Definition Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome, complete genome.
Accession NC_004917
Length 1,799,146

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 32267150

Identifier: 32267150

GI number: 32267150

Start: 1578043

End: 1580133

Strand: Direct

Name: 32267150

Synonym: HH1651

Alternate gene names: NA

Gene position: 1578043-1580133 (Clockwise)

Preceding gene: 32267149

Following gene: 32267152

Centisome position: 87.71

GC content: 32.95

Gene sequence:

>2091_bases
ATGAAAAAATACTGCATTTATATACTATGGGGAATGCTTATAAGTGTATTGTTAGTAGCTTGTAGTGATAAACCCACAGA
TTCTACTCCCGATCAAGCACCTCCAGAGAAACCAGCTCTTATACTTGAGGGTAATGAAAGCCTTGAAAAACTAATGGACA
AGATTTTTGAAAATAATGTTTATAGCACTACGACAGATGAGCTAATGCGTTCTTTTTTACCCAAAGAGGTGCAAAAAAAT
GCAGATACAGATAAATTTATTCCAGTAGAGCATAAACGCTATGAAGTAGCTCAACTTTTTAGACAAGCATATTTTCAGAA
CAAAACACATCAGATTCAAAGTAAAACACTTGAAGAAGCATTTGCCTTGAAAAAAGAATGGAATGTATTATGCACTTCGG
CACAACCTTATGAGAAATTACCCATTCTTCAGCGACTTAATACGGAAATTGAGATTTCCTTAAGCCTTTTGTTGCTTAAT
AGTCAAGATGAGGTGGATACTTTAGAGAGACTTCTTTCGCAGCAGTATCAAAGTGCTAAAGGCACAGGAGAGCTTAATAC
CATTATAGAATCTCAAATGCAAGTGCGACTTTTAATACTTTTTGGTTTGTATCATTTAGATTTGATTAATGAGAGTAAGG
AAGAACATTCAGAGAGCTTTAAATTGCGTTCAACACTTGGTGCAAATCTTGCACAATATCAGGATTTTTTGCCAAAAGAG
CACTATGAGGTATATCACAGAGCCTTTATGCTTCTTAATCACGCAATTTTAAAAGAGCAAGCTCCTTTAGATAGAATTTT
AGTCAAACTTTTAGAATTTTTACCAAGTTTGGAACAAAATATAGGAAATGAGGATTGGTATTTGCATTTAGAACGCGTTA
AGAATGCTTATGAAATTTCAAAAACACAAGATTTTTCTAGCCCAAAAGCTCAAGAATTAATACAAATTGCACAAAATCCC
CATAAAAATGTTTATGATAACGCTCTTATAGGAAATTATCTTTATGGACTTGATTATTTGACTTTAACTTTATTGAATAA
TGATGTGGCAAATAATCTTTCTTTAGCATTAGATTCTTTGCAAAAAGATTTTAAGCATTTTCAAATATTTCAACACCATT
TTGAACCCTCTTCATTTCAAAATTATATTGCATCAATGTTTATAGGGGCTTATGCTCTTTATAATACGCGCCAAAACCAA
GAACGTTTTAATGAGTTGCTCCATTTAATTAAATCCGAGTTATCTCAATATAATGATGTAATTTCAGATGAAAATAAGGA
TTTGTATCAAGATGCACTTTTTGTTTTAGAACAAATGGATAAAACAAAATTTTTGCAAATCACACTTACAGAAGCTAAGC
CTGAAGAAGAGGCAGGATATATCAAAATTCGCTTAAACCTTTCACCCTTTGAAATTGAGAGTATCAAAAGCATTGTTTCA
AAGGAAAATAATGCCCTTAAGGAAAATCTCCCAGTATGTCTTACTCCGCAAGAGGTAGATTTTATGCTATCTTTAGTGTA
TCAAGCTTATAAAACACAAGATGTGAGAGGTGTTGCTCCTGAAATGTTTAAAATACGGCTAGAAGAGGTGTTTGGTATTG
AGAATCTTGAACATCAAAAGCAGTTTAAAGATGCTCAAGGGAAAGAGTGGGGCAGGGAGTATTTGATAGATTTTGATAGA
TTTATGTTGCTTGGCGTAGCAGATAGGGCTTGTTATGTCCAAAGTCTTATTCTTGATGAGAAGTTGAGCGTATTGCAAGA
GAAGCAAAAAATTTGTGGATATAATTTGTATTTTGATAAAGAAAATGGTTTGATAACTAATGAAATCTTGCCCTCGCGTA
TTCTTGAAATTATAGCAGATGGTAATGTGTATTATCGCTTGAGAGAGGCTGATTTGAATCTCAATAAGTTTATTTTTTAT
AATGATGAGATTGCTCTTGAATCTTTAAAAAATGCGCAAGATTTGGGTGAAATCTTACCTGTATTGCTTACAACATTCTC
ACATATGAAAGATTATCTTAATAATCGTCTTTCACCCCAGCAAACACAAGAAATAATACTTAGAGCGAAACAAAAACCTT
GTGCAAAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATTACAAAAGGGGACGCTTGATGTGTATGTGAAAGTGGGCGAGGAAAAACATCGCTTTACATTGCAGCTTAGTAAA
ATAAAATAAAAGGAGCAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATTAGGGCTTTATTTGGGCTCTAAATTCTTTACGTTTTTTAGCGGCTTCAAATCGGCGTTTTTCTTCTTCTGTGGTAG
GTGTAAGCGGTGGAATTTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 696; Mature: 696

Protein sequence:

>696_residues
MKKYCIYILWGMLISVLLVACSDKPTDSTPDQAPPEKPALILEGNESLEKLMDKIFENNVYSTTTDELMRSFLPKEVQKN
ADTDKFIPVEHKRYEVAQLFRQAYFQNKTHQIQSKTLEEAFALKKEWNVLCTSAQPYEKLPILQRLNTEIEISLSLLLLN
SQDEVDTLERLLSQQYQSAKGTGELNTIIESQMQVRLLILFGLYHLDLINESKEEHSESFKLRSTLGANLAQYQDFLPKE
HYEVYHRAFMLLNHAILKEQAPLDRILVKLLEFLPSLEQNIGNEDWYLHLERVKNAYEISKTQDFSSPKAQELIQIAQNP
HKNVYDNALIGNYLYGLDYLTLTLLNNDVANNLSLALDSLQKDFKHFQIFQHHFEPSSFQNYIASMFIGAYALYNTRQNQ
ERFNELLHLIKSELSQYNDVISDENKDLYQDALFVLEQMDKTKFLQITLTEAKPEEEAGYIKIRLNLSPFEIESIKSIVS
KENNALKENLPVCLTPQEVDFMLSLVYQAYKTQDVRGVAPEMFKIRLEEVFGIENLEHQKQFKDAQGKEWGREYLIDFDR
FMLLGVADRACYVQSLILDEKLSVLQEKQKICGYNLYFDKENGLITNEILPSRILEIIADGNVYYRLREADLNLNKFIFY
NDEIALESLKNAQDLGEILPVLLTTFSHMKDYLNNRLSPQQTQEIILRAKQKPCAK

Sequences:

>Translated_696_residues
MKKYCIYILWGMLISVLLVACSDKPTDSTPDQAPPEKPALILEGNESLEKLMDKIFENNVYSTTTDELMRSFLPKEVQKN
ADTDKFIPVEHKRYEVAQLFRQAYFQNKTHQIQSKTLEEAFALKKEWNVLCTSAQPYEKLPILQRLNTEIEISLSLLLLN
SQDEVDTLERLLSQQYQSAKGTGELNTIIESQMQVRLLILFGLYHLDLINESKEEHSESFKLRSTLGANLAQYQDFLPKE
HYEVYHRAFMLLNHAILKEQAPLDRILVKLLEFLPSLEQNIGNEDWYLHLERVKNAYEISKTQDFSSPKAQELIQIAQNP
HKNVYDNALIGNYLYGLDYLTLTLLNNDVANNLSLALDSLQKDFKHFQIFQHHFEPSSFQNYIASMFIGAYALYNTRQNQ
ERFNELLHLIKSELSQYNDVISDENKDLYQDALFVLEQMDKTKFLQITLTEAKPEEEAGYIKIRLNLSPFEIESIKSIVS
KENNALKENLPVCLTPQEVDFMLSLVYQAYKTQDVRGVAPEMFKIRLEEVFGIENLEHQKQFKDAQGKEWGREYLIDFDR
FMLLGVADRACYVQSLILDEKLSVLQEKQKICGYNLYFDKENGLITNEILPSRILEIIADGNVYYRLREADLNLNKFIFY
NDEIALESLKNAQDLGEILPVLLTTFSHMKDYLNNRLSPQQTQEIILRAKQKPCAK
>Mature_696_residues
MKKYCIYILWGMLISVLLVACSDKPTDSTPDQAPPEKPALILEGNESLEKLMDKIFENNVYSTTTDELMRSFLPKEVQKN
ADTDKFIPVEHKRYEVAQLFRQAYFQNKTHQIQSKTLEEAFALKKEWNVLCTSAQPYEKLPILQRLNTEIEISLSLLLLN
SQDEVDTLERLLSQQYQSAKGTGELNTIIESQMQVRLLILFGLYHLDLINESKEEHSESFKLRSTLGANLAQYQDFLPKE
HYEVYHRAFMLLNHAILKEQAPLDRILVKLLEFLPSLEQNIGNEDWYLHLERVKNAYEISKTQDFSSPKAQELIQIAQNP
HKNVYDNALIGNYLYGLDYLTLTLLNNDVANNLSLALDSLQKDFKHFQIFQHHFEPSSFQNYIASMFIGAYALYNTRQNQ
ERFNELLHLIKSELSQYNDVISDENKDLYQDALFVLEQMDKTKFLQITLTEAKPEEEAGYIKIRLNLSPFEIESIKSIVS
KENNALKENLPVCLTPQEVDFMLSLVYQAYKTQDVRGVAPEMFKIRLEEVFGIENLEHQKQFKDAQGKEWGREYLIDFDR
FMLLGVADRACYVQSLILDEKLSVLQEKQKICGYNLYFDKENGLITNEILPSRILEIIADGNVYYRLREADLNLNKFIFY
NDEIALESLKNAQDLGEILPVLLTTFSHMKDYLNNRLSPQQTQEIILRAKQKPCAK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80973; Mature: 80973

Theoretical pI: Translated: 4.89; Mature: 4.89

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKYCIYILWGMLISVLLVACSDKPTDSTPDQAPPEKPALILEGNESLEKLMDKIFENNV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCC
YSTTTDELMRSFLPKEVQKNADTDKFIPVEHKRYEVAQLFRQAYFQNKTHQIQSKTLEEA
CCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
FALKKEWNVLCTSAQPYEKLPILQRLNTEIEISLSLLLLNSQDEVDTLERLLSQQYQSAK
HHHHHHCCEEECCCCCHHHCHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
GTGELNTIIESQMQVRLLILFGLYHLDLINESKEEHSESFKLRSTLGANLAQYQDFLPKE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHH
HYEVYHRAFMLLNHAILKEQAPLDRILVKLLEFLPSLEQNIGNEDWYLHLERVKNAYEIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEHHHHHHHHHHH
KTQDFSSPKAQELIQIAQNPHKNVYDNALIGNYLYGLDYLTLTLLNNDVANNLSLALDSL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
QKDFKHFQIFQHHFEPSSFQNYIASMFIGAYALYNTRQNQERFNELLHLIKSELSQYNDV
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISDENKDLYQDALFVLEQMDKTKFLQITLTEAKPEEEAGYIKIRLNLSPFEIESIKSIVS
HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHH
KENNALKENLPVCLTPQEVDFMLSLVYQAYKTQDVRGVAPEMFKIRLEEVFGIENLEHQK
CCCCHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
QFKDAQGKEWGREYLIDFDRFMLLGVADRACYVQSLILDEKLSVLQEKQKICGYNLYFDK
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC
ENGLITNEILPSRILEIIADGNVYYRLREADLNLNKFIFYNDEIALESLKNAQDLGEILP
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHH
VLLTTFSHMKDYLNNRLSPQQTQEIILRAKQKPCAK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKYCIYILWGMLISVLLVACSDKPTDSTPDQAPPEKPALILEGNESLEKLMDKIFENNV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCC
YSTTTDELMRSFLPKEVQKNADTDKFIPVEHKRYEVAQLFRQAYFQNKTHQIQSKTLEEA
CCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
FALKKEWNVLCTSAQPYEKLPILQRLNTEIEISLSLLLLNSQDEVDTLERLLSQQYQSAK
HHHHHHCCEEECCCCCHHHCHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
GTGELNTIIESQMQVRLLILFGLYHLDLINESKEEHSESFKLRSTLGANLAQYQDFLPKE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHH
HYEVYHRAFMLLNHAILKEQAPLDRILVKLLEFLPSLEQNIGNEDWYLHLERVKNAYEIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEHHHHHHHHHHH
KTQDFSSPKAQELIQIAQNPHKNVYDNALIGNYLYGLDYLTLTLLNNDVANNLSLALDSL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
QKDFKHFQIFQHHFEPSSFQNYIASMFIGAYALYNTRQNQERFNELLHLIKSELSQYNDV
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISDENKDLYQDALFVLEQMDKTKFLQITLTEAKPEEEAGYIKIRLNLSPFEIESIKSIVS
HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHH
KENNALKENLPVCLTPQEVDFMLSLVYQAYKTQDVRGVAPEMFKIRLEEVFGIENLEHQK
CCCCHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
QFKDAQGKEWGREYLIDFDRFMLLGVADRACYVQSLILDEKLSVLQEKQKICGYNLYFDK
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC
ENGLITNEILPSRILEIIADGNVYYRLREADLNLNKFIFYNDEIALESLKNAQDLGEILP
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHH
VLLTTFSHMKDYLNNRLSPQQTQEIILRAKQKPCAK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA