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The map label for this gene is spoVB [H]

Identifier: 28210693

GI number: 28210693

Start: 1057352

End: 1058959

Strand: Direct

Name: spoVB [H]

Synonym: CTC00987

Alternate gene names: 28210693

Gene position: 1057352-1058959 (Clockwise)

Preceding gene: 28210692

Following gene: 28210695

Centisome position: 37.77

GC content: 30.22

Gene sequence:

>1608_bases
ATGAAAGAGCAATCAACTACTAAAGGGTTTGCTATATTATCTTTAGCAGGAATGATGGTAAAAGTATTATCTTTACTATA
TATACCCTTTTTAAGAGTAATAATAACAGATGAGGGCTATGGAGTTTATGGTGCTGCTTATTCTGTATATGTTTTTATCT
TTGTTCTAACTAACTCAGGGATACCGGTGGCTATTTCAAAATTAATATCAGAGCTCACTGCAGTAGGTAATTATAAAGAT
GCAGTGAAAACATTTAAAATAGCAAGATTTATGCTTCTTATAATAGGAATATTTATGACTGGTTTAATGCTGCTTTTTTC
AGCACCTATTTCTAAAGGTATAAATCAAAGGAGGGCGTATCTATCTATAATCGCACTTTCACCAGCAGTACTTTTTACCT
CTATAGCTTCGGCGTATAGAGGATATTTTCAGGGTTGGGGAAATATGACTCCTACTGCTATATCTCAAGTTATAGAGCAG
GTTGGAAATACTATATTTACCCTCTTATTTGGGATTTTTTTAATTAAATATGGTTTAGAAGCAGGTTGCGCTGGAGCAAC
TATGGGGACATCCATAGGGGCATTTCTTTCAGCAATATTTTTAATTATTGTTTATGAAAAAAATAAAAAGATAAAAATTC
CTAGTAAATTTAAGGAAGTTGAAATAAAAAGACACACTAATAAGGAGATAATTTCAAAAATAGTAAATTATGGAATACCT
ATAACAGTTTGTGTTGGAATGACTTACGCAGGAGATTTAATTGATTTAAGTAATACCATGGGAAGATTAATAGTGGGAGG
AAAATTAGAAGGAGAAGCCTCAAGGTTATACGGGTTCTTAGTAAAGTACAAGCAGTTAATAAATGTGCCAATAGCAATAA
TAACTTCATTAGCAGTGGCTATACTACCTGCTATATCAAGTGCGGCAGCTATTAATGACAGAGATACTGTAAAATCTAAA
ATTAGATATGCTTTTAGAATATGCTTTCTAATAGCAATACCATCAGCTGTTGGGCTAGGTATATTAAGTGGAGCTATATT
TAATATGCTAAAATTCGGAGATGGTGCTTATTTAATGAAATATGGTTCAATAGTTGTGGTTTTAATGTCTATTATGCAAA
TACAAACTACTATATTACAGAGTATAGGTAAACTATATACGGCTACACTTTATGCAGTAATAGGTATAGTATGTAAAATA
GTAGCTAATTATTTTTTAATAGCAATACCATCTTTAAATATATTAGGAGCTATTTACGGAAGTATTATAGGTTATCTAGT
ACCAATACTATTAAATCATAGAATGCTTTTAAAATCCTTAAATATAAAGTTCAAACTTTTAGAACAGGCAAAAAAACCAG
CTATAGCATCTATCTTTATGGGACTTGTAGTTATTTTATCAAATTTATTTTTGAGTAAGTTTTTTAATTTGCATTTAAAG
GGTTATTTTGCTAATACCATAGTAACCATAATTGCTGTAGTGCTAGGAATGTATGCCTATTTATTTGCTATGGTAATTAC
AGGAGGAATAACTAAGGAAGACTTTAAGGTTTTTCCAAGAAAATTAAATAGATTTATACCTAATTTTATAATGGAGAAAA
TGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGATACCTAGAAAATAAAACTATAGCAGAAGCTCTACCGCCTATTTTGAAAAAAATAAAAAATGATGTGTTTAAGTTCT
AAAAATAAGGAGATATTACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAGTTTATGGTCTTTTTAAAAGACCATAAACTATTTACTTTTTTGTCTTAAAATATGATAAACAGGATAGAGGCAAAAA
CCAACTATCATTATAATAAT

Product: stage V sporulation protein B

Products: NA

Alternate protein names: Stage III sporulation protein F [H]

Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 535

Protein sequence:

>535_residues
MKEQSTTKGFAILSLAGMMVKVLSLLYIPFLRVIITDEGYGVYGAAYSVYVFIFVLTNSGIPVAISKLISELTAVGNYKD
AVKTFKIARFMLLIIGIFMTGLMLLFSAPISKGINQRRAYLSIIALSPAVLFTSIASAYRGYFQGWGNMTPTAISQVIEQ
VGNTIFTLLFGIFLIKYGLEAGCAGATMGTSIGAFLSAIFLIIVYEKNKKIKIPSKFKEVEIKRHTNKEIISKIVNYGIP
ITVCVGMTYAGDLIDLSNTMGRLIVGGKLEGEASRLYGFLVKYKQLINVPIAIITSLAVAILPAISSAAAINDRDTVKSK
IRYAFRICFLIAIPSAVGLGILSGAIFNMLKFGDGAYLMKYGSIVVVLMSIMQIQTTILQSIGKLYTATLYAVIGIVCKI
VANYFLIAIPSLNILGAIYGSIIGYLVPILLNHRMLLKSLNIKFKLLEQAKKPAIASIFMGLVVILSNLFLSKFFNLHLK
GYFANTIVTIIAVVLGMYAYLFAMVITGGITKEDFKVFPRKLNRFIPNFIMEKMK

Sequences:

>Translated_535_residues
MKEQSTTKGFAILSLAGMMVKVLSLLYIPFLRVIITDEGYGVYGAAYSVYVFIFVLTNSGIPVAISKLISELTAVGNYKD
AVKTFKIARFMLLIIGIFMTGLMLLFSAPISKGINQRRAYLSIIALSPAVLFTSIASAYRGYFQGWGNMTPTAISQVIEQ
VGNTIFTLLFGIFLIKYGLEAGCAGATMGTSIGAFLSAIFLIIVYEKNKKIKIPSKFKEVEIKRHTNKEIISKIVNYGIP
ITVCVGMTYAGDLIDLSNTMGRLIVGGKLEGEASRLYGFLVKYKQLINVPIAIITSLAVAILPAISSAAAINDRDTVKSK
IRYAFRICFLIAIPSAVGLGILSGAIFNMLKFGDGAYLMKYGSIVVVLMSIMQIQTTILQSIGKLYTATLYAVIGIVCKI
VANYFLIAIPSLNILGAIYGSIIGYLVPILLNHRMLLKSLNIKFKLLEQAKKPAIASIFMGLVVILSNLFLSKFFNLHLK
GYFANTIVTIIAVVLGMYAYLFAMVITGGITKEDFKVFPRKLNRFIPNFIMEKMK
>Mature_535_residues
MKEQSTTKGFAILSLAGMMVKVLSLLYIPFLRVIITDEGYGVYGAAYSVYVFIFVLTNSGIPVAISKLISELTAVGNYKD
AVKTFKIARFMLLIIGIFMTGLMLLFSAPISKGINQRRAYLSIIALSPAVLFTSIASAYRGYFQGWGNMTPTAISQVIEQ
VGNTIFTLLFGIFLIKYGLEAGCAGATMGTSIGAFLSAIFLIIVYEKNKKIKIPSKFKEVEIKRHTNKEIISKIVNYGIP
ITVCVGMTYAGDLIDLSNTMGRLIVGGKLEGEASRLYGFLVKYKQLINVPIAIITSLAVAILPAISSAAAINDRDTVKSK
IRYAFRICFLIAIPSAVGLGILSGAIFNMLKFGDGAYLMKYGSIVVVLMSIMQIQTTILQSIGKLYTATLYAVIGIVCKI
VANYFLIAIPSLNILGAIYGSIIGYLVPILLNHRMLLKSLNIKFKLLEQAKKPAIASIFMGLVVILSNLFLSKFFNLHLK
GYFANTIVTIIAVVLGMYAYLFAMVITGGITKEDFKVFPRKLNRFIPNFIMEKMK

Specific function: Involved, directly or indirectly, in spore cortex biosynthesis. Affects only indirectly the expression of late sporulation genes [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797
- InterPro:   IPR014249 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58616; Mature: 58616

Theoretical pI: Translated: 10.32; Mature: 10.32

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1744050; 9384377 [H]