| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446763
Identifier: 46446763
GI number: 46446763
Start: 1354285
End: 1357605
Strand: Reverse
Name: 46446763
Synonym: pc1129
Alternate gene names: NA
Gene position: 1357605-1354285 (Counterclockwise)
Preceding gene: 46446764
Following gene: 46446761
Centisome position: 56.23
GC content: 31.62
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GGAAGCCTTAGATAAGCTCTCTTGAGTTACAACATTAGTCCGGTGACCAAAGGATTTGAGTCTTTGAAATTGTAAATTTG CTACTTTGGCAAAGCTCATC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1106; Mature: 1106
Protein sequence:
>1106_residues MFMNTENYFSKDSLNLWDKESTNIGKLEKHQTLLEPQSEKWVGKLNKYILEGSITSKDVDRIEKYIKKKEGREKNVLLVC NKLVCISRIAIREKVIKDNTEGKNCKEFIGKISTILVDCSIDDILKNISDPDLFNKIIEEKLKGEKLDFESIEKIIDKKI ELGDKSGINEKLISLIQDLNTEEFLKIANKLFGYKQFKKENLDEIVKFKITKTSDINDKISIINKYNNSKDIIDDVIQQF KPASPEEGIKIAEECTLSSENRSILFQNFLSAKEEVKLEEALEFHEKLGLSLEDLAKQLPLLLKICDMEKNDYLANVKIK EALTNPQVNCHFASHLCIAKPQLLVTLFGEQGSFKDIFKIDKQLEVLRNVVAQTKDFKEFEENSLQDLTIELLDKGQEDK DLLDENVFSCLVAINKRDHIYCIENMVSSDAICGIIDTPLLLALQREEGRAETTTYSDISSSWRKEKKEQYLDALLSDPS TQQLALTRIDTGNQQEPSERIEYILENLDKIPLDDAIEAIKKDFKKLSDVSDSLLVKILTNFNLNAIKGVNEETNKKTLN IFAEEYPNLVPTLQKLIESSGKNHYALAKSLFSIAYLIDNMPKKGDQNKFRELLEKKEIQALIIQIATMRKPDEARFFLM NRFMENISKPSSDDDAYNLIEDLKATQKQVEAHKLIKLQVSPFYHPFQKGLGELFGANKDFISDTDYLPTILETLQDIHR DPLLTESEKKYLVDFILGKVPSQVMLDSKQIKKNLSSVKAILRLGGANYLCQASLEKAFEGDHETLLNRLGGQCLSELMK GHLSDTVSLQLIEKINKSRDFSWVLNIAVKLNMLDSDKKDAHLKMFAEALKEDVEGQFVEERFNKSPHLLALAKKLEEKK QNDFIEEWKKPLSEEPLTVAQLLGETAKTGSKVLNEQQVAKYEVFFTDDFLDLAQMGTEVVGSCLNIKTGKSIDVMTILG NAIDGKTRMLAVKTTQDPQQPLQGRVMLRLLWDEEGKTPVIIMEGIRTRKPGDQEEAQIVDQALLEASIKVAEKLKVPLI CGFTVKPQPDVDYEQYPHQVQSLAPNRSPSEKFDPLEEQGEGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP
Sequences:
>Translated_1106_residues MFMNTENYFSKDSLNLWDKESTNIGKLEKHQTLLEPQSEKWVGKLNKYILEGSITSKDVDRIEKYIKKKEGREKNVLLVC NKLVCISRIAIREKVIKDNTEGKNCKEFIGKISTILVDCSIDDILKNISDPDLFNKIIEEKLKGEKLDFESIEKIIDKKI ELGDKSGINEKLISLIQDLNTEEFLKIANKLFGYKQFKKENLDEIVKFKITKTSDINDKISIINKYNNSKDIIDDVIQQF KPASPEEGIKIAEECTLSSENRSILFQNFLSAKEEVKLEEALEFHEKLGLSLEDLAKQLPLLLKICDMEKNDYLANVKIK EALTNPQVNCHFASHLCIAKPQLLVTLFGEQGSFKDIFKIDKQLEVLRNVVAQTKDFKEFEENSLQDLTIELLDKGQEDK DLLDENVFSCLVAINKRDHIYCIENMVSSDAICGIIDTPLLLALQREEGRAETTTYSDISSSWRKEKKEQYLDALLSDPS TQQLALTRIDTGNQQEPSERIEYILENLDKIPLDDAIEAIKKDFKKLSDVSDSLLVKILTNFNLNAIKGVNEETNKKTLN IFAEEYPNLVPTLQKLIESSGKNHYALAKSLFSIAYLIDNMPKKGDQNKFRELLEKKEIQALIIQIATMRKPDEARFFLM NRFMENISKPSSDDDAYNLIEDLKATQKQVEAHKLIKLQVSPFYHPFQKGLGELFGANKDFISDTDYLPTILETLQDIHR DPLLTESEKKYLVDFILGKVPSQVMLDSKQIKKNLSSVKAILRLGGANYLCQASLEKAFEGDHETLLNRLGGQCLSELMK GHLSDTVSLQLIEKINKSRDFSWVLNIAVKLNMLDSDKKDAHLKMFAEALKEDVEGQFVEERFNKSPHLLALAKKLEEKK QNDFIEEWKKPLSEEPLTVAQLLGETAKTGSKVLNEQQVAKYEVFFTDDFLDLAQMGTEVVGSCLNIKTGKSIDVMTILG NAIDGKTRMLAVKTTQDPQQPLQGRVMLRLLWDEEGKTPVIIMEGIRTRKPGDQEEAQIVDQALLEASIKVAEKLKVPLI CGFTVKPQPDVDYEQYPHQVQSLAPNRSPSEKFDPLEEQGEGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP >Mature_1106_residues MFMNTENYFSKDSLNLWDKESTNIGKLEKHQTLLEPQSEKWVGKLNKYILEGSITSKDVDRIEKYIKKKEGREKNVLLVC NKLVCISRIAIREKVIKDNTEGKNCKEFIGKISTILVDCSIDDILKNISDPDLFNKIIEEKLKGEKLDFESIEKIIDKKI ELGDKSGINEKLISLIQDLNTEEFLKIANKLFGYKQFKKENLDEIVKFKITKTSDINDKISIINKYNNSKDIIDDVIQQF KPASPEEGIKIAEECTLSSENRSILFQNFLSAKEEVKLEEALEFHEKLGLSLEDLAKQLPLLLKICDMEKNDYLANVKIK EALTNPQVNCHFASHLCIAKPQLLVTLFGEQGSFKDIFKIDKQLEVLRNVVAQTKDFKEFEENSLQDLTIELLDKGQEDK DLLDENVFSCLVAINKRDHIYCIENMVSSDAICGIIDTPLLLALQREEGRAETTTYSDISSSWRKEKKEQYLDALLSDPS TQQLALTRIDTGNQQEPSERIEYILENLDKIPLDDAIEAIKKDFKKLSDVSDSLLVKILTNFNLNAIKGVNEETNKKTLN IFAEEYPNLVPTLQKLIESSGKNHYALAKSLFSIAYLIDNMPKKGDQNKFRELLEKKEIQALIIQIATMRKPDEARFFLM NRFMENISKPSSDDDAYNLIEDLKATQKQVEAHKLIKLQVSPFYHPFQKGLGELFGANKDFISDTDYLPTILETLQDIHR DPLLTESEKKYLVDFILGKVPSQVMLDSKQIKKNLSSVKAILRLGGANYLCQASLEKAFEGDHETLLNRLGGQCLSELMK GHLSDTVSLQLIEKINKSRDFSWVLNIAVKLNMLDSDKKDAHLKMFAEALKEDVEGQFVEERFNKSPHLLALAKKLEEKK QNDFIEEWKKPLSEEPLTVAQLLGETAKTGSKVLNEQQVAKYEVFFTDDFLDLAQMGTEVVGSCLNIKTGKSIDVMTILG NAIDGKTRMLAVKTTQDPQQPLQGRVMLRLLWDEEGKTPVIIMEGIRTRKPGDQEEAQIVDQALLEASIKVAEKLKVPLI CGFTVKPQPDVDYEQYPHQVQSLAPNRSPSEKFDPLEEQGEGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 125972; Mature: 125972
Theoretical pI: Translated: 5.04; Mature: 5.04
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFMNTENYFSKDSLNLWDKESTNIGKLEKHQTLLEPQSEKWVGKLNKYILEGSITSKDVD CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH RIEKYIKKKEGREKNVLLVCNKLVCISRIAIREKVIKDNTEGKNCKEFIGKISTILVDCS HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEECC IDDILKNISDPDLFNKIIEEKLKGEKLDFESIEKIIDKKIELGDKSGINEKLISLIQDLN HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCC TEEFLKIANKLFGYKQFKKENLDEIVKFKITKTSDINDKISIINKYNNSKDIIDDVIQQF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHC KPASPEEGIKIAEECTLSSENRSILFQNFLSAKEEVKLEEALEFHEKLGLSLEDLAKQLP CCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH LLLKICDMEKNDYLANVKIKEALTNPQVNCHFASHLCIAKPQLLVTLFGEQGSFKDIFKI HHHHHHCCCCCCCEECEEHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHH DKQLEVLRNVVAQTKDFKEFEENSLQDLTIELLDKGQEDKDLLDENVFSCLVAINKRDHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE YCIENMVSSDAICGIIDTPLLLALQREEGRAETTTYSDISSSWRKEKKEQYLDALLSDPS EEHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TQQLALTRIDTGNQQEPSERIEYILENLDKIPLDDAIEAIKKDFKKLSDVSDSLLVKILT CHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NFNLNAIKGVNEETNKKTLNIFAEEYPNLVPTLQKLIESSGKNHYALAKSLFSIAYLIDN CCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC MPKKGDQNKFRELLEKKEIQALIIQIATMRKPDEARFFLMNRFMENISKPSSDDDAYNLI CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH EDLKATQKQVEAHKLIKLQVSPFYHPFQKGLGELFGANKDFISDTDYLPTILETLQDIHR HHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC DPLLTESEKKYLVDFILGKVPSQVMLDSKQIKKNLSSVKAILRLGGANYLCQASLEKAFE CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHC GDHETLLNRLGGQCLSELMKGHLSDTVSLQLIEKINKSRDFSWVLNIAVKLNMLDSDKKD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHEEEECCCCCCH AHLKMFAEALKEDVEGQFVEERFNKSPHLLALAKKLEEKKQNDFIEEWKKPLSEEPLTVA HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH QLLGETAKTGSKVLNEQQVAKYEVFFTDDFLDLAQMGTEVVGSCLNIKTGKSIDVMTILG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHC NAIDGKTRMLAVKTTQDPQQPLQGRVMLRLLWDEEGKTPVIIMEGIRTRKPGDQEEAQIV CCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHEEHEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHH DQALLEASIKVAEKLKVPLICGFTVKPQPDVDYEQYPHQVQSLAPNRSPSEKFDPLEEQG HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHC EGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP CCCHHCCHHHHHHCEEEECCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFMNTENYFSKDSLNLWDKESTNIGKLEKHQTLLEPQSEKWVGKLNKYILEGSITSKDVD CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH RIEKYIKKKEGREKNVLLVCNKLVCISRIAIREKVIKDNTEGKNCKEFIGKISTILVDCS HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEECC IDDILKNISDPDLFNKIIEEKLKGEKLDFESIEKIIDKKIELGDKSGINEKLISLIQDLN HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCC TEEFLKIANKLFGYKQFKKENLDEIVKFKITKTSDINDKISIINKYNNSKDIIDDVIQQF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHC KPASPEEGIKIAEECTLSSENRSILFQNFLSAKEEVKLEEALEFHEKLGLSLEDLAKQLP CCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH LLLKICDMEKNDYLANVKIKEALTNPQVNCHFASHLCIAKPQLLVTLFGEQGSFKDIFKI HHHHHHCCCCCCCEECEEHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHH DKQLEVLRNVVAQTKDFKEFEENSLQDLTIELLDKGQEDKDLLDENVFSCLVAINKRDHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE YCIENMVSSDAICGIIDTPLLLALQREEGRAETTTYSDISSSWRKEKKEQYLDALLSDPS EEHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TQQLALTRIDTGNQQEPSERIEYILENLDKIPLDDAIEAIKKDFKKLSDVSDSLLVKILT CHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NFNLNAIKGVNEETNKKTLNIFAEEYPNLVPTLQKLIESSGKNHYALAKSLFSIAYLIDN CCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC MPKKGDQNKFRELLEKKEIQALIIQIATMRKPDEARFFLMNRFMENISKPSSDDDAYNLI CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH EDLKATQKQVEAHKLIKLQVSPFYHPFQKGLGELFGANKDFISDTDYLPTILETLQDIHR HHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC DPLLTESEKKYLVDFILGKVPSQVMLDSKQIKKNLSSVKAILRLGGANYLCQASLEKAFE CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHC GDHETLLNRLGGQCLSELMKGHLSDTVSLQLIEKINKSRDFSWVLNIAVKLNMLDSDKKD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHEEEECCCCCCH AHLKMFAEALKEDVEGQFVEERFNKSPHLLALAKKLEEKKQNDFIEEWKKPLSEEPLTVA HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH QLLGETAKTGSKVLNEQQVAKYEVFFTDDFLDLAQMGTEVVGSCLNIKTGKSIDVMTILG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHC NAIDGKTRMLAVKTTQDPQQPLQGRVMLRLLWDEEGKTPVIIMEGIRTRKPGDQEEAQIV CCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHEEHEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHH DQALLEASIKVAEKLKVPLICGFTVKPQPDVDYEQYPHQVQSLAPNRSPSEKFDPLEEQG HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHC EGAVERTPEELSGLYTLKKTNTIWKP CCCHHCCHHHHHHCEEEECCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA