Definition Yersinia pestis KIM 10 chromosome, complete genome.
Accession NC_004088
Length 4,600,755

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 22125728

Identifier: 22125728

GI number: 22125728

Start: 2022451

End: 2025327

Strand: Direct

Name: 22125728

Synonym: y1835

Alternate gene names: NA

Gene position: 2022451-2025327 (Clockwise)

Preceding gene: 22125727

Following gene: 229013129

Centisome position: 43.96

GC content: 51.2

Gene sequence:

>2877_bases
ATGGAGTATTGGCTGTTAATTTTTTTACTTATCTTCTTGTTTGTCATCTATATGCAAATAAGTGCGTTATCCAACTCGGT
AAAATATATACGAGAAGAGATAGGCAGGCTGCGCAATGAGCTTGCTCCACGCTTGCCTGAACCTACCGTGGCTACTGTTG
TGGCCACTGTTAAGGAAGAGATCACGCCAACGAATTTGGCAGATGATGTGGCCGCATCCGAGGTATGGACCCCTGATTAC
GCAACCTATCAGAATTATCTACTCACCAAACAGCAAAGCCAGATTAAAGAGATGGCTCTAGCCTATGCCGCAAAAAAAGA
ACCCGCTCGGCCAATAGAATATAGGATTGCTGACCGTCAGGTGGTGCTTGAGCCACAGGATGGGGCTCCTCAAGAATCGC
CGAAAATGGATGCAGGTCCTGCCAGTGGTCATCCACAGAAACCCGATGTGTGGACAAAATTGGAAAATGTCCTGTTTTCT
TTAAAATCACCGGAGAGTTTCTGGAAACGCATCGAGCAAGAGTTTGCCGCGCGTTGGATGGTGTGGATCGGCGGTATGAT
CATGGCACTGGGTGTGATTTTCCTGCTGAAAGCAGGCAGCGAACAGGGTCTGTTCGGGCCAAACTTGCGGATTGGTACCG
CCATTGTGCTGAGTGTGCTGATGGTTGTTGGGGGGGAGTGGCTCAGGCGTTCACGTTTTCAGTTGCCCTTGGTCAATGCC
GGTTATATCCCGGCGGCGCTGAGTGGGGCCGGTATTCTCGGTCTATTTGCCTCAATGCTGGCGGCTAAATATCTCTACGA
CATGTTCCCGATGCCCGTTCTCATGCTGTTGCTCAGCCTGATTTCTCTGTTGGCGATGGTGCTGGCATTGTGGCAGGGGC
CATTTATGGCGGCCTTGGGGCTGCTTGGCGCCTATACCGTCCCGTTATTTGTTTCGACGGGCAGCGGTAATGTCACCGGG
CTGTTGGCCTACCTGTTCCTGGTTAGTTTGGCGTCTATCGGCCTGATGAGCCGTGTCTATCGGCACTGGCTATGGCTGGG
GGCGATGGTCGGAAACTATCTATGGCTTTTGGTTTCTTTATTCATAGCAACGTCCGAACACCAGTTAGCGCGTTCACTAT
TCCTGCTAGCAACCACATACGGCTTCCTGGCCTGGCCACATCTGGGGTGGGCGCTAAAAAGCAAAATACGTTTTCGCCAT
AATGACTGGAAAAACTGGCCCCCGGCTTTGCTGGATCCGTTATTAACTGGGTTGATTGCCGGGCTTTCGCTATTAGCCTT
AACGTTAAGCGCAAATCATTCGATCCTGGTCTGGAGCACGTTGGTATTCTCCTGTATTAGCCTGTTACTGATTGCCAGAC
GCTCACCTTCATTGGATTTATTTGTTCCACTGGCCGCGATATTAGCCATTTCTCCCTTTATTAATGCAGGAACGCTGTTT
GAGCCAGAAACCGTCTGGACGAGTTTGCTCGCGCTCAGCACATTAGCGCTATTCTGCGGGATATATGGTAGCTACCAGGT
CACCCGGCCGGTTTACCGCAAGCTGTGGTGGGCGTTATTGTCGGTGCTGGTGCCAATGTATCTCGTTGCAAGTACCTATT
ATGCCTGTCGCGATAATTTTGAGCTGGCTCCAGTTAAATACACACTGCTGGCGGTTTGTCTGGCTATGTATATCGCGTGG
AATGCATTCAGTGATGGGTATCGCCGTGGCTCAGCGCTGTTGCGGACGATCTATCAGGTCGCCGCCCAACTGACGTTGAC
CTTTGCATTATTTATGGCTTTCAGCCAGGTTACGCTAACCCTGCTGCTCGCGGGTCAGCTTTTAGTTTTGGTACTCTGGC
AACGTTGGCGACAGGTTTCGTTACTGTCTTGGATTTTGAAACTGCATGCGATCATACTGCTGGTTCGTCTGTCAATGAAC
CCGTATATCCTTGGATATTCCTCGCCGTTGCACATTGGTTCGGTCGTTATTCCTTGGACGCTATACGGTTTTGGGATTCC
GATTCTCTGCCTGTGGCTAAGTTCACGCTGGTTACCTGCGCGTCGCGGTGAGCAGACCGCCAATTGGTTAGCGGCCAATG
CTATTTATCTGTTGGCCTTGTGGATCAACGTTGAATTACGTCACCTGCTGCATGGCAGCTATCATCTGTCGCTGGATTTC
GCTTCTCTTACCGATTGTGCGTTGCATGGGGTGACCTTCGGGCTGATGGCGCTGGCCTACGGCTATCGTGAACAGTTTGC
AGATTCGCTACAACGGATATACCGCCTGGCGGCTAAAACCAGTGCCATTCTGATGCTCACCCTAACGTTGCTCTGCCTGG
TTGTCTTTAACCCCATCTGGTCAGCACAACAGGTTGGCGGCCTACCGCTGCTGAATATGGTGACCGTTGCCTATGCGATC
CCGATGGTGTTCATGGTGGTAGCACTAAGATACTGGCCAGATCACTGGCTAGATATCCGTCTGAAGCCCTACGTTATCGG
TGCGATTGCGCTACTGGGAATGGTGTTCATTACCTTGACGGTCCGCCAGCTCTGGCATGGTGACCGGTTGGATAATGATA
TCGTGTACAGCGGCGAACAATACTCTTACTCCTTAGCGTGGATGTTAACTGCCATTGGCATGATGTACAGCGCAATACAC
TGGCCTAACTATAAAGTGCGCCGCGCCTCCCTGGGGTTGTTGGCGCTCACGATCGTCAAACTGTTCCTGTGGGATATGTC
TGGTCTTGAAGGGCTATATCGTTCGGTCTCATTCCTCGGTCTGGGGCTGTGTCTGGTAGCGATTGGTTGGTTCTACCAGA
AGTTTGTCGTTATGAAGGAAGTCATTGAGCAAAACAAGGATCAGCCGACAGCGGACGTGGTACAAAGCGGGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAAATACCTGTCAGATACTGTTTCATGCTATCCGATGAATGGATAGGGTTATCTCATAGAGAATTTTTTACTTAATA
AACGCTGAGTTGGATACATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGCCATTTGTCTTACCGGAGCGTGCATCGACTGATGTGGGAAAATCAATATACAGCAAGGAGTCAGTGTGATTAATTTT
GTGAAGTTAATGTGTAATGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: MSF Permease

Number of amino acids: Translated: 958; Mature: 958

Protein sequence:

>958_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEEITPTNLADDVAASEVWTPDY
ATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQVVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFS
LKSPESFWKRIEQEFAARWMVWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA
GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTG
LLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRH
NDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF
EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAW
NAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMN
PYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF
ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAI
PMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIH
WPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ

Sequences:

>Translated_958_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEEITPTNLADDVAASEVWTPDY
ATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQVVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFS
LKSPESFWKRIEQEFAARWMVWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA
GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTG
LLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRH
NDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF
EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAW
NAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMN
PYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF
ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAI
PMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIH
WPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
>Mature_958_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEEITPTNLADDVAASEVWTPDY
ATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQVVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFS
LKSPESFWKRIEQEFAARWMVWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA
GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTG
LLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRH
NDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF
EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAW
NAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMN
PYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF
ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAI
PMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIH
WPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ

Specific function: Unknown

COG id: COG5373

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107457; Mature: 107457

Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ITPTNLADDVAASEVWTPDYATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQ
CCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCE
VVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRIEQEFAARWM
EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCC
GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALG
CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSL
HHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIA
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
GLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHH
LYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEH
ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLT
CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVK
HHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
LFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ITPTNLADDVAASEVWTPDYATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQ
CCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCE
VVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRIEQEFAARWM
EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCC
GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALG
CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSL
HHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIA
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
GLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHH
LYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEH
ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLT
CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVK
HHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
LFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA