Definition Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome, complete genome.
Accession NC_004663
Length 6,260,361

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The map label for this gene is 29348276

Identifier: 29348276

GI number: 29348276

Start: 3587548

End: 3588792

Strand: Reverse

Name: 29348276

Synonym: BT_2867

Alternate gene names: NA

Gene position: 3588792-3587548 (Counterclockwise)

Preceding gene: 29348277

Following gene: 29348275

Centisome position: 57.33

GC content: 36.71

Gene sequence:

>1245_bases
ATGGTGCGTTTATTGACTATGTTATTGATATCAATGGTTGTGAGTGGCTATTATTTTCCATTCAGTTTTTCTGTCTTACC
GCAACTGAACACTAAAATGGCATTAGCGATGTTAGGTATTGCTTTGGTAGCTTATCAGGGATTTCAAAAACATCGGATTA
CTTTTTCGAGAGATTTGCTGGGTGCTATTGTCTTTGCTTTTATTTTCTCATTTATCTGCTTTGTTGCTGCTGACTATAAT
CATACAGATGATTATTCTTATGTCACTTACTTCGTGTCCTTTTTTACGTGGTTGGGAGGTGCATATGTGGTTTGTTATGT
TATTCGCGCATTTCACGGTAAGGCGACATTAAATTTGCTCATAGCCTATTCGGCTTTTGTATGCGTGTCTCAGTGTATAT
TGGCAATTTTAATCGATAGATTCTCGGCATTCCGGGCTTTGGTAGATACCTATATCTCTCAAGGGCAAGAGTTTTTTCAG
GAAGTGGGAAGATTGTATGGTATCGGTGCGGCATTGGATCCTGCCGGTGTAAGGTTTTCTATTGTGCTTCTTTTGATAGT
CTATCTTCTCTGTGAGGATGAGGGTGTAAAGCAGGTTAGGTGGAAAACTTTTGCCTGTTTATTCGCTTTTTTCGTGATTG
CTGTTATCGGTAATATGATTTCTCGTACTACATCTGTCGGATTATTCCTGGGAATAGTATATTTAATATGCTCTACAGGT
ATTTTCCGTTTGGTAATCAAGGGTCGTTATATCAGGCTTTATTCTATTTTAGGAGGAATGTTAATCGTATTTACGATGTT
ATCGGTCTATTTATATAATAACGATCCTTTTTTCTACAAGAATATCAGATTTGCCTTTGAAGCTTTCTTTAACTGGGTGG
AAACGGGAGAACTAAGAACGGATTCAACGGACAAATTAAATACAATGATGTGGGTTTGGCCGGAAGATGTTAAAAGTTGG
ATAATTGGCACAGGCTTGTTTGCTAATTTTGTGTATAGCACAGATATTGGCTATTGCCGTTTTATTTTGTATTGCGGTTT
AATTGGCTTCGGAACTTTTGTTTTGTTTTTTGTGTATAATGCCTGTGTGTTTGCATGGAAGTTCCCTTCTTTCCGGCTTT
TTTCTTTCGTTCTTTTATCATTGAGTTTCATTATCTGGATGAAAGTAGCTACTGATCTATTTTTTATTTATGCTTTATTT
TATTGTCTGGACTGGAAAATGGAACCAGTTCTTATAGAAGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGGATGGCGGTAAAACGATATTTCATTTTGTTGAGGTTATATTATCGGACGGTATTTAAGCTGGTTTATGGTATTATTT
ATAAATAATATAGTTGGAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATCGTTTACTGTATAGCCGGAACCTACAATTCCGGAGGAATGGAACGGGTATTGGCAAATAAAGCCAATTATCTGGTC
AGTCATGGATATGAAGTTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 414; Mature: 414

Protein sequence:

>414_residues
MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLLGAIVFAFIFSFICFVAADYN
HTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLLIAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQ
EVGRLYGIGAALDPAGVRFSIVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG
IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRTDSTDKLNTMMWVWPEDVKSW
IIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYNACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALF
YCLDWKMEPVLIEE

Sequences:

>Translated_414_residues
MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLLGAIVFAFIFSFICFVAADYN
HTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLLIAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQ
EVGRLYGIGAALDPAGVRFSIVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG
IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRTDSTDKLNTMMWVWPEDVKSW
IIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYNACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALF
YCLDWKMEPVLIEE
>Mature_414_residues
MVRLLTMLLISMVVSGYYFPFSFSVLPQLNTKMALAMLGIALVAYQGFQKHRITFSRDLLGAIVFAFIFSFICFVAADYN
HTDDYSYVTYFVSFFTWLGGAYVVCYVIRAFHGKATLNLLIAYSAFVCVSQCILAILIDRFSAFRALVDTYISQGQEFFQ
EVGRLYGIGAALDPAGVRFSIVLLLIVYLLCEDEGVKQVRWKTFACLFAFFVIAVIGNMISRTTSVGLFLGIVYLICSTG
IFRLVIKGRYIRLYSILGGMLIVFTMLSVYLYNNDPFFYKNIRFAFEAFFNWVETGELRTDSTDKLNTMMWVWPEDVKSW
IIGTGLFANFVYSTDIGYCRFILYCGLIGFGTFVLFFVYNACVFAWKFPSFRLFSFVLLSLSFIIWMKVATDLFFIYALF
YCLDWKMEPVLIEE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47580; Mature: 47580

Theoretical pI: Translated: 8.01; Mature: 8.01

Prosite motif: PS00430 TONB_DEPENDENT_REC_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.7 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
5.6 %Cys+Met (Translated Protein)
2.7 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA