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Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46447174

Identifier: 46447174

GI number: 46447174

Start: 1843181

End: 1845751

Strand: Direct

Name: 46447174

Synonym: pc1540

Alternate gene names: NA

Gene position: 1843181-1845751 (Clockwise)

Preceding gene: 46447173

Following gene: 46447175

Centisome position: 76.34

GC content: 30.65

Gene sequence:

>2571_bases
ATGGCTTCACCTGCTGGAGGTCCAATCCATTCAAGTAATCTTATTCCTTCGTATTTTTTTGAAACAAAAAAACAAACAAC
TTATAAATTAATTGATAATAATCCCCTTTTTCCAGTCAATCAAACTTTATTACCTCCACTAAAACTTTCAAATTCCGAAC
GATTGAATTTATTATTGGAGGAAGAATTAGATGCTTTAATTGTTCAAAAAGAAGAACAAATTACGCAAACTCTAGAAAAA
ATAGATGAAGTAATTCACGGTAGTCGTTTTTATAAAATGGTTTTGGATTTCACTAAATGGGCACATGAATATGCTGATAC
CGGCAATGACACTGTGCAAAGTGGAATAGAATATCTCCAAAATTTGCTTCCAGAAAAATTAATCAAAGAAGGATCGATCC
TTGGAAATCATTTAGAGTCTTTAGATGAGATAGCTGACCATGCCGGGAAATTTTTAAATGCTCTTGATTTGGGAGTAAGT
GGTTTAGTGTTAATGCATAAAATAAAGATTTTAGAAATTTCAAAAAAAGTTTTTTTAAGTTTAAAAAACGAATATGACAC
AAAAAAAGAAATGCTTCATGATAAGAAAATTTCCAAAGGCGAACAAAGAGAAATTAAAAAAATTTTAGCTACATTGGGAA
AAATTATTAGTGAATTAGAAATTAAGCTTAAAATTCAAGAAAAGCAAATCAACTTACAAAAAACTAAGTATCAATTAAAA
GTCGGTAAAAAATTCTTTTCATTCGTCAAAATTCCTTTAAAATATCTTCCCATTGATCAAACTGCTAAGGCCTTTCAATT
TCTTTTAACAGGTGTCACTGTTGCAAAAACAGCTTTATCACTTGTTCTTTCTGGATTCATTTTACATAGAGCTGTAACCA
ATCATTGTGTTTATACAGGGTGGACAGAAACGTTTAAGCAATGGAAAAAACGTCAACAACCAACTAGTCATATAGCTACC
CAAATAGAGCCCCCCCTTCAAGTTCAATTTCCTGAAATTTTAAGTGAAATTTCTGAAAAAAACTTTCAGAAATTTCAAGA
AGAGCTAGATAAGCTCATTTATCACCCAACGATGGTTTTTGAAGAAATTAAACAAGAGCTTAAAAATTTTGGTATTGAAT
TAATGGAAGATATCAATACAACGAGTGAATTAATTGATCATTGGGAACTTCACGCTGAATTTAAACAAGATTTGATTTTT
AAATACACGGACTTTGCAATAGTTTTAGGTCAGCTCGATTATCTTATTCAAACAAGTAAAAACTTGCTGATTAAAAGAGA
AGCTGTTAGCAGAAAAAAAGTCTTACAATTAACCCCTCATTTTGAAGAACTCAAACCTAAAATTGTTGAATTGAAAAAGA
GGCAGTACGAACAACTTGCTGGGCAATTTAGAGTTTTATATGGAGAAAAATTTTCTAAAAAAAACTTATCTCCTATTCTT
TTTGAAAACCTACCGGAAAAAGAAGTTGAACGTATTTTAAAAGAACAAGAAGTTATTTTTAATGAACAGAAAATCATCAA
GCTACAAAGCATTGCGAACCAGCTTCAACTCGGTTTTACAATTTCTCGTTTTAAGGACAAAGCTCACATAATCAATGCTT
TTGAACGTGTAATCGTTTCAGATAAACAATTTGATCGATTTATGAAAAATTATACTTCAGCAGACCTGTTATATTTTTAT
GTGGACCATCAAGAAACTTTAGAACATATAACGAAAAATAGCCTTAAAGAAATGATTTCAAAAAAACATGAAATCGAGCG
AAATTTTACAAAATTTAAATTAGTAGAATCAGGGACACTTTTTACCATAGCTTCGATTTTTGCCATTATTTCTACTACCT
TCGCTATTATAGGATTATTAACCATACCTGTCGCTGGCGCTGGTTTTATCTTAATAGGCTTATCTATCGCATCGACAATT
TTTTCGTTGGGGTTTTTATGTGCTAGCTATTATCAAAAATCTAAATACAAATCTGCTTCTACGGCTGTAGAAACATATTT
GACAGATGTGAAATTAATGTTCAATCGTGTCCGAGCAAGAATTGAAGAATATTGCTCTCTACGCAAAAATAAAAAATTAC
AAGATATAGCTTTTATTCTAAAAAACTTACATAAAAAAGACGTTTCAACTGAGGAATATCAAAAAGCATTTAAAAAATAT
GAAGAAGCTAAGACGCAATATGCACTGAGTCAATCTAAAGTCCAAGAGTGGAATCGAAAAATAAAAGCAATACAAACTCG
TATTAATAATGCACGTTTGCAAGACTTTGCAAAATCTGCGTCTTTAAAAATTGCGGAGAGTCCACAAAATTTTGATACTT
GGAAGGCTTTAAACGAATCATTATTAGCTATGGATTTAAGCTTATTGAGCGAAGAAACCAAATTACTTCTTCAAACACAA
TTAGGGTTAGACATTGAAGTTTTACAAGCTCAAGCGATGAAAAATCCAGAATCTTTAAAAAAAGCTTTGCAAAAATTCTT
CACATTAGAAGATTCTGAAATAGTTGAATTTATTCAATATCAACAAGCTCGTATCCAAGCAAATCTAATTCCTTCTATGA
ATCCTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATAATTTTTAATTATTCAATGTAATTAATTATAAATTAATAATCAAATTATATAATTCGATTATACATTTATTATTAT
CATTATTTTAGGAGGAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGAAATTATGGTTTTACAACGCATTTCTTCTCTTTTAAAAGAAACTTTTTTTGATTGTTCCTATGTTGCAGCCTCTGAA
ATAGAGCCATTTGATTATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 856; Mature: 855

Protein sequence:

>856_residues
MASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLEEELDALIVQKEEQITQTLEK
IDEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQNLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVS
GLVLMHKIKILEISKKVFLSLKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLK
VGKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTGWTETFKQWKKRQQPTSHIAT
QIEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVFEEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIF
KYTDFAIVLGQLDYLIQTSKNLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPIL
FENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVSDKQFDRFMKNYTSADLLYFY
VDHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTLFTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTI
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EEAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNESLLAMDLSLLSEETKLLLQTQ
LGLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQYQQARIQANLIPSMNPN

Sequences:

>Translated_856_residues
MASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLEEELDALIVQKEEQITQTLEK
IDEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQNLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVS
GLVLMHKIKILEISKKVFLSLKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLK
VGKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTGWTETFKQWKKRQQPTSHIAT
QIEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVFEEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIF
KYTDFAIVLGQLDYLIQTSKNLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPIL
FENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVSDKQFDRFMKNYTSADLLYFY
VDHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTLFTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTI
FSLGFLCASYYQKSKYKSASTAVETYLTDVKLMFNRVRARIEEYCSLRKNKKLQDIAFILKNLHKKDVSTEEYQKAFKKY
EEAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNESLLAMDLSLLSEETKLLLQTQ
LGLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQYQQARIQANLIPSMNPN
>Mature_855_residues
ASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLEEELDALIVQKEEQITQTLEKI
DEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQNLLPEKLIKEGSILGNHLESLDEIADHAGKFLNALDLGVSG
LVLMHKIKILEISKKVFLSLKNEYDTKKEMLHDKKISKGEQREIKKILATLGKIISELEIKLKIQEKQINLQKTKYQLKV
GKKFFSFVKIPLKYLPIDQTAKAFQFLLTGVTVAKTALSLVLSGFILHRAVTNHCVYTGWTETFKQWKKRQQPTSHIATQ
IEPPLQVQFPEILSEISEKNFQKFQEELDKLIYHPTMVFEEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIFK
YTDFAIVLGQLDYLIQTSKNLLIKREAVSRKKVLQLTPHFEELKPKIVELKKRQYEQLAGQFRVLYGEKFSKKNLSPILF
ENLPEKEVERILKEQEVIFNEQKIIKLQSIANQLQLGFTISRFKDKAHIINAFERVIVSDKQFDRFMKNYTSADLLYFYV
DHQETLEHITKNSLKEMISKKHEIERNFTKFKLVESGTLFTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTIF
SLGFLCASYYQKSKYKSASTAVETYLTDVKLMFNRVRARIEEYCSLRKNKKLQDIAFILKNLHKKDVSTEEYQKAFKKYE
EAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNESLLAMDLSLLSEETKLLLQTQL
GLDIEVLQAQAMKNPESLKKALQKFFTLEDSEIVEFIQYQQARIQANLIPSMNPN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 98886; Mature: 98755

Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ASPAGGPIHSSNLIPSYFFETKKQTTYKLIDNNPLFPVNQTLLPPLKLSNSERLNLLLE
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
EELDALIVQKEEQITQTLEKIDEVIHGSRFYKMVLDFTKWAHEYADTGNDTVQSGIEYLQ
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EEIKQELKNFGIELMEDINTTSELIDHWELHAEFKQDLIFKYTDFAIVLGQLDYLIQTSK
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FTIASIFAIISTTFAIIGLLTIPVAGAGFILIGLSIASTIFSLGFLCASYYQKSKYKSAS
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EEAKTQYALSQSKVQEWNRKIKAIQTRINNARLQDFAKSASLKIAESPQNFDTWKALNES
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
QQARIQANLIPSMNPN
HHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA