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The map label for this gene is tuaB [H]

Identifier: 29347127

GI number: 29347127

Start: 2113482

End: 2114966

Strand: Reverse

Name: tuaB [H]

Synonym: BT_1717

Alternate gene names: 29347127

Gene position: 2114966-2113482 (Counterclockwise)

Preceding gene: 29347128

Following gene: 29347126

Centisome position: 33.78

GC content: 29.43

Gene sequence:

>1485_bases
ATGGAAAATCTAAAGCAGAAAACTGTATCAGGAATAATGTGGAGCGCTATAGAACGTTTCTCTTTACAAGGAGTACAGTT
TATAATTCAAATAATATTAGCTCGTTTGTTACTACCATCGGATTATGGTATGATCGGGATGTTAGCTATTTTTCTTCAAG
TCGCTCAAGTATTTATAGATAGCGGTTTTACAAATGCTTTAATCCAGAAAAAAGATAGAACTGAAGAGGATTTTGCCACT
GTCTTTTATTTTAATATTCTTGTCGCAGTATTATTCTATGGTATATTGTTTTTTTCGGCTTCTTTGATTGCAGACTTTTA
TAATATGCCGACTTTAGTTCTTGTAATTCGTTTTATAGCATTGTCGTTGATAATAAATGCTTTATCGGCTATTCACAGAA
CGAAATTAATTATTTCTGTAAACTTTAAAACTCAATCTAAAATTTCATTAGGTGCAGCTTTTATATCAGGCGTGATTGGA
ATATGGATGGCTTATGTCGGTTGCGGGGTTTGGGCTTTAGTTTGGCAAACTCTCTTAAATAGTATAATTTTGACAATTTT
GTTTTACTGTTTAGTTCATTGGAAACCTTTACATACTTTCTCCAAAAGTTCTTTTGAAAGATTATTCAATTTCGGATCTA
AATTATTGATCTCAAGTCTTATCAATACAGTATATCGTAATCTGTATACCATTGTAATAGGAAAAAAGTTTTCTGTTGTA
GAGCTTGGTTACTATACAAGAGCAGAACAATTTGCTATTTTTCCTTCCAATAATTTAAATGCTTTAGTTTCTAGAGTAGC
GTATCCTATTTTAAGTTCCATTCAAGATGATGATAAATGTTTAACAAACGCATATCGAAATTATATCAGATTATCCTCAT
ATATAATTTTTCCTTTAATGGTAGGTTTACTTGTTTTGGCTAATCCTATTATTAGTCTATTGTTAACAGATAAATGGTCT
GGGGTTGTTATTCTTTTACAGATATTATGTTTGGATTGGATGTTTGATCATTTGAGCCAAATTAATTTGAATTTATTATG
GGTTAAAGGAAGATCTGATCTGTCGTTACGTCTTGAAATAATAAAAAAGACGATTGCTATATTCATTCTTTTTGTGTCAA
TTCCATTTGGGCTTGAGGTGATGTGTTGGGGTAGAGTTATTTACTCTCTGATAGCGACATATTTGAATACATATTATACT
AATTCTCTTATTGATTTGACCTTAAAGTTGCAAGTTAAAGATGTATTTCCAAGTTTAATACTCTCTTTCATAATGGGGGG
GATCGTTTTTATATGTATTTCTTTCTTTGAAACTGATATAGTAAAAATTGTGATTGGATGTATTACTGGGATGTCCTTCT
ATATTTTACTTTCTTTTCTTTTTAAGCTAGATTCTTTTTTTTGTATTTTAACATTGATCATTAAAACTAAAAACATAGAT
GAAAATATTAAAAAAGATTTTTCAAGTAATAGTAAAGATAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCGGTAAGGGGCGAAGAAGATAATAACCAATTAGTGAGAATATTGGAAAAATATAATTGATATCGGTAAATGTAGTTGT
TTTTATACTGTATTTAAGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCATTGTGTGCCAGTTGATAGTAGATCATTGTATTTTATTCCTCATCCTAATTGTAGAACAGATAAATATGATATTATAA
ATTATTCGTCAGATAATGTT

Product: putative lipopolysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 494; Mature: 494

Protein sequence:

>494_residues
MENLKQKTVSGIMWSAIERFSLQGVQFIIQIILARLLLPSDYGMIGMLAIFLQVAQVFIDSGFTNALIQKKDRTEEDFAT
VFYFNILVAVLFYGILFFSASLIADFYNMPTLVLVIRFIALSLIINALSAIHRTKLIISVNFKTQSKISLGAAFISGVIG
IWMAYVGCGVWALVWQTLLNSIILTILFYCLVHWKPLHTFSKSSFERLFNFGSKLLISSLINTVYRNLYTIVIGKKFSVV
ELGYYTRAEQFAIFPSNNLNALVSRVAYPILSSIQDDDKCLTNAYRNYIRLSSYIIFPLMVGLLVLANPIISLLLTDKWS
GVVILLQILCLDWMFDHLSQINLNLLWVKGRSDLSLRLEIIKKTIAIFILFVSIPFGLEVMCWGRVIYSLIATYLNTYYT
NSLIDLTLKLQVKDVFPSLILSFIMGGIVFICISFFETDIVKIVIGCITGMSFYILLSFLFKLDSFFCILTLIIKTKNID
ENIKKDFSSNSKDN

Sequences:

>Translated_494_residues
MENLKQKTVSGIMWSAIERFSLQGVQFIIQIILARLLLPSDYGMIGMLAIFLQVAQVFIDSGFTNALIQKKDRTEEDFAT
VFYFNILVAVLFYGILFFSASLIADFYNMPTLVLVIRFIALSLIINALSAIHRTKLIISVNFKTQSKISLGAAFISGVIG
IWMAYVGCGVWALVWQTLLNSIILTILFYCLVHWKPLHTFSKSSFERLFNFGSKLLISSLINTVYRNLYTIVIGKKFSVV
ELGYYTRAEQFAIFPSNNLNALVSRVAYPILSSIQDDDKCLTNAYRNYIRLSSYIIFPLMVGLLVLANPIISLLLTDKWS
GVVILLQILCLDWMFDHLSQINLNLLWVKGRSDLSLRLEIIKKTIAIFILFVSIPFGLEVMCWGRVIYSLIATYLNTYYT
NSLIDLTLKLQVKDVFPSLILSFIMGGIVFICISFFETDIVKIVIGCITGMSFYILLSFLFKLDSFFCILTLIIKTKNID
ENIKKDFSSNSKDN
>Mature_494_residues
MENLKQKTVSGIMWSAIERFSLQGVQFIIQIILARLLLPSDYGMIGMLAIFLQVAQVFIDSGFTNALIQKKDRTEEDFAT
VFYFNILVAVLFYGILFFSASLIADFYNMPTLVLVIRFIALSLIINALSAIHRTKLIISVNFKTQSKISLGAAFISGVIG
IWMAYVGCGVWALVWQTLLNSIILTILFYCLVHWKPLHTFSKSSFERLFNFGSKLLISSLINTVYRNLYTIVIGKKFSVV
ELGYYTRAEQFAIFPSNNLNALVSRVAYPILSSIQDDDKCLTNAYRNYIRLSSYIIFPLMVGLLVLANPIISLLLTDKWS
GVVILLQILCLDWMFDHLSQINLNLLWVKGRSDLSLRLEIIKKTIAIFILFVSIPFGLEVMCWGRVIYSLIATYLNTYYT
NSLIDLTLKLQVKDVFPSLILSFIMGGIVFICISFFETDIVKIVIGCITGMSFYILLSFLFKLDSFFCILTLIIKTKNID
ENIKKDFSSNSKDN

Specific function: Might be involved in the translocation of teichuronic acid repeating units from the inner to the outer surface of the membrane [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788359, Length=366, Percent_Identity=26.2295081967213, Blast_Score=144, Evalue=2e-35,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56147; Mature: 56147

Theoretical pI: Translated: 9.17; Mature: 9.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENLKQKTVSGIMWSAIERFSLQGVQFIIQIILARLLLPSDYGMIGMLAIFLQVAQVFID
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGFTNALIQKKDRTEEDFATVFYFNILVAVLFYGILFFSASLIADFYNMPTLVLVIRFIA
CCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LSLIINALSAIHRTKLIISVNFKTQSKISLGAAFISGVIGIWMAYVGCGVWALVWQTLLN
HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIILTILFYCLVHWKPLHTFSKSSFERLFNFGSKLLISSLINTVYRNLYTIVIGKKFSVV
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
ELGYYTRAEQFAIFPSNNLNALVSRVAYPILSSIQDDDKCLTNAYRNYIRLSSYIIFPLM
EECHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGLLVLANPIISLLLTDKWSGVVILLQILCLDWMFDHLSQINLNLLWVKGRSDLSLRLEI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHH
IKKTIAIFILFVSIPFGLEVMCWGRVIYSLIATYLNTYYTNSLIDLTLKLQVKDVFPSLI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEEHHHHHHHHHH
LSFIMGGIVFICISFFETDIVKIVIGCITGMSFYILLSFLFKLDSFFCILTLIIKTKNID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ENIKKDFSSNSKDN
HHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MENLKQKTVSGIMWSAIERFSLQGVQFIIQIILARLLLPSDYGMIGMLAIFLQVAQVFID
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGFTNALIQKKDRTEEDFATVFYFNILVAVLFYGILFFSASLIADFYNMPTLVLVIRFIA
CCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LSLIINALSAIHRTKLIISVNFKTQSKISLGAAFISGVIGIWMAYVGCGVWALVWQTLLN
HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIILTILFYCLVHWKPLHTFSKSSFERLFNFGSKLLISSLINTVYRNLYTIVIGKKFSVV
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
ELGYYTRAEQFAIFPSNNLNALVSRVAYPILSSIQDDDKCLTNAYRNYIRLSSYIIFPLM
EECHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGLLVLANPIISLLLTDKWSGVVILLQILCLDWMFDHLSQINLNLLWVKGRSDLSLRLEI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHH
IKKTIAIFILFVSIPFGLEVMCWGRVIYSLIATYLNTYYTNSLIDLTLKLQVKDVFPSLI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEEHHHHHHHHHH
LSFIMGGIVFICISFFETDIVKIVIGCITGMSFYILLSFLFKLDSFFCILTLIIKTKNID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ENIKKDFSSNSKDN
HHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10048024; 9384377 [H]