| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is maf-1
Identifier: 57238379
GI number: 57238379
Start: 1412428
End: 1414389
Strand: Direct
Name: maf-1
Synonym: CJE1522
Alternate gene names: NA
Gene position: 1412428-1414389 (Clockwise)
Preceding gene: 57238378
Following gene: 57238380
Centisome position: 79.45
GC content: 26.45
Gene sequence:
>1962_bases ATGGGGCTTATGATGACCTTCACCCCTACCCAAAAAGAACTCTTTAACAAAAACATTGAGGCTTTAAGTAATATTCTTTT AAAAGAAAGTTTAAAAGAAATTAAATCAAGTAAATTTGAACTTATCTTAGGTAAAGATAATCTAGATATCAATCTAAAAG ATACAAGTGATAATACTTTTCTTTATGAAAATGTTATTGATGAATTCAACTCTATGCTAAATACTTATAATGATAAATAT CTACTTTATCCTGTATTGTATTTTTATGGTTTTGGAAATGGAATTTTATATAAAGCTTTATTGCAAAATAAAAATCATCA ACATATTGTTGTTTTTGAAAAAGATATAGAAATCATTTGGATAATGTTTCATATCTTAGATTTTTCACATGAATTACAAA GTGCAAGATTGATGATTTTGCAAACAAGTTCTTTGGATATAGAATTTTTTTCTAATTTTTGCTCTAGCAAACCTTTCTTT CAATTTTCTAGAATTTATTTTTTAGAACTGATGAGTCATTATTATGAAAGATTTCATGAAGATATTTTAGGATTGAATAA AAAATTAGCAGAAAATTTTAAAAATTCTATTGTTTCTCATGGCAATGATCCCCTTGATGCTCTTCAAGGCATAGAGCAAT TTGTTTATAATCTTCCTCAAATGATTACCCATCCTAGTTATAAAGAATTACTTTCTAAAAGAAAGGGTATAAGTGATACA GCTATCATTGTTTCTACAGGACCATCTCTTACTAAACAACTTCCTTTGTTAAAAAAATATGCTAATAAAGCTACAATTTT TTGTGCAGATTCTTCTTATCCTATTTTAGCTAAACATGGTATAAAGCCTGATTATGTTTGTATGCTAGAAAGAACAGAAA TTACTGCTGAGTTTTTTAATAATGATTTTGGGGAATTTGATAAGGATATTGTGTTTATTGTTAAATCTGTTACACATCCT CACACTATCAAATATCTTCAAAAAAATAATAGAGCTTTTATACTTGTATCCACCTATGCAAGCTTTATACAATATTTAAA ATTAGATTATTTTGGATATTTTAATATGGGATTTAGCGTAGCACATATGAATTTTTTATTAACCATTCATCTAAAATACA AAAACATCATTCTCATAGGTCAGGATTTAGCTTATGCCAAAGATGGGCAAACACACTCTCAAGGTTTTATCCATGCTAAT TTACACAATGGAGACTATGAAAGAGATTTAGATAGATTTAGCACTACAGCTTATGGAGGAAATGGAAAAGTTCAAAGTTC TGAAATTTGGACACTTTTTAGACATAACTTTGAAAAAGATATAGTCAATATAAAAATGAATTATCACATCACCACCTACA ACTGCACCGAAGGTGGAGCAAGGATAGAAGGAACCATAGAAAAACCTTTTCTATGGGCTTGTGAGAATTTACTTGATAAA GATTTAAATAAACCTTTTGAAAAATTAGAACCTTTAAGTTTAAATAAACAAAATGAGTTTTTACTTAAGGCTTATTATAA AGTTTATCAAAGTATTAAACATTGTAGAGATTTTAACGATAATTTTATTAAAGTTTATGATAAAATAAAAAACTCTTTTA TGAGTTTACAAAATTCTCAAAAAAATGAAATTTTTATTCAAGAAATTATTCAAGATATAGATAAAACCAAAACTCAAATA GATGAACTTTACAATACTCAAAAAGATTTGATACAAATTTTAGGTCCCTTACTAACTCAATTTGAACTTAATCTTGCTAG AATTTATGTTTTAAATCCTAAAACCAAAGAAGATGCTTTTAATAAAAGCATTCTTTGGATAAAAGAACATTTAGAATTTA TGGAATTAGTTTATGGGCATATTAAAGCACAAGAAAATGCTTTGATTAAAAATATACTTCCTTTAGAAGAAAAACTTAAA GAAAGAAAATTAGATAAATGGATGGAAAGGGTGAGAAGGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGGTATGTTAGATGCTGATGATATATGTGGAACTTTGGTGTTTTTACTTAGCGATGAGAGTAAATTTATCACAGGGCAA ACCTTAGTAGTAGATGATGG
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGAAGAGCTTTTTTTAAAAAATACTCAAGCTTTGTTTGAGGTCGATGAGTTTTTAGCTTGTACACTAAGATCACTTAAA TACTTAACTTTTGCACTTAT
Product: motility accessory factor
Products: NA
Alternate protein names: PseD Protein
Number of amino acids: Translated: 653; Mature: 652
Protein sequence:
>653_residues MGLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTFLYENVIDEFNSMLNTYNDKY LLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIWIMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFF QFSRIYFLELMSHYYERFHEDILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFNNDFGEFDKDIVFIVKSVTHP HTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSVAHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHAN LHNGDYERDLDRFSTTAYGGNGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQKNEIFIQEIIQDIDKTKTQI DELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAFNKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLK ERKLDKWMERVRR
Sequences:
>Translated_653_residues MGLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTFLYENVIDEFNSMLNTYNDKY LLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIWIMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFF QFSRIYFLELMSHYYERFHEDILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFNNDFGEFDKDIVFIVKSVTHP HTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSVAHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHAN LHNGDYERDLDRFSTTAYGGNGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQKNEIFIQEIIQDIDKTKTQI DELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAFNKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLK ERKLDKWMERVRR >Mature_652_residues GLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTFLYENVIDEFNSMLNTYNDKYL LYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIWIMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFFQ FSRIYFLELMSHYYERFHEDILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDTA IIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFNNDFGEFDKDIVFIVKSVTHPH TIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSVAHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHANL HNGDYERDLDRFSTTAYGGNGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDKD LNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQKNEIFIQEIIQDIDKTKTQID ELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAFNKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLKE RKLDKWMERVRR
Specific function: Unknown
COG id: COG2604
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76604; Mature: 76473
Theoretical pI: Translated: 7.22; Mature: 7.22
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTF CCEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCC LYENVIDEFNSMLNTYNDKYLLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIW HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHH IMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFFQFSRIYFLELMSHYYERFHE HHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCC AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFN EEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHC NDFGEFDKDIVFIVKSVTHPHTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSV CCCCHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCHHH AHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHANLHNGDYERDLDRFSTTAYGG EEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCEECC NGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQ HCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KNEIFIQEIIQDIDKTKTQIDELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHH NKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLKERKLDKWMERVRR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure GLMMTFTPTQKELFNKNIEALSNILLKESLKEIKSSKFELILGKDNLDINLKDTSDNTF CEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCC LYENVIDEFNSMLNTYNDKYLLYPVLYFYGFGNGILYKALLQNKNHQHIVVFEKDIEIIW HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHH IMFHILDFSHELQSARLMILQTSSLDIEFFSNFCSSKPFFQFSRIYFLELMSHYYERFHE HHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DILGLNKKLAENFKNSIVSHGNDPLDALQGIEQFVYNLPQMITHPSYKELLSKRKGISDT HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCC AIIVSTGPSLTKQLPLLKKYANKATIFCADSSYPILAKHGIKPDYVCMLERTEITAEFFN EEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHC NDFGEFDKDIVFIVKSVTHPHTIKYLQKNNRAFILVSTYASFIQYLKLDYFGYFNMGFSV CCCCHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCHHH AHMNFLLTIHLKYKNIILIGQDLAYAKDGQTHSQGFIHANLHNGDYERDLDRFSTTAYGG EEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCEECC NGKVQSSEIWTLFRHNFEKDIVNIKMNYHITTYNCTEGGARIEGTIEKPFLWACENLLDK CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHH DLNKPFEKLEPLSLNKQNEFLLKAYYKVYQSIKHCRDFNDNFIKVYDKIKNSFMSLQNSQ HCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KNEIFIQEIIQDIDKTKTQIDELYNTQKDLIQILGPLLTQFELNLARIYVLNPKTKEDAF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHH NKSILWIKEHLEFMELVYGHIKAQENALIKNILPLEEKLKERKLDKWMERVRR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA