Definition Vibrio vulnificus YJ016 chromosome I, complete sequence.
Accession NC_005139
Length 3,354,505

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The map label for this gene is 37678528

Identifier: 37678528

GI number: 37678528

Start: 352520

End: 353737

Strand: Direct

Name: 37678528

Synonym: VV0344

Alternate gene names: NA

Gene position: 352520-353737 (Clockwise)

Preceding gene: 37678527

Following gene: 37678529

Centisome position: 10.51

GC content: 33.33

Gene sequence:

>1218_bases
ATGGGGGGTGTTTGTATTGCATTTTTGTATTTTACTAATCCATTCTTATTTGGTAGGGTTTTTTGGGGTAGTGACTTAAT
CACTCTTGCCTTAATATTTTCATCGGCACTTTTCTTGCTAAAGAATAACGCATGCTTTTCCCAAAAAATATCACCTCTAA
AGTTATCTTTGTTATTGTCACTTAGTTTATACTTCATAACTACTACTATAATTAGATTGAGGGTTGGTCAAGATTTTGGA
GATTTAAGTCTACATTTTTATCAATATCTAAGTGTTCTGATTCTACTTGCGCTAAGGATTGACCATAGAAACCTTGAAAT
TTTTTATAAGGCTATATGTATAGCTCTGCTGTGGCATGTTTGGACTATTATTCCTCAACTACCGCTGAATGGTTTTTTAT
CGAGCAAGTTATCATCACAAACAGCATATGCAGTTGGTGAATATAGTATAGGTGGGCTTAGTAGAAGAGCTACAGGCTTC
TTTACTGCTCCTGGTTACTTGTCCCTATTTGCTTCTTCCTCTTTAGCTATAGGGGTTTTGTTGTGCATAAGCAAGGTTAA
TAAATTAAACACTTCAATTTTAATTCTATCATGTATGGCTGGCTTTGGTTCATTTAGCCGAACATTTATGGTTATATTTA
TACTACTAGTTATTTATATACTTATAGTTTCAAGGTTTAAACATAAGATTTTTTACGGTGCTATATTACTGTTATTAGGA
AGTTATTTTACATCTACAACTATTTTTAAGGACTATTTGGGGTTTGTTGGCGAGCGATTAGCACAATCTACAGACTTTTC
CAGTAATGATAGAATTACTGGTGATACAGGTGTATTAATTGTGCTTGAAGCAATTGCACAGAATCCTTTTACTGGTTCAG
CAATCGCCCCTGATGGTGGTGATATTAAGGCTAGTGTTGATGGTAGAATAATTAGACCTCACTTTGGTATATTAGCTATT
ATTTCTTTTTATGGCGTTGTGGTCTCTTTAGCTTTGGTTATCCCAATGTTATTTGCTTTGTTTAAGAGTTTTACAACTTT
TACTTCTAATAAAGATATTGAAAAACCTGTTACGGCAGCATTTTTAGCAGCATTTTTAGTCTGTGTTGCAGAGCCTTTAA
TAGACACAAATTTGACCGTTATTTTTATGGCATTTTCATTATTGCTGTCATCTGAATTCTACAAAAATAGGAGCTTTTCA
AGTGATTTTAATCACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGTGTTGAAGGTGTGGTTGGTTACTCAGTTCTAATATACTTCCTATTGGCTATTTCTCAAAAAACTTATATAGTACTTT
CTTTAAAAGGGGAAAGATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAGGTAAAAACATGTGATAACTTAAAGGATCAAAGGCTTTCACAAGCTGGATTAAACTATCAAGCTAAATTAAGTGAGT
TTTTAAACCCAGAGTTAGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 405; Mature: 404

Protein sequence:

>405_residues
MGGVCIAFLYFTNPFLFGRVFWGSDLITLALIFSSALFLLKNNACFSQKISPLKLSLLLSLSLYFITTTIIRLRVGQDFG
DLSLHFYQYLSVLILLALRIDHRNLEIFYKAICIALLWHVWTIIPQLPLNGFLSSKLSSQTAYAVGEYSIGGLSRRATGF
FTAPGYLSLFASSSLAIGVLLCISKVNKLNTSILILSCMAGFGSFSRTFMVIFILLVIYILIVSRFKHKIFYGAILLLLG
SYFTSTTIFKDYLGFVGERLAQSTDFSSNDRITGDTGVLIVLEAIAQNPFTGSAIAPDGGDIKASVDGRIIRPHFGILAI
ISFYGVVVSLALVIPMLFALFKSFTTFTSNKDIEKPVTAAFLAAFLVCVAEPLIDTNLTVIFMAFSLLLSSEFYKNRSFS
SDFNH

Sequences:

>Translated_405_residues
MGGVCIAFLYFTNPFLFGRVFWGSDLITLALIFSSALFLLKNNACFSQKISPLKLSLLLSLSLYFITTTIIRLRVGQDFG
DLSLHFYQYLSVLILLALRIDHRNLEIFYKAICIALLWHVWTIIPQLPLNGFLSSKLSSQTAYAVGEYSIGGLSRRATGF
FTAPGYLSLFASSSLAIGVLLCISKVNKLNTSILILSCMAGFGSFSRTFMVIFILLVIYILIVSRFKHKIFYGAILLLLG
SYFTSTTIFKDYLGFVGERLAQSTDFSSNDRITGDTGVLIVLEAIAQNPFTGSAIAPDGGDIKASVDGRIIRPHFGILAI
ISFYGVVVSLALVIPMLFALFKSFTTFTSNKDIEKPVTAAFLAAFLVCVAEPLIDTNLTVIFMAFSLLLSSEFYKNRSFS
SDFNH
>Mature_404_residues
GGVCIAFLYFTNPFLFGRVFWGSDLITLALIFSSALFLLKNNACFSQKISPLKLSLLLSLSLYFITTTIIRLRVGQDFGD
LSLHFYQYLSVLILLALRIDHRNLEIFYKAICIALLWHVWTIIPQLPLNGFLSSKLSSQTAYAVGEYSIGGLSRRATGFF
TAPGYLSLFASSSLAIGVLLCISKVNKLNTSILILSCMAGFGSFSRTFMVIFILLVIYILIVSRFKHKIFYGAILLLLGS
YFTSTTIFKDYLGFVGERLAQSTDFSSNDRITGDTGVLIVLEAIAQNPFTGSAIAPDGGDIKASVDGRIIRPHFGILAII
SFYGVVVSLALVIPMLFALFKSFTTFTSNKDIEKPVTAAFLAAFLVCVAEPLIDTNLTVIFMAFSLLLSSEFYKNRSFSS
DFNH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44698; Mature: 44567

Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGGVCIAFLYFTNPFLFGRVFWGSDLITLALIFSSALFLLKNNACFSQKISPLKLSLLLS
CCCCEEEHHHHHCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHH
LSLYFITTTIIRLRVGQDFGDLSLHFYQYLSVLILLALRIDHRNLEIFYKAICIALLWHV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
WTIIPQLPLNGFLSSKLSSQTAYAVGEYSIGGLSRRATGFFTAPGYLSLFASSSLAIGVL
HHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHH
LCISKVNKLNTSILILSCMAGFGSFSRTFMVIFILLVIYILIVSRFKHKIFYGAILLLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYFTSTTIFKDYLGFVGERLAQSTDFSSNDRITGDTGVLIVLEAIAQNPFTGSAIAPDGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
DIKASVDGRIIRPHFGILAIISFYGVVVSLALVIPMLFALFKSFTTFTSNKDIEKPVTAA
CEEEECCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
FLAAFLVCVAEPLIDTNLTVIFMAFSLLLSSEFYKNRSFSSDFNH
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GGVCIAFLYFTNPFLFGRVFWGSDLITLALIFSSALFLLKNNACFSQKISPLKLSLLLS
CCCEEEHHHHHCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHH
LSLYFITTTIIRLRVGQDFGDLSLHFYQYLSVLILLALRIDHRNLEIFYKAICIALLWHV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
WTIIPQLPLNGFLSSKLSSQTAYAVGEYSIGGLSRRATGFFTAPGYLSLFASSSLAIGVL
HHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHH
LCISKVNKLNTSILILSCMAGFGSFSRTFMVIFILLVIYILIVSRFKHKIFYGAILLLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYFTSTTIFKDYLGFVGERLAQSTDFSSNDRITGDTGVLIVLEAIAQNPFTGSAIAPDGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
DIKASVDGRIIRPHFGILAIISFYGVVVSLALVIPMLFALFKSFTTFTSNKDIEKPVTAA
CEEEECCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
FLAAFLVCVAEPLIDTNLTVIFMAFSLLLSSEFYKNRSFSSDFNH
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA