Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is maf-1

Identifier: 57238379

GI number: 57238379

Start: 1412428

End: 1414389

Strand: Direct

Name: maf-1

Synonym: CJE1522

Alternate gene names: NA

Gene position: 1412428-1414389 (Clockwise)

Preceding gene: 57238378

Following gene: 57238380

Centisome position: 79.45

GC content: 26.45

Gene sequence:

>1962_bases
ATGGGGCTTATGATGACCTTCACCCCTACCCAAAAAGAACTCTTTAACAAAAACATTGAGGCTTTAAGTAATATTCTTTT
AAAAGAAAGTTTAAAAGAAATTAAATCAAGTAAATTTGAACTTATCTTAGGTAAAGATAATCTAGATATCAATCTAAAAG
ATACAAGTGATAATACTTTTCTTTATGAAAATGTTATTGATGAATTCAACTCTATGCTAAATACTTATAATGATAAATAT
CTACTTTATCCTGTATTGTATTTTTATGGTTTTGGAAATGGAATTTTATATAAAGCTTTATTGCAAAATAAAAATCATCA
ACATATTGTTGTTTTTGAAAAAGATATAGAAATCATTTGGATAATGTTTCATATCTTAGATTTTTCACATGAATTACAAA
GTGCAAGATTGATGATTTTGCAAACAAGTTCTTTGGATATAGAATTTTTTTCTAATTTTTGCTCTAGCAAACCTTTCTTT
CAATTTTCTAGAATTTATTTTTTAGAACTGATGAGTCATTATTATGAAAGATTTCATGAAGATATTTTAGGATTGAATAA
AAAATTAGCAGAAAATTTTAAAAATTCTATTGTTTCTCATGGCAATGATCCCCTTGATGCTCTTCAAGGCATAGAGCAAT
TTGTTTATAATCTTCCTCAAATGATTACCCATCCTAGTTATAAAGAATTACTTTCTAAAAGAAAGGGTATAAGTGATACA
GCTATCATTGTTTCTACAGGACCATCTCTTACTAAACAACTTCCTTTGTTAAAAAAATATGCTAATAAAGCTACAATTTT
TTGTGCAGATTCTTCTTATCCTATTTTAGCTAAACATGGTATAAAGCCTGATTATGTTTGTATGCTAGAAAGAACAGAAA
TTACTGCTGAGTTTTTTAATAATGATTTTGGGGAATTTGATAAGGATATTGTGTTTATTGTTAAATCTGTTACACATCCT
CACACTATCAAATATCTTCAAAAAAATAATAGAGCTTTTATACTTGTATCCACCTATGCAAGCTTTATACAATATTTAAA
ATTAGATTATTTTGGATATTTTAATATGGGATTTAGCGTAGCACATATGAATTTTTTATTAACCATTCATCTAAAATACA
AAAACATCATTCTCATAGGTCAGGATTTAGCTTATGCCAAAGATGGGCAAACACACTCTCAAGGTTTTATCCATGCTAAT
TTACACAATGGAGACTATGAAAGAGATTTAGATAGATTTAGCACTACAGCTTATGGAGGAAATGGAAAAGTTCAAAGTTC
TGAAATTTGGACACTTTTTAGACATAACTTTGAAAAAGATATAGTCAATATAAAAATGAATTATCACATCACCACCTACA
ACTGCACCGAAGGTGGAGCAAGGATAGAAGGAACCATAGAAAAACCTTTTCTATGGGCTTGTGAGAATTTACTTGATAAA
GATTTAAATAAACCTTTTGAAAAATTAGAACCTTTAAGTTTAAATAAACAAAATGAGTTTTTACTTAAGGCTTATTATAA
AGTTTATCAAAGTATTAAACATTGTAGAGATTTTAACGATAATTTTATTAAAGTTTATGATAAAATAAAAAACTCTTTTA
TGAGTTTACAAAATTCTCAAAAAAATGAAATTTTTATTCAAGAAATTATTCAAGATATAGATAAAACCAAAACTCAAATA
GATGAACTTTACAATACTCAAAAAGATTTGATACAAATTTTAGGTCCCTTACTAACTCAATTTGAACTTAATCTTGCTAG
AATTTATGTTTTAAATCCTAAAACCAAAGAAGATGCTTTTAATAAAAGCATTCTTTGGATAAAAGAACATTTAGAATTTA
TGGAATTAGTTTATGGGCATATTAAAGCACAAGAAAATGCTTTGATTAAAAATATACTTCCTTTAGAAGAAAAACTTAAA
GAAAGAAAATTAGATAAATGGATGGAAAGGGTGAGAAGGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGGTATGTTAGATGCTGATGATATATGTGGAACTTTGGTGTTTTTACTTAGCGATGAGAGTAAATTTATCACAGGGCAA
ACCTTAGTAGTAGATGATGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGAAGAGCTTTTTTTAAAAAATACTCAAGCTTTGTTTGAGGTCGATGAGTTTTTAGCTTGTACACTAAGATCACTTAAA
TACTTAACTTTTGCACTTAT

Product: motility accessory factor

Products: NA

Alternate protein names: PseD Protein

Number of amino acids: Translated: 653; Mature: 652

Protein sequence:

>653_residues
MGLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTFLYENVIDEFNSMLNTYNDKY
LLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIWIMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFF
QFSRIYFLELMSHYYERFHEDILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT
AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFNNDFGEFDKDIVFIVKSVTHP
HTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSVAHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHAN
LHNGDYERDLDRFSTTAYGGNGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK
DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQKNEIFIQEIIQDIDKTKTQI
DELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAFNKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLK
ERKLDKWMERVRR

Sequences:

>Translated_653_residues
MGLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTFLYENVIDEFNSMLNTYNDKY
LLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIWIMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFF
QFSRIYFLELMSHYYERFHEDILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT
AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFNNDFGEFDKDIVFIVKSVTHP
HTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSVAHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHAN
LHNGDYERDLDRFSTTAYGGNGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK
DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQKNEIFIQEIIQDIDKTKTQI
DELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAFNKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLK
ERKLDKWMERVRR
>Mature_652_residues
GLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTFLYENVIDEFNSMLNTYNDKYL
LYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIWIMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFFQ
FSRIYFLELMSHYYERFHEDILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDTA
IIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFNNDFGEFDKDIVFIVKSVTHPH
TIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSVAHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHANL
HNGDYERDLDRFSTTAYGGNGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDKD
LNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQKNEIFIQEIIQDIDKTKTQID
ELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAFNKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLKE
RKLDKWMERVRR

Specific function: Unknown

COG id: COG2604

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76604; Mature: 76473

Theoretical pI: Translated: 7.22; Mature: 7.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTF
CCEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCC
LYENVIDEFNSMLNTYNDKYLLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIW
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHH
IMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFFQFSRIYFLELMSHYYERFHE
HHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCC
AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFN
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHC
NDFGEFDKDIVFIVKSVTHPHTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSV
CCCCHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCHHH
AHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHANLHNGDYERDLDRFSTTAYGG
EEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCEECC
NGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK
CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQ
HCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KNEIFIQEIIQDIDKTKTQIDELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHH
NKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLKERKLDKWMERVRR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTF
CEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCC
LYENVIDEFNSMLNTYNDKYLLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIW
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHH
IMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFFQFSRIYFLELMSHYYERFHE
HHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCC
AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFN
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHC
NDFGEFDKDIVFIVKSVTHPHTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSV
CCCCHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCHHH
AHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHANLHNGDYERDLDRFSTTAYGG
EEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCEECC
NGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK
CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQ
HCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KNEIFIQEIIQDIDKTKTQIDELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHH
NKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLKERKLDKWMERVRR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA