| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is ntt_2 [H]
Identifier: 46445875
GI number: 46445875
Start: 338779
End: 340329
Strand: Direct
Name: ntt_2 [H]
Synonym: pc0241
Alternate gene names: 46445875
Gene position: 338779-340329 (Clockwise)
Preceding gene: 46445874
Following gene: 46445881
Centisome position: 14.03
GC content: 35.85
Gene sequence:
>1551_bases ATGTCTCAACAAGAATCAGAGTTTGGTAAATTGAGGGCATTTTTTTGGCCTATTCACGGCCATGAAGTCAAAAAAGTGCT GCCGATGATGTTGATGCTATTTTTGATTTGTTTCAACTATAGTATTTTACGCAATGTTAAAGATGCTATTGTTGTGACTG CTAAGGCTTCAGGGGCTGAAGTTATTCCATTTATTAAAGTATGGGTGCTGTTACCCACGGCAGTCTTATTTACTTTAATT TTTACTAAGTTGTCTAACCGTTTTAGCCAAGAAAAAGTTTTTTATATTGTCATTTCTACATTTTTGCTATTTTTTGGTTC GTTTACTTATATTTTTTATCCTTTACGTGACGTACTACATCCTCATCAACTATGCGATTACTTAGAAACGATTTTACCAG CGGGATTTAAAGGATTAATTGCCATGTTCCGTAATTGGTCATTTACTTTGTTTTATGTAATTTGTGAACTTTGGGGCAGT ATTGTTTTAACTGTCCTTTTTTGGGGATTTGCGAATGAAATCACAAAAATGACTGAAGCTCGTCGTTTTTATAGTATGCT TGGTGTCATTGCAAGTTTTGCCGCGACGATAGCAGGAATCATAGCCAATCTTCTTTCTAATGATCAAAGTTGGGAACAGA CTTTAAATATTCTCATGGTTGCTGTAATTGTAAGTGGAACGATAGCCATGGTTATTTTTCGTTGGATGAATAAAAATGTA CTCAATGGCCCAGAATTCCAAGAATTCCATGAAGCAAAACGCATTCAAAAAATGAAAAAAAGATTATCGATCCGAGAAAG TTTTACCTATCTCGCTAATTCTAAATATCTTATTTGTATTGCAGTTTTAGTTATTTCTTATAATCTTGTCATTAACTTAG TTGAAATTGTATGGAAAGACCAGCTTCGCCAACTTTATTCGTCAGCCCTTGATTATAATCGCTATATGAATAACATGACA TCAGCAGTCGGAATTATTGCCACAATCACATCCTTATTTATGTCTACAATGATTACTCGGTTTGGATGGACACGGACAGC TCTAGTAACACCGACTATTATGCTTGTCACAAGTGTGGGATTTTTTGCTTTTATGCTATTTCGAAATGATTTGGCTGATC CTGTTTATATATTAACAGGAACGACACCTTTAACTATAGCCGTCTTTTTTGGTGCAGCTCAAGTCTGCATGAGTAAAGCC TGTAAGTATTCTGTTTTTGATTCTACAAAAGAAATGGCTTTTATCCCTCTGGATTATGAAAGTAAATTGAAAGGAAAAGC TGCGATTGATGGTGTGGGTTCTCGTCTTGGTAAATCGGGCGGTTCCTTAATTCATCAAAGTTTATTGATGATTTTTGCAA CTGTTAGCTCCAGCGCTCCTTATGTAGCTGTGATCTTAATTGGCGTTATCATTGTTTGGATGCTCTGCGTACGTTCATTA GGTAAGCAATTTGCTGCTATTATTGGGGAAAAGGCTCGAGAAGATATTGGTGAATCTACTCCAAGAACGAGTGAAGAGCA AGTTTTACATCCCTTAAAAGCTGCATCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTATTTATTATTAATGTGCTTTTTATTTTTTTATTAATTAAATAAATAGTTGAGAATTAATAAAAAATATAATATACTAT TTTATAACAAAAGGTTTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAATATCATGTTTTGGTGCAGCAAATTTTACTAAAAAACAAGCGTTAAGGGTGGATATATATATATCCCTATATATATGA GTTTATTTTCAAATATCATT
Product: ADP/ATP translocase
Products: NA
Alternate protein names: ADP/ATP translocase 1 [H]
Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 515
Protein sequence:
>516_residues MSQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAEVIPFIKVWVLLPTAVLFTLI FTKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLHPHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGS IVLTVLFWGFANEITKMTEARRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNV LNGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKDQLRQLYSSALDYNRYMNNMT SAVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVGFFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKA CKYSVFDSTKEMAFIPLDYESKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSL GKQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS
Sequences:
>Translated_516_residues MSQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAEVIPFIKVWVLLPTAVLFTLI FTKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLHPHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGS IVLTVLFWGFANEITKMTEARRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNV LNGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKDQLRQLYSSALDYNRYMNNMT SAVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVGFFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKA CKYSVFDSTKEMAFIPLDYESKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSL GKQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS >Mature_515_residues SQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAEVIPFIKVWVLLPTAVLFTLIF TKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLHPHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGSI VLTVLFWGFANEITKMTEARRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNVL NGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKDQLRQLYSSALDYNRYMNNMTS AVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVGFFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKAC KYSVFDSTKEMAFIPLDYESKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSLG KQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS
Specific function: Unknown
COG id: COG3202
COG function: function code C; ATP/ADP translocase
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ADP/ATP translocase tlc family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004667 - InterPro: IPR016196 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58149; Mature: 58017
Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 4.1 %Met (Translated Protein) 5.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 3.9 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAE CCCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEECCCCCC VIPFIKVWVLLPTAVLFTLIFTKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGSIVLTVLFWGFANEITKMTEA HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LNGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKD CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLRQLYSSALDYNRYMNNMTSAVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKACKYSVFDSTKEMAFIPLDYE HHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCEEEEECCCH SKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSL HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GKQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SQQESEFGKLRAFFWPIHGHEVKKVLPMMLMLFLICFNYSILRNVKDAIVVTAKASGAE CCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEECCCCCC VIPFIKVWVLLPTAVLFTLIFTKLSNRFSQEKVFYIVISTFLLFFGSFTYIFYPLRDVLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PHQLCDYLETILPAGFKGLIAMFRNWSFTLFYVICELWGSIVLTVLFWGFANEITKMTEA HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RRFYSMLGVIASFAATIAGIIANLLSNDQSWEQTLNILMVAVIVSGTIAMVIFRWMNKNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LNGPEFQEFHEAKRIQKMKKRLSIRESFTYLANSKYLICIAVLVISYNLVINLVEIVWKD CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLRQLYSSALDYNRYMNNMTSAVGIIATITSLFMSTMITRFGWTRTALVTPTIMLVTSVG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FFAFMLFRNDLADPVYILTGTTPLTIAVFFGAAQVCMSKACKYSVFDSTKEMAFIPLDYE HHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCEEEEECCCH SKLKGKAAIDGVGSRLGKSGGSLIHQSLLMIFATVSSSAPYVAVILIGVIIVWMLCVRSL HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GKQFAAIIGEKAREDIGESTPRTSEEQVLHPLKAAS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 10192388; 10684935; 10871362 [H]