| Definition | Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004917 |
| Length | 1,799,146 |
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The map label for this gene is 32266563
Identifier: 32266563
GI number: 32266563
Start: 1036272
End: 1037438
Strand: Direct
Name: 32266563
Synonym: HH1064
Alternate gene names: NA
Gene position: 1036272-1037438 (Clockwise)
Preceding gene: 32266562
Following gene: 32266564
Centisome position: 57.6
GC content: 40.02
Gene sequence:
>1167_bases ATGACACAAGAATATAAAACAAAAGGTTATTTTAGCTATCTGCCCATAAGCTTTTTTGGTGCGTGTATGGGGCTTAGTGC AATCAGCGTGGCGTGGGATAAAATGATGCGCTTAATCCAAAACCTCACCATAAATACAGAAAATTTCCTTGCCCCAACCC ATAACACAAACTTCTTGCCTTCAACTCTCCTTGCTAATTTTAGCTTTGCTCTTTCTGTCTCTTTTGCACTCCTTGCCCTC ATTGCGTTTATAGGGCTAGTAAGTGCCTATGCTTTGAAGATTCTAAGCAGCTTTGAGAGTGTCAAGCTTGAGTTTGTCTC GCCTCTGACGCGTCCATTTTTTGGCACATTTTTTATCTCTTTACTGCTTTTGCCCTTTGCACTCCATAGACTTGGACTTC CTGAATCCTTAAGCCTTGCGGTATGGATTGTAGGAGCAATTTTAATGTTTATCTTTAGTGTGCATATCGTGCAATTTTGG ATTTGCAACAAGCTTGAGCTTTCCCATATTACCCCTGCGTGGATTATCCCTGTCGTAGGTTTGCTAGACTTGCCCTTAGC CTTGCCTTTGTTTGTGGATAAAGTATGGGTGCAGGATTTTAGCTTTATCATTGCTGGATTTTGTGTGGGTGTTGGATTCT TTTGGAGTATCGTGCTATGTGTGCTTATTTTTGCACGCATCGTGTTTTTTGAAAAACTCCCTGAAAAGCTAATGCCCACC CTTGTGATACTTCTAGCTCCATTTGGTGCAGGAGTAAGTGCCTATGCAGTATTCATTCGAATTCCTATTCTTAGTAGCAT AGATAATTCAAGCTATGTACAAGCTCTTATTAGTCTCCTTAATAGTACAAATAACTTAGACTACGCGCTGCTTTCCATTG GATTATTTTTGCTTTTTGCTCTATTGCCTCAAGTCTTTCAAATCGGCAAATGTTGCCCATTTAGAATCTCGTGGTGGGCG ATTAGTTTCCCTTTGGCTGCAATGTGTATTGCAAGCTTTAATATTGCAGAATCTATCGCTTCAAAATCCTCTGCTCTAAG TGGTGGAGCAATATTCTTTTCTGCACTCTCTAGTATGCTCTTAATTGCTGTAACACTTACTTTTATATGGCTACTTGTAC GCACATTGAGAGGAATTATCAAAGGTGAGTTAAAAAATCTTGCCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGAAAAAGATTTTGATACGCACGATAAAATAAAGAAAAAGTTAAATAAATCTCAATTAAAATATAATACAAAATAATA TGCCATATAAGGAATCCAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTTTAAAGCTTAGAATTTATCATTGAAGTTTTCAGAAAATTCTGCTGAGAGTGAGAAATTGTGCTTTGCATTGTTGCTC CTTGCAATCTAATATAAAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 388; Mature: 387
Protein sequence:
>388_residues MTQEYKTKGYFSYLPISFFGACMGLSAISVAWDKMMRLIQNLTINTENFLAPTHNTNFLPSTLLANFSFALSVSFALLAL IAFIGLVSAYALKILSSFESVKLEFVSPLTRPFFGTFFISLLLLPFALHRLGLPESLSLAVWIVGAILMFIFSVHIVQFW ICNKLELSHITPAWIIPVVGLLDLPLALPLFVDKVWVQDFSFIIAGFCVGVGFFWSIVLCVLIFARIVFFEKLPEKLMPT LVILLAPFGAGVSAYAVFIRIPILSSIDNSSYVQALISLLNSTNNLDYALLSIGLFLLFALLPQVFQIGKCCPFRISWWA ISFPLAAMCIASFNIAESIASKSSALSGGAIFFSALSSMLLIAVTLTFIWLLVRTLRGIIKGELKNLA
Sequences:
>Translated_388_residues MTQEYKTKGYFSYLPISFFGACMGLSAISVAWDKMMRLIQNLTINTENFLAPTHNTNFLPSTLLANFSFALSVSFALLAL IAFIGLVSAYALKILSSFESVKLEFVSPLTRPFFGTFFISLLLLPFALHRLGLPESLSLAVWIVGAILMFIFSVHIVQFW ICNKLELSHITPAWIIPVVGLLDLPLALPLFVDKVWVQDFSFIIAGFCVGVGFFWSIVLCVLIFARIVFFEKLPEKLMPT LVILLAPFGAGVSAYAVFIRIPILSSIDNSSYVQALISLLNSTNNLDYALLSIGLFLLFALLPQVFQIGKCCPFRISWWA ISFPLAAMCIASFNIAESIASKSSALSGGAIFFSALSSMLLIAVTLTFIWLLVRTLRGIIKGELKNLA >Mature_387_residues TQEYKTKGYFSYLPISFFGACMGLSAISVAWDKMMRLIQNLTINTENFLAPTHNTNFLPSTLLANFSFALSVSFALLALI AFIGLVSAYALKILSSFESVKLEFVSPLTRPFFGTFFISLLLLPFALHRLGLPESLSLAVWIVGAILMFIFSVHIVQFWI CNKLELSHITPAWIIPVVGLLDLPLALPLFVDKVWVQDFSFIIAGFCVGVGFFWSIVLCVLIFARIVFFEKLPEKLMPTL VILLAPFGAGVSAYAVFIRIPILSSIDNSSYVQALISLLNSTNNLDYALLSIGLFLLFALLPQVFQIGKCCPFRISWWAI SFPLAAMCIASFNIAESIASKSSALSGGAIFFSALSSMLLIAVTLTFIWLLVRTLRGIIKGELKNLA
Specific function: Unknown
COG id: COG1275
COG function: function code P; Tellurite resistance protein and related permeases
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the tellurite-resistance/dicarboxylate transporter (TDT) family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004695 - InterPro: IPR011552 [H]
Pfam domain/function: PF03595 C4dic_mal_tran [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42824; Mature: 42693
Theoretical pI: Translated: 8.66; Mature: 8.66
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTQEYKTKGYFSYLPISFFGACMGLSAISVAWDKMMRLIQNLTINTENFLAPTHNTNFLP CCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCH STLLANFSFALSVSFALLALIAFIGLVSAYALKILSSFESVKLEFVSPLTRPFFGTFFIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLLPFALHRLGLPESLSLAVWIVGAILMFIFSVHIVQFWICNKLELSHITPAWIIPVVG HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHH LLDLPLALPLFVDKVWVQDFSFIIAGFCVGVGFFWSIVLCVLIFARIVFFEKLPEKLMPT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVILLAPFGAGVSAYAVFIRIPILSSIDNSSYVQALISLLNSTNNLDYALLSIGLFLLFA HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLPQVFQIGKCCPFRISWWAISFPLAAMCIASFNIAESIASKSSALSGGAIFFSALSSML HHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH LIAVTLTFIWLLVRTLRGIIKGELKNLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure TQEYKTKGYFSYLPISFFGACMGLSAISVAWDKMMRLIQNLTINTENFLAPTHNTNFLP CCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCH STLLANFSFALSVSFALLALIAFIGLVSAYALKILSSFESVKLEFVSPLTRPFFGTFFIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLLPFALHRLGLPESLSLAVWIVGAILMFIFSVHIVQFWICNKLELSHITPAWIIPVVG HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHH LLDLPLALPLFVDKVWVQDFSFIIAGFCVGVGFFWSIVLCVLIFARIVFFEKLPEKLMPT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVILLAPFGAGVSAYAVFIRIPILSSIDNSSYVQALISLLNSTNNLDYALLSIGLFLLFA HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLPQVFQIGKCCPFRISWWAISFPLAAMCIASFNIAESIASKSSALSGGAIFFSALSSML HHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH LIAVTLTFIWLLVRTLRGIIKGELKNLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]