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The map label for this gene is cps2I

Identifier: 28377979

GI number: 28377979

Start: 1098097

End: 1099647

Strand: Direct

Name: cps2I

Synonym: lp_1205

Alternate gene names: NA

Gene position: 1098097-1099647 (Clockwise)

Preceding gene: 28377978

Following gene: 28377980

Centisome position: 33.19

GC content: 32.11

Gene sequence:

>1551_bases
ATGTGGAGTAGAACGGCTAGATCGGTGCAGAATATTATTTATTCAGTAATTGGGCAATCAGTCGCCTTACTTTTGAGTTT
TATATTGCGAATAGTATTTGTTAGGACTCTTAGTAATGAGTATCTTGGTGTAGATAGTTTATTTACCAGTTTAGTGACAG
TTTTATCGCTGGCCGAGTTAAGAGTTGGGTCGGCGATAAATTTTAGCTTATATCAACCGTTGGCTAAAAAAAATGTCAAT
AGAATAAAATCATTGATGCATCTTTATAAAAAGGCGTATACGATAATTGGATTGGCCGTTTTGATTATTGGATTTTGCAT
GGTTCCATTCATTCAAAACATTGGTAATGTGAAGTCTTCAGTGCCCAATCTAAAGTTTTTATTCTCGTTGTTTGTTGTAA
ATAGCTCAATATCTTATTTTTATTCTTATAAAAAATCTTTAATAGTTGCGGATCAATATAGATATATTACAGTTATATAC
ACATATGTCTCATTTGCATTAATGAGTATTGTGCAGGGGATAGTCCTGATAATTTTTAAGCAGTATATACTTTATTTAGT
TACAATGATAATATTTACGTTTTTACAGAATCTGTTTCTTTCTAAAAAGGCAGATAAAATGTATCCATTCTTAAAAGATA
CAAATATTGATCCTGTAGATAAGATGACAACTCGTTTAATTGTTCGAAATGCTTATGCAATGAGTTTACATAAAATTGGC
GGTGTAATAGTCAACTCTATGGACAGCGTTATTATTTCGGCATTTGCAGGAATCAAACAGGTAGGCCGATACTCTAACTA
TTTATTAATTACCAATGCTTTGAATTTAGTGTTTAGTCAAATATTTACTGCCATTATTGCCAGTGTTGGTAACTTAGGTG
CTGAGGTTAATCGGAGGCATACCAAAGAAGTATTTAATACCGTCTTTTTTGCGGGGTACTGGTTAGTCTCGTTTAGTTCG
TGCTGTTTATTTGTATTGTTTAATCCATTTATTAGTATTTGGATTGGAAAAGGATATGTGTTTAATACTTTTGTCGTAGC
TGTAATTGTATTGAATTTTTATATTTATCAGATTAGACGTCCAGTACTCACATTTAGAGATGCTTTGGGTATTTACTGGT
ATGATCGTTATGTTCCAATTATCGAATCAGGTTTAAATTTAGTGATATCAATATTTCTTGCACGACAAATTGGCGTGTCC
GGTGCTCTACTCGGTACAATTATTAGCTCATTGTTGACGAACGTTTGGATTGAGCCTCTAATGTTATACCGACATGGACT
CAAGTCAAAAACAATACAATATTATTGTAAGCTTGCTGGATATTCAGTTGTTGCTGTGATACATATCGCAGTTGTACAAC
TATTAGTGTTGACAGTAACTGCTAAAATAAGAAATACGATTATTTCTTTTGTTGTAATGTTACTAGCTACAATTGTTTTT
TTTAATGTTGTATTTGTCGCTTTCTTCTTCAAATCACATGATTTTAAATTGGTTTGGAAATTGATGGCCAATATTTTTAT
TACTGTGAAGAACAAACTTGTTAAGGGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTACTGCATTTTCTGGTGAAAATAATTATTATAACTATTCTACAATTATTAATGATGTTCCAGTATCTGTTCAAGAAT
TTATAAGTAGGTGAAAGAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACGTGATTTGATTGGTACAAGATAATTATAAGATGGCAGAATATCATATAGTTGTACTAAATATGGAGGAAAAATGGTA
GAACGAATATTACATTGTGT

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 516

Protein sequence:

>516_residues
MWSRTARSVQNIIYSVIGQSVALLLSFILRIVFVRTLSNEYLGVDSLFTSLVTVLSLAELRVGSAINFSLYQPLAKKNVN
RIKSLMHLYKKAYTIIGLAVLIIGFCMVPFIQNIGNVKSSVPNLKFLFSLFVVNSSISYFYSYKKSLIVADQYRYITVIY
TYVSFALMSIVQGIVLIIFKQYILYLVTMIIFTFLQNLFLSKKADKMYPFLKDTNIDPVDKMTTRLIVRNAYAMSLHKIG
GVIVNSMDSVIISAFAGIKQVGRYSNYLLITNALNLVFSQIFTAIIASVGNLGAEVNRRHTKEVFNTVFFAGYWLVSFSS
CCLFVLFNPFISIWIGKGYVFNTFVVAVIVLNFYIYQIRRPVLTFRDALGIYWYDRYVPIIESGLNLVISIFLARQIGVS
GALLGTIISSLLTNVWIEPLMLYRHGLKSKTIQYYCKLAGYSVVAVIHIAVVQLLVLTVTAKIRNTIISFVVMLLATIVF
FNVVFVAFFFKSHDFKLVWKLMANIFITVKNKLVKG

Sequences:

>Translated_516_residues
MWSRTARSVQNIIYSVIGQSVALLLSFILRIVFVRTLSNEYLGVDSLFTSLVTVLSLAELRVGSAINFSLYQPLAKKNVN
RIKSLMHLYKKAYTIIGLAVLIIGFCMVPFIQNIGNVKSSVPNLKFLFSLFVVNSSISYFYSYKKSLIVADQYRYITVIY
TYVSFALMSIVQGIVLIIFKQYILYLVTMIIFTFLQNLFLSKKADKMYPFLKDTNIDPVDKMTTRLIVRNAYAMSLHKIG
GVIVNSMDSVIISAFAGIKQVGRYSNYLLITNALNLVFSQIFTAIIASVGNLGAEVNRRHTKEVFNTVFFAGYWLVSFSS
CCLFVLFNPFISIWIGKGYVFNTFVVAVIVLNFYIYQIRRPVLTFRDALGIYWYDRYVPIIESGLNLVISIFLARQIGVS
GALLGTIISSLLTNVWIEPLMLYRHGLKSKTIQYYCKLAGYSVVAVIHIAVVQLLVLTVTAKIRNTIISFVVMLLATIVF
FNVVFVAFFFKSHDFKLVWKLMANIFITVKNKLVKG
>Mature_516_residues
MWSRTARSVQNIIYSVIGQSVALLLSFILRIVFVRTLSNEYLGVDSLFTSLVTVLSLAELRVGSAINFSLYQPLAKKNVN
RIKSLMHLYKKAYTIIGLAVLIIGFCMVPFIQNIGNVKSSVPNLKFLFSLFVVNSSISYFYSYKKSLIVADQYRYITVIY
TYVSFALMSIVQGIVLIIFKQYILYLVTMIIFTFLQNLFLSKKADKMYPFLKDTNIDPVDKMTTRLIVRNAYAMSLHKIG
GVIVNSMDSVIISAFAGIKQVGRYSNYLLITNALNLVFSQIFTAIIASVGNLGAEVNRRHTKEVFNTVFFAGYWLVSFSS
CCLFVLFNPFISIWIGKGYVFNTFVVAVIVLNFYIYQIRRPVLTFRDALGIYWYDRYVPIIESGLNLVISIFLARQIGVS
GALLGTIISSLLTNVWIEPLMLYRHGLKSKTIQYYCKLAGYSVVAVIHIAVVQLLVLTVTAKIRNTIISFVVMLLATIVF
FNVVFVAFFFKSHDFKLVWKLMANIFITVKNKLVKG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58539; Mature: 58539

Theoretical pI: Translated: 10.38; Mature: 10.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MWSRTARSVQNIIYSVIGQSVALLLSFILRIVFVRTLSNEYLGVDSLFTSLVTVLSLAEL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
RVGSAINFSLYQPLAKKNVNRIKSLMHLYKKAYTIIGLAVLIIGFCMVPFIQNIGNVKSS
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VPNLKFLFSLFVVNSSISYFYSYKKSLIVADQYRYITVIYTYVSFALMSIVQGIVLIIFK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QYILYLVTMIIFTFLQNLFLSKKADKMYPFLKDTNIDPVDKMTTRLIVRNAYAMSLHKIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVIVNSMDSVIISAFAGIKQVGRYSNYLLITNALNLVFSQIFTAIIASVGNLGAEVNRRH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
TKEVFNTVFFAGYWLVSFSSCCLFVLFNPFISIWIGKGYVFNTFVVAVIVLNFYIYQIRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PVLTFRDALGIYWYDRYVPIIESGLNLVISIFLARQIGVSGALLGTIISSLLTNVWIEPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLYRHGLKSKTIQYYCKLAGYSVVAVIHIAVVQLLVLTVTAKIRNTIISFVVMLLATIVF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNVVFVAFFFKSHDFKLVWKLMANIFITVKNKLVKG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA