Definition Clostridium tetani E88 chromosome, complete genome.
Accession NC_004557
Length 2,799,251

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The map label for this gene is 28210007

Identifier: 28210007

GI number: 28210007

Start: 208774

End: 210420

Strand: Direct

Name: 28210007

Synonym: CTC00241

Alternate gene names: NA

Gene position: 208774-210420 (Clockwise)

Preceding gene: 28210006

Following gene: 28210008

Centisome position: 7.46

GC content: 24.53

Gene sequence:

>1647_bases
ATGAGTAGATTTATATCTCTTACAAAGGTTTTTATTAAGACTAATTTAGGAGAGGATAAAAAGAAGGCTATTACGTTGGT
AATATTATTAGCCATAGGATTTGCGCCTCTTTTAAAAAGTTTTGCCATGGCAACCTCCGCTGCTTATGATATATTAAAAG
AAATAAATGAAGAAAGTATACTTTTATATACAGGTTTATCAGCTACTTCTTTGGCTATATTCATATTTGCTATATTTCAT
GTAATGAATACATTTTATTTTTCTATGGATATAGAAAGTTTACTACCACTTCCACTGCGTTCATATGAAATAATGGGGAG
TAAATTAATACTTATAGTGATATATGAATATGTAACAGAAATAATATTTTTATTACCTATATTGATACAATATGGTATAA
AAATTAATGCAGGAGTCAGTTATTATATTTATGGAGCTATAATATTTTTGGTAAATCCAATTGTTCCAACAATTCTATGT
ACTATATTAATAATGATAATCATGAGATTTTCTAATTTAGGAAAAAACAAAGATAGATTTAAGATGATTAGTGGAGTTAT
TGCATTAGGTATAGGTATAGGAATTAATCTACTTATACAAGGTACTTTTTCTAAAGATCAAAGTAAAGATCAGATTCAAA
ATATAATAATGGGAATTAAGAATAAATACGTAGGAGTTTTATCCAAAATTTTTACTACTACTAAATCAGGAGTATATAGT
TTAGTAGAACATAATAATATCAAAGGATTTATTAATATTTGTTTATTTTTAATAATAACTTTATTATTTTTAGTAATATT
TATATATATAGCAGAAAAACTTTATTTAAAAGGAGTTGTAGGAATATCAGAAACTACATCCACAAGAAAGGTGATAGAAG
ATAATAAATTACATAAGTATACCACAAAAAGAGATGTTGTTATATCTTATGTTTTAAAAGAAATAAAAGTACTTTTAAGA
ACACCTATATATTTTATAAATTGTATATTGATGAATTTTTTATGGCCAATATTTTTTATATTACCTATAGCTATGCAGAA
AGATATAAATGAAATAACACAATATGCAAATGCAATGTTGCAAGATAGTAATGGGATGAAGACTGTAGTTATTATAGCTT
TTTCAGTTATATTATTTATAACTGCCACAAATGGTATAGCTGCATCTTCAATATCACGGGAAGGACAAAATCTATATTTC
AATAAATTTATACCACTAGATATAAAGAAGCTGTTTATATCTAAGATATTAACAGCGGTTATAATAGAAGTTGTAAGTAC
ATTCCTTATTCTACTATTAGTAAATTTAATAATTAAAGTTCCTTTAATTGTTGCTATGAGTATAGTTATTATAGCCATAC
CAGCTATGTTTTTTTCATCATTAATGGGCTTGATTATAGATTTATATTATCCTAAGTTAAATTGGGATAATGAACAAAAA
GCAGTAAAGCAAAATCTTAATATAGTAGGTAATATGGTGTTAAATATAATAATAGCAGTAATAACAGCTATTACATTTAT
AGATCTAAATTTAAATTTAACCATCACCGTTTTACTTATTATGGCAATATATACTTTAATAGATATTTTCATGTATAATT
TCTTGAAAAATAAAGGAGTATCTATGTTTAATGATATCGAAGTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACAATGGTAAAGTATTATTATGTGGAAAGCTTAATGAAATAAAGGAAAAGTTTAAGGAAGATGAATCTTTAGAAAAAAT
ATTCCTAGAGGTAACTGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAATTTGTGAAATATTTGTTTGGAGTGAAGTTTTGTGTTAGGGTGGAAAGAACTACATAATAATTGTTTGGCTTGTA
ACAAGTGTGATTTATCTAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 548; Mature: 547

Protein sequence:

>548_residues
MSRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESILLYTGLSATSLAIFIFAIFH
VMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTEIIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILC
TILIMIIMRFSNLGKNKDRFKMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS
LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKYTTKRDVVISYVLKEIKVLLR
TPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAMLQDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYF
NKFIPLDIKKLFISKILTAVIIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK
AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGVSMFNDIEV

Sequences:

>Translated_548_residues
MSRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESILLYTGLSATSLAIFIFAIFH
VMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTEIIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILC
TILIMIIMRFSNLGKNKDRFKMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS
LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKYTTKRDVVISYVLKEIKVLLR
TPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAMLQDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYF
NKFIPLDIKKLFISKILTAVIIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK
AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGVSMFNDIEV
>Mature_547_residues
SRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESILLYTGLSATSLAIFIFAIFHV
MNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTEIIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILCT
ILIMIIMRFSNLGKNKDRFKMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYSL
VEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKYTTKRDVVISYVLKEIKVLLRT
PIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAMLQDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYFN
KFIPLDIKKLFISKILTAVIIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQKA
VKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGVSMFNDIEV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61754; Mature: 61623

Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESI
CCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
LLYTGLSATSLAIFIFAIFHVMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTE
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILCTILIMIIMRFSNLGKNKDRF
HHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
KMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS
HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKY
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHH
TTKRDVVISYVLKEIKVLLRTPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAML
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYFNKFIPLDIKKLFISKILTAV
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SMFNDIEV
CCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SRFISLTKVFIKTNLGEDKKKAITLVILLAIGFAPLLKSFAMATSAAYDILKEINEESI
CHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
LLYTGLSATSLAIFIFAIFHVMNTFYFSMDIESLLPLPLRSYEIMGSKLILIVIYEYVTE
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IIFLLPILIQYGIKINAGVSYYIYGAIIFLVNPIVPTILCTILIMIIMRFSNLGKNKDRF
HHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
KMISGVIALGIGIGINLLIQGTFSKDQSKDQIQNIIMGIKNKYVGVLSKIFTTTKSGVYS
HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVEHNNIKGFINICLFLIITLLFLVIFIYIAEKLYLKGVVGISETTSTRKVIEDNKLHKY
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHH
TTKRDVVISYVLKEIKVLLRTPIYFINCILMNFLWPIFFILPIAMQKDINEITQYANAML
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QDSNGMKTVVIIAFSVILFITATNGIAASSISREGQNLYFNKFIPLDIKKLFISKILTAV
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IIEVVSTFLILLLVNLIIKVPLIVAMSIVIIAIPAMFFSSLMGLIIDLYYPKLNWDNEQK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
AVKQNLNIVGNMVLNIIIAVITAITFIDLNLNLTITVLLIMAIYTLIDIFMYNFLKNKGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SMFNDIEV
CCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA