Definition Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome.
Accession NC_004567
Length 3,308,274

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The map label for this gene is 28378156

Identifier: 28378156

GI number: 28378156

Start: 1310325

End: 1312361

Strand: Direct

Name: 28378156

Synonym: lp_1431

Alternate gene names: NA

Gene position: 1310325-1312361 (Clockwise)

Preceding gene: 28378155

Following gene: 28378157

Centisome position: 39.61

GC content: 52.38

Gene sequence:

>2037_bases
ATGAAGGCCGTGGTTAAGAGCGTCAATTGGCTGGCGGCCGCGGTATTGGTCGTCGCAGTTGGCATGGCGTGGTTGCAACC
GATTCACTTCTTCGGCAACCCGGACTGGGCGTCACCGGTCGTTCAATTAGCCATGGTTCTGGGATTATTGGTCATGACGA
TGGCTGGCCGGCAGGTGCTCAAACAGTTATCATCTCGTCAGTATCGTTGGCTGTTGATTGGGCTGGTCGGCTTAATCGCC
ATCGTGCAAATATTGATTGCCACTAGTTTTGTTGACGTGGCGCGGGCCGACCCGTTTTTCGTTCGGCAGCAGGCACTGTT
ATTAGCGCGGGGCAGCCATCATTGGCAACATTATTTTATGATTTATCCCAATAATGTGAATTTTACGTTATTAGTTGCGA
ATCTGCTCAAGCCATTATTGAAACTGACGCAGACGCCCTGGGTATTATTAAATGTCATCCGATTTATCTGGATCGATACC
GGACTAATCAGTGGGTTATATTTACTAAACCGTTGGCGTTACTGGCAACCGGGGGCGGTCTCATTTAGTTTGTTGTGGCT
CGTCAGCGTTCCCGTGGCCGCATTTGGACTATTTGCATACACGGACGCCCTCGTTTTGCCGCTACTTCCAGACAGCTTGG
CCTTGCTCACACTCGGACTAAGCTTAACCGGCTGGCGTCGTTGGGGCGTTTTGATTGGTGATGGGTTATTGGTGGCCGTG
GGCGTGGTGATGAAGACTAATCTCATTGTGCTCTGGCTCACTCTCGTATTGATGGGGATCATCTTGTGGTGGCAACGACA
ATTCAGTGGTCGGCAAATGTTAGGCTGGCTTGTTAGTTTAGTGATGACACTCGGGGTGATGTTTGCGGTGATGCGAACTG
CCCAACAGCAAGCGGGTTATACGCGCCAAGCTGATGCCGCCTTACCGGCAACCAGCTGGATTGCGATGAGCTTGAACCCC
CAAAGCTCGGGTGAGTACCGACATGGCGATTTTGCGCGCGTTAATCAGATGCCAACTGCGGCGGCCAAGCGCCAACAGAC
CCAGCAAATGATTCAGCAGCGGTTACATCAGATGGGCGTTACGGGGACCCTCGTACATTTACTCAAAAAGATGCGGGTCT
TCTGGGCGACTGGCGATTTTGATAGCTTTAAGTTGACCACCCAGTGGATTCGTGCACCCCGCTGGTATTTGAATCATCAA
CGCCAGCTTCAATTTTGGCTGGTTCTAATGACGCAAACGATTTACCTGACGATGCTGGTGCAAGCAATCGTGACTTTGAT
GAGGCGGCGCGAGTGGGCCGTGACGTTCGTTGCCCTGGCAATTCTCGGTTTAACGGCTTTTCATGTCGGACTTTGGGAAG
TAGAAGGGCGCTATGCGTTGCCACTACTACCGGGATTGATGCTTCTCAGTATTGTGGGTGGTCGTGAGTTGCCGGTGTGG
CACCTTAACCGAGTAATGCGGCGCCAATTGACGTGGTTGGTCGTCGTATTGGCGGCAATCAGTGTGGTCAGTTTGTGGCA
GACGAGTCGGGCGACGAGGATTACTGATGTGGTACGTGGCAATCAGGGCAATGGGCGTTATGTTGTGTCCACGGTTCAAA
AAATTAGACCGGGTCAAGCTGTTACTACGCCGTTAGCCGTTAGTGGTAAGAGTAATGTTTTACGGTTGAAGCCAGTTGCG
ACGCATGGGCGCGTAACAATTACCTTGACTAAGGAGACGCATGTCGTCAAACGGTGGCGGGGCTCGGCCAATGAGCTGAC
CACTTTGAATTATCCGTTGACAGCGGCGGGCAACCTGCGATTAGCGATTAAAAACATTGGTCAGACGCCCGTCCGGTATG
GTGTGATGGCGGCCAACTACAGCCCGTTAACAGGCCGGGTGACGGCTAAGCGGCACGCGTACTTACAAGTCGTGATAAAA
CAGCAGTTTATTAAGCCACACGCGTTAACAACGGGTGCCGCCAGTCTAGCAGTTGTCGGCTGTGTGGCGCTGGCGACCAT
TTTGGCGTTAGGTCGGTTACGGCCAGAAACTGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTGCGGAAGTCAAGCACCGGCCCCGCTATATTATTGAAACGGATGATTATACGGCAACTCAACAGCCAGCTATTGTG
AATTCGCAACGGGTGCACGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAACTTGAAGCGAAAGTCTTAATAACTGGTGTTGCCAGTGTTGGAACTTTTATTTGTGGTTAAACGAAATATAATAGC
CGTTAATTTGGGTGACTTAT

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 678; Mature: 678

Protein sequence:

>678_residues
MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVLKQLSSRQYRWLLIGLVGLIA
IVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFMIYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDT
GLISGLYLLNRWRYWQPGAVSFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV
GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGYTRQADAALPATSWIAMSLNP
QSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGVTGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQ
RQLQFWLVLMTQTIYLTMLVQAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW
HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQAVTTPLAVSGKSNVLRLKPVA
THGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLRLAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIK
QQFIKPHALTTGAASLAVVGCVALATILALGRLRPETE

Sequences:

>Translated_678_residues
MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVLKQLSSRQYRWLLIGLVGLIA
IVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFMIYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDT
GLISGLYLLNRWRYWQPGAVSFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV
GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGYTRQADAALPATSWIAMSLNP
QSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGVTGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQ
RQLQFWLVLMTQTIYLTMLVQAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW
HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQAVTTPLAVSGKSNVLRLKPVA
THGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLRLAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIK
QQFIKPHALTTGAASLAVVGCVALATILALGRLRPETE
>Mature_678_residues
MKAVVKSVNWLAAAVLVVAVGMAWLQPIHFFGNPDWASPVVQLAMVLGLLVMTMAGRQVLKQLSSRQYRWLLIGLVGLIA
IVQILIATSFVDVARADPFFVRQQALLLARGSHHWQHYFMIYPNNVNFTLLVANLLKPLLKLTQTPWVLLNVIRFIWIDT
GLISGLYLLNRWRYWQPGAVSFSLLWLVSVPVAAFGLFAYTDALVLPLLPDSLALLTLGLSLTGWRRWGVLIGDGLLVAV
GVVMKTNLIVLWLTLVLMGIILWWQRQFSGRQMLGWLVSLVMTLGVMFAVMRTAQQQAGYTRQADAALPATSWIAMSLNP
QSSGEYRHGDFARVNQMPTAAAKRQQTQQMIQQRLHQMGVTGTLVHLLKKMRVFWATGDFDSFKLTTQWIRAPRWYLNHQ
RQLQFWLVLMTQTIYLTMLVQAIVTLMRRREWAVTFVALAILGLTAFHVGLWEVEGRYALPLLPGLMLLSIVGGRELPVW
HLNRVMRRQLTWLVVVLAAISVVSLWQTSRATRITDVVRGNQGNGRYVVSTVQKIRPGQAVTTPLAVSGKSNVLRLKPVA
THGRVTITLTKETHVVKRWRGSANELTTLNYPLTAAGNLRLAIKNIGQTPVRYGVMAANYSPLTGRVTAKRHAYLQVVIK
QQFIKPHALTTGAASLAVVGCVALATILALGRLRPETE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75876; Mature: 75876

Theoretical pI: Translated: 11.87; Mature: 11.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA