Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 28210303

Identifier: 28210303

GI number: 28210303

Start: 586174

End: 587934

Strand: Direct

Name: 28210303

Synonym: CTC00567

Alternate gene names: NA

Gene position: 586174-587934 (Clockwise)

Preceding gene: 28210302

Following gene: 28210305

Centisome position: 20.94

GC content: 33.56

Gene sequence:

>1761_bases
ATGAAAAGGAAGAGGACGTTTATTCTGACCATATGCCTTATGCTAGTGGTATTAATGGGAACTACGGTATTTGCGGCAGA
GGTTGATCAAGTACAGTTAAATGCAGATAGATTTGGTTTTTTAACGTTATTACCACCTTTTATAGCTATAGTATTAGCAT
TCATAACTAAAAATGTTGTATTATCATTGTCTTTGGGAGTTTTTTCAGGTACATTTTTATTACAATTGCAAGGTAAAAAT
ATATTTGGAGCAATATTAAATGGATTCTTAGATATAGTAAATAAAATATTAGGTTCACTATCAGATCCTTGGAATGCAGG
TATAATACTTCAATGTATGACTATAGGAGGACTTATAGCTTTAGTGTCTAAAATGGGTGGAGCGAAGGCTGTTGCAGAAA
GCTTAGCTAAAAGGGCAAAAAGTCCAACCAGTGCTCAATTAATAACTTGGTTTTTAGGATTACTTGTATTCTTTGATGAC
TATGCAAACTCTTTAATAGTTGGACCAATTATGAGACCAGTTTCGGATAAAATGAGAATATCTAGAGAAAAACAAGCATT
TATTGTAGACTCTACGGCAGCACCTATATCAGGTATAGCACTTATATCTACTTGGGTAGGATATGAAATTAGTTTAATAA
AAGATGCCTATGGTAGTATAGGGCAAGATATAAATGCCTATGGAGTATTTATAGATACAATACCATATAGATTTTATAAC
ATATTAATACTTGTATTTATAGTGGCTTCAGCTATAATGCTAAGAGATTATGGACCTATGCTTAAATCAGAAGTAAGAGC
TAGAACAACAGGTAAAGTTTTAGGAGACGGAGCAAAGCCTATGGTGTCATCAGAAGCTACAGCTCTTGAACCTAAAGAAA
ACATAAAATTAAATATATGGAATGCAATAGTACCTATAGGTGTCTTATTAGTTGGTGCTTTCGTAGGTTTTTATTTTAAC
GGATATAATGCAATTATGGGTGGAGAAGATGAGGCTTTGAAGGCAATATTTACATCAAGTCCATATTCCTTTGCAGCAAT
AAGAGAAGCTTTTGGAGCATCTGATGCCAGTGTGGTTTTATTCCAAGCGGCTTTATTTGCAAGTATAGTAGCTATGGTTA
TGGGTGTAGCACAAAAAATATTTACTATAGAGGAAGCAGTAGATACTTGGGTTGAAGGTATGAAATCCCTGATGATTACT
GGTGTAATACTATTATTAGCATGGTCTTTAAGTAGTGTTATAAAGGAACTGGGAACAGCTAAATTTTTAGTAACAGTACT
TTCAGATGCGTTACCTGCTTTTATATTGCCATCTATTATATTTGTTATGGGAGCTATAATATCCTTTGCTACTGGAACAT
CCTATGGAACAATGGGAATATTAATGCCGCTTACAATCCCATTAGCATTTAGCTTAGGTGGGGGAGATGCTCAGTATATT
ATTGTAAATGCTAGTGCAGTTTTAACTGGAGCTATATTTGGAGATCACTGTTCACCTATTTCAGATACAACTATATTATC
TTCTATGGGTACAGCATGTGACCACTTAGAACATGTTAAAACTCAAATGTGGTATTCACTAACAGTTGCAACTATTACAA
TATTATTTGGATATATCCCAGCAGGTTTTGGATTTAAAGCATCAATAGTTTTGCCGATATCAATAATTATGACTGTATTA
GTGCTTTATTTATTAGGAAAGCCTGTTGAAGAAATAAGTAAGGCAAAAGATTTTTCTGATGAAGTTGCAACTTCAAAATA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACGAAGCTCAAGGAGTGTTTTTTGTTGGATGGACTCTTCTCCTCAAAAGATATTCACTAAAATTAATTATAAAAATATT
TAAGGAGGAGAAAGAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTAAAATAGGTTGACTTTTTAAGTCAACCTATTTTTCTACATAAATTTTTTATCTCTACCTAAAAATTATATATGT
AAGTCTATGTTTCTATCAAT

Product: Na+/H+ antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 586; Mature: 586

Protein sequence:

>586_residues
MKRKRTFILTICLMLVVLMGTTVFAAEVDQVQLNADRFGFLTLLPPFIAIVLAFITKNVVLSLSLGVFSGTFLLQLQGKN
IFGAILNGFLDIVNKILGSLSDPWNAGIILQCMTIGGLIALVSKMGGAKAVAESLAKRAKSPTSAQLITWFLGLLVFFDD
YANSLIVGPIMRPVSDKMRISREKQAFIVDSTAAPISGIALISTWVGYEISLIKDAYGSIGQDINAYGVFIDTIPYRFYN
ILILVFIVASAIMLRDYGPMLKSEVRARTTGKVLGDGAKPMVSSEATALEPKENIKLNIWNAIVPIGVLLVGAFVGFYFN
GYNAIMGGEDEALKAIFTSSPYSFAAIREAFGASDASVVLFQAALFASIVAMVMGVAQKIFTIEEAVDTWVEGMKSLMIT
GVILLLAWSLSSVIKELGTAKFLVTVLSDALPAFILPSIIFVMGAIISFATGTSYGTMGILMPLTIPLAFSLGGGDAQYI
IVNASAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGTACDHLEHVKTQMWYSLTVATITILFGYIPAGFGFKASIVLPISIIMTVL
VLYLLGKPVEEISKAKDFSDEVATSK

Sequences:

>Translated_586_residues
MKRKRTFILTICLMLVVLMGTTVFAAEVDQVQLNADRFGFLTLLPPFIAIVLAFITKNVVLSLSLGVFSGTFLLQLQGKN
IFGAILNGFLDIVNKILGSLSDPWNAGIILQCMTIGGLIALVSKMGGAKAVAESLAKRAKSPTSAQLITWFLGLLVFFDD
YANSLIVGPIMRPVSDKMRISREKQAFIVDSTAAPISGIALISTWVGYEISLIKDAYGSIGQDINAYGVFIDTIPYRFYN
ILILVFIVASAIMLRDYGPMLKSEVRARTTGKVLGDGAKPMVSSEATALEPKENIKLNIWNAIVPIGVLLVGAFVGFYFN
GYNAIMGGEDEALKAIFTSSPYSFAAIREAFGASDASVVLFQAALFASIVAMVMGVAQKIFTIEEAVDTWVEGMKSLMIT
GVILLLAWSLSSVIKELGTAKFLVTVLSDALPAFILPSIIFVMGAIISFATGTSYGTMGILMPLTIPLAFSLGGGDAQYI
IVNASAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGTACDHLEHVKTQMWYSLTVATITILFGYIPAGFGFKASIVLPISIIMTVL
VLYLLGKPVEEISKAKDFSDEVATSK
>Mature_586_residues
MKRKRTFILTICLMLVVLMGTTVFAAEVDQVQLNADRFGFLTLLPPFIAIVLAFITKNVVLSLSLGVFSGTFLLQLQGKN
IFGAILNGFLDIVNKILGSLSDPWNAGIILQCMTIGGLIALVSKMGGAKAVAESLAKRAKSPTSAQLITWFLGLLVFFDD
YANSLIVGPIMRPVSDKMRISREKQAFIVDSTAAPISGIALISTWVGYEISLIKDAYGSIGQDINAYGVFIDTIPYRFYN
ILILVFIVASAIMLRDYGPMLKSEVRARTTGKVLGDGAKPMVSSEATALEPKENIKLNIWNAIVPIGVLLVGAFVGFYFN
GYNAIMGGEDEALKAIFTSSPYSFAAIREAFGASDASVVLFQAALFASIVAMVMGVAQKIFTIEEAVDTWVEGMKSLMIT
GVILLLAWSLSSVIKELGTAKFLVTVLSDALPAFILPSIIFVMGAIISFATGTSYGTMGILMPLTIPLAFSLGGGDAQYI
IVNASAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGTACDHLEHVKTQMWYSLTVATITILFGYIPAGFGFKASIVLPISIIMTVL
VLYLLGKPVEEISKAKDFSDEVATSK

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62761; Mature: 62761

Theoretical pI: Translated: 6.31; Mature: 6.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRKRTFILTICLMLVVLMGTTVFAAEVDQVQLNADRFGFLTLLPPFIAIVLAFITKNVV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLSLGVFSGTFLLQLQGKNIFGAILNGFLDIVNKILGSLSDPWNAGIILQCMTIGGLIA
HEEEHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LVSKMGGAKAVAESLAKRAKSPTSAQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPIMRPVSDKMRI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHCCHHHHHH
SREKQAFIVDSTAAPISGIALISTWVGYEISLIKDAYGSIGQDINAYGVFIDTIPYRFYN
CCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHH
ILILVFIVASAIMLRDYGPMLKSEVRARTTGKVLGDGAKPMVSSEATALEPKENIKLNIW
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEH
NAIVPIGVLLVGAFVGFYFNGYNAIMGGEDEALKAIFTSSPYSFAAIREAFGASDASVVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHH
FQAALFASIVAMVMGVAQKIFTIEEAVDTWVEGMKSLMITGVILLLAWSLSSVIKELGTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
KFLVTVLSDALPAFILPSIIFVMGAIISFATGTSYGTMGILMPLTIPLAFSLGGGDAQYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEE
IVNASAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGTACDHLEHVKTQMWYSLTVATITILFGYIP
EEECHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
AGFGFKASIVLPISIIMTVLVLYLLGKPVEEISKAKDFSDEVATSK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKRKRTFILTICLMLVVLMGTTVFAAEVDQVQLNADRFGFLTLLPPFIAIVLAFITKNVV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLSLGVFSGTFLLQLQGKNIFGAILNGFLDIVNKILGSLSDPWNAGIILQCMTIGGLIA
HEEEHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LVSKMGGAKAVAESLAKRAKSPTSAQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPIMRPVSDKMRI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHCCHHHHHH
SREKQAFIVDSTAAPISGIALISTWVGYEISLIKDAYGSIGQDINAYGVFIDTIPYRFYN
CCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHH
ILILVFIVASAIMLRDYGPMLKSEVRARTTGKVLGDGAKPMVSSEATALEPKENIKLNIW
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEH
NAIVPIGVLLVGAFVGFYFNGYNAIMGGEDEALKAIFTSSPYSFAAIREAFGASDASVVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHH
FQAALFASIVAMVMGVAQKIFTIEEAVDTWVEGMKSLMITGVILLLAWSLSSVIKELGTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
KFLVTVLSDALPAFILPSIIFVMGAIISFATGTSYGTMGILMPLTIPLAFSLGGGDAQYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEE
IVNASAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGTACDHLEHVKTQMWYSLTVATITILFGYIP
EEECHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
AGFGFKASIVLPISIIMTVLVLYLLGKPVEEISKAKDFSDEVATSK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]