Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57238245

Identifier: 57238245

GI number: 57238245

Start: 595486

End: 596772

Strand: Direct

Name: 57238245

Synonym: CJE0659

Alternate gene names: NA

Gene position: 595486-596772 (Clockwise)

Preceding gene: 57238246

Following gene: 57238244

Centisome position: 33.5

GC content: 30.15

Gene sequence:

>1287_bases
ATGGTTTTTTTAATCATCTCTAGTATTATAGTGGCTATTATTTTGGGCTATATTACTAGACATAATGTTGGAATTTTTGC
TATGATTTTTGCTTATATTATAGGAGCTTTTTTTATGGATTTAGCTCCTAAAAAAATCATAGCTTTTTGGCCTATTTCTA
TATTTTTTGTTATTTTTGCTGTCTCATTGTTTTATAATTTTGCAACCGTAAATGGAACTCTTGAAAAATTAGCTGGACAT
TTGATGTATCGTTTTGTTAATCATCCTTATTTGCTTCCTTTTGTTATTTTTGTGGTTAGTGCTATTATAGCTGCTTTAGG
AGCAGGTTTTTATACAGTTTTAGCTTTTATGGCACCACTTACTTTTTTACTTTGCGATAAAATCGGTTTAAGCAAAATTG
CTGGAGCTATGGCTATAAATTATGGTGCTTTGGGAGGAGCAAATTTTATGACTTCTCAAAGCGGGATTATTTTTCGAGGA
TTGATGGAAAATTCAGGTATTGAAGCAAATGAAGCTTTTGCAAATTCTAGTATTATTTTTGCTTTTACTATAATCTTGCC
TATTGTGGTATTATCTTTTTTTGTGTTTAATGCTTTTAAAAATAATATAAAAATTAGTGTTATTTCAAAACCTGATCCAT
TTGATTATAAACAAAAAACTACTTTAATTCTCATGTTTATGATGATTGTTGTTGTTTTAATCTTTCCTGTGCTAAATATT
ATTTTTCCACATAATGAGACAATTAGTTATTTTAATAAAAAAATAGATATAGCTATGATAGCCATGATTTTTGTTGCCAT
TGCTTTATTTTTAAAATTGGCCGATGAGAAACAAGTTGTTGCTTTAATTCCTTGGGGAACCTTGATAATGATTTGTGGAG
TAGGGATGTTAATTAGCATAGCAGTTGAAGCAGGGGTTATAAAATTATTTTCAGATCTTGTAGAAAATGAGATCAATGTG
ATTTTTATTCCGTTAATAATGTGTGCTATTGCAGCTTTTATGTCGCTTTTTTCAAGTACTTTGGGTGTGGTTACTCCAGC
GCTTTTTCCTATAGTTTCAAGCATTGCTGCAAGCAGTGGATTAAGCGAGGCATTGCTTTTTTCTTGTATTGTTGTAGGGG
CTCAAGCTTCTGCTATTTCTCCTTTTTCTTCTGGAGGAAGTCTAATTTTAGGATCTTGCCCTGATAAATATAAGGAAAAA
TTATTTAAAGATTTACTTATTAAAGCTGTGCCTATAGGATTTATAGCGGCGATTTTAGCTACTATTATAATGAGTTTTAT
TTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTGCTAAATAGATATTTTTTAAATTTAGATTTTGTTTTTATGCTTTGAAAAATATATTTTTTGATATTATAAGCCTTA
TAATATTTTAAAGGATGATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGATAATTTAATGAAGATTGATACTCACGCACATATATTTTTGAAAAAGTTAAATACGGTTGCAAATGCAAGATATAAGC
CTGATTATGACGCTAGTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Dicarboxylate Carrier MatC Domain-Containing Protein; Integral Membrane Protein; Gram-Positive Signal Peptide YSIRK Family; Dicarboxylate Carrier Protein; Di- And Tricarboxylate Transporter; Na+/H+ Antiporter NhaD-Like Permease; Dicarboxylate Carrier Protein MatC; Membrane Associated Dicarboxylate Carrier Protein

Number of amino acids: Translated: 428; Mature: 428

Protein sequence:

>428_residues
MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH
LMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG
LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI
IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGVIKLFSDLVENEINV
IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK
LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL

Sequences:

>Translated_428_residues
MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH
LMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG
LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI
IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGVIKLFSDLVENEINV
IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK
LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL
>Mature_428_residues
MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH
LMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG
LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI
IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGVIKLFSDLVENEINV
IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK
LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL

Specific function: Unknown

COG id: COG0471

COG function: function code P; Di- and tricarboxylate transporters

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46427; Mature: 46427

Theoretical pI: Translated: 8.44; Mature: 8.44

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSLFYNFATVNGTLEKLAGHLMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
TFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRGLMENSGIEANEAFANSSIIF
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHCCCCCCCHHHHCCCHHHH
AFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISI
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH
AVEAGVIKLFSDLVENEINVIFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEKLFKDLLIKAVPIGFIAAILA
HHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIIMSFIL
HHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSLFYNFATVNGTLEKLAGHLMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
TFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRGLMENSGIEANEAFANSSIIF
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHCCCCCCCHHHHCCCHHHH
AFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISI
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH
AVEAGVIKLFSDLVENEINVIFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEKLFKDLLIKAVPIGFIAAILA
HHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIIMSFIL
HHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA