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Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57238505

Identifier: 57238505

GI number: 57238505

Start: 1557225

End: 1559591

Strand: Reverse

Name: 57238505

Synonym: CJE1655

Alternate gene names: NA

Gene position: 1559591-1557225 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57238506

Following gene: 57238504

Centisome position: 87.72

GC content: 25.81

Gene sequence:

>2367_bases
ATGAAATTAAGAATTTTTAGCTCTTCAAGGCAAATTAGAGAATATTATAATCAAAAAAAACAGCAAAATGCTTTATTAGA
TAGTGCTATTCATATAGGTGAATTTTTAGATAAAGTTTGTTTGAGCAATTTTCATAAAGCAAGTTCTTATGAAAGTTTGC
TTTTAATGCAAGAAGCTTGTCTAAAAAGTAAGGATTTAGAAAAAAAACTAGGAATTTCGGTAGAATTTTTTGCTTTTTTG
AAAAATAACGAATATCTTTTTTCTTTTTTTAAAGAACTGAGTTTGGAAAAAAAAAGCATAGAAGATCTTAAAAACAATGA
TTATTATGCCACCTATAATGAACATTTGGAAATTTTAGATGAGGTATATAAGAATTATCTTGCTTTGCTTGAAAAGAATT
CTTTTTATGATGATCTTTCTTTACCTAAAAATTACACTCTTAATAAAGATTTTTTAGATGAGTATGAAGCTATAGTTTAT
GATTTGCAAGGTTTTTTAAGTAAATTTGAAGAAAATTTATTAAGTGAAATTTCTCAGATTAAAGAAGTGGTTTTAAGTTT
TAAAACGAGTAAATTTAATCTTGAATATCTTTTAAAACTTGATTTTTTAAAAATATTTGATTTAAAAATAAACACTCATT
ATGAAATCAATCTTTCAAAACAAGAGATCTTAAAAGAAGAAATTTTTAAAACAAAAAATTCAAAAATGAAACTCAAATCT
TTTGAATTAAGGGCTTTGCAATGTGCTTTTGTTATGGATGAAATTTCACATTTTGTACGCAAAGGTTTAAAGCCTGAAAA
TATTGCAGTTATAACTCCAGATGAAAGTTTTTGTGAGTTTTTAAGACTTTTTGATAAAGACAATATGCTTAACTTTGCAA
GTGGAATTAGTATTAAAGAGAGTTTGTTTTATCAAAAATTTCAAGCACTTTATGAAAGTGCTAGTAGTGCTTCTTTTGTC
TATAAAAATCAAGAGGATTATTTTGAAGACACGCAGATGATTTTTGATTATCACAATACGCTTTTACATTCTTTAAAACT
TGATTTTATAGAGTTTAAAAAGTATTTTGATGAGAAATGTGATTTTGAATATTTTGAAAAATTACTTGCTTTGTTTTTAG
AAAATGAAAAGCAAGAGCTTATGTATTTGATACGAAAAGAACTTTATTTTATTAAAGATTTATTGAAAAATCAGTCTTTA
ACTCTTAAAGAGTTGATCCATCTTTTTTTCATGCAAATTTCACAACTTTCCCTTAGTGATGTAGGTGGAGGTAAGGTTAC
GGTAATGGGACTTTTAGAAAGTCGTGGGCTTTGTTTTGATGGAGTGATTTTGGTTGATTTTAATGAAGAATTTATTCCTA
AAAGAAGTGTTAATGAGCTTTTTTTAAACAATGAAGTGCGTAAAAAAGCAGGATTGATTAGCTATGATAGAAGAGAAAAT
TTACAAAGATTTTATTATGAAAGCTTGATGAAGAATGCTTTAGAAGTAAGTATTTGCTTTGTGGAAAATGAAGAAAAAAG
CAAATCACGTTTTTTAGATGAACTTGATTTTGACTTTTTTTATGAAACTCATATCCACCAAAAAGCTTATCTTAATGCTT
TAAAATTAGACTATGAAGGCATAAAACCTAATCTAACTCCTATAAAAGCTCCTATTTTAAAGCATAATCCTTTCGAGTTT
CCGCTTTCTTTTAGTCGTTTTAATTTATTGGAAAATCAAAAAAGAACTTATTATTATCGTTATATTTTAAATTTAGCAGA
ACCTAGGGTTTTAAGCGAGGAAAGCAAAGCGAAAAATCAAGGAAATTTTATCCATAAAATGCTTGAAATTTATTATAAAA
ATTATGCAAATAATGATTTTGATATAAAAGTTTTTGCAAATTTATTGGATAAAGAATATCAAAAATACAATATCAGTGAA
CTTGATCTTGAAGTATTTAAATTAAAATTTATACAATTTGCTAAAAATGAAAAAGAGCATTTTTCAAAAGGCTTTTATGT
CGTACATACAGAGCTTGAGTTAAACAATATTTTAAAGCTCGGAACAGATAGTATAAAACTTAAGGGTACTATAGATCGTA
TCGATAGTTCAAAAGAAGGTAATTTGATTATTGATTATAAAAGTGGAAAAGTGCCAAGTAATTCTTATCAACTTGCTTTT
TACCAAGCTTTATATGATAAAAATGCAAGCGTGGGTTTTTATGATTTAAATAGTATGCAAATATTGCATCAAAAAGCCAA
AAGTTTAGATGAGCTAAGAGAAAGACTTAAAGATTTAGTTCTTATGAGTAAGGAAGAAATAGAGTTTGAAAATGAACAAG
ATGAGTATTGTCCTTATAAACTCATTTATAAAAAGGAATTAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGCTTTACCTAAATTAGATAAAGGTAGATGGGAGCTTAAGCTAAAGTTTTATGCAAATCAAGAAACAGTGGGTTTTTTT
AGCTACGAATTAAATGCTCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTCAATTTGAGCCTTTTTTGGCATTAGAAGCGAGTGCAGGAAGCGGAAAAACCTTTGCCCTGAGTGTGCGTTTTGTAGCA
CTTATTTTAAAAGGAGCTAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 788; Mature: 788

Protein sequence:

>788_residues
MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEACLKSKDLEKKLGISVEFFAFL
KNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILDEVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVY
DLQGFLSKFEENLLSEISQIKEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS
FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKESLFYQKFQALYESASSASFV
YKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKCDFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSL
TLKELIHLFFMQISQLSLSDVGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN
LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEGIKPNLTPIKAPILKHNPFEF
PLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQGNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISE
LDLEVFKLKFIQFAKNEKEHFSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF
YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYKLIYKKELK

Sequences:

>Translated_788_residues
MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEACLKSKDLEKKLGISVEFFAFL
KNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILDEVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVY
DLQGFLSKFEENLLSEISQIKEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS
FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKESLFYQKFQALYESASSASFV
YKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKCDFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSL
TLKELIHLFFMQISQLSLSDVGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN
LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEGIKPNLTPIKAPILKHNPFEF
PLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQGNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISE
LDLEVFKLKFIQFAKNEKEHFSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF
YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYKLIYKKELK
>Mature_788_residues
MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEACLKSKDLEKKLGISVEFFAFL
KNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILDEVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVY
DLQGFLSKFEENLLSEISQIKEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS
FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKESLFYQKFQALYESASSASFV
YKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKCDFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSL
TLKELIHLFFMQISQLSLSDVGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN
LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEGIKPNLTPIKAPILKHNPFEF
PLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQGNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISE
LDLEVFKLKFIQFAKNEKEHFSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF
YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYKLIYKKELK

Specific function: Unknown

COG id: COG3893

COG function: function code L; Inactivated superfamily I helicase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93623; Mature: 93623

Theoretical pI: Translated: 5.66; Mature: 5.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEAC
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LKSKDLEKKLGISVEFFAFLKNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILD
HCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHH
EVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVYDLQGFLSKFEENLLSEISQI
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS
HHHHHHHCCCCCCHHHHHEEHHEEEEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHH
FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHH
SLFYQKFQALYESASSASFVYKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKC
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSLTLKELIHLFFMQISQLSLSD
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
VGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN
CCCCEEEEEEEHHCCCCEECCEEEEECCHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHH
LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEG
HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
IKPNLTPIKAPILKHNPFEFPLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQ
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCC
GNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISELDLEVFKLKFIQFAKNEKEH
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
FSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF
HCCCEEEEEEEECHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHH
YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYK
HHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCEE
LIYKKELK
EEEECCCC
>Mature Secondary Structure
MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEAC
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LKSKDLEKKLGISVEFFAFLKNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILD
HCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHH
EVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVYDLQGFLSKFEENLLSEISQI
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS
HHHHHHHCCCCCCHHHHHEEHHEEEEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHH
FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHH
SLFYQKFQALYESASSASFVYKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKC
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSLTLKELIHLFFMQISQLSLSD
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
VGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN
CCCCEEEEEEEHHCCCCEECCEEEEECCHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHH
LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEG
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IKPNLTPIKAPILKHNPFEFPLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQ
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCC
GNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISELDLEVFKLKFIQFAKNEKEH
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
FSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF
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YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYK
HHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCEE
LIYKKELK
EEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]