Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46446763

Identifier: 46446763

GI number: 46446763

Start: 1354285

End: 1357605

Strand: Reverse

Name: 46446763

Synonym: pc1129

Alternate gene names: NA

Gene position: 1357605-1354285 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46446764

Following gene: 46446761

Centisome position: 56.23

GC content: 31.62

Gene sequence:

>3321_bases
ATGTTTATGAATACAGAAAATTATTTTTCAAAAGATTCATTAAATTTATGGGACAAAGAATCTACAAATATAGGTAAGTT
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TAACATCTAAAGATGTTGATCGTATTGAGAAATATATAAAAAAAAAGGAGGGAAGAGAGAAAAATGTTTTATTAGTTTGT
AATAAGTTAGTTTGTATAAGTAGAATAGCTATAAGAGAAAAGGTTATTAAAGATAATACAGAAGGAAAAAATTGTAAAGA
GTTTATAGGAAAAATTTCAACAATATTGGTTGATTGTTCAATCGATGATATCTTAAAAAATATTTCGGATCCAGATTTAT
TCAATAAAATTATCGAAGAAAAATTAAAAGGGGAAAAATTAGACTTTGAATCAATTGAAAAAATAATTGATAAAAAAATT
GAACTAGGGGATAAATCGGGAATTAACGAAAAATTGATTAGCTTAATACAGGATTTAAATACTGAAGAATTCTTAAAAAT
CGCAAATAAATTATTCGGATATAAGCAATTTAAAAAAGAAAATTTAGATGAAATTGTTAAATTTAAAATAACAAAAACTT
CTGATATTAATGATAAAATATCTATTATAAATAAGTATAATAATAGTAAAGATATAATAGATGATGTCATTCAGCAGTTT
AAACCAGCTAGTCCAGAAGAAGGAATAAAAATTGCTGAAGAATGTACTTTATCTTCAGAAAACAGATCTATTCTCTTTCA
AAATTTTTTGAGTGCTAAAGAAGAAGTGAAATTAGAGGAAGCTCTTGAGTTTCACGAAAAATTAGGCTTATCCTTAGAAG
ATTTAGCAAAACAGCTCCCTTTGTTATTAAAAATTTGCGATATGGAAAAAAATGATTATCTTGCAAACGTAAAAATTAAA
GAAGCTTTAACCAACCCTCAAGTAAATTGCCATTTTGCTTCGCATCTCTGCATTGCCAAACCACAGTTATTAGTGACCTT
GTTTGGAGAACAAGGATCTTTTAAGGATATCTTCAAGATTGATAAACAATTAGAAGTTTTAAGAAATGTGGTGGCTCAAA
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GATTTGCTAGACGAAAATGTGTTTTCTTGTTTAGTAGCTATCAACAAAAGAGATCACATTTATTGTATTGAAAATATGGT
ATCATCTGATGCTATCTGTGGAATAATAGACACTCCTCTTTTGCTAGCTTTGCAAAGAGAAGAAGGACGTGCGGAAACAA
CTACTTATTCTGATATTTCGTCAAGTTGGAGAAAAGAAAAGAAAGAACAATACTTAGATGCGTTATTGAGCGATCCCTCT
ACACAGCAGCTTGCTTTGACACGTATCGATACAGGTAACCAACAAGAGCCTAGCGAAAGGATTGAATATATTTTAGAGAA
CCTCGATAAAATTCCTTTGGATGATGCCATTGAAGCAATCAAAAAAGATTTTAAAAAACTCTCCGACGTAAGTGATTCTT
TATTGGTTAAAATTCTAACAAATTTCAATTTAAATGCGATCAAAGGTGTGAATGAAGAAACGAATAAAAAAACTTTAAAC
ATCTTCGCAGAAGAATATCCTAATTTAGTTCCAACCTTACAAAAGCTAATAGAATCTAGTGGCAAAAATCATTATGCTTT
AGCAAAAAGCTTATTTTCCATTGCCTATTTGATAGACAATATGCCAAAAAAAGGTGATCAAAACAAATTTCGGGAATTAT
TAGAAAAAAAAGAAATACAAGCATTAATTATCCAAATTGCCACTATGAGGAAACCGGACGAAGCTCGATTTTTTTTGATG
AATCGCTTTATGGAAAATATATCGAAGCCATCTTCTGATGATGATGCATACAATTTAATAGAAGATTTAAAGGCAACTCA
AAAACAAGTTGAAGCTCATAAACTAATAAAGCTACAAGTATCTCCATTTTATCATCCTTTCCAAAAAGGTTTAGGGGAGT
TATTCGGTGCAAATAAAGACTTTATTAGTGATACGGATTACCTACCGACCATTTTAGAAACTTTACAAGATATTCATCGA
GATCCTCTTTTAACGGAAAGCGAAAAGAAATACCTAGTAGATTTTATCCTAGGAAAAGTTCCTTCCCAAGTAATGCTCGA
TTCCAAACAGATAAAAAAAAATTTAAGCAGTGTAAAGGCAATTTTACGCTTAGGAGGAGCTAATTATTTATGTCAAGCAA
GTTTAGAAAAAGCATTCGAAGGAGATCATGAAACATTATTAAATCGACTGGGAGGGCAGTGCTTATCTGAATTAATGAAA
GGACATTTATCCGATACAGTTTCTTTACAGCTTATTGAAAAAATCAATAAGTCTAGAGATTTCAGTTGGGTTTTAAATAT
TGCTGTAAAATTAAACATGTTAGATTCTGATAAAAAAGATGCTCATCTCAAAATGTTCGCTGAAGCTCTTAAAGAAGATG
TAGAAGGGCAATTTGTTGAAGAAAGATTCAATAAAAGTCCTCATTTATTAGCTTTAGCTAAAAAATTAGAAGAAAAAAAA
CAAAATGATTTTATCGAAGAGTGGAAAAAACCCCTTTCTGAAGAACCTTTAACAGTCGCACAACTGCTTGGAGAAACTGC
TAAAACAGGAAGTAAAGTACTTAATGAACAGCAAGTGGCCAAGTATGAAGTGTTCTTTACTGATGACTTTTTAGATCTTG
CGCAAATGGGAACTGAAGTTGTTGGAAGCTGTTTAAATATTAAAACAGGTAAATCAATAGACGTGATGACAATTCTAGGG
AATGCGATTGATGGGAAAACGAGAATGTTGGCAGTAAAAACAACTCAAGATCCTCAACAACCTTTGCAAGGACGCGTGAT
GCTGAGACTTTTGTGGGATGAGGAAGGTAAAACTCCTGTAATTATCATGGAAGGAATTCGAACTCGCAAGCCAGGAGACC
AAGAGGAAGCTCAAATTGTCGATCAGGCCTTACTAGAAGCTTCAATTAAAGTTGCTGAAAAGCTGAAGGTTCCTTTGATT
TGCGGATTTACTGTTAAACCTCAGCCTGATGTTGATTATGAACAATATCCTCATCAAGTGCAATCTTTGGCTCCCAATAG
ATCCCCATCAGAGAAATTTGATCCTCTTGAGGAACAAGGAGAGGGAGCAGTTGAAAGAACCCCAGAAGAATTGTCCGGTT
TATATACTCTCAAAAAGACAAACACAATATGGAAGCCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTAATAATTTAAATAAATATTATTTCTTTAATTTATTTTTTTTAATTATTAAATAAAAAATAAATTATAATTAAAATA
TAACACTATTAACAAGTGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAAGCCTTAGATAAGCTCTCTTGAGTTACAACATTAGTCCGGTGACCAAAGGATTTGAGTCTTTGAAATTGTAAATTTG
CTACTTTGGCAAAGCTCATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1106; Mature: 1106

Protein sequence:

>1106_residues
MFMNTENYFSKDSLNLWDKESTNIGKLEKHQTLLEPQSEKWVGKLNKYILEGSITSKDVDRIEKYIKKKEGREKNVLLVC
NKLVCISRIAIREKVIKDNTEGKNCKEFIGKISTILVDCSIDDILKNISDPDLFNKIIEEKLKGEKLDFESIEKIIDKKI
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DLLDENVFSCLVAINKRDHIYCIENMVSSDAICGIIDTPLLLALQREEGRAETTTYSDISSSWRKEKKEQYLDALLSDPS
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CGFTVKPQPDVDYEQYPHQVQSLAPNRSPSEKFDPLEEQGEGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP

Sequences:

>Translated_1106_residues
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DLLDENVFSCLVAINKRDHIYCIENMVSSDAICGIIDTPLLLALQREEGRAETTTYSDISSSWRKEKKEQYLDALLSDPS
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>Mature_1106_residues
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NAIDGKTRMLAVKTTQDPQQPLQGRVMLRLLWDEEGKTPVIIMEGIRTRKPGDQEEAQIVDQALLEASIKVAEKLKVPLI
CGFTVKPQPDVDYEQYPHQVQSLAPNRSPSEKFDPLEEQGEGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 125972; Mature: 125972

Theoretical pI: Translated: 5.04; Mature: 5.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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RIEKYIKKKEGREKNVLLVCNKLVCISRIAIREKVIKDNTEGKNCKEFIGKISTILVDCS
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>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHC
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHEEEECCCCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHC
EGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP
CCCHHCCHHHHHHCEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA