Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is yqeW [H]

Identifier: 57238276

GI number: 57238276

Start: 564133

End: 565785

Strand: Direct

Name: yqeW [H]

Synonym: CJE0628

Alternate gene names: 57238276

Gene position: 564133-565785 (Clockwise)

Preceding gene: 57238277

Following gene: 57238270

Centisome position: 31.73

GC content: 29.04

Gene sequence:

>1653_bases
GTGGCAATACTTCTTATTGGAATGACTAATTCAGGTATAGGTTTTAAAGCTTTTAGTGGTGGTTTGCTTGAAAAAATTTT
AGCGAAGTCAACCGATACAAAGATAAAAAGTATACTTTTTGGTACTTTAAGTACTTTAATTATGCAATCTTCAACTTTAG
TTTCTATTATTACGATTTCTTTTTTGAGTGCAGGGCTTATTTCTTTGGGTGCGGGCATAGGGATTATTTTTGGAGCAAAT
TTAGGAAATACGGCAAGCTCTTGGCTGATTGTTGGTTTGACAAATATTAAAATTTCAATGCTAGCTATCCCACTTTTGAT
TATTGGAGTATTATTTTTCTTTCAAAAAGATAGTGTTTTAAAAGGTTTGGGTAATATTTTTATTGGTATAGGATTTTTCT
TTTTGGGTGTGGATTATATTAAAAGTGGTTTTGAAAATTTTAAACATATAATTGATCTTTCTCGTTTTGATTTTGCTGGT
TTTAAAGGAGTTTTTGTTTTTTTAGGATTAGGTGCTTTGCTTACAGGAGTTATACAATCAAGCACAGCTACAATGGCTAT
TATTGTCGCTGCTTTACTTGCAGGACAAATCAGTTTGGAAAATTCCTTAGCAGCAACTTTAGGTACTAGTGTTGGAGGAG
TTGTAACGGCTGTTTTAGCTTCTTTAAGTACCAATATTGAAGGAAAGAAATTAGCGTTTGCAAGTTGTATTTTTAATTTT
GGTATAGCTTTTTTAATAGTGCTTATTTTTCCTTATTTTATACATTTTCTTAATTTTTTATCCATTGTATTAAACATAGA
AGATATAGCTTTGAAAGTAGCATTATTTCACACTTTGTTTAATTTAATTGGTGTTGTGCTTTTTTCATTCTTTACTCCTC
AAATTGTTCTTTTTTTAAATAAGATAGTAAAAGCTCCTAAAGATAAGAATAAAGACAAGCCTTTATATCTTGATAGTAGT
TTGGTTAAGTTTAGTGACACAGCCATCGAAGCTTTAAGGAAAGAAAGCGAGCATCTTTATAACAATACCTATGCAATTGT
TGCTCATGCTATAGGTTTTAGTCGTAAAGATATACAAAGTGATAAAAGTTTTAAAGAAATTTTAGAAAATAAAAAGTGGT
TTAGTAAAAATGTGGATTTGGACTATTTGTATCAAACTAGGATAAAGGTTCTTTTTGAAGCTATTATCGATTTTTCAACT
AAAGCACAAGTTTATATTAACGATGAAACAAAGAATCATAAAATTTTTACCTTTAAGATGGCAGCTAAAAATTTAGCCGA
AACAACTAAAAATTTAAAAATTATCCAAGCAAATATTAAGAAATATTCTAGTTCTTCTAATGAATTTTTGGCTTTAGAGT
ACAATAAAATTAGATCGAATTTAGGAGAGCTTTTAAGAAGTATCGAAGAGCTTAGAGTTGTTGAAGATCGTGAAAAGCTT
TATTTGATTATTAAAAATCTTCAAAAAGGAAAAGAAATTTTAAAAGAAATCGATACTTTAACCTTGAGCAATGTTGAACA
TCTTATTTCAGTAAGAAAAATCACAACAGCTGAAGGAATTTCAATACTTAATGATACAACTTTTGCTGCTAAGATTGCTG
AAGAACTTATAGATGCTGTTGAGGTGATGTTTTCTAAAGATATATCAAACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTTAAAATATTTTAAATTTATTTCATGGAGTATTTTTACTTTAGTTCTGATTTTTATTTTAATTCGTTATGACGAGC
TTGCCAATCTTTTAGCAGGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGTTTGTGCTAGTTTAGTTATTGTCTTGTATAGGCGTTAGAAATTCTTCATTGATTAAAATATCAACAACATCTTTAAA
CATAGGCAAAGCACTTTGTG

Product: Na/Pi-cotransporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 550; Mature: 549

Protein sequence:

>550_residues
MAILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITISFLSAGLISLGAGIGIIFGAN
LGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVLKGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAG
FKGVFVFLGLGALLTGVIQSSTATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF
GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLNKIVKAPKDKNKDKPLYLDSS
LVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQSDKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFST
KAQVYINDETKNHKIFTFKMAAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL
YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAVEVMFSKDISN

Sequences:

>Translated_550_residues
MAILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITISFLSAGLISLGAGIGIIFGAN
LGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVLKGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAG
FKGVFVFLGLGALLTGVIQSSTATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF
GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLNKIVKAPKDKNKDKPLYLDSS
LVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQSDKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFST
KAQVYINDETKNHKIFTFKMAAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL
YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAVEVMFSKDISN
>Mature_549_residues
AILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITISFLSAGLISLGAGIGIIFGANL
GNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVLKGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAGF
KGVFVFLGLGALLTGVIQSSTATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNFG
IAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLNKIVKAPKDKNKDKPLYLDSSL
VKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQSDKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFSTK
AQVYINDETKNHKIFTFKMAAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKLY
LIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAVEVMFSKDISN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To E.coli yjbB [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=341, Percent_Identity=25.5131964809384, Blast_Score=65, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60562; Mature: 60431

Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITIS
CEEEEEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
FLSAGLISLGAGIGIIFGANLGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVL
HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
KGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAGFKGVFVFLGLGALLTGVIQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
STATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF
CHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIVKAPKDKNKDKPLYLDSSLVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQS
HHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHCC
DKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFSTKAQVYINDETKNHKIFTFKM
CHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEH
AAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL
HHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
EVMFSKDISN
HHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
AILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITIS
EEEEEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
FLSAGLISLGAGIGIIFGANLGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVL
HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
KGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAGFKGVFVFLGLGALLTGVIQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
STATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF
CHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIVKAPKDKNKDKPLYLDSSLVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQS
HHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHCC
DKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFSTKAQVYINDETKNHKIFTFKM
CHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEH
AAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL
HHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
EVMFSKDISN
HHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9023197; 9384377 [H]