQITQTLEKIDEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH NLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVSGLVLMHKIKILEISKKVFLS HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLK HHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHH VGKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECC WTETFKQWKKRQQPTSHIATQIEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVF HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIFKYTDFAIVLGQLDYLIQTSK HHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPIL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH FENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVS HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC DKQFDRFMKNYTSADLLYFYVDHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTL CHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCCH FTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTIFSLGFLCASYYQKSKYKSAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH TAVETYLTDVKLMFNRVRARIEEYCSLRKNKKLQDIAFILKNLHKKDVSTEEYQKAFKKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH EEAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHH LLAMDLSLLSEETKLLLQTQLGLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH QQARIQANLIPSMNPN HHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA