| Definition | Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome chromosome I, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_005823 |
| Length | 4,277,185 |
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The map label for this gene is 45657900
Identifier: 45657900
GI number: 45657900
Start: 2482018
End: 2485746
Strand: Reverse
Name: 45657900
Synonym: LIC12051
Alternate gene names: NA
Gene position: 2485746-2482018 (Counterclockwise)
Preceding gene: 45657905
Following gene: 45657897
Centisome position: 58.12
GC content: 29.63
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CAGATTAAAATTTATCAAAAAATAAGTATTTATTTAAAGTTTTATATTAATGAATTGTAATAGTTAGAACTTGATTTTAC ACTCCTAAGAAAGGATAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1242; Mature: 1241
Protein sequence:
>1242_residues MSRIQNIETNLTSINDAAFQELCDRLIYFKYKNPSAFARIGSVTGKQKTKKGTPDSFLLMSDGEYIFTEITTNISDKDKL LKDIIACFDYKKTNISSDKVKEINLFFNFNIDNAYIEKLKSVATSFNPKTEIIFWSLNLLTSVLSTNHHDLVSDYLGLSY DTGQIVSIEKFISEYNRSSHGIATPLDNEFVQRRQEMDELKRKIAEKDFIIVTGAAGVGKTKLVLESIREFIQENKTYKS YCISYKYDSILNDIYQYVSDGDDYILFADDANRIDHFNQLIAYYQSKQFGKLKILITARDYAYSDLYLNCPAELTEVIKL KKLSDNQLIDIVKGEPFGITNPNYQDVITRISDGNPRLAVMLSRLAVEKQDIAVLSDVSNLFETYFNTFIKDQKELANPI NIKSLGVISFFNAINIRNKERLLEILKNFDIPYEDFLEAVQKLNSFEVVGINYDYVKISEQNLSTFFFYLAFIKNKQLSF GTLLTHYYADYMSRFSDCIIPANNTFGSEKVMDVVLPDLKKHFDTIYDDSERSYKFLSIFWFYLRSETLEYLYNEINTYS EHESINTKRMILEKKSTLSGKDQTLELLGKFYVGCPELKDAIELSFEYIEKCPFLTHKLISQFKELINFEAKDQHNNFRR QTILLKTLIDKIEKGSCSCLQVFHGIAKLFLKFKFQYVNGYKDRTIHFHTYTIPLSKKIKDIRKMIWDTLDLYFLENQDE CFQVLKDYSAVGGEISKEILEYDLLFIFNIIDNHLKNEFFEHCLYVQKLIRWLQRHNIQSSKFERYRNDFINPMYDLFTK VNMYGYGHKEDYEFDDYGEFLRLKELEIRSAYIFKDQADMDSFHSMFTDIVNVHKPETIHLESLDFILEENFKRDYNIGF KFLELLAKRNDKLLFIPTRSLKQILVIEENVCLVWELIEKISFRSKPLWKISFFTEIDSALIKNEHIDMILEIFREIENL KFMSLDWAERYLNFDYELYDKILTIVTERNREPNVKIGLQIHYFEKTFKMLSKNMPLIQEAYLQQVKIDSHFDYNKNGLF RIIEMNPGFLKDYFDYFYFSDDIEFTERKADWGFIWEIEGMGPVFSEIFKRITEKNVFSGFSSHFLNNFFSNLKEDKKAK ANEFLFELLKANYKDIRIVNLIVNIARYARKEIYENILLLYISLNQAPDVFGKIWWRGNGGEYNGGDISGEIEANDWKKI LSIIERSEHGTNLIPIKKVIKDRIYSCLRFAESEKTNLFLDR
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 146575; Mature: 146444
Theoretical pI: Translated: 5.86; Mature: 5.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSRIQNIETNLTSINDAAFQELCDRLIYFKYKNPSAFARIGSVTGKQKTKKGTPDSFLLM CCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEE SDGEYIFTEITTNISDKDKLLKDIIACFDYKKTNISSDKVKEINLFFNFNIDNAYIEKLK ECCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHH SVATSFNPKTEIIFWSLNLLTSVLSTNHHDLVSDYLGLSYDTGQIVSIEKFISEYNRSSH HHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCC GIATPLDNEFVQRRQEMDELKRKIAEKDFIIVTGAAGVGKTKLVLESIREFIQENKTYKS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH YCISYKYDSILNDIYQYVSDGDDYILFADDANRIDHFNQLIAYYQSKQFGKLKILITARD HHEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECC YAYSDLYLNCPAELTEVIKLKKLSDNQLIDIVKGEPFGITNPNYQDVITRISDGNPRLAV CEECCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHH MLSRLAVEKQDIAVLSDVSNLFETYFNTFIKDQKELANPINIKSLGVISFFNAINIRNKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH RLLEILKNFDIPYEDFLEAVQKLNSFEVVGINYDYVKISEQNLSTFFFYLAFIKNKQLSF 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PDB accession: NA
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Structure class: Unstructured
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Specific reaction: NA
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Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA