| Definition | Yersinia pestis KIM 10 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004088 |
| Length | 4,600,755 |
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The map label for this gene is 22125034
Identifier: 22125034
GI number: 22125034
Start: 1268793
End: 1271000
Strand: Reverse
Name: 22125034
Synonym: y1130
Alternate gene names: NA
Gene position: 1271000-1268793 (Counterclockwise)
Preceding gene: 22125038
Following gene: 22125033
Centisome position: 27.63
GC content: 49.23
Gene sequence:
>2208_bases ATGGCTGAACCGAAACCCGCGTCTTGGATGCCTTCACATGCGGCAGCGCAACTCTGCCGCCAGTTGCAGTCACTCTTGCC AATGCATCTTCTTGCACCTGCGGCCTTTGAACAGATATTACGTTATTGCGGTGTCCGGCCCGGACGTCAGGCTTGGCGTT TGTTTCTCAGTAGAACGCTGCTACTGGCCGGATCCCTCGCGGCCATCTGTGGCGTCATCTTTTTCTTTGCGTGGAACTGG GCAGCAATGCCCGCAATGGCAAAGTTCGGTATCATCGAATTGCTGATCGTGGCCTTGGCCATTCTCATCTGGTGGCGCTG GTATGATGCCGTCAGTCGCACGGCATTATTGGCCGCAGGGTTCCTCTTTGGTGCGCTGTTTGCCGTCTTCGGGCAGATTT ACCAAACCGGGGCCGATAGCTGGGAGTTATTCCGCGCTTGGGCACTAATTCTTCTCCCTTTAGCGTTGCTCAGCAGGCAG GGGGGATTATGGTTTTTAACCTGGCTGGTGACCAATATTGGCCTGAATCTCTTTTTCTTCAGTTACTCATCGCCGTTTAC GGTCTCTTTCTCACTGTTCGACAACATTTTTTATCTCAACACCTTGTTCACGTATGGTTATTTGCTTTTTCAGGGATTAT GTCTTTTGGCCTGGGAAGTGACACAAAGATTCAGCAAAACCCAATCCCCCGATAAAACGGTAAATCGCTGGTTTCCGAGG CTCATGGCAGCCTATTTTTTACTGTCACTGACAACCCCAATAATCAGTGAACTCACTTACTTTCACTTCCAACAGCCTGG CTACGTTTTACTACTTTGCTGGGTAGCGGTTATGGCCGGTGGCTACTGGTGGTATCGCTATCGCCAACCCGATTTATGCA TGCTGACACTGGGTGTTTGCAGCTTATTAGCGGTGGGAACTGCCGCTATCCTTACCTCGGCGGGTTGGGGTTGGTATAGA AATGTTGGCTCCCTGTTCCTGATTGGGATATTAATCGCCCTATTGCTTGGCGCAGGGGGCAAATTGTTACTCCACTGGCG CCGAAAGATGTATCCAAATCAAGCCGTGGAGTTATCCCGATCAGCCTACGACGAACTGTTAGTTAATCTCGAACAGCATT CGTTGCTCAACGCAGACCAAAAAGCGGTGTTGCTTGCTGAACAAGGCAAGTTAACTCTGCCTTGGTATATTCGTACCGCT TTTGCGTTCGGCGGGTGGATCGCGGCATTAATCCTGTTAGCTCTGTTGATATTGCTGGGATTTGTCAGTGGGATGTTTGA CAATCTCAATGCTGGAACAATTATTGTTGTTTCACTGATAGGCGGAGCCTTTGCCGCGTTCTTGCTCACCCGACCGGGTA TGGGGATACAGCAGATTGGTTTGGTATGGGCAATAGCGTCCTCGATCGGGTTATATAGCGGAATAATATTAATCCAGGAT TCAAGCAGCAGATTGATGCTGATGCAAAGTCTGTGGTTCATTCCTGTTTTGGCGGTTCTGATTGTGGTATTCCACAATGA TATGTATCGCTTTCTGGCGACGGGCACGTTGGTATTCATGAGTATTGTGACGACAAGCTACGCTCTGATATGGCACTTGG CACCCGATAACCAACAGCTCTTTTTCTTCATTCCAATCCTGATAGTCACCGTCATTGTCATGTTGATTCTTTGGCTGATC TGCAATGAAATTAAATTGCTGGCGACCGTCAATGCACCACTGATTCATCCGTTAATGTATGGCGGGATCGGGGGCATACT GGTGGTTTGCCTGCACAGCATTCAGATGGGGAATATCCATGAATTCTACTGGATGTCAGATCGGGGGCTTTATTTGGAAC AGAGTTTGAGCTACGGGATCCCTGCCGCTTTCTTGCTGTTTACGCTAATTCAATGGGTTTTGCATCGCAGTAAGCTCAAG CCACTCTGGTTGATAGCGGCGGTCGTAACCTCCCTTGCAGCCTATTTTGCACCGGGAATGGGTTTTGGTTTGGCACTGTT ATTGATTGCCCGTTATCAGGGGAATCAGTGGTTACTGGGGGTTGCAGCCAGTTTTCTCGCGGTTTACACCAGTGGCTGGT ATTACTTCCTCGGCTTCAGCTTGTTGTATAAATCATTGTTATTAATTGGGGGGGGTGTCTTGCTGCTGGTTTTGGCCGGC GTATTGAATCGAGTACTCTCTGCTGGGGAGGTCAATCAACATGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAAACCAGAGATGACTCGCCATCTTGCCGCCGTCAGAGCCTATCGGCAACAAGACGGCATTTGATATCCCTTTCGCTTT CAGAAACAAGGATGTAAACC
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGAAAATGGCTCAGCATCGCGGTTATTATCGTTGCCCTGATCATGGTGAATATCTCTATTTATCAGAAACAACATTTGT TGGCTAAAGGTGACATCATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 735; Mature: 734
Protein sequence:
>735_residues MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNW AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD SSSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI CNEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAG VLNRVLSAGEVNQHA
Sequences:
>Translated_735_residues MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNW AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD SSSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI CNEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAG VLNRVLSAGEVNQHA >Mature_734_residues AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNWA AMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQG GLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPRL MAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYRN VGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAF AFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQDS SSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLIC NEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKP LWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAGV LNRVLSAGEVNQHA
Specific function: Unknown
COG id: COG4984
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82027; Mature: 81896
Theoretical pI: Translated: 9.29; Mature: 9.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTL CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLAGSLAAICGVIFFFAWNWAAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQGGLWFLTWLVTNIGLNLFFF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEEE SYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR ECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH SLLAVGTAAILTSAGWGWYRNVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSR HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH SAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAFAFGGWIAALILLALLILLG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC SSSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCH FFFIPILIVTVIVMLILWLICNEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCE EFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKPLWLIAAVVTSLAAYFAPGM EEEEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAG HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH VLNRVLSAGEVNQHA HHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTL CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLAGSLAAICGVIFFFAWNWAAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQGGLWFLTWLVTNIGLNLFFF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEEE SYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR ECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH SLLAVGTAAILTSAGWGWYRNVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSR HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH SAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAFAFGGWIAALILLALLILLG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC SSSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCH FFFIPILIVTVIVMLILWLICNEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCE EFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKPLWLIAAVVTSLAAYFAPGM EEEEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAG HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH VLNRVLSAGEVNQHA HHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA