| Definition | Bacillus anthracis str. Ames, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003997 |
| Length | 5,227,293 |
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The map label for this gene is 30263653
Identifier: 30263653
GI number: 30263653
Start: 3468749
End: 3471184
Strand: Reverse
Name: 30263653
Synonym: BA_3774
Alternate gene names: NA
Gene position: 3471184-3468749 (Counterclockwise)
Preceding gene: 30263654
Following gene: 30263652
Centisome position: 66.41
GC content: 37.6
Gene sequence:
>2436_bases ATGTTGCGAGTCCTGTTGAACATATCGGGTGTTAAAGAAGGGCGTATCAAAATGGCTGAGTTTGGGGCCGGTGTAGATAA ATCTATGCAAGAGGTTTTAGATAAAACAAAGATTTCGGCAGATCAGTTTGAAAAATGGGGTCAGGCAATTGCTGGTGGCG GTGAAAATGGACAAAAAGCTATGCTTGAAGCAACAAAGGCCTTAGCTGGTGTTGAAAATGCAACAGACAGAAATGCACTT GGCACGAAGATGTTCGGTACTCTTTGGGAAGACCAAGGAAAGAAAATTATAGACACCATCTTGAAAGCAGAAGGTAAACA AGTTGATTTGAAAAAAGGAGTAGAGGACTTACATGGTGCTACTTCTAAAATAGATGCAAGTCCAGCAGTGAAATTCCAAA AGGCAATGCAAGATTTACAAATGGCTCTCCAACCGGTACTTGGAGTAATAGCAGATGTTGTTGCTAAAATAGCTGATTGG ATTTCTAATAATCCTAAATTGGCAGCTACATTGGCAGCCATTGCAGTAGCGGCAGGAGTAATAGCAGGAGCATTTATGGC TTTAGCACCAATAGTTGTTGTCATATCGGGTGTAGGGGCAGCAATGATGGGGTGGGTAGCGTTAATTGCTATAGTTGTAG CCGCAGTTGTGGCTTTAGGTATTGCAATTTATCAAAATTGGGATTCCATAAAACAATGGACCATTGATGCCTGGAATGCA ATTGGAGAATTCTTAGTAGGAATATGGGATGGGATTGTGCAATGGGCAAGTGAAGCGTGGAATAGCATTAGTGAATCTAC ATCAGCAGTTTGGAACTCAATTAAGGAGTTTTTAATAGGGATATGGAATGGCATTGTAGAGTTTGTTGTAACCTGGGGAA CCGCTATTCTAGAAGCATACGTTGGTATTTGGACATCTATTTTTAATTTCTGTATGGAAATCTGGAATGGGATAGTTGAA TATTTAACTTCAGTTTTGCAGGGGATAGCCACGTTCTTTACAGAAATATGGACTTCTATTTCTACATTCTTTCAAGAGAC TTGGAATGGATTAGTGGCTTTTATAACTCCTATTTTACAAGGGATTGCTGATTTCTTCTCTATGATTTGGAATGGTATTT CTACAGTGATCCAAACTGTATGGAATTTCATTACTCAATACTTACAAGCGATTTGGACGGCTATTTTATACTTTGCTACT CCATTATTTGAAAGTATCAAGAATTTCATTTCTGAATGTTGGAATACAATTAGTTCTACTACAAGTTTTGTATGGGAAAC GATTAAGAATTTCTTAGTTTCCTGTTGGAATGGACTTGTAGCATTTGTTATGCCGATTTTTGAACAAATCAAGTCTTGGA TCATTAGTGTATGGGATACAATCAGTTCAGCGACAATGACAGTATGGAATGCTGTTAAGAATTTCTTACAGTCATGCTGG AACGGGTTAGTAGCTTTTGTAACGCCAATATTCAATTCAATAAAAGATTGGATTATAAATACTTGGAACACGATTAGTTC CACAACAAGTGCTGTATGGAATACGATTAAAAGCTTCCTTTCTGGCTTATGGAACTCAATTGTTTCCACAGCAAGTTCCG TATTCAATAACATCAAAGAAGCTATTTCAACTGTATGGAATATGATTAGTAGCACAAGCAGTAGTATATGGAATGGTATT AAATCTACTCTTTCAAATATTTGGGAAGGTATTAAATCAACCGCATCTTCTGTATGGAATGGATTAAAAGATGCCATTAT GACTCCTGTTAGATGGGTAACAAATGCTGTGAGTGGAGCATTCGAGGGAATGAAGTCAGCAGTATTAGGCGTGTGGGATG GAATTAAGAGTGGTATTCGTACAGCTATCAACGGAATCATTCGTATTATTAATAAGTTCATAGATGGCTTTAATACACCA GCAGAATTGTTAAATAATATACCAGGAGTAAGTGCTCCAACTATTCCACATGTACCAATGCTTGCTAAAGGTGGAAAACC TGTAGGTGATGGTTCATTTATTACAGGTGAAGCTGGACCGGAATTATTTACGAAAAAGGGTAATTCAATTACAGTTACAC CTTTATCATCAAAAGAAAAATCACTCGGTATTACTGGGACTATGAATCAATTAATGGGTGATATGAGTCGGATGATGGCT AGTTCTATGAGTCAATTAGCTGGATTAAAGTCTGTTATGAGTGGTGTATATGGAAGTATGTCAAATAGTAGACAAGCCAT GGCTGGTAATATCGCAAATCAAGTATTCAATTATTCATCAGGGCAAACTGGTGGTAATGAATTAATTCCAGCACAAGGTG GCGATTTGGTAATTGAAGTACCAGTTATTTTAGATGGTAGAGACTTAGCACGCGGTACTTTTCGGTATACAAAAGAATAC CAAGAAAGAGAAGAGAAAAGAAACTCAGACTTTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGCTAATGACATCCGAAATGGGGAGCATCTTATATAAAAGATGATGATATAGTCTGGTCTGTATAGTGATATACAGAAG TTCATAAGAGAACTGGCAGG
Downstream 100 bases:
>100_bases GTTTGGGTTTCTTTCATTTTATAAAGAAATGAGGTGTCAATATGAGTTCTTTTACATTTAATAACGAACGAAAAGACTTT ATTCAAATCGCAAAAGGATG
Product: prophage LambdaBa01, membrane protein, putative
Products: NA
Alternate protein names: Phage Protein; Phage Tail Tape Measure Protein; Phage Tape Measure Protein; Tail Tape Measure Protein; TMP Repeat-Containing Protein; Phage-Related Tail Protein; Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Protein TP; TMP Repeat Protein; Tail Length Tape Measure Protein; Phage Related Protein Minor Tail Protein; Phage Related Protein; TMP Repeat Family; Phage Tail Length Tape-Measure Protein; Minor Tail -Like Protein; Bacteriophage Minor Tail Proteins; Prophage Membrane Protein; Phage-Like Protein; Phage-Related Protein-Like Protein; Phage Minor Tail Protein; Prophage Lp2 Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family; Endoglucanase Y; Tail Protein; Phage-Related Minor Tail Protein; Mu-Like Phage Minor Tail Protein
Number of amino acids: Translated: 811; Mature: 811
Protein sequence:
>811_residues MLRVLLNISGVKEGRIKMAEFGAGVDKSMQEVLDKTKISADQFEKWGQAIAGGGENGQKAMLEATKALAGVENATDRNAL GTKMFGTLWEDQGKKIIDTILKAEGKQVDLKKGVEDLHGATSKIDASPAVKFQKAMQDLQMALQPVLGVIADVVAKIADW ISNNPKLAATLAAIAVAAGVIAGAFMALAPIVVVISGVGAAMMGWVALIAIVVAAVVALGIAIYQNWDSIKQWTIDAWNA IGEFLVGIWDGIVQWASEAWNSISESTSAVWNSIKEFLIGIWNGIVEFVVTWGTAILEAYVGIWTSIFNFCMEIWNGIVE YLTSVLQGIATFFTEIWTSISTFFQETWNGLVAFITPILQGIADFFSMIWNGISTVIQTVWNFITQYLQAIWTAILYFAT PLFESIKNFISECWNTISSTTSFVWETIKNFLVSCWNGLVAFVMPIFEQIKSWIISVWDTISSATMTVWNAVKNFLQSCW NGLVAFVTPIFNSIKDWIINTWNTISSTTSAVWNTIKSFLSGLWNSIVSTASSVFNNIKEAISTVWNMISSTSSSIWNGI KSTLSNIWEGIKSTASSVWNGLKDAIMTPVRWVTNAVSGAFEGMKSAVLGVWDGIKSGIRTAINGIIRIINKFIDGFNTP AELLNNIPGVSAPTIPHVPMLAKGGKPVGDGSFITGEAGPELFTKKGNSITVTPLSSKEKSLGITGTMNQLMGDMSRMMA SSMSQLAGLKSVMSGVYGSMSNSRQAMAGNIANQVFNYSSGQTGGNELIPAQGGDLVIEVPVILDGRDLARGTFRYTKEY QEREEKRNSDF
Sequences:
>Translated_811_residues MLRVLLNISGVKEGRIKMAEFGAGVDKSMQEVLDKTKISADQFEKWGQAIAGGGENGQKAMLEATKALAGVENATDRNAL GTKMFGTLWEDQGKKIIDTILKAEGKQVDLKKGVEDLHGATSKIDASPAVKFQKAMQDLQMALQPVLGVIADVVAKIADW ISNNPKLAATLAAIAVAAGVIAGAFMALAPIVVVISGVGAAMMGWVALIAIVVAAVVALGIAIYQNWDSIKQWTIDAWNA IGEFLVGIWDGIVQWASEAWNSISESTSAVWNSIKEFLIGIWNGIVEFVVTWGTAILEAYVGIWTSIFNFCMEIWNGIVE YLTSVLQGIATFFTEIWTSISTFFQETWNGLVAFITPILQGIADFFSMIWNGISTVIQTVWNFITQYLQAIWTAILYFAT PLFESIKNFISECWNTISSTTSFVWETIKNFLVSCWNGLVAFVMPIFEQIKSWIISVWDTISSATMTVWNAVKNFLQSCW NGLVAFVTPIFNSIKDWIINTWNTISSTTSAVWNTIKSFLSGLWNSIVSTASSVFNNIKEAISTVWNMISSTSSSIWNGI KSTLSNIWEGIKSTASSVWNGLKDAIMTPVRWVTNAVSGAFEGMKSAVLGVWDGIKSGIRTAINGIIRIINKFIDGFNTP AELLNNIPGVSAPTIPHVPMLAKGGKPVGDGSFITGEAGPELFTKKGNSITVTPLSSKEKSLGITGTMNQLMGDMSRMMA SSMSQLAGLKSVMSGVYGSMSNSRQAMAGNIANQVFNYSSGQTGGNELIPAQGGDLVIEVPVILDGRDLARGTFRYTKEY QEREEKRNSDF >Mature_811_residues MLRVLLNISGVKEGRIKMAEFGAGVDKSMQEVLDKTKISADQFEKWGQAIAGGGENGQKAMLEATKALAGVENATDRNAL GTKMFGTLWEDQGKKIIDTILKAEGKQVDLKKGVEDLHGATSKIDASPAVKFQKAMQDLQMALQPVLGVIADVVAKIADW ISNNPKLAATLAAIAVAAGVIAGAFMALAPIVVVISGVGAAMMGWVALIAIVVAAVVALGIAIYQNWDSIKQWTIDAWNA IGEFLVGIWDGIVQWASEAWNSISESTSAVWNSIKEFLIGIWNGIVEFVVTWGTAILEAYVGIWTSIFNFCMEIWNGIVE YLTSVLQGIATFFTEIWTSISTFFQETWNGLVAFITPILQGIADFFSMIWNGISTVIQTVWNFITQYLQAIWTAILYFAT PLFESIKNFISECWNTISSTTSFVWETIKNFLVSCWNGLVAFVMPIFEQIKSWIISVWDTISSATMTVWNAVKNFLQSCW NGLVAFVTPIFNSIKDWIINTWNTISSTTSAVWNTIKSFLSGLWNSIVSTASSVFNNIKEAISTVWNMISSTSSSIWNGI KSTLSNIWEGIKSTASSVWNGLKDAIMTPVRWVTNAVSGAFEGMKSAVLGVWDGIKSGIRTAINGIIRIINKFIDGFNTP AELLNNIPGVSAPTIPHVPMLAKGGKPVGDGSFITGEAGPELFTKKGNSITVTPLSSKEKSLGITGTMNQLMGDMSRMMA SSMSQLAGLKSVMSGVYGSMSNSRQAMAGNIANQVFNYSSGQTGGNELIPAQGGDLVIEVPVILDGRDLARGTFRYTKEY QEREEKRNSDF
Specific function: Unknown
COG id: COG5280
COG function: function code S; Phage-related minor tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88139; Mature: 88139
Theoretical pI: Translated: 5.09; Mature: 5.09
Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLRVLLNISGVKEGRIKMAEFGAGVDKSMQEVLDKTKISADQFEKWGQAIAGGGENGQKA CEEEEEECCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH MLEATKALAGVENATDRNALGTKMFGTLWEDQGKKIIDTILKAEGKQVDLKKGVEDLHGA HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCHHHHCCC TSKIDASPAVKFQKAMQDLQMALQPVLGVIADVVAKIADWISNNPKLAATLAAIAVAAGV HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IAGAFMALAPIVVVISGVGAAMMGWVALIAIVVAAVVALGIAIYQNWDSIKQWTIDAWNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH IGEFLVGIWDGIVQWASEAWNSISESTSAVWNSIKEFLIGIWNGIVEFVVTWGTAILEAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGIWTSIFNFCMEIWNGIVEYLTSVLQGIATFFTEIWTSISTFFQETWNGLVAFITPILQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIADFFSMIWNGISTVIQTVWNFITQYLQAIWTAILYFATPLFESIKNFISECWNTISST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSFVWETIKNFLVSCWNGLVAFVMPIFEQIKSWIISVWDTISSATMTVWNAVKNFLQSCW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NGLVAFVTPIFNSIKDWIINTWNTISSTTSAVWNTIKSFLSGLWNSIVSTASSVFNNIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AISTVWNMISSTSSSIWNGIKSTLSNIWEGIKSTASSVWNGLKDAIMTPVRWVTNAVSGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FEGMKSAVLGVWDGIKSGIRTAINGIIRIINKFIDGFNTPAELLNNIPGVSAPTIPHVPM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH LAKGGKPVGDGSFITGEAGPELFTKKGNSITVTPLSSKEKSLGITGTMNQLMGDMSRMMA HHCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SSMSQLAGLKSVMSGVYGSMSNSRQAMAGNIANQVFNYSSGQTGGNELIPAQGGDLVIEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE PVILDGRDLARGTFRYTKEYQEREEKRNSDF CEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MLRVLLNISGVKEGRIKMAEFGAGVDKSMQEVLDKTKISADQFEKWGQAIAGGGENGQKA CEEEEEECCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH MLEATKALAGVENATDRNALGTKMFGTLWEDQGKKIIDTILKAEGKQVDLKKGVEDLHGA HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCHHHHCCC TSKIDASPAVKFQKAMQDLQMALQPVLGVIADVVAKIADWISNNPKLAATLAAIAVAAGV HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IAGAFMALAPIVVVISGVGAAMMGWVALIAIVVAAVVALGIAIYQNWDSIKQWTIDAWNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH IGEFLVGIWDGIVQWASEAWNSISESTSAVWNSIKEFLIGIWNGIVEFVVTWGTAILEAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGIWTSIFNFCMEIWNGIVEYLTSVLQGIATFFTEIWTSISTFFQETWNGLVAFITPILQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIADFFSMIWNGISTVIQTVWNFITQYLQAIWTAILYFATPLFESIKNFISECWNTISST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSFVWETIKNFLVSCWNGLVAFVMPIFEQIKSWIISVWDTISSATMTVWNAVKNFLQSCW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NGLVAFVTPIFNSIKDWIINTWNTISSTTSAVWNTIKSFLSGLWNSIVSTASSVFNNIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AISTVWNMISSTSSSIWNGIKSTLSNIWEGIKSTASSVWNGLKDAIMTPVRWVTNAVSGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FEGMKSAVLGVWDGIKSGIRTAINGIIRIINKFIDGFNTPAELLNNIPGVSAPTIPHVPM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH LAKGGKPVGDGSFITGEAGPELFTKKGNSITVTPLSSKEKSLGITGTMNQLMGDMSRMMA HHCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SSMSQLAGLKSVMSGVYGSMSNSRQAMAGNIANQVFNYSSGQTGGNELIPAQGGDLVIEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE PVILDGRDLARGTFRYTKEYQEREEKRNSDF CEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA