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The map label for this gene is nhaC [H]

Identifier: 23098573

GI number: 23098573

Start: 1170335

End: 1171699

Strand: Reverse

Name: nhaC [H]

Synonym: OB1118

Alternate gene names: 23098573

Gene position: 1171699-1170335 (Counterclockwise)

Preceding gene: 23098578

Following gene: 23098572

Centisome position: 32.27

GC content: 34.43

Gene sequence:

>1365_bases
ATGAAACCTATTTCGGCAAAACACAAACCAGCTTTTTGGGAAGCTTTGTTATTCTTTATATGTATTATTATATTTATTAG
CTACTTTATCATCGGATTAGAAACAACACCGCATATACCCATTTTAATTGGAATGTTAATTTTAATTTGTTATGGACTAT
TTAAGAAGATTAATTACGCTTCTCTCCAAGATGCAATGTCGACTGGAGCTTCTTCCGGAATGGGAGCTATTTTCCTTTTC
TTCATTATCGGAGTGTTAATTAGTAGTTGGATGATAAGTGGTACTATACCTACTTTAATTAACACAGGTTTCTCATTAAT
TGGCACTACGTGGTTTTATGCGGTTGTCTTTGCAGTTACTGCGATAATCGGGATTTCTATGGGAAGCTCTCTTACAACTA
CGGCAACTATTGGTGTAGCATTTATTGGAATGGCTGAAGCAATGGATGCTTCATTAGCCATCACTGCTGGTGCTATTGTT
TCAGGGGCATTTTTTGGAGATAAGATGTCACCCTTATCTGATACAACGAATCTCGCATCTTCTATAATTGGAGTAGATTT
ATTTGATCATATAAAACATATTAGTTTAACTACTATACCAGCATTTATTATTTCATTTATTGTATTTGCAATACTTTCTC
CTAAACAGGGTACATCGATAAGCAATGTAGAAGCTTATCGAGAAGCTTTAATAAATAGTGGTCTTATGCATTGGACGTCT
TGGATCCCTTTAATCATTTTAATTGTGTGTACTGTATTTCGAATGTCAGCGTTCCTAGCTTTGTCATTAAGTAGTTTAAT
CGCCGTTATCCTTGGAAAAATCACCAATGGATTTACATGGAAAGAAATTACCAGTGCTTGGTTTAATGGTTTTACTGGAA
CTACGAACTTTGAACCTGTTAATGAATTATTAACTCGCGGCGGAATAAATGGAATGTTATTTACTATTTCATTAGTTATA
TTAGCCTTAAGTTTTGGCGGATTACTTTTTGTTACAGGTATTATCCCAAGTTTATTAAATAGTTTCCAAGAGAAATTACA
ACGTGCAAGATCGATTATTGTATCAACTGCAGGAACAGCTATTGGTGTTAATGTACTTATCGGTGAGCAATATTTATCTA
TATTATTAACTGGTGAAACGTTTAAGCCTATATATGAAAAAGCTGGATTAACGAAGCGCTCCTTGTCTCGAACACTAGAA
GATGCTGGTACAGTTATTAATCCATTAGTTCCTTGGAGTGTATGTGGAGTATTTATAGCGGATGTACTTGGAGTACCGGT
GCTCACTTATTTACCATTTGCATTTTTCTGCCTGCTAAGCCCAATTATTACTATTTTATTTGGTGCTAAAACAGCAAAAA
AATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGTGGATAGAATTCTTTCTATCAACCAGGGTGGTAACGCGGAGTATACAGCTTCGTCCCTTAGAGGGACGGGGCTTTTT
ATATTTTAGGAGGAAAGACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTGAAATAAAGTGAAAGTAAAGCAAGATAAAAGACGCTGGGACATAACAAAAAGTGCTAGTCAAAAGACGAATGAAAG
CTAGAATAAGCGTAAGAAAT

Product: Na(+):H(+) antiporter

Products: NA

Alternate protein names: Sodium/hydrogen antiporter; Sodium/proton antiporter [H]

Number of amino acids: Translated: 454; Mature: 454

Protein sequence:

>454_residues
MKPISAKHKPAFWEALLFFICIIIFISYFIIGLETTPHIPILIGMLILICYGLFKKINYASLQDAMSTGASSGMGAIFLF
FIIGVLISSWMISGTIPTLINTGFSLIGTTWFYAVVFAVTAIIGISMGSSLTTTATIGVAFIGMAEAMDASLAITAGAIV
SGAFFGDKMSPLSDTTNLASSIIGVDLFDHIKHISLTTIPAFIISFIVFAILSPKQGTSISNVEAYREALINSGLMHWTS
WIPLIILIVCTVFRMSAFLALSLSSLIAVILGKITNGFTWKEITSAWFNGFTGTTNFEPVNELLTRGGINGMLFTISLVI
LALSFGGLLFVTGIIPSLLNSFQEKLQRARSIIVSTAGTAIGVNVLIGEQYLSILLTGETFKPIYEKAGLTKRSLSRTLE
DAGTVINPLVPWSVCGVFIADVLGVPVLTYLPFAFFCLLSPIITILFGAKTAKK

Sequences:

>Translated_454_residues
MKPISAKHKPAFWEALLFFICIIIFISYFIIGLETTPHIPILIGMLILICYGLFKKINYASLQDAMSTGASSGMGAIFLF
FIIGVLISSWMISGTIPTLINTGFSLIGTTWFYAVVFAVTAIIGISMGSSLTTTATIGVAFIGMAEAMDASLAITAGAIV
SGAFFGDKMSPLSDTTNLASSIIGVDLFDHIKHISLTTIPAFIISFIVFAILSPKQGTSISNVEAYREALINSGLMHWTS
WIPLIILIVCTVFRMSAFLALSLSSLIAVILGKITNGFTWKEITSAWFNGFTGTTNFEPVNELLTRGGINGMLFTISLVI
LALSFGGLLFVTGIIPSLLNSFQEKLQRARSIIVSTAGTAIGVNVLIGEQYLSILLTGETFKPIYEKAGLTKRSLSRTLE
DAGTVINPLVPWSVCGVFIADVLGVPVLTYLPFAFFCLLSPIITILFGAKTAKK
>Mature_454_residues
MKPISAKHKPAFWEALLFFICIIIFISYFIIGLETTPHIPILIGMLILICYGLFKKINYASLQDAMSTGASSGMGAIFLF
FIIGVLISSWMISGTIPTLINTGFSLIGTTWFYAVVFAVTAIIGISMGSSLTTTATIGVAFIGMAEAMDASLAITAGAIV
SGAFFGDKMSPLSDTTNLASSIIGVDLFDHIKHISLTTIPAFIISFIVFAILSPKQGTSISNVEAYREALINSGLMHWTS
WIPLIILIVCTVFRMSAFLALSLSSLIAVILGKITNGFTWKEITSAWFNGFTGTTNFEPVNELLTRGGINGMLFTISLVI
LALSFGGLLFVTGIIPSLLNSFQEKLQRARSIIVSTAGTAIGVNVLIGEQYLSILLTGETFKPIYEKAGLTKRSLSRTLE
DAGTVINPLVPWSVCGVFIADVLGVPVLTYLPFAFFCLLSPIITILFGAKTAKK

Specific function: Na(+)/H(+) antiporter. Involved in pH homeostasis and sodium extrusion [H]

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004770
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48733; Mature: 48733

Theoretical pI: Translated: 8.46; Mature: 8.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKPISAKHKPAFWEALLFFICIIIFISYFIIGLETTPHIPILIGMLILICYGLFKKINYA
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
SLQDAMSTGASSGMGAIFLFFIIGVLISSWMISGTIPTLINTGFSLIGTTWFYAVVFAVT
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIGISMGSSLTTTATIGVAFIGMAEAMDASLAITAGAIVSGAFFGDKMSPLSDTTNLAS
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
SIIGVDLFDHIKHISLTTIPAFIISFIVFAILSPKQGTSISNVEAYREALINSGLMHWTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
WIPLIILIVCTVFRMSAFLALSLSSLIAVILGKITNGFTWKEITSAWFNGFTGTTNFEPV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
NELLTRGGINGMLFTISLVILALSFGGLLFVTGIIPSLLNSFQEKLQRARSIIVSTAGTA
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
IGVNVLIGEQYLSILLTGETFKPIYEKAGLTKRSLSRTLEDAGTVINPLVPWSVCGVFIA
HHHHHEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHH
DVLGVPVLTYLPFAFFCLLSPIITILFGAKTAKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKPISAKHKPAFWEALLFFICIIIFISYFIIGLETTPHIPILIGMLILICYGLFKKINYA
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
SLQDAMSTGASSGMGAIFLFFIIGVLISSWMISGTIPTLINTGFSLIGTTWFYAVVFAVT
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIGISMGSSLTTTATIGVAFIGMAEAMDASLAITAGAIVSGAFFGDKMSPLSDTTNLAS
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
SIIGVDLFDHIKHISLTTIPAFIISFIVFAILSPKQGTSISNVEAYREALINSGLMHWTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
WIPLIILIVCTVFRMSAFLALSLSSLIAVILGKITNGFTWKEITSAWFNGFTGTTNFEPV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
NELLTRGGINGMLFTISLVILALSFGGLLFVTGIIPSLLNSFQEKLQRARSIIVSTAGTA
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
IGVNVLIGEQYLSILLTGETFKPIYEKAGLTKRSLSRTLEDAGTVINPLVPWSVCGVFIA
HHHHHEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHH
DVLGVPVLTYLPFAFFCLLSPIITILFGAKTAKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1660475; 9190799 [H]