Definition Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome chromosome I, complete sequence.
Accession NC_004459
Length 3,281,866

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The map label for this gene is 326423702

Identifier: 326423702

GI number: 326423702

Start: 375640

End: 378201

Strand: Reverse

Name: 326423702

Synonym: NA

Alternate gene names: NA

Gene position: 378201-375640 (Counterclockwise)

Preceding gene: 326423703

Following gene: 326423701

Centisome position: 11.52

GC content: 30.29

Gene sequence:

>2562_bases
ATGACTAAAAAATTAATATCAGAAACAATAATTCCTAGAGAATTATATATAGAACGAGACGCAGATAGGCAGATTGAGCA
AATAGTCAATGATATGGGGAGACCTGGATACATACTAGTATCTAGACAAATGGGTAAAACAAATTTATTAATCCATACAA
AAAGAAAACTTGAAACTGAGAATGATATCTTTGCTTATATAGATCTATCTAATCGTTTTGATACAGCAAGAGAGTGTTTT
AGAAGTATAATAGACACAATCATTGAATCTAACTATGAGAAATTGGAAGATATAGAAGAAGAAATAGAAAACAGAAGAAA
CAACAGAAAAATACCATCACATAAAGAACATGGATTTGAAATAAGAAAGATACTAAATAAAATTTCTGGAAAACTAATTA
TCAACCTTGATGAAATTGATTCCCTTACTTCATCAGATTACTCTGATAAAATATTCGCACATATTAGAAGTGTATATTTC
GAGCGAGTAAACTTCCCAGAGTTAAAGCGTTTAACATATGTAATATCTGGTGTTGCCGAACCAAGTGAGATAATAAAAGA
TAAATCTATATCACCATTTAACATTGGTCAGAAAATATTCTTAACTGATTTTAGCCTTAGCGAGTTTCGTTTATTTGTCG
AGAAGTCAAAATTAGAACTGAACGATATTGTCATTGAGCGTATTTATTATTGGATTCAGGGGAATCCTAGAATGTCATGG
GAAGTTTTATCTACTATAGAAGACAAGGTAAAAGCTGGTATAAATATTGATGTTGATTCAATTAACTCTGTAATAAAAGA
CCTATATCTTTCAAATTATGATCGACCACCAATAGATCATATAAGAGTTCTTGCATCTGCTGATAAAGATTTACAAAGTG
GTTTATTTTCAATGCACTACAATAAACCAGTATCCGATCACATAAGGTCTAAGTTATATTTAGCGGGCATTGCTGCTCCA
TCTGAAGCTGACGAATCTGTAGCATTTAAAAATAGAGTAGTTGAAGCAAGTCTATCTGAAACCTGGTTAAGTAGTCTAAG
TCTAAATAGTTATGTATCTATTGACTCAACACTAGAACTATTCAATAAAAAAGAATATATAGCCGCTGAAAAGCAGTTTC
TGACATTAATTGAGTCTGAAATCAACGATGAAATGTTGGATTTTATTCGTTACAAGCTAGCTGCTTGTACGCTATTTAAT
GCTAAATATACTGATACTATTAAGTATTGCAAGTTATTAAAAGACGTAGAAAAAATAGATCAAAGAGAAGTTTCTTGGAT
GCTTGGGTTTAGTTTTTTTAAAACAAACTCTATAGAGCCAGCTATCGAAGAGCTATCAATTTTAGTTAGTGGCGAAGAGC
TAGATTCATTGAAGTATCGAGCAACAGTAGATTATTGTCTAGCTCTGTTAAAGTCTAATAATAATCATACCGATGAAATA
ATACGACTTTGTAAATCAATAATTCAAGAATTATCTATATCAGTTGAAAATGAACCTTTAATTGATATAAAGAATTCAAT
TATGGAAGTATTATATATTGCAAGTATGATTCTTCAAGAGCTAGATAATATGAATTCTGAACGGCATATAGATAGTGCAT
GTCAGTATGCTGTTGGACTGGATGTTATAGTTCCTTCTATTATGCGATATGAAAAAGATGAAGACTGTGATTTATTTTGG
GATTCTATATTCCTAAAGGTTAATGAGAGTGAAAAAATCCACACTTCCAATAAAAATTCCAACCCATACCTATTGAAAGA
CACTCATATAAAATCTTTTATAAACCTATCTCAATGTCTTGATGATGATAGATTTTTGGAATATCTAAAATGTATACAAA
AAATAATTGAACAATCAGAATCACTAAATATTGACTTTTTCCACAACTTAATCATGTGTCTTGTGCTTGATTTACAAAAT
AAGTCTAAAAAGGAAAGGTGGATATCTACGTTAAACTTTATTAAATCATTAGATAGAGAAATTATAGACCCTGAATTTGA
ATTTTTGTGCAATAAGTTTTCTACATATTTGGAACCACAGAATGAAGAAGCAAGGTCTTTATACTTTCAAGGTATTCAAA
ATTATAGCTCAACACCAGAAATAATCGATGCTGAGATTTTTGAACGTGAAATAATAAGACTATATGATGAAGGTAAAGAT
GAACAAGCAATATCGCTATCAGACTTAGTTCATAGCCTAGATGTTCTCTCATCAACCTCAACTAAGGTCATTCTTATAAG
AATAATGTACATTAGAATGATTCGTTCAAAAAATACTGATAAAAAGGTATCACTAGCTAAAGAACTCGATAATCTACTAG
ATAAAATAACCGTTGAGAACGTTGCTCATGCTAGGCTTAATATGAAAGAAGTAGACAATATACGAAAAAACGTTAAAGGT
ATCATAATTAAAAATACACCTATTAAACAGGTGATTCATGAACGAAAATATAAAAGAAATGAGTTAATTTCCGTTCTATA
CATTGAAAATGATACTACCGAAGTTGGTAAGTACAAAAAATTCATAAACGACTTAGAAAATGGCAAATGCCGCATCATTT
AG

Upstream 100 bases:
NA

Downstream 100 bases:
NA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 853; Mature: 852

Protein sequence:
NA

Sequences:

>Translated_853_residues
MTKKLISETIIPRELYIERDADRQIEQIVNDMGRPGYILVSRQMGKTNLLIHTKRKLETENDIFAYIDLSNRFDTARECF
RSIIDTIIESNYEKLEDIEEEIENRRNNRKIPSHKEHGFEIRKILNKISGKLIINLDEIDSLTSSDYSDKIFAHIRSVYF
ERVNFPELKRLTYVISGVAEPSEIIKDKSISPFNIGQKIFLTDFSLSEFRLFVEKSKLELNDIVIERIYYWIQGNPRMSW
EVLSTIEDKVKAGINIDVDSINSVIKDLYLSNYDRPPIDHIRVLASADKDLQSGLFSMHYNKPVSDHIRSKLYLAGIAAP
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AKYTDTIKYCKLLKDVEKIDQREVSWMLGFSFFKTNSIEPAIEELSILVSGEELDSLKYRATVDYCLALLKSNNNHTDEI
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DSIFLKVNESEKIHTSNKNSNPYLLKDTHIKSFINLSQCLDDDRFLEYLKCIQKIIEQSESLNIDFFHNLIMCLVLDLQN
KSKKERWISTLNFIKSLDREIIDPEFEFLCNKFSTYLEPQNEEARSLYFQGIQNYSSTPEIIDAEIFEREIIRLYDEGKD
EQAISLSDLVHSLDVLSSTSTKVILIRIMYIRMIRSKNTDKKVSLAKELDNLLDKITVENVAHARLNMKEVDNIRKNVKG
IIIKNTPIKQVIHERKYKRNELISVLYIENDTTEVGKYKKFINDLENGKCRII
>Mature_852_residues
TKKLISETIIPRELYIERDADRQIEQIVNDMGRPGYILVSRQMGKTNLLIHTKRKLETENDIFAYIDLSNRFDTARECFR
SIIDTIIESNYEKLEDIEEEIENRRNNRKIPSHKEHGFEIRKILNKISGKLIINLDEIDSLTSSDYSDKIFAHIRSVYFE
RVNFPELKRLTYVISGVAEPSEIIKDKSISPFNIGQKIFLTDFSLSEFRLFVEKSKLELNDIVIERIYYWIQGNPRMSWE
VLSTIEDKVKAGINIDVDSINSVIKDLYLSNYDRPPIDHIRVLASADKDLQSGLFSMHYNKPVSDHIRSKLYLAGIAAPS
EADESVAFKNRVVEASLSETWLSSLSLNSYVSIDSTLELFNKKEYIAAEKQFLTLIESEINDEMLDFIRYKLAACTLFNA
KYTDTIKYCKLLKDVEKIDQREVSWMLGFSFFKTNSIEPAIEELSILVSGEELDSLKYRATVDYCLALLKSNNNHTDEII
RLCKSIIQELSISVENEPLIDIKNSIMEVLYIASMILQELDNMNSERHIDSACQYAVGLDVIVPSIMRYEKDEDCDLFWD
SIFLKVNESEKIHTSNKNSNPYLLKDTHIKSFINLSQCLDDDRFLEYLKCIQKIIEQSESLNIDFFHNLIMCLVLDLQNK
SKKERWISTLNFIKSLDREIIDPEFEFLCNKFSTYLEPQNEEARSLYFQGIQNYSSTPEIIDAEIFEREIIRLYDEGKDE
QAISLSDLVHSLDVLSSTSTKVILIRIMYIRMIRSKNTDKKVSLAKELDNLLDKITVENVAHARLNMKEVDNIRKNVKGI
IIKNTPIKQVIHERKYKRNELISVLYIENDTTEVGKYKKFINDLENGKCRII

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 11 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 99247; Mature: 99116

Theoretical pI: Translated: 5.03; Mature: 5.03

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKKLISETIIPRELYIERDADRQIEQIVNDMGRPGYILVSRQMGKTNLLIHTKRKLETE
CCHHHHHHHCCCHHHEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEHHHCCCC
NDIFAYIDLSNRFDTARECFRSIIDTIIESNYEKLEDIEEEIENRRNNRKIPSHKEHGFE
CCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH
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HHHHHHHCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCC
PSEIIKDKSISPFNIGQKIFLTDFSLSEFRLFVEKSKLELNDIVIERIYYWIQGNPRMSW
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EVLSTIEDKVKAGINIDVDSINSVIKDLYLSNYDRPPIDHIRVLASADKDLQSGLFSMHY
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCHHHHCC
NKPVSDHIRSKLYLAGIAAPSEADESVAFKNRVVEASLSETWLSSLSLNSYVSIDSTLEL
CCCHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECHHHHHHH
FNKKEYIAAEKQFLTLIESEINDEMLDFIRYKLAACTLFNAKYTDTIKYCKLLKDVEKID
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QREVSWMLGFSFFKTNSIEPAIEELSILVSGEELDSLKYRATVDYCLALLKSNNNHTDEI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
IRLCKSIIQELSISVENEPLIDIKNSIMEVLYIASMILQELDNMNSERHIDSACQYAVGL
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
DVIVPSIMRYEKDEDCDLFWDSIFLKVNESEKIHTSNKNSNPYLLKDTHIKSFINLSQCL
HHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEEEEECCCCCEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHC
DDDRFLEYLKCIQKIIEQSESLNIDFFHNLIMCLVLDLQNKSKKERWISTLNFIKSLDRE
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIDPEFEFLCNKFSTYLEPQNEEARSLYFQGIQNYSSTPEIIDAEIFEREIIRLYDEGKD
HCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
EQAISLSDLVHSLDVLSSTSTKVILIRIMYIRMIRSKNTDKKVSLAKELDNLLDKITVEN
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAHARLNMKEVDNIRKNVKGIIIKNTPIKQVIHERKYKRNELISVLYIENDTTEVGKYKK
HHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHH
FINDLENGKCRII
HHHHCCCCCEEEC
>Mature Secondary Structure 
TKKLISETIIPRELYIERDADRQIEQIVNDMGRPGYILVSRQMGKTNLLIHTKRKLETE
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HHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHH
FINDLENGKCRII
HHHHCCCCCEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]