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The map label for this gene is yvcS [H]

Identifier: 28210150

GI number: 28210150

Start: 388628

End: 390595

Strand: Direct

Name: yvcS [H]

Synonym: CTC00396

Alternate gene names: 28210150

Gene position: 388628-390595 (Clockwise)

Preceding gene: 28210149

Following gene: 28210151

Centisome position: 13.88

GC content: 24.44

Gene sequence:

>1968_bases
ATGACAATTAATAATATAGCTATTAAAAATATTAAAGGAAATTTAAATAAATATGCTATGTATTATCTTAGCAATGTAAT
AGTTGTAACTATATTTTTTATATTTGCTAATTTTATATATAATCCAGGTGTCAGTAGTGGAAGTATTAGTAACAAGACCA
TAAGTGAAGTTGCCGGTAGATTAATGTATTTGTGTGAGTTTGTAATAATAATTTTTACTTTTATATTTTCAAATTACTCA
ATAACTACTTTTTTAAAGTCTAGAGAAAAAGAATTTGGACTTTTATCAATGTTTGGACTAACCAAAGGTCAAATAAGAAG
ATATGTTATGTTTGAAAATATAACAATTTCAATTGTTTCTATTATAACAGGATTGTTCTTTGGAATTTTGTTTTCAAAAT
TATTCTTTATGGCTGTATCTGTAATTTTAGATTTAAATTCAGAAATTCCATTTTTAATATCAAATAAAGCTATAAAAATA
ACAATATTAAGTTTTTTAATAGTACTTAATCTTATAAGTTTTATTACAAGTTTTAAAATAAAAAATAATAATATTGCAGA
ATTATTAAAAGGTGAGAGAATACCTAAAATGACACCAAAGTTTTCTAAAATAAAATCAATACTTGGAATAGTACTTATAG
TTTCTGGGTATATTGTAGGCGTATTTTCTGGAACAGCTATTATAGCTACAATGATTCCCATACTTATAGTTGTAATAATA
GGAACTAAGCTTTTGTTTTCTCAATTTAGTGTATTTTTTACAAATAGGCTTCAAAATAATAAGGGGATTTATTATAAAGG
AACAAATCTAATAACCTTATCTCAAATTATATATAAATTAAAAGATAATGCAAAGGTACTATTTATTACTTCAATACTTA
GTGGAATTACTCTTGCATCAGCTATATCAGTTTATTCTCTGCAAAAGGTAAGTTTATCTTCAATGGAAGAAAATTGTCCA
CAGGATATAGGAGTTATAGAGCAGAATATAAATTCTCATAAAGTTATAGCTGATAGAAAAATTGAAGAAATATTGAAAAA
GCATAAATTTGATATAAAATATAAAAATAAAATAGAATTAATAAAAGCAAAAAATAATGATACGGTAAAAGAAAATAAGA
AAGAGCCTTATATAAAAATAAACAAAGATGATTTTAACATAATGTCTCAAAATAGCTTTAATGAGCTTGCAAAGCAGTAT
AACAGAAAACCTTTAACTTTAAAAAATGGAGAAGTGGTAGTATATACCTATGATTTCAATAGTAATATAGCTAATATGAA
AACAGAACTTCCTTTTAAGCATCAAAAGATTTTAAATCTAAATATTGAAGGTGAAGTAAGTAGCTTTAATATACTAGGTA
ATTTAAAAGGTGGAATTATAAATGCAGATATAAAAAATACTAATACTGTAATTGTTAATAACAGTGATTTTAAAAACTTG
TGGGGAAAGGTTTCAAATGGTAATAAATGTATTTATTATGGATATAACATTAAACATAATTTAAAAGCTGCTAATGCAGT
AACTGAAATAAAAAATGCAGTTACAAAAGGTCAAGAAATTTTCTTTACTGAAAGGGTAATAAGTATGGCAAGCGTAATGC
AACTTTTATCTGTACTTTTATTTATAGGAACCTTTATTGCGATTATATTCTTTATTGCAACAGGAAGTATATTATATTTC
AAAATGTTTAATGAAGTTCAGAAAGATAAGCAAGATTTTATAGGATTAAAAAAGATAGGGGTTACACAAGAAGAAATAAA
AAAGGTGGTTAGTATTCAAAGTTTTACAATGTTTTTCTTACCACTTACAGTTGCAACCCTCCATGCCGCTTTTGCTGTAA
AATCTGTAGGACTTTTATATACAAAATATTTTATATTCATTGCAGGAATATATTTAGTTTTACAAATAGCATATTATCTG
TTTGCTAAATGGATGTACATCAAACAAATTAATAGTTGGAACATCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGAATGGAGGAAACAGGCAAACATTTTTTAAAGAAATTATGGATTCTCTTTCACTTTTAGGAAGTAGATCAAATAATTA
TACACTGTAGGAGGGTTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTTATGTGACTTTTGTATATTGAGGGTTTTACCTTTATCTGTAATTGATTTATTAAAGATTTATAGTATATAATTA
TGAATACAAAATATAGATTT

Product: ABC transporter permease protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 655; Mature: 654

Protein sequence:

>655_residues
MTINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGSISNKTISEVAGRLMYLCEFVIIIFTFIFSNYS
ITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKGQIRRYVMFENITISIVSIITGLFFGILFSKLFFMAVSVILDLNSEIPFLISNKAIKI
TILSFLIVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKMTPKFSKIKSILGIVLIVSGYIVGVFSGTAIIATMIPILIVVII
GTKLLFSQFSVFFTNRLQNNKGIYYKGTNLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQKVSLSSMEENCP
QDIGVIEQNINSHKVIADRKIEEILKKHKFDIKYKNKIELIKAKNNDTVKENKKEPYIKINKDDFNIMSQNSFNELAKQY
NRKPLTLKNGEVVVYTYDFNSNIANMKTELPFKHQKILNLNIEGEVSSFNILGNLKGGIINADIKNTNTVIVNNSDFKNL
WGKVSNGNKCIYYGYNIKHNLKAANAVTEIKNAVTKGQEIFFTERVISMASVMQLLSVLLFIGTFIAIIFFIATGSILYF
KMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKVVSIQSFTMFFLPLTVATLHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIAYYL
FAKWMYIKQINSWNI

Sequences:

>Translated_655_residues
MTINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGSISNKTISEVAGRLMYLCEFVIIIFTFIFSNYS
ITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKGQIRRYVMFENITISIVSIITGLFFGILFSKLFFMAVSVILDLNSEIPFLISNKAIKI
TILSFLIVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKMTPKFSKIKSILGIVLIVSGYIVGVFSGTAIIATMIPILIVVII
GTKLLFSQFSVFFTNRLQNNKGIYYKGTNLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQKVSLSSMEENCP
QDIGVIEQNINSHKVIADRKIEEILKKHKFDIKYKNKIELIKAKNNDTVKENKKEPYIKINKDDFNIMSQNSFNELAKQY
NRKPLTLKNGEVVVYTYDFNSNIANMKTELPFKHQKILNLNIEGEVSSFNILGNLKGGIINADIKNTNTVIVNNSDFKNL
WGKVSNGNKCIYYGYNIKHNLKAANAVTEIKNAVTKGQEIFFTERVISMASVMQLLSVLLFIGTFIAIIFFIATGSILYF
KMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKVVSIQSFTMFFLPLTVATLHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIAYYL
FAKWMYIKQINSWNI
>Mature_654_residues
TINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGSISNKTISEVAGRLMYLCEFVIIIFTFIFSNYSI
TTFLKSREKEFGLLSMFGLTKGQIRRYVMFENITISIVSIITGLFFGILFSKLFFMAVSVILDLNSEIPFLISNKAIKIT
ILSFLIVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKMTPKFSKIKSILGIVLIVSGYIVGVFSGTAIIATMIPILIVVIIG
TKLLFSQFSVFFTNRLQNNKGIYYKGTNLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQKVSLSSMEENCPQ
DIGVIEQNINSHKVIADRKIEEILKKHKFDIKYKNKIELIKAKNNDTVKENKKEPYIKINKDDFNIMSQNSFNELAKQYN
RKPLTLKNGEVVVYTYDFNSNIANMKTELPFKHQKILNLNIEGEVSSFNILGNLKGGIINADIKNTNTVIVNNSDFKNLW
GKVSNGNKCIYYGYNIKHNLKAANAVTEIKNAVTKGQEIFFTERVISMASVMQLLSVLLFIGTFIAIIFFIATGSILYFK
MFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKVVSIQSFTMFFLPLTVATLHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIAYYLF
AKWMYIKQINSWNI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74236; Mature: 74105

Theoretical pI: Translated: 10.25; Mature: 10.25

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGSISNKTISEVAGR
CCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LMYLCEFVIIIFTFIFSNYSITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKGQIRRYVMFENITISIVS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHEEEEEECCHHHHHHH
IITGLFFGILFSKLFFMAVSVILDLNSEIPFLISNKAIKITILSFLIVLNLISFITSFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
KNNNIAELLKGERIPKMTPKFSKIKSILGIVLIVSGYIVGVFSGTAIIATMIPILIVVII
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKLLFSQFSVFFTNRLQNNKGIYYKGTNLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
AISVYSLQKVSLSSMEENCPQDIGVIEQNINSHKVIADRKIEEILKKHKFDIKYKNKIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCEEE
IKAKNNDTVKENKKEPYIKINKDDFNIMSQNSFNELAKQYNRKPLTLKNGEVVVYTYDFN
EEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEEECC
SNIANMKTELPFKHQKILNLNIEGEVSSFNILGNLKGGIINADIKNTNTVIVNNSDFKNL
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCHHHH
WGKVSNGNKCIYYGYNIKHNLKAANAVTEIKNAVTKGQEIFFTERVISMASVMQLLSVLL
CCCCCCCCEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIGTFIAIIFFIATGSILYFKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKVVSIQSFTMFFL
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLTVATLHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIAYYLFAKWMYIKQINSWNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TINNIAIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGSISNKTISEVAGR
CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LMYLCEFVIIIFTFIFSNYSITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKGQIRRYVMFENITISIVS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHEEEEEECCHHHHHHH
IITGLFFGILFSKLFFMAVSVILDLNSEIPFLISNKAIKITILSFLIVLNLISFITSFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
KNNNIAELLKGERIPKMTPKFSKIKSILGIVLIVSGYIVGVFSGTAIIATMIPILIVVII
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKLLFSQFSVFFTNRLQNNKGIYYKGTNLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
AISVYSLQKVSLSSMEENCPQDIGVIEQNINSHKVIADRKIEEILKKHKFDIKYKNKIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCEEE
IKAKNNDTVKENKKEPYIKINKDDFNIMSQNSFNELAKQYNRKPLTLKNGEVVVYTYDFN
EEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEEECC
SNIANMKTELPFKHQKILNLNIEGEVSSFNILGNLKGGIINADIKNTNTVIVNNSDFKNL
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCHHHH
WGKVSNGNKCIYYGYNIKHNLKAANAVTEIKNAVTKGQEIFFTERVISMASVMQLLSVLL
CCCCCCCCEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIGTFIAIIFFIATGSILYFKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKVVSIQSFTMFFL
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLTVATLHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIAYYLFAKWMYIKQINSWNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]