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The map label for this gene is 45656408

Identifier: 45656408

GI number: 45656408

Start: 607847

End: 614539

Strand: Direct

Name: 45656408

Synonym: LIC10510

Alternate gene names: NA

Gene position: 607847-614539 (Clockwise)

Preceding gene: 45656407

Following gene: 45656409

Centisome position: 14.21

GC content: 41.7

Gene sequence:

>6693_bases
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CTATAGCGCGTTATACGCCCCGCCTGTCGTGGTTCCAAACCTAAATACACCCGTGTTTAACGCAACGTCTATGGACCAGA
CTTTTAATGTCGCCAATGGAATGCAAACGGTAGGAAACTGGGATGTGTTTGTATTTCAAGGAGTGAGTATTTTACAAACT
CAGTGGGAAGCACAGGTGCAAGCCCAGATTACGATGATGGTGAACTCAATTACAACGAGTGATCACTACGCATCGGTGCA
AGAATATCAAACCTACGTATATAACTCCTTACAAAGTAAGGCGTCAGAACAATTGATTGTGTGGCAGACGGCGGTAGAAG
CAGAGATTTTACAAGAAAGAAGTCAATACTTGTCACAGAAATATGGAGCAAACTCCAATGCGGTTCAAAACTCGACTTCA
CAGTTTCAGAGTCAATGGGATTCTTTTGTAAGTGGTAACGGGCTAAACTTAAATATGAACGGCTCTTTGAGCCAGACGGT
TTTAAACAGCGGTCAACAAACCTTAGAAGGATTAGAAGGTCAGTGGTGGAATGACTTTCAGAATAATTTACAAAGCGGTT
TACAAACGTACCAACAAGCACTTGCTGGACTGACAGAAAAATATCAGAACTTAATCAATCAAATCAATCAGACGGAATTA
CAGTATCAGGCTCATTTGGCACAGATACAACAATCTCAAGCAGGAACTAAAGATCAGATCTTGTCTAGTTTAGAAGGATA
CCAGTCTTATTTAAACTCGAACGGTTTATTTTGGAACACGATGAGTGTTGTGTATGACAATAGTACAGGTAGCTACGCAC
AAGGAAGTTGTCCCGGCGGCCATGTGTGCGTTACCTATCAATACGATACGGTAACGAGTCAGTTTTATACAGCAGGGAAT
TGTCCTGTAGGGCATGTATGTGCCAACGTATTATATGATAATAATACTAGCAGTTATGTACAAGCGGGTTGTCCGGGTGG
ACATATCTGTGATGGAAGTCAAAGAGAGAGTTTGATTATCAGAACGGGATTAAACGCGGACGGTAGAGCATTTCAGAACG
TAATCAATAACGTAGTAAATGCAATGCAAGACGGATTTATAATGCCGGCTATATTTGATTACAGCAGCGGTACAATGCTT
AGCTATAACTCTAACTGCTTAAATACAGGAACGAGTTGTATAAAAGGTTTATATGATATAACGAGCAACAGCTTTGTAGC
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ACTTTGCAAATAGTTGTACTGTAGGCGATAGCCGCTGTGTGACTTGTCAGGCCGGACATACCTGTCAAGTGCAAGAAATG
GAAGCAAGCTTTCTATATGCTTCTAGTTTAATGAGTAACTTTTTACACAATGAGTTACTTGCGACTCAAGGTGCGTTACA
AAGTGCAATCAATTATCAGAACGGAGGAGGTGCGAGCCATACGTATACGTATGGTCAAGGAACAGGACCTTACGACAATC
AGGCACTGAATTATCATACTGCTTATGGTGGGATGAGTTTTAACCATTTTAGCGGAAGCGCTAGTTTAACTACGGCGGAA
GTTTCGATAAATGAGTTATTTAACGGAGGATTTACGGAAGGAGCCGGTGGACTTGGGAAAAAGATCATACAATTGATTAC
GGGTCAGATTTCTCAGACAGAACTAGCGAACTGGATTATGAACGCGTATGAAAGTAGCATGATCGGAGACGGATCGTATT
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ATGAATGAGGATAATGACCCTCATCCAAACGGAGGACCGAACCAATATTGTCCGGACCCATTGGGATGCCATTCCGGGGA
TATATTTCATCCTGATCCTGGAATTTATGGAGCCAATGATACTTTTTCCCAAAGAGGATATGACTTTAACCGTTATATAG
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TCTTTTACAGTAACGAATAACAATGCGTATGCGAATGTAACTACCTATCAAGACTTAGTGTTACAGTTACAAAGTTTTGA
ACACGACTGGATGACAAACGTTATGCCTTCGGTTACAAACTGGACCGCACAAGTAGCTTCGTATAACGCACAGTATGCGA
ATTGGCAAACACAAATGCAAACCGCGTTAACGGACGCACAAAACGCATACAATGCGGGTGTTCAAGATTTACAAGATCAT
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GACAGTTTAGTCAAAACGGTCAACAAGCCTTGATAGATGCTCATCATCTAAGAACCAAAACGATCACAACAAAAGACAAA
TATTCTGGGGAAGATATTAGTACCACATACGTGTTAGACGAAAATGGAAACATCCGTATGTTTACGGATGAAGACGGTGA
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AATTCAAGCCAGTGTGGAGCGGATGCTACTCAAAGCGGATCTTATTGTTATGATGAAAGTGATCGAATCGTAACGATTGC
CCCTCCTGATCCTAAAGCACTTTTATTAGGAAGGGGAGCGTCTAGGTTAGGAGACATTTTTAACTCAAAAGAAAACGGAA
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AAGCAATACAAGACGTAGTAGCAACGGCGCTTTCGAATGCGTTTGATTTACCACCGGACGCGGCGGCGCTTTTGTCGGGT
GGTTTAGTTGCTCATTTAGAAGCGGATCGTGCCAAACATCATTTAGAATCTAGACATTTAGGACTTGGGAAACATTTAGA
TTCGATAGAAGGTAGGGCGTTTGGGATGATAAGCGGCGGGATCTATGATATAGGAATGAGAACCGCTCATACAAATGACC
TTGCTGCTTTAAATCGTTGGAAAGAATTTAAGAACAGCATGATAGGTTTTGCAGTACAGAAGTATGGAGAAAGCCAACAC
TGGTCCCCAGAGTTTACCGGATTTGCATCCCAATATGTAGCCGACTATTTTCAAATGAAACAAGCCAAAGAAGAGTTAGG
CAGAAGATCGGGAGCTTTTTCCATAAACTCTGTGTTAGGTGATTTAAAGGTTGGATTAGCGAATTTAGAAGGAATGCGGG
GGGAAGTAATAGGAGCGTTAATAAACGGAACGGCTCATATAACTGGGGACTTGGGTTTGACGTCAGAGAGATATGAAAGA
GAAATCAATCAGAACCTAAGAACGGCGATCAATGACATAAAACTAAAGAACCTCAAAGACGATATACGCACTTGGAGCGG
GGATCAAGTAGGCCTAGCGAGTGCGAGTGTAAAAGAATACGGAAAACAAAACCACTGGGATCAAGCTAAGATAGATCTGT
GGTCCAGACAAGCGTCTGACTTTGTAGTAAGACACCAAGCAGAAAGAGAAATACAGAAAAGGGACAATTTACTGTTAGGT
GGTAACCCAGCCCTTTTCTTAGATAGAAAATTATTTAGCGGTGGTTTAACGAGTTTAATAACCAAAGGATATAGAGGAGT
AGCTACTACATTAGCAGACGTAGGAAATATGTTAGGCGAAGGGGTAGTGTCTTCTGCATTTAGAGATAGTGTATATGACC
AGACGAGAGATTGGCGTAATACGATTACACAAGAAGACGTCAAAGCAAGAACCGGTCAAGGAATTATCAATAAATCGTAT
ATAGAAACAGAAATGCGTAACCAGTTGTTTGATGTGATTGGGGAAACCTTTATACCCGGAGACAAGGAAGCGGCGCATAA
CCTAGGATTATTACTAAAACATCATATAGACGCAAAAGAAGAAAAGAAACAAGCGAAAGAACAACGTCTAAGAGACGCCC
AAACGATAGTACAAGTAGCGGCTGCAGCAGCAGCGATATATTTTACAGCGGGAGCGGCATCGGGAGCGGCGAACAGTTGG
CTTTCTACATTGGCCATCCAAACCGGAACGACAACAACAGCTTCTGTAGGAGGAGTGTCAACGGTAGTAGCGACAGGACT
AACGAACGGCCAAATATTAGCGTTAGCCGCAAGCACAGCGGTAAGCATGGGAGTAGAAGGTAGTATCAACGGAACGAACG
GAGCACTATCAGCCCTCGTAAACGGAGTTATCTCAGCGGCGACGATGGGAGTAAGAACGCCTTTAACAGGATATGTAAGC
TATACCAAACACCAAAACGCAAACCTCTTAACGGGTCAACATGAGGTAAAAGGAGGCTGGGGAGGCGGGTTCTCAGTGAA
CATATCAGGAGCGAAAGCATCGGCGTTAGGTGAAGCGATGCAAACAGTAGTATCTGCTATGAAGATGAGTAACTTAAATT
TCGGACTGAGTTACAATCAAGACTCGGGACTCGGAATGAACGTAAATACAAACTTTACGAGCGGATTGGGCTTAGGACTT
GATTACAACTTTAAGAGCGGAGATTACACAGCGAACGCAAGCTACGACAAAAACCATATCGGTGGACAAAGCTGGGCGAA
TGCAAGTTTTAATGTATCTGCAAGTAAGACCGGCCATGCAAGTGCGTCTGTATCTTACAACAGTGATGGAAATACAGCGA
TCCCACAGAGACTGAGAGGAGGCGGAGGAACATTAGATTTTGGTAATGATGGGAAGATAGGGTTGAGTGTGCAAGGTATG
AAAGGAGCGACCATCGGAACCTTGACGTATGATACAAATACGCACGGGTTTGAACCAGTGTCTTTTAACAGTAACTTTCA
GAACGAATTTAATCAGGGTCAAGCGGCTGAAAATTCTTCGGAGAACCATGAAAGAAACCAAATAGAGATTTTAATGAAAG
AGATTAGTTTGGGTAGTAAGATGGACAAACCTTTGTTTACAGAAAGGGAAATAGACTCAGCGCTTCCGAGAGACGGTAAG
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AATCCATACAACTTGGAACCACCCGTTTAGACGTAAGACGCAGAATGCACAAGAAGTTCAACCGTTTGATTTGAGAGGAG
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TAGTTGGTGGGGATGTATTCGGAATTGGTTATGTAGTTCATAACTATGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACAATTGGATCATTTGTAATTTTTCGAACCATTCATAGAAAAAACAAGGTGAAACTTTGAAAAGAAGAATTTGGTTAAG
GCGCTAAAAAAGCGAAATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATGCGGGATGTATTAGCAAAAGTAAAAACGTCGATAGCTGACAGAATAGCACAGGCGACAGATAGAGAAAGTTTTGA
TTTTGAGGGTTCGACGTGGA

Product: cytoplasmic membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 2230; Mature: 2230

Protein sequence:

>2230_residues
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Sequences:

>Translated_2230_residues
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Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 242757; Mature: 242757

Theoretical pI: Translated: 5.07; Mature: 5.07

Prosite motif: PS50817 INTEIN_N_TER ; PS50818 INTEIN_C_TER

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNITYKGVTMKIDILKHIITVILLCTYSALYAPPVVVPNLNTPVFNATSMDQTFNVANG
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MQTVGNWDVFVFQGVSILQTQWEAQVQAQITMMVNSITTSDHYASVQEYQTYVYNSLQSK
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ASEQLIVWQTAVEAEILQERSQYLSQKYGANSNAVQNSTSQFQSQWDSFVSGNGLNLNMN
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GSLSQTVLNSGQQTLEGLEGQWWNDFQNNLQSGLQTYQQALAGLTEKYQNLINQINQTEL
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HVCVTYQYDTVTSQFYTAGNCPVGHVCANVLYDNNTSSYVQAGCPGGHICDGSQRESLII
CEEEEEEECCCCHHHEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEE
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EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
TSNSFVAGTTCAAGHTCYSAVVDNTNPAAMTGSYFANSCTVGDSRCVTCQAGHTCQVQEM
CCCCEEECCCHHCCHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEHHH
EASFLYASSLMSNFLHNELLATQGALQSAINYQNGGGASHTYTYGQGTGPYDNQALNYHT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEEE
AYGGMSFNHFSGSASLTTAEVSINELFNGGFTEGAGGLGKKIIQLITGQISQTELANWIM
ECCCCEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
NAYESSMIGDGSYLAGLFGPNGLGPGMTITGINQADLRAFMNEDNDPHPNGGPNQYCPDP
HHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCEEEEEE
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EEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
TALTDAQNAYNAGVQDLQDHESSWLAQMGQLQQQAQNAFDAASNALKNGQGQSNYGQLTG
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
QVLAGLNKGQLDSGIKPLEIRKFNSYGGDILENLDRDANRGVPNFNLLSTFGSSMSRAIT
HHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GVSNLTLLSSTNNALMDNILGYMQNVAESMRNERQFSQNGQQALIDAHHLRTKTITTKDK
CCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCCC
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