| Definition | Chlamydophila abortus S26/3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004552 |
| Length | 1,144,377 |
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The map label for this gene is 62184799
Identifier: 62184799
GI number: 62184799
Start: 164494
End: 167532
Strand: Direct
Name: 62184799
Synonym: CAB154
Alternate gene names: NA
Gene position: 164494-167532 (Clockwise)
Preceding gene: 62184794
Following gene: 62184803
Centisome position: 14.37
GC content: 41.89
Gene sequence:
>3039_bases ATGACTTCTTCAATACCAAACACCTCAGTTTTTTCGTCACATCCAGAAACTTTGGGTTCTCGTTTATCTTTATTTTCAGA CTTAACTCCTTTAGAGAGAGGCGAGGTATCATCCTCCTGGAAAGAAAAATGTCAGAGAGCCTCTTGTATCGGATTATTCT GTTTATCCCTGCTTACCATTTGTGCTGGAGTTTTAGTCCTTACTTTACTTCCAACTACCCCCGTATTTTTGGGTATAGTA TTTATCGCTATCGGTAGTGTTTTACTAGTCACGAGTTTGTTACTGCACGCATCACTGCGGCCGAGTAAAAAAATCACCAC ACAACAAGTCAACATTCGGGACTTACAAACACAGCTTCAAGGGTTGTTAGCCACGACCAATGCGCGTAGTTTAGCCATAA ACGGTTTTGACCCTAATGGCAATGCAGAATTAATTATTCAAGAAAGAGAGGCACTTTTAGCAAAATTCGATAGAGATTTG CGTAGGAAGGAAGTGGCTTTATACCGTTTCTTATCTTCTGGCACAGAAAACAGGTACCCTGTTTTATGTGATTTATCCGC ATTCCGTGAAATGCAAGAGCGTATTAGTGATGAGCTTGAGCTTTTATATCGTTCTTACAATCATCATATACGAGGAACGG TTGAGGCGAACCCCGATGAACGCTTACTGATCTTACATCAAGAAAGGAATTTATTAATTCAACAGCTCGCTGACATGGGA ATTGAAAAAGCCAATCAAACAGAAGCTCTTGTAGATCTACAATCTACTTTAGATGTTCTTAATCAAAACATTAGATTATT AGAGGACCAAATTGCACAGAACTCGAGTCACGGTCAACAACACGCAGGGTTAGTCAGTGGGCTTCAGCCTTTGCTGCAGG AGCGCAATACTTTACTCATCCGGCTTTCTCTGATTTATGAGGCACTCATTTCTTTAGCTAAGCAAGAAGAAGAATTGACA AGCAGGCGTATTGATTTAGATAAGGATATTGAGGTGGTTGTCGAGTCTAGAGCTGAGCGGATCACATTTAACAATGAATA CAGAGAAAGGTTCCTGCGTTCTTCAGGAAACATCAATCAGTTAACAAATAATTTACGTGAGAAAGAAGCGACTCTTTTAG CGCTTACTCAGGAAGTGGAAGCACTACATGAGGAAGTGGAAAGACTACGCAATCGTCCTTTTGGTGGAGAATATACCCAA CAGGATATCGAACGGTATCGCAATGCATTAACGGTTAAAGAACAAGTTGTCCAGGATCTGGAAGAGCAGGTTGTAAAATA TAGGAGGTTTCTTGAGGAAGCTGTTGAGGTGAATAACCGGATCACTTTGGGAATTCAAGAAAGTGAAAGACGTTCCTTAG AGTTTGCGGCTTTAGAACAAAGAGAGAGGGTGTTAAATCACCAGATACAGGTGTTAACAGTTGATCTTCAAAAACACAAA GAAGAACACCAACGTCTACGAGGGGAAAATGACGATTTGCGAGAGCTTGTTTTAACCACCGAGAGTAATCCTGGTTCTGA TGCGCAGATAGAAGCTCTTCAAAAGGAAATCCGAAGATTAACAGTGGATTTAGAGACTGTTGTCAATGAGCGGATGAACG TATCTGAAGAACTGGCTATTGTACGTGCAGAGTTAACGAATATGGAACTACGCTACGTTGCAATCAAAGAAGAGATGCTT TCCAGAGATGAGGAAAACGCCACTCTTAAAATGGAAGCGGAGGAATTGCGTGGTTTAGTTGTTCAGAATGAGGAGAATCT CGAAAATTTACAGCATGCTTTAACAAATGAAATGAATTTAAAACATGCCGTGGATGTCTTACGACCGGAGATTGATAGAT TAGAACAAGAAAAGCTGAGTCTCAATGCGCGTATGTTAGAAGCTGTTGAGCAAAATCGTATCAACATTGGTCTGCTACAG AAAAACGAACAAGAAAAAGAGAAACTGATTCAAGAGCTGCAAGGTTTACGCTCCCTTCATGCTCAAGAGAAAGAGAGCTT GCAAGAGGAGATTACTAAATTACAAAAGGAGATGCACGAGCGTCATTTACACCATCTGGAAGAGACCTCGCGCTTGAGAT TAGAAAATAATCAATTAGAAAGTCTTCTTAAAGATGCACAGAGAATGGGTGAGCACAGTCATGAGGGAGCTTTACGGATG TTAGGCTCTCAGTTAATTGTCTTATCTTCTCACATTAAGCAGCGAAGTAAATCTGAGATACAATCTGCAGGAGATGTCAT GGAAATGTTGGCTTTCACATCTCCAAGATTCTTTGGCAACTTGGGGGCAGGAATCTCTTGTAGAAGCCTACGTCCCGGCG TGTATTTAGAAGCAGAACTTCCTGTTGATGCTAGTGATGAGCAAAAACGTGTTGTTATAGAACAGCGTTGCTTGCGTGAG TGGTTCTTCGCTCTGTTAGGACACTTCACTGTGGAACAAATAGAAAGTCTCTCACAAAGAGCTAGGGATCTGGTTCAAGA AGCTGGTGAGCAAGCGAGTGCCCATGAACTGTTCGATCAGTTAGCGAGCGAGTTCTCTGAAATTCGTGATGCTTCCGGAG CTCTTTCTCAGTGGTTATCTACTTGCTATAGCTATGTGACCAATCTCCAGATTTTCAACAACTACTTCGAGTGGTCAGGG TTCCTATTCTCCCTATTGCAGAAAATGCACAAGGGAACTGGGGGCATATTGCATAATTTGTCTGAGGAAGAACAACAGTT CTTCAAGATTGTGTCTAACTTCTCTGGTAGGGTGCCTCTAGTTTTAGGCAGTATCGGCCATAGTGAAGGAACCACACCGG GGGCAGCAAATCCTCTAGGGGATCTCAATTTTGAAAATGTTGGGAATATTACTTGGAGTCGATTTATAAGAATCATAGAG GGGCTACTAGAAGCAAGAAGTAGTCTCAGTGGCCCGATGATTTTAGAGATGAGCGATATCAGAGAGAGTGTGGTACGTAC AATCTCTTCTAACGTTTACACCGACATGCTAACCGAGAAATATTCACCGACTACCTGGACGCCTCCGGCTGATCTATAA
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1012; Mature: 1011
Protein sequence:
>1012_residues MTSSIPNTSVFSSHPETLGSRLSLFSDLTPLERGEVSSSWKEKCQRASCIGLFCLSLLTICAGVLVLTLLPTTPVFLGIV FIAIGSVLLVTSLLLHASLRPSKKITTQQVNIRDLQTQLQGLLATTNARSLAINGFDPNGNAELIIQEREALLAKFDRDL RRKEVALYRFLSSGTENRYPVLCDLSAFREMQERISDELELLYRSYNHHIRGTVEANPDERLLILHQERNLLIQQLADMG IEKANQTEALVDLQSTLDVLNQNIRLLEDQIAQNSSHGQQHAGLVSGLQPLLQERNTLLIRLSLIYEALISLAKQEEELT SRRIDLDKDIEVVVESRAERITFNNEYRERFLRSSGNINQLTNNLREKEATLLALTQEVEALHEEVERLRNRPFGGEYTQ QDIERYRNALTVKEQVVQDLEEQVVKYRRFLEEAVEVNNRITLGIQESERRSLEFAALEQRERVLNHQIQVLTVDLQKHK EEHQRLRGENDDLRELVLTTESNPGSDAQIEALQKEIRRLTVDLETVVNERMNVSEELAIVRAELTNMELRYVAIKEEML SRDEENATLKMEAEELRGLVVQNEENLENLQHALTNEMNLKHAVDVLRPEIDRLEQEKLSLNARMLEAVEQNRINIGLLQ KNEQEKEKLIQELQGLRSLHAQEKESLQEEITKLQKEMHERHLHHLEETSRLRLENNQLESLLKDAQRMGEHSHEGALRM LGSQLIVLSSHIKQRSKSEIQSAGDVMEMLAFTSPRFFGNLGAGISCRSLRPGVYLEAELPVDASDEQKRVVIEQRCLRE WFFALLGHFTVEQIESLSQRARDLVQEAGEQASAHELFDQLASEFSEIRDASGALSQWLSTCYSYVTNLQIFNNYFEWSG FLFSLLQKMHKGTGGILHNLSEEEQQFFKIVSNFSGRVPLVLGSIGHSEGTTPGAANPLGDLNFENVGNITWSRFIRIIE GLLEARSSLSGPMILEMSDIRESVVRTISSNVYTDMLTEKYSPTTWTPPADL
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 115425; Mature: 115293
Theoretical pI: Translated: 4.90; Mature: 4.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTSSIPNTSVFSSHPETLGSRLSLFSDLTPLERGEVSSSWKEKCQRASCIGLFCLSLLTI CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CAGVLVLTLLPTTPVFLGIVFIAIGSVLLVTSLLLHASLRPSKKITTQQVNIRDLQTQLQ HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHH GLLATTNARSLAINGFDPNGNAELIIQEREALLAKFDRDLRRKEVALYRFLSSGTENRYP HHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC VLCDLSAFREMQERISDELELLYRSYNHHIRGTVEANPDERLLILHQERNLLIQQLADMG EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHC IEKANQTEALVDLQSTLDVLNQNIRLLEDQIAQNSSHGQQHAGLVSGLQPLLQERNTLLI CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH RLSLIYEALISLAKQEEELTSRRIDLDKDIEVVVESRAERITFNNEYRERFLRSSGNINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHH LTNNLREKEATLLALTQEVEALHEEVERLRNRPFGGEYTQQDIERYRNALTVKEQVVQDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEQVVKYRRFLEEAVEVNNRITLGIQESERRSLEFAALEQRERVLNHQIQVLTVDLQKHK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHH EEHQRLRGENDDLRELVLTTESNPGSDAQIEALQKEIRRLTVDLETVVNERMNVSEELAI HHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH VRAELTNMELRYVAIKEEMLSRDEENATLKMEAEELRGLVVQNEENLENLQHALTNEMNL HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCH KHAVDVLRPEIDRLEQEKLSLNARMLEAVEQNRINIGLLQKNEQEKEKLIQELQGLRSLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQEKESLQEEITKLQKEMHERHLHHLEETSRLRLENNQLESLLKDAQRMGEHSHEGALRM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LGSQLIVLSSHIKQRSKSEIQSAGDVMEMLAFTSPRFFGNLGAGISCRSLRPGVYLEAEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCEECCCCCCEEEEEEC PVDASDEQKRVVIEQRCLREWFFALLGHFTVEQIESLSQRARDLVQEAGEQASAHELFDQ CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LASEFSEIRDASGALSQWLSTCYSYVTNLQIFNNYFEWSGFLFSLLQKMHKGTGGILHNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCC SEEEQQFFKIVSNFSGRVPLVLGSIGHSEGTTPGAANPLGDLNFENVGNITWSRFIRIIE CHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH GLLEARSSLSGPMILEMSDIRESVVRTISSNVYTDMLTEKYSPTTWTPPADL HHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure TSSIPNTSVFSSHPETLGSRLSLFSDLTPLERGEVSSSWKEKCQRASCIGLFCLSLLTI CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CAGVLVLTLLPTTPVFLGIVFIAIGSVLLVTSLLLHASLRPSKKITTQQVNIRDLQTQLQ HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHH GLLATTNARSLAINGFDPNGNAELIIQEREALLAKFDRDLRRKEVALYRFLSSGTENRYP HHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC VLCDLSAFREMQERISDELELLYRSYNHHIRGTVEANPDERLLILHQERNLLIQQLADMG EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHC IEKANQTEALVDLQSTLDVLNQNIRLLEDQIAQNSSHGQQHAGLVSGLQPLLQERNTLLI CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH RLSLIYEALISLAKQEEELTSRRIDLDKDIEVVVESRAERITFNNEYRERFLRSSGNINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHH LTNNLREKEATLLALTQEVEALHEEVERLRNRPFGGEYTQQDIERYRNALTVKEQVVQDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEQVVKYRRFLEEAVEVNNRITLGIQESERRSLEFAALEQRERVLNHQIQVLTVDLQKHK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHH EEHQRLRGENDDLRELVLTTESNPGSDAQIEALQKEIRRLTVDLETVVNERMNVSEELAI HHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH VRAELTNMELRYVAIKEEMLSRDEENATLKMEAEELRGLVVQNEENLENLQHALTNEMNL HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCH KHAVDVLRPEIDRLEQEKLSLNARMLEAVEQNRINIGLLQKNEQEKEKLIQELQGLRSLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQEKESLQEEITKLQKEMHERHLHHLEETSRLRLENNQLESLLKDAQRMGEHSHEGALRM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LGSQLIVLSSHIKQRSKSEIQSAGDVMEMLAFTSPRFFGNLGAGISCRSLRPGVYLEAEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCEECCCCCCEEEEEEC PVDASDEQKRVVIEQRCLREWFFALLGHFTVEQIESLSQRARDLVQEAGEQASAHELFDQ CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LASEFSEIRDASGALSQWLSTCYSYVTNLQIFNNYFEWSGFLFSLLQKMHKGTGGILHNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCC SEEEQQFFKIVSNFSGRVPLVLGSIGHSEGTTPGAANPLGDLNFENVGNITWSRFIRIIE CHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH GLLEARSSLSGPMILEMSDIRESVVRTISSNVYTDMLTEKYSPTTWTPPADL HHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
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References: NA