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The map label for this gene is 45658188

Identifier: 45658188

GI number: 45658188

Start: 2834668

End: 2837622

Strand: Direct

Name: 45658188

Synonym: LIC12342

Alternate gene names: NA

Gene position: 2834668-2837622 (Clockwise)

Preceding gene: 45658187

Following gene: 45658189

Centisome position: 66.27

GC content: 34.82

Gene sequence:

>2955_bases
ATGAAACAATTCCTTTCCAGAATCACAGATTCAATTTTACTCAATCCGATTCGTTCTTGTAGCATACTTTTTGTTTTACT
TCTTCTTTCTTTTTGGCAAGCTTCTAAACTTACAGTCAATAGTAACAACTTAGATCTTCTTCCAAAAAATAATCCTTCTG
TAGTCAAAACCCAAAAAGTAATCGAGATGATCGGAGGAAACGGTTTTTACATCCTCAGTATCAAATTTAAAGACGAAAAG
GGAATGACGGATCATTTAGTCAAAGCCTTTGTCGCAAGAAAAAAAGGACAACCAGAGATCGCTGAAAAAGAACTGAAAGA
AGCTGAAAAGATAAAACAACAAAACGTTTCTTATTACAAAGAAAGAGAAAATGCGATCAAAAAGGCTTCGGATATTTTGA
ATGAAAGACTTTTGAAAGAGAAAAAATTTGTTCAATATATTTCTTATCGTTACAACGTATCTTTTTTACAGGACAGACTT
CCTTTATTTCTAAAAACTGAAGACTTAATCGAAGTAAGAAAACGAGTCAAAAGAAAAATCGACGAAGAAGTAGAAAGGGC
CAATCCGTTTTTTATCAAACTTTCGAACGAAGAATACAATCCGGATTTTAACGACATTCTTTCCAAGTATCAAAAACTTG
CAAAAAGAGATATATTCGACGAATATAATATTTCTCCGGATAAAGGGATGTTAATCTTTTTGATAAAACCCGCCGGTTCT
TTTACCAATATAGAATTTAACATAGCGTTAGACAAAAAAATCAAGGAAATCGTAGCCGATCTTGGTTTAGATAAAAATGG
AATTCAAGTCGGCTATACTGGAACGTATAGACTTCATTTAGACGACTACGAAACTCTGATGGCGGCGCTAAAACCAATCG
CAATCACTTCCTTTATCGGAATCGCCTTACTTTTACTTTTCTTTTTTAGAAATCCACTTTTTATTCTCATACTTCTCATT
TCTCTTCTTTCCGGAATTTTATTCTCTTTTGGACTCACCACGATCGTAATCGGTCAGCTCAATTCTGTAACCAGTATCAT
CGCGTCCATTTTAATGGGTCTTGGAATCGACTACGGAATTCAGTTTTTATATCGTTTCCGAGAAGAATTTACCAGAGAAC
AAAATACTCTTCGTTCTATCAAAGACACAATCTATCATACTGGAATCGCATCTTTTATCTCGGCTCTGACAACTACTTCC
GCGTTTGTAGTACTTGCGTTTTCCGAATTCAGAGGTTTTAGTGAGTTCGGAATTATTGCTACATATGGAATTTTAATCAT
AGCAATTTCGATGTATGGAGTAACCGCTCTTCAAATTACACTCCTTTTTCGTTTGTTTCCTTCTATCAAAAGTAAGTTTC
TTCTTTCGGTTAAAGAACAATCCACTTCTCCTTTTCTCTACCGCTTTTACAAAAAGCCGGGGCTTTTAACGTTAGTCGTC
ATTATAGTCGTTTTGATGATTTCATTTTTTAATTTCAGCCCCGGAATTCAGTTCAATTATAATGGAAGAGATCTAATTGT
AGACAATCTGGATTCGGTCAATTTATACGATGAAATTGGAGATAGATTCGATATTAGTTCAGATCCGCAAGTAATCGTAG
TAGATACTTTAGAAGAATCGGAAGCCGTTTTCGATTATATGACTCCCGTTCCCGACGAAATCGCGGGTTCCGTGGATCAG
GTGGTTTCTCTTTGGAATTTTGTTCCTCCAAAAGGACAACAAAGAGCAAATCTAAAAATTTTAAAACAACTTCAATCGGA
TATGAAACCTGTCAAAGCCAGTTTTCTAAAACCGGAACAAAGAAAATATCTTCCTGTAGTAAAAAAATATCTAAATGTAA
AAGAATATTCTCTTTCTGAAGTTCCAATTTATTTTAGTTCTCAATTTACAGAAGTAAAAGGTTCTAAGGAAAAAGGACAT
CTTGTATTCATTTATCCTAAAGTAGCTCTTTGGCACGGACAAAAACTTCTCAAGTTTTTTGACGCAGTAGGAGAATTACA
TTATCCTAAACTATCTAGAAGGGTATTAAATACTCTACTCTACGATTCAAACGGACATACGGCCGTAAATCCTACCCGAG
ATAAGTGGACCCAAAACGAAAAACGTTTGATTGTAAATAGTTTAAATACGTATTCTACTTCTCAATTTAAAAATCTGGGA
CTTTTAGATGCTACGATTTCTTTCATTTTAGAAACCAGACCTTTTTCCAGTTTAGAACAAGCAAGATCTCATAAATATAT
TTCTAATACTGCGGGAAGTTTAATTCTCTTTGCAAATCTTATCAAGATTGTTCAAAGGGAAGGTGTGATTGCATTTCTTA
GCACCTTAGTTCTTGTAGTCATTGTCTTGATTTTGTTCTTTAGAGGAATCGTTCCTGCTTTAATTTCTTTGATTCCTCTG
GTCCTTGGCATTTTCGTAACTTTAGGAATTATGGCTGCGTTTAGAATCCAACTAAACTTTATGAACGTATTAGTATTTCC
TGTAATTATAGGTTACGGAATCCAGAATGGAATTTATATTTACTACAGGTTTAGAGAAGACCATGACGTGATTCGTGCCA
TGGCAATGGTCGGTCCTGCCATCATTGCGTCTACGTTAACTACTCTTGTAGGTTGGAGTTCTCTTTTAATCGCAGATCAA
AAAGGACTTAAATCAATCGGAATCGTGGCGAGTATCGGAATTGGTTCGTCCTTGATCATAGCACTTACTTTAGTTCCAGC
AGTTCTTGAAATCGTATATCGTTCTAGAAAAGAAGAGGAAAAAGAATCTAAACCTGTAGGTTTTGATCAAGCAGAAGCAA
ATTCTTCCGGCAACTTACTTTTTGCGTCTAAAACAAAAACAGCGGAAAACTTAAAAACGGAAACGATTGAAAATTCTAAA
ACAGCTACCTCCAAAAAGAAATCTGTTAAGAAAAAAACGACCGTCTCTAAAAAATCCATCCAAAAAAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGAAACAAACCGAGTCAAATCGATAGATCCTTCTATTAAAAAGAACGGAGTCAAACAAACCATCGCTCTTATTAAAAAAG
AAGCAAAAAATTAAACCGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGCTACATTAGAATATTAAAATATTCTTTACTATTTTTTTCTATCATCTTTATAACTATGAATTGTACCGTTAAATACG
TAAAAACAGGTCCAACTTGG

Product: export protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 984; Mature: 984

Protein sequence:

>984_residues
MKQFLSRITDSILLNPIRSCSILFVLLLLSFWQASKLTVNSNNLDLLPKNNPSVVKTQKVIEMIGGNGFYILSIKFKDEK
GMTDHLVKAFVARKKGQPEIAEKELKEAEKIKQQNVSYYKERENAIKKASDILNERLLKEKKFVQYISYRYNVSFLQDRL
PLFLKTEDLIEVRKRVKRKIDEEVERANPFFIKLSNEEYNPDFNDILSKYQKLAKRDIFDEYNISPDKGMLIFLIKPAGS
FTNIEFNIALDKKIKEIVADLGLDKNGIQVGYTGTYRLHLDDYETLMAALKPIAITSFIGIALLLLFFFRNPLFILILLI
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LVFIYPKVALWHGQKLLKFFDAVGELHYPKLSRRVLNTLLYDSNGHTAVNPTRDKWTQNEKRLIVNSLNTYSTSQFKNLG
LLDATISFILETRPFSSLEQARSHKYISNTAGSLILFANLIKIVQREGVIAFLSTLVLVVIVLILFFRGIVPALISLIPL
VLGIFVTLGIMAAFRIQLNFMNVLVFPVIIGYGIQNGIYIYYRFREDHDVIRAMAMVGPAIIASTLTTLVGWSSLLIADQ
KGLKSIGIVASIGIGSSLIIALTLVPAVLEIVYRSRKEEEKESKPVGFDQAEANSSGNLLFASKTKTAENLKTETIENSK
TATSKKKSVKKKTTVSKKSIQKKK

Sequences:

>Translated_984_residues
MKQFLSRITDSILLNPIRSCSILFVLLLLSFWQASKLTVNSNNLDLLPKNNPSVVKTQKVIEMIGGNGFYILSIKFKDEK
GMTDHLVKAFVARKKGQPEIAEKELKEAEKIKQQNVSYYKERENAIKKASDILNERLLKEKKFVQYISYRYNVSFLQDRL
PLFLKTEDLIEVRKRVKRKIDEEVERANPFFIKLSNEEYNPDFNDILSKYQKLAKRDIFDEYNISPDKGMLIFLIKPAGS
FTNIEFNIALDKKIKEIVADLGLDKNGIQVGYTGTYRLHLDDYETLMAALKPIAITSFIGIALLLLFFFRNPLFILILLI
SLLSGILFSFGLTTIVIGQLNSVTSIIASILMGLGIDYGIQFLYRFREEFTREQNTLRSIKDTIYHTGIASFISALTTTS
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LVFIYPKVALWHGQKLLKFFDAVGELHYPKLSRRVLNTLLYDSNGHTAVNPTRDKWTQNEKRLIVNSLNTYSTSQFKNLG
LLDATISFILETRPFSSLEQARSHKYISNTAGSLILFANLIKIVQREGVIAFLSTLVLVVIVLILFFRGIVPALISLIPL
VLGIFVTLGIMAAFRIQLNFMNVLVFPVIIGYGIQNGIYIYYRFREDHDVIRAMAMVGPAIIASTLTTLVGWSSLLIADQ
KGLKSIGIVASIGIGSSLIIALTLVPAVLEIVYRSRKEEEKESKPVGFDQAEANSSGNLLFASKTKTAENLKTETIENSK
TATSKKKSVKKKTTVSKKSIQKKK
>Mature_984_residues
MKQFLSRITDSILLNPIRSCSILFVLLLLSFWQASKLTVNSNNLDLLPKNNPSVVKTQKVIEMIGGNGFYILSIKFKDEK
GMTDHLVKAFVARKKGQPEIAEKELKEAEKIKQQNVSYYKERENAIKKASDILNERLLKEKKFVQYISYRYNVSFLQDRL
PLFLKTEDLIEVRKRVKRKIDEEVERANPFFIKLSNEEYNPDFNDILSKYQKLAKRDIFDEYNISPDKGMLIFLIKPAGS
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VVSLWNFVPPKGQQRANLKILKQLQSDMKPVKASFLKPEQRKYLPVVKKYLNVKEYSLSEVPIYFSSQFTEVKGSKEKGH
LVFIYPKVALWHGQKLLKFFDAVGELHYPKLSRRVLNTLLYDSNGHTAVNPTRDKWTQNEKRLIVNSLNTYSTSQFKNLG
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VLGIFVTLGIMAAFRIQLNFMNVLVFPVIIGYGIQNGIYIYYRFREDHDVIRAMAMVGPAIIASTLTTLVGWSSLLIADQ
KGLKSIGIVASIGIGSSLIIALTLVPAVLEIVYRSRKEEEKESKPVGFDQAEANSSGNLLFASKTKTAENLKTETIENSK
TATSKKKSVKKKTTVSKKSIQKKK

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 111280; Mature: 111280

Theoretical pI: Translated: 10.01; Mature: 10.01

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKQFLSRITDSILLNPIRSCSILFVLLLLSFWQASKLTVNSNNLDLLPKNNPSVVKTQKV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEECCCCCCCHHHHHHH
IEMIGGNGFYILSIKFKDEKGMTDHLVKAFVARKKGQPEIAEKELKEAEKIKQQNVSYYK
HHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH
DEEVERANPFFIKLSNEEYNPDFNDILSKYQKLAKRDIFDEYNISPDKGMLIFLIKPAGS
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCH
TATSKKKSVKKKTTVSKKSIQKKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCH
TATSKKKSVKKKTTVSKKSIQKKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA