| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46445741
Identifier: 46445741
GI number: 46445741
Start: 172510
End: 174561
Strand: Reverse
Name: 46445741
Synonym: pc0107
Alternate gene names: NA
Gene position: 174561-172510 (Counterclockwise)
Preceding gene: 46445742
Following gene: 46445739
Centisome position: 7.23
GC content: 34.41
Gene sequence:
>2052_bases ATGTCTAGTCCTCATATTCAACCTGTGCCCCCGTCAAGTTCTAATCCTGCATCAACTTTAGATCCGAAAAGAACTTTGCC AAAAAAACCTACTGCTCCTTCAACAAAAAAAAGTGGTGGTATTTTTAATCCATTCGGCTTCAGTAAACCTTCTAGTAGCT CCAGTTCGACAACAAAAAAAGCAGAATCGATTTTTACAAATGTTAATCCAATAACTCAATCGAGTAAAGCCAGTGCTCAA AAACCTCTGGCAAATAGGCGTTCTTCTATTTCTTCAACCAAAACTGAATCAGGACCTTCTGATTTTATAGACAGAAAAGT AAAGAGAGCTTCTTCAAAACAATTACCACTGACTCAAGAAACGCAAAGTTCTGAAGTTGTTTCCTTAGAATCTGTTCAAT CAGAACTCCACAACTTCGCAAAAAACTTTACCTCCACCTTATCGCTAATCAGACAAGAATTACAACAAGAAGTGGATGAG TTACCAGAAGAATTTAAAAATCGCATAAACTTTGCTACTGGCTTTGCGCTTGCGGATTCAGATAATGGCTTAGATGAAAG TAAGCTGGCCCAAAAGGTTTGGAAGCGTCTTGATAGCCAGTGGAAACAGCTTGCCAGTCACGTTAATACTTCTCAAAATT CCGCTAAAAGTCGACGGCTAAGTTTCAGCCCTGATGATGAAAGCATTAAAAAGTTAACAGAAAGCGTTTCAAGGGGAATT CCTTCAAGATCAGATGTTGCAAAAAACTTAGAAAGTATAAAAGATGAAACGCAGCATGGAAATTATATTTGCAATGTTTA TTACAAGCCTTTGTGTATTGATGATCTTTCTGAAAATAGTGAGATAAACGAAGTAAATCCTGGCTATTTAACCTCTGCAA AATGCCCCACAATTACTCTATTTACCTACATGCAGCATTTACAACTAGTAGCTCAACACTTTTCTAATTTGAGTAACATA CCACCAAAACCTTCTTTTAATGATAAAAATCTGAAGGACTTAATCACAAAATTTATAGAAAGTTTAAACAATAAATTCAA AAAAACACCTCGTGACATTGTCCGTTTTTGTCAACAATTGGGAAGAAGTGTTCATCTTTATGTTGAAAAACTAGAAAATA CCCTTTATATCACTTATAAAGAACCTGTTAATAAAGCTGGGGCTGATTATCAGCAAATTGCAAATCGTATTCTTGAAACT ATCACTAGTAATGATAAAGGAAGCTGGGATGCAGATATGCGAAGAATTTTATGCAGCTATGGATTGCATATCAAAGGACT TGCTCTACCTCCAGGATTAAATTGGGAAAAAGAATTACAAGAACACTATTTTTATTCAGATAAGCTAAATCTTCCCGATG AATTTAAAACATGGCTTAAGCAGCAATTTAATGAGAAAAACTGGGACTTCAGTGATGTCGAGAAAACATTAAGCAATCTT AAGAGCGTTCATCACAAAGTCTCTAACAGGTTAAAGAAAAGTTTGAAAACTTTCTTAACGTTATTAATGCAAGGAGTAAA ATTAAATCTTCAACAACAAGAATGTATAGAGCTTTTATCTATCATGGGATCTGTAGAAAAAGAAAAAGTTAGCATTTCCA CTATCTTTACAAGATTTAATGAAGTATTTAGCAAAATCTCAGAAAGCCAGAATAGTGAAATTAAAAAACTTCTCCCTTTT TTACAAATTTTAAGACAAGATATGCTCATTTCTATTCATAGAGAAACTGAGAATGCCTGGCGTTTCATTCGGGGTATAGA ATCTAAACTCATTACAGACTTACCAGAATCGAATAAAAAGGTAAATATTAAATGGGACGATTTTGGAAGTAAAATATGCA TTTCTCGTGACGCACAGTTAGAAGGGCATCCAGAATGTATCTTAAAATCTAGCATCACTATTTCATCAACGGAAGAAGGA GCTTGGATTGTTCTACCTAATTTAGAAATTACTTCTCCAAAAATCTCTGATATTAGCTTTAAAGAAAGATACATGGAATT AATTGTGACATTAAAAGCCATGGGTCTTCCGTATAGCGAAATCATTGCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAAAATAAATATGCTTTGCAACTGTAAATCTAAATATATTAAAGTTTTATTTTAAAAATTCAATTATTAAGCTTAATTT TAAATAAAGTATAGGTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CCCTCACCTTATCGATGCTGAAGTTCCTTCAGCATCGATTGTGCGCTGCATAATCGTAGCGCACACGATCTAAGAGCTCT TGATCAATTGGACAAGGCTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 683; Mature: 682
Protein sequence:
>683_residues MSSPHIQPVPPSSSNPASTLDPKRTLPKKPTAPSTKKSGGIFNPFGFSKPSSSSSSTTKKAESIFTNVNPITQSSKASAQ KPLANRRSSISSTKTESGPSDFIDRKVKRASSKQLPLTQETQSSEVVSLESVQSELHNFAKNFTSTLSLIRQELQQEVDE LPEEFKNRINFATGFALADSDNGLDESKLAQKVWKRLDSQWKQLASHVNTSQNSAKSRRLSFSPDDESIKKLTESVSRGI PSRSDVAKNLESIKDETQHGNYICNVYYKPLCIDDLSENSEINEVNPGYLTSAKCPTITLFTYMQHLQLVAQHFSNLSNI PPKPSFNDKNLKDLITKFIESLNNKFKKTPRDIVRFCQQLGRSVHLYVEKLENTLYITYKEPVNKAGADYQQIANRILET ITSNDKGSWDADMRRILCSYGLHIKGLALPPGLNWEKELQEHYFYSDKLNLPDEFKTWLKQQFNEKNWDFSDVEKTLSNL KSVHHKVSNRLKKSLKTFLTLLMQGVKLNLQQQECIELLSIMGSVEKEKVSISTIFTRFNEVFSKISESQNSEIKKLLPF LQILRQDMLISIHRETENAWRFIRGIESKLITDLPESNKKVNIKWDDFGSKICISRDAQLEGHPECILKSSITISSTEEG AWIVLPNLEITSPKISDISFKERYMELIVTLKAMGLPYSEIIA
Sequences:
>Translated_683_residues MSSPHIQPVPPSSSNPASTLDPKRTLPKKPTAPSTKKSGGIFNPFGFSKPSSSSSSTTKKAESIFTNVNPITQSSKASAQ KPLANRRSSISSTKTESGPSDFIDRKVKRASSKQLPLTQETQSSEVVSLESVQSELHNFAKNFTSTLSLIRQELQQEVDE LPEEFKNRINFATGFALADSDNGLDESKLAQKVWKRLDSQWKQLASHVNTSQNSAKSRRLSFSPDDESIKKLTESVSRGI PSRSDVAKNLESIKDETQHGNYICNVYYKPLCIDDLSENSEINEVNPGYLTSAKCPTITLFTYMQHLQLVAQHFSNLSNI PPKPSFNDKNLKDLITKFIESLNNKFKKTPRDIVRFCQQLGRSVHLYVEKLENTLYITYKEPVNKAGADYQQIANRILET ITSNDKGSWDADMRRILCSYGLHIKGLALPPGLNWEKELQEHYFYSDKLNLPDEFKTWLKQQFNEKNWDFSDVEKTLSNL KSVHHKVSNRLKKSLKTFLTLLMQGVKLNLQQQECIELLSIMGSVEKEKVSISTIFTRFNEVFSKISESQNSEIKKLLPF LQILRQDMLISIHRETENAWRFIRGIESKLITDLPESNKKVNIKWDDFGSKICISRDAQLEGHPECILKSSITISSTEEG AWIVLPNLEITSPKISDISFKERYMELIVTLKAMGLPYSEIIA >Mature_682_residues SSPHIQPVPPSSSNPASTLDPKRTLPKKPTAPSTKKSGGIFNPFGFSKPSSSSSSTTKKAESIFTNVNPITQSSKASAQK PLANRRSSISSTKTESGPSDFIDRKVKRASSKQLPLTQETQSSEVVSLESVQSELHNFAKNFTSTLSLIRQELQQEVDEL PEEFKNRINFATGFALADSDNGLDESKLAQKVWKRLDSQWKQLASHVNTSQNSAKSRRLSFSPDDESIKKLTESVSRGIP SRSDVAKNLESIKDETQHGNYICNVYYKPLCIDDLSENSEINEVNPGYLTSAKCPTITLFTYMQHLQLVAQHFSNLSNIP PKPSFNDKNLKDLITKFIESLNNKFKKTPRDIVRFCQQLGRSVHLYVEKLENTLYITYKEPVNKAGADYQQIANRILETI TSNDKGSWDADMRRILCSYGLHIKGLALPPGLNWEKELQEHYFYSDKLNLPDEFKTWLKQQFNEKNWDFSDVEKTLSNLK SVHHKVSNRLKKSLKTFLTLLMQGVKLNLQQQECIELLSIMGSVEKEKVSISTIFTRFNEVFSKISESQNSEIKKLLPFL QILRQDMLISIHRETENAWRFIRGIESKLITDLPESNKKVNIKWDDFGSKICISRDAQLEGHPECILKSSITISSTEEGA WIVLPNLEITSPKISDISFKERYMELIVTLKAMGLPYSEIIA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 77420; Mature: 77288
Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSSPHIQPVPPSSSNPASTLDPKRTLPKKPTAPSTKKSGGIFNPFGFSKPSSSSSSTTKK CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH AESIFTNVNPITQSSKASAQKPLANRRSSISSTKTESGPSDFIDRKVKRASSKQLPLTQE HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC TQSSEVVSLESVQSELHNFAKNFTSTLSLIRQELQQEVDELPEEFKNRINFATGFALADS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECC DNGLDESKLAQKVWKRLDSQWKQLASHVNTSQNSAKSRRLSFSPDDESIKKLTESVSRGI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC PSRSDVAKNLESIKDETQHGNYICNVYYKPLCIDDLSENSEINEVNPGYLTSAKCPTITL CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCEECCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHH FTYMQHLQLVAQHFSNLSNIPPKPSFNDKNLKDLITKFIESLNNKFKKTPRDIVRFCQQL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH GRSVHLYVEKLENTLYITYKEPVNKAGADYQQIANRILETITSNDKGSWDADMRRILCSY CCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHC GLHIKGLALPPGLNWEKELQEHYFYSDKLNLPDEFKTWLKQQFNEKNWDFSDVEKTLSNL CCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH KSVHHKVSNRLKKSLKTFLTLLMQGVKLNLQQQECIELLSIMGSVEKEKVSISTIFTRFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH EVFSKISESQNSEIKKLLPFLQILRQDMLISIHRETENAWRFIRGIESKLITDLPESNKK HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE VNIKWDDFGSKICISRDAQLEGHPECILKSSITISSTEEGAWIVLPNLEITSPKISDISF EEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHEECCEEEECCCCCCEEEECCCEECCCCCCCCHH KERYMELIVTLKAMGLPYSEIIA HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC >Mature Secondary Structure SSPHIQPVPPSSSNPASTLDPKRTLPKKPTAPSTKKSGGIFNPFGFSKPSSSSSSTTKK CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH AESIFTNVNPITQSSKASAQKPLANRRSSISSTKTESGPSDFIDRKVKRASSKQLPLTQE HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC TQSSEVVSLESVQSELHNFAKNFTSTLSLIRQELQQEVDELPEEFKNRINFATGFALADS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECC DNGLDESKLAQKVWKRLDSQWKQLASHVNTSQNSAKSRRLSFSPDDESIKKLTESVSRGI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC PSRSDVAKNLESIKDETQHGNYICNVYYKPLCIDDLSENSEINEVNPGYLTSAKCPTITL CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCEECCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHH FTYMQHLQLVAQHFSNLSNIPPKPSFNDKNLKDLITKFIESLNNKFKKTPRDIVRFCQQL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH GRSVHLYVEKLENTLYITYKEPVNKAGADYQQIANRILETITSNDKGSWDADMRRILCSY CCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHC GLHIKGLALPPGLNWEKELQEHYFYSDKLNLPDEFKTWLKQQFNEKNWDFSDVEKTLSNL CCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH KSVHHKVSNRLKKSLKTFLTLLMQGVKLNLQQQECIELLSIMGSVEKEKVSISTIFTRFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH EVFSKISESQNSEIKKLLPFLQILRQDMLISIHRETENAWRFIRGIESKLITDLPESNKK HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE VNIKWDDFGSKICISRDAQLEGHPECILKSSITISSTEEGAWIVLPNLEITSPKISDISF EEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHEECCEEEECCCCCCEEEECCCEECCCCCCCCHH KERYMELIVTLKAMGLPYSEIIA HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA