| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446533
Identifier: 46446533
GI number: 46446533
Start: 1088807
End: 1091212
Strand: Reverse
Name: 46446533
Synonym: pc0899
Alternate gene names: NA
Gene position: 1091212-1088807 (Counterclockwise)
Preceding gene: 46446536
Following gene: 46446532
Centisome position: 45.19
GC content: 33.83
Gene sequence:
>2406_bases ATGAAAATTCATGGATTAATTCCTTTAGAAAGGTTGATGAACCAAATTCAAAACGATATTGCTAATGGGAATTTAGCTAA AGCAAATTTAAAAATGCTTGCAATTCCCATTTTCGAAGCTGCTGGATGTATTTGTGTAATAGGAAATATTCTTTTTAAAT CAGTACAAAATGAAGGATTTAAAAGAAATCCGGAACCTTTTTATCGTCTTTTAGGGAAAGCAGGATTGTTGGCTTTTAAT ATTTTATTCGGCCCTTATTATATGCAAAGAAATCCCAAAGCATGTTATCAATATCACGTTTATACTGGATTAATCTCTGA TAATCGAATTGTACCGTCAAGCAATTCAGCTTCTCTTTCTTCACCAATCTGTATTCCTAGATCTTCATCTTCATCCTTTA TTACCCCCACAGGATCTAATATTACGCCCACAAGATCTGAAAAACAAATTCCACGTAACTCAATAAGGCAAGGTTCAATC GCTGTTACTTCACCTGATTCTACTGATATGCAAAAACTTACGATGCCAACAGTTAATCCAGCCACAGAAGGATTATCAGC TAAAAATTCTACTCCTCATTCAATAAATGCTATTTCAATAGAAATACCACAAGTTTTGCCTACTGCAACGCCAGCTCGAG CAAATCAACCTAACTCAAAAAGCATTGAATTACCCAATATTACAGTTGAATTACCCAATATTACATCTGTAACAACTCTA CATCAACAAGTAACTGTATTAGAAACAAATGCATATGTAGATTTGAAAGCAAAAGTTACCCAATCTAATGATTTTTATCA GAGTTCTTTTAATTTAGCTGAAGACCAACCGGTTTCTCCAACGGCTCCTCGAAATTATCTTGAAGAAACACCTTCTTTGA TAGCTGAAAAAGAAGGTATGAGAGTCGAAAATTTAGTTGATAATTTCCAAACAGAAACAAATTCTATCCCTTCAACTCTA GAGGCACTGAAGGAACCTGCTACTGTAACAGAGACATGTTTACCAAATGCTAATTTGAACCCAAAATTTCCTTTACATCA AGCTACAGAAGAGCCTGCTATAAAACAAATTAGGCCGATCAAGACGACTTCATCCAGTGACCAAACTTCTAAACAGGTAA CGGAAGTTTCTTCTCAAGTGACTGCTTCTACCCCTTCCACCACTTCACCTGTCAATCTTAAGCCTATAAGTTCAGATTTT TTTGATTTGCCAAGCTCTTTTTGGGATTCAAATTTACCTTCCGCTAGTACTGCTACCAAGACACTCATTGAAACTCCTAT TTTTTCTACCCCTCAAAAAGATAAAATAAAATCTAAAACAAAAAGACCCCCTTCAAGCCCAGAAAAAGGAACTGAATTAA AGACCGTATTAAAAACCGAAGAAGATAAAGTCATAGAAATTCAAAATTCTATCAACTGGTCATTGCGTTGGCTAACATCA TTAAAAATTGATCCTACACAACGCTTTCAGTTAAAAGTTAAATCTACCGCTATTCAAACGAAAGATTATGGAAAAATTTC GAAACGAGTTTTAGAATTTAAAAAATTGGAAAAACCAACTGATATAACAGTTATAAAAGGAAAATTCCTGGAATTAATTC AATCTAGTAATTTTAGCAAATCTGTATTGGATCAATGCTCTTATGATCAACTTAAGAACTTGTATGAAAATTTAAATATT ATCAAAAATCACATAGATGATTCTAGATTGATTATTCCAAAGTTATGTCAAGATTTAGAAAATCGTATGATCGATAAAAC AATTCAAAAATTTGCAAGTAGCGATACTCTTAACTTTCAATTACATCGTTTAATCTCCTCAATGTTGTCTAGACTTTACC CTTCGCAAGGTGTTCCAGAAGGAAGATCTGAGGGCCCAAGCCAACGTCTAATGCGACAAAATAATCCATCTAACACCCTA GATAAATTAGACGAATTTTTTTATCAAGACGTTGATCCATCCTCTTTTACTATTTTTGAATCTTATGCCATTCTTAAAAG AATTTTGATGCGAATATCAGGACCAAATGATGAGGACAGTCAATTTAAACACATTACGGCCATTTTTAGTGACCTTAGAG ATGCAATATCTAAAGATGCGTTCATTAATAAAGTGGTAGAAATTTCAGATTTGACAAAGCGTGCCTTTGTCATAGATCTT CTTTCTTTGCTTTATGGAACGTTGCAACAAGTTTGGTTGCCAGAAGAGGAAGAGAAATTAAAAAAAGACGTTTATAATCC TGACGTTCAGCGCAATACGGCTAATGCAATGCTAACAGGAGGAATGATTATCGCTTCATTATTTTGTCCAACTCATTCCT ACATAGTGTCACATGATATTTTAATTGATGTATTACTCGACTACCCTAAGCAATTTAAACGACTTAAAGCATCTTTTTCC ATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAACAACAATTAAATTATCCTTATTAAATAATCTTTGCGTTGACTTTTAAAAAAAAGTTTTTATAATTTTTTATTTTATT TATTATACAAGGGGCCAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GCTGTTTATTAAGCGAATAGAAGTTTATTTCTATTCGCTTAATATTAAGGGAATCTTCGAAAAGTTTATTGACAAAGTCC TTATTGCATGTAATGTTAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 801; Mature: 801
Protein sequence:
>801_residues MKIHGLIPLERLMNQIQNDIANGNLAKANLKMLAIPIFEAAGCICVIGNILFKSVQNEGFKRNPEPFYRLLGKAGLLAFN ILFGPYYMQRNPKACYQYHVYTGLISDNRIVPSSNSASLSSPICIPRSSSSSFITPTGSNITPTRSEKQIPRNSIRQGSI AVTSPDSTDMQKLTMPTVNPATEGLSAKNSTPHSINAISIEIPQVLPTATPARANQPNSKSIELPNITVELPNITSVTTL HQQVTVLETNAYVDLKAKVTQSNDFYQSSFNLAEDQPVSPTAPRNYLEETPSLIAEKEGMRVENLVDNFQTETNSIPSTL EALKEPATVTETCLPNANLNPKFPLHQATEEPAIKQIRPIKTTSSSDQTSKQVTEVSSQVTASTPSTTSPVNLKPISSDF FDLPSSFWDSNLPSASTATKTLIETPIFSTPQKDKIKSKTKRPPSSPEKGTELKTVLKTEEDKVIEIQNSINWSLRWLTS LKIDPTQRFQLKVKSTAIQTKDYGKISKRVLEFKKLEKPTDITVIKGKFLELIQSSNFSKSVLDQCSYDQLKNLYENLNI IKNHIDDSRLIIPKLCQDLENRMIDKTIQKFASSDTLNFQLHRLISSMLSRLYPSQGVPEGRSEGPSQRLMRQNNPSNTL DKLDEFFYQDVDPSSFTIFESYAILKRILMRISGPNDEDSQFKHITAIFSDLRDAISKDAFINKVVEISDLTKRAFVIDL LSLLYGTLQQVWLPEEEEKLKKDVYNPDVQRNTANAMLTGGMIIASLFCPTHSYIVSHDILIDVLLDYPKQFKRLKASFS I
Sequences:
>Translated_801_residues MKIHGLIPLERLMNQIQNDIANGNLAKANLKMLAIPIFEAAGCICVIGNILFKSVQNEGFKRNPEPFYRLLGKAGLLAFN ILFGPYYMQRNPKACYQYHVYTGLISDNRIVPSSNSASLSSPICIPRSSSSSFITPTGSNITPTRSEKQIPRNSIRQGSI AVTSPDSTDMQKLTMPTVNPATEGLSAKNSTPHSINAISIEIPQVLPTATPARANQPNSKSIELPNITVELPNITSVTTL HQQVTVLETNAYVDLKAKVTQSNDFYQSSFNLAEDQPVSPTAPRNYLEETPSLIAEKEGMRVENLVDNFQTETNSIPSTL EALKEPATVTETCLPNANLNPKFPLHQATEEPAIKQIRPIKTTSSSDQTSKQVTEVSSQVTASTPSTTSPVNLKPISSDF FDLPSSFWDSNLPSASTATKTLIETPIFSTPQKDKIKSKTKRPPSSPEKGTELKTVLKTEEDKVIEIQNSINWSLRWLTS LKIDPTQRFQLKVKSTAIQTKDYGKISKRVLEFKKLEKPTDITVIKGKFLELIQSSNFSKSVLDQCSYDQLKNLYENLNI IKNHIDDSRLIIPKLCQDLENRMIDKTIQKFASSDTLNFQLHRLISSMLSRLYPSQGVPEGRSEGPSQRLMRQNNPSNTL DKLDEFFYQDVDPSSFTIFESYAILKRILMRISGPNDEDSQFKHITAIFSDLRDAISKDAFINKVVEISDLTKRAFVIDL LSLLYGTLQQVWLPEEEEKLKKDVYNPDVQRNTANAMLTGGMIIASLFCPTHSYIVSHDILIDVLLDYPKQFKRLKASFS I >Mature_801_residues MKIHGLIPLERLMNQIQNDIANGNLAKANLKMLAIPIFEAAGCICVIGNILFKSVQNEGFKRNPEPFYRLLGKAGLLAFN ILFGPYYMQRNPKACYQYHVYTGLISDNRIVPSSNSASLSSPICIPRSSSSSFITPTGSNITPTRSEKQIPRNSIRQGSI AVTSPDSTDMQKLTMPTVNPATEGLSAKNSTPHSINAISIEIPQVLPTATPARANQPNSKSIELPNITVELPNITSVTTL HQQVTVLETNAYVDLKAKVTQSNDFYQSSFNLAEDQPVSPTAPRNYLEETPSLIAEKEGMRVENLVDNFQTETNSIPSTL EALKEPATVTETCLPNANLNPKFPLHQATEEPAIKQIRPIKTTSSSDQTSKQVTEVSSQVTASTPSTTSPVNLKPISSDF FDLPSSFWDSNLPSASTATKTLIETPIFSTPQKDKIKSKTKRPPSSPEKGTELKTVLKTEEDKVIEIQNSINWSLRWLTS LKIDPTQRFQLKVKSTAIQTKDYGKISKRVLEFKKLEKPTDITVIKGKFLELIQSSNFSKSVLDQCSYDQLKNLYENLNI IKNHIDDSRLIIPKLCQDLENRMIDKTIQKFASSDTLNFQLHRLISSMLSRLYPSQGVPEGRSEGPSQRLMRQNNPSNTL DKLDEFFYQDVDPSSFTIFESYAILKRILMRISGPNDEDSQFKHITAIFSDLRDAISKDAFINKVVEISDLTKRAFVIDL LSLLYGTLQQVWLPEEEEKLKKDVYNPDVQRNTANAMLTGGMIIASLFCPTHSYIVSHDILIDVLLDYPKQFKRLKASFS I
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 89552; Mature: 89552
Theoretical pI: Translated: 8.49; Mature: 8.49
Prosite motif: PS00636 DNAJ_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIHGLIPLERLMNQIQNDIANGNLAKANLKMLAIPIFEAAGCICVIGNILFKSVQNEGF CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC KRNPEPFYRLLGKAGLLAFNILFGPYYMQRNPKACYQYHVYTGLISDNRIVPSSNSASLS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEEEEEEECCCEECCCCCCCCCC SPICIPRSSSSSFITPTGSNITPTRSEKQIPRNSIRQGSIAVTSPDSTDMQKLTMPTVNP CCEEEECCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHCCCHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCCCCC ATEGLSAKNSTPHSINAISIEIPQVLPTATPARANQPNSKSIELPNITVELPNITSVTTL HHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCEEEEECCCCCHHHHH HQQVTVLETNAYVDLKAKVTQSNDFYQSSFNLAEDQPVSPTAPRNYLEETPSLIAEKEGM HHEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC RVENLVDNFQTETNSIPSTLEALKEPATVTETCLPNANLNPKFPLHQATEEPAIKQIRPI CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCC KTTSSSDQTSKQVTEVSSQVTASTPSTTSPVNLKPISSDFFDLPSSFWDSNLPSASTATK CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHCCHHHHCCCCCCCHHHHH TLIETPIFSTPQKDKIKSKTKRPPSSPEKGTELKTVLKTEEDKVIEIQNSINWSLRWLTS HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEE LKIDPTQRFQLKVKSTAIQTKDYGKISKRVLEFKKLEKPTDITVIKGKFLELIQSSNFSK ECCCCCCCEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCH SVLDQCSYDQLKNLYENLNIIKNHIDDSRLIIPKLCQDLENRMIDKTIQKFASSDTLNFQ HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH LHRLISSMLSRLYPSQGVPEGRSEGPSQRLMRQNNPSNTLDKLDEFFYQDVDPSSFTIFE HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH SYAILKRILMRISGPNDEDSQFKHITAIFSDLRDAISKDAFINKVVEISDLTKRAFVIDL HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSLLYGTLQQVWLPEEEEKLKKDVYNPDVQRNTANAMLTGGMIIASLFCPTHSYIVSHDI HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH LIDVLLDYPKQFKRLKASFSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKIHGLIPLERLMNQIQNDIANGNLAKANLKMLAIPIFEAAGCICVIGNILFKSVQNEGF CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC KRNPEPFYRLLGKAGLLAFNILFGPYYMQRNPKACYQYHVYTGLISDNRIVPSSNSASLS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEEEEEEECCCEECCCCCCCCCC SPICIPRSSSSSFITPTGSNITPTRSEKQIPRNSIRQGSIAVTSPDSTDMQKLTMPTVNP CCEEEECCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHCCCHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCCCCC ATEGLSAKNSTPHSINAISIEIPQVLPTATPARANQPNSKSIELPNITVELPNITSVTTL HHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCEEEEECCCCCHHHHH HQQVTVLETNAYVDLKAKVTQSNDFYQSSFNLAEDQPVSPTAPRNYLEETPSLIAEKEGM HHEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC RVENLVDNFQTETNSIPSTLEALKEPATVTETCLPNANLNPKFPLHQATEEPAIKQIRPI CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCC KTTSSSDQTSKQVTEVSSQVTASTPSTTSPVNLKPISSDFFDLPSSFWDSNLPSASTATK CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHCCHHHHCCCCCCCHHHHH TLIETPIFSTPQKDKIKSKTKRPPSSPEKGTELKTVLKTEEDKVIEIQNSINWSLRWLTS HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEE LKIDPTQRFQLKVKSTAIQTKDYGKISKRVLEFKKLEKPTDITVIKGKFLELIQSSNFSK ECCCCCCCEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCH SVLDQCSYDQLKNLYENLNIIKNHIDDSRLIIPKLCQDLENRMIDKTIQKFASSDTLNFQ HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH LHRLISSMLSRLYPSQGVPEGRSEGPSQRLMRQNNPSNTLDKLDEFFYQDVDPSSFTIFE HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH SYAILKRILMRISGPNDEDSQFKHITAIFSDLRDAISKDAFINKVVEISDLTKRAFVIDL HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSLLYGTLQQVWLPEEEEKLKKDVYNPDVQRNTANAMLTGGMIIASLFCPTHSYIVSHDI HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH LIDVLLDYPKQFKRLKASFSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA