| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57238245
Identifier: 57238245
GI number: 57238245
Start: 595486
End: 596772
Strand: Direct
Name: 57238245
Synonym: CJE0659
Alternate gene names: NA
Gene position: 595486-596772 (Clockwise)
Preceding gene: 57238246
Following gene: 57238244
Centisome position: 33.5
GC content: 30.15
Gene sequence:
>1287_bases ATGGTTTTTTTAATCATCTCTAGTATTATAGTGGCTATTATTTTGGGCTATATTACTAGACATAATGTTGGAATTTTTGC TATGATTTTTGCTTATATTATAGGAGCTTTTTTTATGGATTTAGCTCCTAAAAAAATCATAGCTTTTTGGCCTATTTCTA TATTTTTTGTTATTTTTGCTGTCTCATTGTTTTATAATTTTGCAACCGTAAATGGAACTCTTGAAAAATTAGCTGGACAT TTGATGTATCGTTTTGTTAATCATCCTTATTTGCTTCCTTTTGTTATTTTTGTGGTTAGTGCTATTATAGCTGCTTTAGG AGCAGGTTTTTATACAGTTTTAGCTTTTATGGCACCACTTACTTTTTTACTTTGCGATAAAATCGGTTTAAGCAAAATTG CTGGAGCTATGGCTATAAATTATGGTGCTTTGGGAGGAGCAAATTTTATGACTTCTCAAAGCGGGATTATTTTTCGAGGA TTGATGGAAAATTCAGGTATTGAAGCAAATGAAGCTTTTGCAAATTCTAGTATTATTTTTGCTTTTACTATAATCTTGCC TATTGTGGTATTATCTTTTTTTGTGTTTAATGCTTTTAAAAATAATATAAAAATTAGTGTTATTTCAAAACCTGATCCAT TTGATTATAAACAAAAAACTACTTTAATTCTCATGTTTATGATGATTGTTGTTGTTTTAATCTTTCCTGTGCTAAATATT ATTTTTCCACATAATGAGACAATTAGTTATTTTAATAAAAAAATAGATATAGCTATGATAGCCATGATTTTTGTTGCCAT TGCTTTATTTTTAAAATTGGCCGATGAGAAACAAGTTGTTGCTTTAATTCCTTGGGGAACCTTGATAATGATTTGTGGAG TAGGGATGTTAATTAGCATAGCAGTTGAAGCAGGGGTTATAAAATTATTTTCAGATCTTGTAGAAAATGAGATCAATGTG ATTTTTATTCCGTTAATAATGTGTGCTATTGCAGCTTTTATGTCGCTTTTTTCAAGTACTTTGGGTGTGGTTACTCCAGC GCTTTTTCCTATAGTTTCAAGCATTGCTGCAAGCAGTGGATTAAGCGAGGCATTGCTTTTTTCTTGTATTGTTGTAGGGG CTCAAGCTTCTGCTATTTCTCCTTTTTCTTCTGGAGGAAGTCTAATTTTAGGATCTTGCCCTGATAAATATAAGGAAAAA TTATTTAAAGATTTACTTATTAAAGCTGTGCCTATAGGATTTATAGCGGCGATTTTAGCTACTATTATAATGAGTTTTAT TTTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTGCTAAATAGATATTTTTTAAATTTAGATTTTGTTTTTATGCTTTGAAAAATATATTTTTTGATATTATAAGCCTTA TAATATTTTAAAGGATGATA
Downstream 100 bases:
>100_bases GGATAATTTAATGAAGATTGATACTCACGCACATATATTTTTGAAAAAGTTAAATACGGTTGCAAATGCAAGATATAAGC CTGATTATGACGCTAGTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Dicarboxylate Carrier MatC Domain-Containing Protein; Integral Membrane Protein; Gram-Positive Signal Peptide YSIRK Family; Dicarboxylate Carrier Protein; Di- And Tricarboxylate Transporter; Na+/H+ Antiporter NhaD-Like Permease; Dicarboxylate Carrier Protein MatC; Membrane Associated Dicarboxylate Carrier Protein
Number of amino acids: Translated: 428; Mature: 428
Protein sequence:
>428_residues MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH LMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGVIKLFSDLVENEINV IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL
Sequences:
>Translated_428_residues MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH LMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGVIKLFSDLVENEINV IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL >Mature_428_residues MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH LMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGVIKLFSDLVENEINV IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL
Specific function: Unknown
COG id: COG0471
COG function: function code P; Di- and tricarboxylate transporters
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46427; Mature: 46427
Theoretical pI: Translated: 8.44; Mature: 8.44
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 4.2 %Met (Translated Protein) 5.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 4.2 %Met (Mature Protein) 5.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSLFYNFATVNGTLEKLAGHLMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH TFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRGLMENSGIEANEAFANSSIIF HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHCCCCCCCHHHHCCCHHHH AFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISI HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH AVEAGVIKLFSDLVENEINVIFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEKLFKDLLIKAVPIGFIAAILA HHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIIMSFIL HHHHHHHC >Mature Secondary Structure MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSLFYNFATVNGTLEKLAGHLMYRFVNHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH TFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRGLMENSGIEANEAFANSSIIF HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHCCCCCCCHHHHCCCHHHH AFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISI HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH AVEAGVIKLFSDLVENEINVIFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVSSIAASSG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEKLFKDLLIKAVPIGFIAAILA HHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIIMSFIL HHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA