| Definition | Xylella fastidiosa Temecula1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004556 |
| Length | 2,519,802 |
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The map label for this gene is actII
Identifier: 28199750
GI number: 28199750
Start: 2210767
End: 2213163
Strand: Reverse
Name: actII
Synonym: PD1882
Alternate gene names: NA
Gene position: 2213163-2210767 (Counterclockwise)
Preceding gene: 28199751
Following gene: 28199749
Centisome position: 87.83
GC content: 57.36
Gene sequence:
>2397_bases GTGGTGTCTGCTGCACTATGGGGGTCGATCGTGGGTGATTGGATCTCTCGGTGTCGTATCGGTATTGCTGTGTTGTGGTT GTTGTTGTTAGTCGGTCTGGGCTGGTGGCTTGCGGGTCGGCTGCAACTCACGGGTGATCTGCGTCAGTTTATGCCTGAGG CACAGACTCCCGCACAAAAGTTGTTACTTGAGGAGCTGGGTGAGGGGCCGGGTTCACGGTTGTTGTTGATGTCGTTACGT GGGAGTGATCCAGCCATTTTGGCGCGGCAATCGCAGGCATTACGGGAAGTGTTGGCAGGGCAGCCTCAGGTGTTTGAGTT GGTTGCTAATGGTGCGCATGTTGGGCTGGAGGCAATTCCGCCCCGATTATTGCCATACCGCTATCTGTTTAGTGACAGTT TTGATGCTGCGCCGCTGGATGTTGGGTATCTCAAGCAGGCGTTGCAGATGCGGGTACAGGATTTGGGGTCTCCAGCCGCG CGTGTGGTTGAGCCGCTGTTGCCTCGGGATCCAACGTTGGAAGTGTTGCATGTGGCTGAGCGTTTGCAGCCGTTAGCGGC ACCTGCAATGCGTGATGGGGTTTGGTTTGATCGTGCTGGACGGCGTGCGTTATTGCTGGCGCAGACGCATGCTGCTGGTT TTGATCCGACGGGCCAGCAGCGCGCTTACGATGCGGTGCAGGCGGCGTTTACTCGGGTGTCGGTGAATACGGCAACGCAG TTGGAACTCACGGGACCTGGTGCGTTTGCGGTGGAGATTGCTGCAAAGACTCAAGGGGAGGCGCAGTGGATCGGGATGTT GGATACGGTAGGACTGATTGTGCTGTTGCTGTTGGCGTATCGCAGTTGGAAGGTGCCGTTGTTGGGGGTGTTACCTCTTG CCAGTGCTGGTCTGGCTGGTTTGGTTGCGGTGGCATTGCTGTTTGATCGTGTGCATGGCATCACGGTGGCGTTTGGTTTT ACCTTGATTGGTGTGGTGCAGGATTATCCGATTCACTTATTTAGCCATCAACGGCCGGGGCTGGACCCGCGGGAAAATGC GCGCCATTTGTGGCCGGCTTTGGCGACGGGTGTTGTTTCTACCTGTATTGCTTACGTTACGTTTCTATTTTCAGGGGTGG ATGGGCTACGTCAGCTTGCAACTTTCACGATTGCAGGGTTGTTGGTCGCGGCAGTGACCACGCGTTGGTTGTTGCCGGGG TTGATTGATCCTGCGCCGCGTGATCCTGCCGATTCGGTCGTGCTCGCGCGGTTATGGCAGTGGACCGCGGGGGTGCGGTG TCCGCATTGGTCGCTAGCATTATTGAGTGTGGCCGCAGTCGCTGCGGTGCTGCTGGTGCCTGGTCCGTTCTGGGAGAATG ATCTGTCTAAGTTGACTCCGGTACCGGTTGCTGCGTTGTTGCGTGATATGCGCTTGCGTCAGGAGTTGGGGGCGCCGGAT GTGCGCTATGTGCTGGCACTGCATGCGGTTTCGGCCGAGCAGGCGTTGCAAGCTGCTGAGGCGTTGCGCCCACGTCTGGA TGGTGCGGTTGCCCAGGGTATTGTTGCCGGTTACGACATGGCGGCGCGTTATTTGCCTAGCATCCAGACGCAGCGTCGGC GTCAACAGGCGTTACCCCCGCCGGAGCAAGTGCGCCGTTTGATCGCAGAGGCTGTGATCGCTTCGGGGTTTCGTGCTGAT GTATTTGAGCCATTTCAGGCGGATGTGGAGATGGCACGGCAGGCACCGCCAATGACGATGCAGATGTTGGGAGGGACTGC GTTGGCGATGCCGGTCAGTGGTTTGTTGTTGGTGGGTACTGACGGTGTCACCGCGCTGGTGTCGCTGATTGGTTTGCATG ATCCGCAGGCGCTCGCTGTCGTGGTAGGTGGTAGTGGTGCACAGTTGATGGATTTGAAGGAGGCGTCTGAGTCACTGGTT GTGGCTTACCGTGGTCGTGTGCTGGGGGCGTTGGGTGTGGCTGGGTTTCTGTTGGTTGGCACGGTGGCTTTGGCATTGCG TCAGTGGCGACGGATGGTGCGTGTGCTCTTGCCTATGGCGATGACAACGTTATGGATTGTGGCATTGCAACGCATCTGTG GGGTGGAGTTGAATTTGTTTCACCTGATTGCGTTGATTCTTGCGGCTGGGTTGGGCCTGGACTATGCGTTGTTCTTTGAA CACGCCGGTGATCATCGCGCCGAGCAATTGCGCACGTTGCATGCGTTGTTGGTGTGCAGTGTGATGACGTTGGTGGTGTT CGCTTTGTTGGCTGTCTCAAGTATTCCGGTGCTGAGTGCGATTGGGAGTACGGTGGCTCTGGGTGTGCTGCTTAACTTTG TTCTTGCGTTGTTGATCTCGCGTGTTCCGGTGTTGGAGAGGATTGCTGGGAGTGATGCTCTTGTCGCAGGGGGGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTATTGGTAAACGTTGGGGTGTATTTTTCTGTCAGTTCCTTCACGTTTGATGATGGCTTCGGGGGTGATGGTTTGATGTT GTGGCAGTGGTATGCCGCTG
Downstream 100 bases:
>100_bases AGAGATTGCCCAGCTGGTGCCTCACCAAGGCAGGATGTGTTTTTGGGAGCAGGTTGTGGAGTGGGATACGACGCGCATTG TGCTGTGTAGTGACATGCAC
Product: membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: Transmembrane Protein; Mmpl Exporter Transmembrane Protein; XanthomoNADin Exporter; MMPL Domain Protein; Exporter TRANSMEMBRANE PROTEIN; Phosphoglucomutase/Phosphomannomutase Alpha/Beta/Subunit
Number of amino acids: Translated: 798; Mature: 798
Protein sequence:
>798_residues MVSAALWGSIVGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGPGSRLLLMSLR GSDPAILARQSQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAA RVVEPLLPRDPTLEVLHVAERLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQ LELTGPGAFAVEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDRVHGITVAFGF TLIGVVQDYPIHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPG LIDPAPRDPADSVVLARLWQWTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPD VRYVLALHAVSAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAEAVIASGFRAD VFEPFQADVEMARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLV VAYRGRVLGALGVAGFLLVGTVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFE HAGDHRAEQLRTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAGSDALVAGG
Sequences:
>Translated_798_residues MVSAALWGSIVGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGPGSRLLLMSLR GSDPAILARQSQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAA RVVEPLLPRDPTLEVLHVAERLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQ LELTGPGAFAVEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDRVHGITVAFGF TLIGVVQDYPIHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPG LIDPAPRDPADSVVLARLWQWTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPD VRYVLALHAVSAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAEAVIASGFRAD VFEPFQADVEMARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLV VAYRGRVLGALGVAGFLLVGTVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFE HAGDHRAEQLRTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAGSDALVAGG >Mature_798_residues MVSAALWGSIVGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQKLLLEELGEGPGSRLLLMSLR GSDPAILARQSQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIPPRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAA RVVEPLLPRDPTLEVLHVAERLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQ LELTGPGAFAVEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAGLVAVALLFDRVHGITVAFGF TLIGVVQDYPIHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVSTCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPG LIDPAPRDPADSVVLARLWQWTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPD VRYVLALHAVSAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPPPEQVRRLIAEAVIASGFRAD VFEPFQADVEMARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGTDGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLV VAYRGRVLGALGVAGFLLVGTVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFE HAGDHRAEQLRTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLISRVPVLERIAGSDALVAGG
Specific function: Unknown
COG id: COG4258
COG function: function code R; Predicted exporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 85409; Mature: 85409
Theoretical pI: Translated: 7.70; Mature: 7.70
Prosite motif: PS00435 PEROXIDASE_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVSAALWGSIVGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHHH LLLEELGEGPGSRLLLMSLRGSDPAILARQSQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIP HHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHCC PRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAARVVEPLLPRDPTLEVLHVAE CCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH RLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQ HHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEE LELTGPGAFAVEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAG EEEECCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCHHH LVAVALLFDRVHGITVAFGFTLIGVVQDYPIHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPGLIDPAPRDPADSVVLARLWQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH WTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPD HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH VRYVLALHAVSAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC PEQVRRLIAEAVIASGFRADVFEPFQADVEMARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGT HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHCCCCEEEECC DGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLVVAYRGRVLGALGVAGFLLVG CCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH HAGDHRAEQLRTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLIS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RVPVLERIAGSDALVAGG HCHHHHHHCCCCCEECCC >Mature Secondary Structure MVSAALWGSIVGDWISRCRIGIAVLWLLLLVGLGWWLAGRLQLTGDLRQFMPEAQTPAQK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHHH LLLEELGEGPGSRLLLMSLRGSDPAILARQSQALREVLAGQPQVFELVANGAHVGLEAIP HHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHCC PRLLPYRYLFSDSFDAAPLDVGYLKQALQMRVQDLGSPAARVVEPLLPRDPTLEVLHVAE CCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH RLQPLAAPAMRDGVWFDRAGRRALLLAQTHAAGFDPTGQQRAYDAVQAAFTRVSVNTATQ HHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEE LELTGPGAFAVEIAAKTQGEAQWIGMLDTVGLIVLLLLAYRSWKVPLLGVLPLASAGLAG EEEECCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCHHH LVAVALLFDRVHGITVAFGFTLIGVVQDYPIHLFSHQRPGLDPRENARHLWPALATGVVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TCIAYVTFLFSGVDGLRQLATFTIAGLLVAAVTTRWLLPGLIDPAPRDPADSVVLARLWQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH WTAGVRCPHWSLALLSVAAVAAVLLVPGPFWENDLSKLTPVPVAALLRDMRLRQELGAPD HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH VRYVLALHAVSAEQALQAAEALRPRLDGAVAQGIVAGYDMAARYLPSIQTQRRRQQALPP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC PEQVRRLIAEAVIASGFRADVFEPFQADVEMARQAPPMTMQMLGGTALAMPVSGLLLVGT HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHCCCCEEEECC DGVTALVSLIGLHDPQALAVVVGGSGAQLMDLKEASESLVVAYRGRVLGALGVAGFLLVG CCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TVALALRQWRRMVRVLLPMAMTTLWIVALQRICGVELNLFHLIALILAAGLGLDYALFFE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH HAGDHRAEQLRTLHALLVCSVMTLVVFALLAVSSIPVLSAIGSTVALGVLLNFVLALLIS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RVPVLERIAGSDALVAGG HCHHHHHHCCCCCEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA