| Definition | Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome chromosome I, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_005823 |
| Length | 4,277,185 |
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The map label for this gene is yehM [H]
Identifier: 45658733
GI number: 45658733
Start: 3521950
End: 3524247
Strand: Direct
Name: yehM [H]
Synonym: LIC12903
Alternate gene names: 45658733
Gene position: 3521950-3524247 (Clockwise)
Preceding gene: 45658732
Following gene: 45658734
Centisome position: 82.34
GC content: 35.77
Gene sequence:
>2298_bases ATGAATTCTATTTTTTTCTTCCCGATACGACATCACAGCGTTTCTGCTTCTCTCGCTCTTCAAAAATATATAAATGACTT ACGTCCTTCTATAATTTTAATCGAAGGCCCTTATGATTTCAATCCAAAGTTAGAAGAATTATTTTTACCTCATACCCTAC CGATCGCAATCTACAGCGTTATCAGAGACGAACAAGGGATTTCTAAAGGTGCATATTATCCTTTTTGCAATTACTCTCCA GAATGGATTGCTCTACAAACAGCCAAATCCCTAAAAATTCCTGCTCGTTTTATAGATCTTCCTTGGGCTGATTTATGTTC TATCAAAAGTGTTTCAGAAAAACCAAACGCTAAAACGTTACAACTGTATAACGACGAACCTTTTTGGAATAATAATTTCA TTTTGGCACTTTGTAAAAAAATGGGAGTTTCTAATTTTCATGATCTATGGGACGAACTTTTCGAAATTAATCGCCTAACA CAAATAGACGAATACAAAGAACAAGTGACCCTTTTTTGTAATTACGCTCGAAAAGAAAATAATCATTCCGAAGAAATCGT TCAAGCAAGAGAAGCATTTATGACACATCAGATTCGACTTGCACAAACACAATTTACGAGTCCGATTTTAGTAGTTACCG GAGGTTATCATTCTTATACACTCCAAGAAAAAATTTCCAAACCGCCCCAAACAGACGAATTATTTTGGGTCAATCAAAAA GAAAAATTTTATGACCGAGAAATTTCCCTAACTCCTTATTCCAACTCTAGATTAAACGCGACTAATGGTTATACTTCCGG AATACCAAGTCCAGGTTTTTATGATTTTGTCTGGGAAAGTTTTCAAAAACAAGAATCGTTTAATCATCGCCCACTGGTTC AAAAAATCCTAAGTGTATTTCGTAAAAAAGGATATAGAATTGCTTCCGCAGATAGGATCGCTTGCGAAACCATGAGTAGA GCCCTGGCCGATTTACGAGGTCACAAAAATATTTGGAAAAAAGATCTGATCGACGGCTTTCGTGCGACTATCATCAAAGA TGAGATTGCAAGAGACGTTAGACACATCTTACTTGATTGTATTTCAGAAGTGATGGAAGGGGATCGCATCGGCCGTTTAG CAGAAGGAACATCTCTACCCCCAATCTTTTTTGACATAGAAACTACATTAAAAAAATTGAATCTTTTAGCAAAACGAGAA ACTAGAATTTTAGAATTGAATTTGACGGATTTAGAACAAAGGGAACAAAGCAAAGTTTTACATCGTTTATATCTTTTAGA AATAGCCGGTTACACCTTTTTAGAAGGTACGGATATGATCTCTCGAAAAGATTTAGAAAAAATAAGAGAAAAATGGAACA TCTCCATGAAAACGGAGTTTCATTCTTCTTGTATAGAAGCATCCCGTTACGGAGCTACACTTTCAGAAGCAGCAGCAGGA GTATTAAACCAACGTATCCGTTCAGAAATTGATCCTGAACTGGCAGCAGCCTGTCTCGTTGATGCAGCGTTAGCCGGTTT AGGTAAACATTTAACTTTTTTACTAAAACAATTTTCAGATATAATTCCGATTGCAGGCGATTTTCTGAAAATGTGTTCCG CGTTAAAGCATATTTCTTATTTATATAAATATGATGAAGTTATAATATTAGAAAATAGAAAAAGTTTAGAGGGAATTTTT AGAGAAAGTTATTTACGATGTCTCAATCTTTTGGATCGATTAGGAGCCACGTCCTCTGACGGCCTAAAATTAGCCCAAGG AGTTCAAACAATCGTACAGACGTATCAACATTTTGCCGAACCTTTAAAGTTATCCTTGGAAGAGATACGAGGTGTGTTCT CACGCTTGGGAATAGATTTAAAAATAGATTCTTTTGTACGCGGAGCTGTTTGTGGGGGGCTAAATTTAATCGACGAACAA CCAATCTTAGATCAACTCAATTCATTTTATGATCCCATCGAACTTGGAGATTTTTTATCCGGATTTTTTTTAATTGCTCG AGAAACGGCCCAAAGAGATAAAACACTTTTAACTGCACTAAACATTAGAATATCAGAATTATCTCATTCTGAATTTTTAG AGGCCTTACCCGCCCTTCGTATGGCTTTTACTTTTTTTACTCCTAGAGAAAAGTATAAAATCGGCCAAAATTTATTTGAA ATCATACAACCTCCCCTAGGTAAACTATCCGATTACGAGAATCAAGAAACGATCCTTAGAGCGATCGAATTTGAAAGAAT CCTATTTGAAACCGCATTCAAATACGGAATTAGGACTACTTATTACGAAGACATATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCAAGTTTTTTATACCAAATTACGGGTACAAATAGTTATTATGACTTCTAATATAACTTCCTATTTTTCGAATATTCTAA AAATTGAAATATAATTTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATGGAAAAATACAAATCGGAATTATTAAATGATCCACCAAAAACAAAGAAAAAATCAAGACACATTTTTTATGCTTCA TTTTATGGATATAACTCAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 765; Mature: 765
Protein sequence:
>765_residues MNSIFFFPIRHHSVSASLALQKYINDLRPSIILIEGPYDFNPKLEELFLPHTLPIAIYSVIRDEQGISKGAYYPFCNYSP EWIALQTAKSLKIPARFIDLPWADLCSIKSVSEKPNAKTLQLYNDEPFWNNNFILALCKKMGVSNFHDLWDELFEINRLT QIDEYKEQVTLFCNYARKENNHSEEIVQAREAFMTHQIRLAQTQFTSPILVVTGGYHSYTLQEKISKPPQTDELFWVNQK EKFYDREISLTPYSNSRLNATNGYTSGIPSPGFYDFVWESFQKQESFNHRPLVQKILSVFRKKGYRIASADRIACETMSR ALADLRGHKNIWKKDLIDGFRATIIKDEIARDVRHILLDCISEVMEGDRIGRLAEGTSLPPIFFDIETTLKKLNLLAKRE TRILELNLTDLEQREQSKVLHRLYLLEIAGYTFLEGTDMISRKDLEKIREKWNISMKTEFHSSCIEASRYGATLSEAAAG VLNQRIRSEIDPELAAACLVDAALAGLGKHLTFLLKQFSDIIPIAGDFLKMCSALKHISYLYKYDEVIILENRKSLEGIF RESYLRCLNLLDRLGATSSDGLKLAQGVQTIVQTYQHFAEPLKLSLEEIRGVFSRLGIDLKIDSFVRGAVCGGLNLIDEQ PILDQLNSFYDPIELGDFLSGFFLIARETAQRDKTLLTALNIRISELSHSEFLEALPALRMAFTFFTPREKYKIGQNLFE IIQPPLGKLSDYENQETILRAIEFERILFETAFKYGIRTTYYEDI
Sequences:
>Translated_765_residues MNSIFFFPIRHHSVSASLALQKYINDLRPSIILIEGPYDFNPKLEELFLPHTLPIAIYSVIRDEQGISKGAYYPFCNYSP EWIALQTAKSLKIPARFIDLPWADLCSIKSVSEKPNAKTLQLYNDEPFWNNNFILALCKKMGVSNFHDLWDELFEINRLT QIDEYKEQVTLFCNYARKENNHSEEIVQAREAFMTHQIRLAQTQFTSPILVVTGGYHSYTLQEKISKPPQTDELFWVNQK EKFYDREISLTPYSNSRLNATNGYTSGIPSPGFYDFVWESFQKQESFNHRPLVQKILSVFRKKGYRIASADRIACETMSR ALADLRGHKNIWKKDLIDGFRATIIKDEIARDVRHILLDCISEVMEGDRIGRLAEGTSLPPIFFDIETTLKKLNLLAKRE TRILELNLTDLEQREQSKVLHRLYLLEIAGYTFLEGTDMISRKDLEKIREKWNISMKTEFHSSCIEASRYGATLSEAAAG VLNQRIRSEIDPELAAACLVDAALAGLGKHLTFLLKQFSDIIPIAGDFLKMCSALKHISYLYKYDEVIILENRKSLEGIF RESYLRCLNLLDRLGATSSDGLKLAQGVQTIVQTYQHFAEPLKLSLEEIRGVFSRLGIDLKIDSFVRGAVCGGLNLIDEQ PILDQLNSFYDPIELGDFLSGFFLIARETAQRDKTLLTALNIRISELSHSEFLEALPALRMAFTFFTPREKYKIGQNLFE IIQPPLGKLSDYENQETILRAIEFERILFETAFKYGIRTTYYEDI >Mature_765_residues MNSIFFFPIRHHSVSASLALQKYINDLRPSIILIEGPYDFNPKLEELFLPHTLPIAIYSVIRDEQGISKGAYYPFCNYSP EWIALQTAKSLKIPARFIDLPWADLCSIKSVSEKPNAKTLQLYNDEPFWNNNFILALCKKMGVSNFHDLWDELFEINRLT QIDEYKEQVTLFCNYARKENNHSEEIVQAREAFMTHQIRLAQTQFTSPILVVTGGYHSYTLQEKISKPPQTDELFWVNQK EKFYDREISLTPYSNSRLNATNGYTSGIPSPGFYDFVWESFQKQESFNHRPLVQKILSVFRKKGYRIASADRIACETMSR ALADLRGHKNIWKKDLIDGFRATIIKDEIARDVRHILLDCISEVMEGDRIGRLAEGTSLPPIFFDIETTLKKLNLLAKRE TRILELNLTDLEQREQSKVLHRLYLLEIAGYTFLEGTDMISRKDLEKIREKWNISMKTEFHSSCIEASRYGATLSEAAAG VLNQRIRSEIDPELAAACLVDAALAGLGKHLTFLLKQFSDIIPIAGDFLKMCSALKHISYLYKYDEVIILENRKSLEGIF RESYLRCLNLLDRLGATSSDGLKLAQGVQTIVQTYQHFAEPLKLSLEEIRGVFSRLGIDLKIDSFVRGAVCGGLNLIDEQ PILDQLNSFYDPIELGDFLSGFFLIARETAQRDKTLLTALNIRISELSHSEFLEALPALRMAFTFFTPREKYKIGQNLFE IIQPPLGKLSDYENQETILRAIEFERILFETAFKYGIRTTYYEDI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788439, Length=759, Percent_Identity=29.6442687747036, Blast_Score=264, Evalue=2e-71,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88025; Mature: 88025
Theoretical pI: Translated: 6.33; Mature: 6.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNSIFFFPIRHHSVSASLALQKYINDLRPSIILIEGPYDFNPKLEELFLPHTLPIAIYSV CCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHH IRDEQGISKGAYYPFCNYSPEWIALQTAKSLKIPARFIDLPWADLCSIKSVSEKPNAKTL HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEE QLYNDEPFWNNNFILALCKKMGVSNFHDLWDELFEINRLTQIDEYKEQVTLFCNYARKEN EEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NHSEEIVQAREAFMTHQIRLAQTQFTSPILVVTGGYHSYTLQEKISKPPQTDELFWVNQK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEHHHHHCCCCCCCCEEEECCH EKFYDREISLTPYSNSRLNATNGYTSGIPSPGFYDFVWESFQKQESFNHRPLVQKILSVF HHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH RKKGYRIASADRIACETMSRALADLRGHKNIWKKDLIDGFRATIIKDEIARDVRHILLDC HHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISEVMEGDRIGRLAEGTSLPPIFFDIETTLKKLNLLAKRETRILELNLTDLEQREQSKVL HHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH HRLYLLEIAGYTFLEGTDMISRKDLEKIREKWNISMKTEFHSSCIEASRYGATLSEAAAG HHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH VLNQRIRSEIDPELAAACLVDAALAGLGKHLTFLLKQFSDIIPIAGDFLKMCSALKHISY HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYKYDEVIILENRKSLEGIFRESYLRCLNLLDRLGATSSDGLKLAQGVQTIVQTYQHFAE HHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLKLSLEEIRGVFSRLGIDLKIDSFVRGAVCGGLNLIDEQPILDQLNSFYDPIELGDFLS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH GFFLIARETAQRDKTLLTALNIRISELSHSEFLEALPALRMAFTFFTPREKYKIGQNLFE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH IIQPPLGKLSDYENQETILRAIEFERILFETAFKYGIRTTYYEDI HHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNSIFFFPIRHHSVSASLALQKYINDLRPSIILIEGPYDFNPKLEELFLPHTLPIAIYSV CCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHH IRDEQGISKGAYYPFCNYSPEWIALQTAKSLKIPARFIDLPWADLCSIKSVSEKPNAKTL HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEE QLYNDEPFWNNNFILALCKKMGVSNFHDLWDELFEINRLTQIDEYKEQVTLFCNYARKEN EEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NHSEEIVQAREAFMTHQIRLAQTQFTSPILVVTGGYHSYTLQEKISKPPQTDELFWVNQK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEHHHHHCCCCCCCCEEEECCH EKFYDREISLTPYSNSRLNATNGYTSGIPSPGFYDFVWESFQKQESFNHRPLVQKILSVF HHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH RKKGYRIASADRIACETMSRALADLRGHKNIWKKDLIDGFRATIIKDEIARDVRHILLDC HHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISEVMEGDRIGRLAEGTSLPPIFFDIETTLKKLNLLAKRETRILELNLTDLEQREQSKVL HHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH HRLYLLEIAGYTFLEGTDMISRKDLEKIREKWNISMKTEFHSSCIEASRYGATLSEAAAG HHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH VLNQRIRSEIDPELAAACLVDAALAGLGKHLTFLLKQFSDIIPIAGDFLKMCSALKHISY HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYKYDEVIILENRKSLEGIFRESYLRCLNLLDRLGATSSDGLKLAQGVQTIVQTYQHFAE HHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLKLSLEEIRGVFSRLGIDLKIDSFVRGAVCGGLNLIDEQPILDQLNSFYDPIELGDFLS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH GFFLIARETAQRDKTLLTALNIRISELSHSEFLEALPALRMAFTFFTPREKYKIGQNLFE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH IIQPPLGKLSDYENQETILRAIEFERILFETAFKYGIRTTYYEDI HHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9278503 [H]