| Definition | Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004663 |
| Length | 6,260,361 |
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The map label for this gene is 29347057
Identifier: 29347057
GI number: 29347057
Start: 2036422
End: 2037720
Strand: Reverse
Name: 29347057
Synonym: BT_1647
Alternate gene names: NA
Gene position: 2037720-2036422 (Counterclockwise)
Preceding gene: 29347058
Following gene: 29347056
Centisome position: 32.55
GC content: 28.56
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: putative integral membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 432; Mature: 432
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49900; Mature: 49900
Theoretical pI: Translated: 8.77; Mature: 8.77
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
2.1 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 5.1 %Cys+Met (Translated Protein) 2.1 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 5.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEINNNISSTIPLVDIVLVFCYVFSFYVIGPLTSSVIIALPLMFCCLYKKKWGYCLLLEL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEE KNSFIVRIFISQWLLIGIAVFYSCLHLTMELEYIKVLIAQMFHFICGIFIIIYLKYQKQY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH TTLKIEQTIIWAFLVQSIIQLIAMSIPSFAHFILYFSRAHDLQDAYGGGVRGLALSSGVG HEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCC WSLGLAYGLIYIVFVKRYLLSGVNMKSTLIGILLLMGTIFAGRTGFVGACLGGIFFIISN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC QLSYRTKLMFVLKILLGVILFFLCIYFLFPSMTEHLVDNVFPFAFEPFYKMYYNDEFSTS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC STDRLEEMWRVSTSVEEILYGSGSFIDTITGAYYKHIDIGILRNLFYWGIGGYILLIIYQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILIAPIKYNKIQRVSHFNMFFYKLLIIVYLFLLECKAVTIGLNKMTFSVIFLIAYFYFD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIHSKKYIAELR HHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MEINNNISSTIPLVDIVLVFCYVFSFYVIGPLTSSVIIALPLMFCCLYKKKWGYCLLLEL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEE KNSFIVRIFISQWLLIGIAVFYSCLHLTMELEYIKVLIAQMFHFICGIFIIIYLKYQKQY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH TTLKIEQTIIWAFLVQSIIQLIAMSIPSFAHFILYFSRAHDLQDAYGGGVRGLALSSGVG HEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCC WSLGLAYGLIYIVFVKRYLLSGVNMKSTLIGILLLMGTIFAGRTGFVGACLGGIFFIISN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC QLSYRTKLMFVLKILLGVILFFLCIYFLFPSMTEHLVDNVFPFAFEPFYKMYYNDEFSTS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC STDRLEEMWRVSTSVEEILYGSGSFIDTITGAYYKHIDIGILRNLFYWGIGGYILLIIYQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILIAPIKYNKIQRVSHFNMFFYKLLIIVYLFLLECKAVTIGLNKMTFSVIFLIAYFYFD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIHSKKYIAELR HHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA